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Nature子刊:用于阿尔茨海默病痴呆评估的多模态深度学习模型

在全球范围内,每年有近1000万新发痴呆病例,其中阿尔茨海默病(AD)最为常见。需要新的措施来改善对各种病因导致认知障碍的个体的诊断。作者报告了一个深度学习框架,该框架以连续方式完成多个诊断步骤,以识别具有正常认知(NC)、轻度认知障碍(MCI)、AD和非AD痴呆(nADD)的人。作者展示了一系列能够接受常规收集的临床信息的灵活组合的模型,包括人口统计、病史、神经心理学测试、神经影像学和功能评估。然后,作者表明这些框架与执业神经科医生和神经放射科医生的诊断准确性相比具有优势。最后,作者在计算机视觉中应用可解释性方法,以表明模型检测到的疾病特异性模式可以跟踪整个大脑的退行性变化的不同模式,并与尸检时神经病理学病变的存在密切相关。作者的工作证明了使用既定的医学诊断标准验证计算预测的方法。

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Molecular Psychiatry:静息态fMRI预测青少年认知能力

青春期是主要的身体、认知和社会心理的变化时期,极易出现不良行为模式和精神疾病,可能会导致整个成年期的精神和身体健康状况恶化。其中主要危险因素之一是难以获得较高层次的认知功能,其中包括各种不同的推理和解决问题的能力、认知能力和学习/回忆信息能力。目前普遍认为,高阶认知功能依赖于任务控制网络和默认模式网络(DMN)之间的复杂相互作用。而且,从儿童早期到成年早期,任务控制网络和DMN之间的功能联系逐渐发展,这意味着信息交换的增长和自上而下的监管关系的成熟。这提出了一个有趣的问题:这些网络之间的连接模式的差异是否预示着高阶认知功能的差异。

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8个技巧,提高你的数据分析工作效率

前言 我刚和一位老友恢复了联系。她一直对数据科学很感兴趣,但10个月前才涉足这一领域——作为一个数据科学家加入了一个组织。我明显感觉到她已经在新的岗位上学到了很多东西。然而,我们聊天时,她提到了一个至今在我脑海里都挥之不去的事实或者说是问题。她说,不论她表现如何,每一个项目或分析任务在令经理满意之前都要做好多次。她还提到,往往事后发现原本不需要花这么多时间! 听起来是不是很像你的遭遇?你会不会在得出像样的答案之前反复分析很多次?或者一遍又一遍地为类似的活动写着代码?如果是这样的话,这篇文章正好适合你。我会分

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BrainStat:一个用于全脑统计和多模态特征关联的工具箱

神经影像数据分析和解释需要结合多学科的共同努力,不仅依赖于统计方法,而且越来越多地依赖于与其他脑源性特征相关的关联,如基因表达、组织学数据、功能和认知结构。在这里,我们介绍了BrainStat,它是一个工具箱,包括(i)在体素空间和皮层空间的神经影像数据集中的单变量和多变量线性模型,以及(ii)死后基因表达和组织学的空间图谱,基于任务的功能磁共振成像元分析,以及几个常见静息态功能磁共振成像大脑皮层模板在内的多模态特征关联。统计和特征关联结合成一个关键的工具箱简化了分析过程并加速了跨模态研究。工具箱用Python和MATLAB实现,这两种编程语言在神经影像和神经信息学领域中广泛使用的。BrainStat是公开提供的,并包括一个可扩展的文件。

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fMRI中自发性短暂脑网络交互的行为相关性

几十年来,大脑不同区域的自发波动功能磁共振成像(fMRI)信号如何与行为相关一直是一个悬而未决的问题。这些信号中的相关性,被称为功能连接,可以在几分钟的数据中求平均值,为个人提供一个稳定的功能网络体系结构的表示。然而,这些稳定的特征和行为特征之间的联系已经被证明是由个体解剖学差异所主导的。在此,我们利用核学习工具,提出了评估和比较时变功能连接、时均功能连接、大脑结构数据和非成像受试者行为特征之间关系的方法。我们将这些方法应用于人类连接体项目静息状态fMRI数据,以显示时变的fMRI功能连接,在几秒钟的时间尺度上检测到,与一些不受解剖学支配的行为特征有关。尽管时间平均的功能连接在个体间的fMRI信号变化中占最大比例,但我们发现,智力的某些方面只能用时间变化的功能连接来解释。随着时间变化的fMRI功能连通性与群体行为变异性有一种独特的关系,这一发现表明,它可能反映了稳定神经结构周围的瞬时神经元通信波动。

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Python让Excel飞起来—批量进行数据分析

corr()函数默认计算的是两个变量之间的皮尔逊相关系数。该系数用于描述两个变量间线性相关性的强弱,取值范围为[-1,1]。系数为正值表示存在正相关性,为负值表示存在负相关性,为0表示不存在线性相关性。系数的绝对值越大,说明相关性越强。- 上表中第1行第2列的数值0.982321,表示的就是年销售额与年广告费投入额的皮尔逊相关系数,其余单元格中数值的含义依此类推。需要说明的是,上表中从左上角至右下角的对角线上的数值都为1,这个1其实没有什么实际意义,因为它表示的是变量自身与自身的皮尔逊相关系数,自然是1。- 从上表可以看到,年销售额与年广告费投入额、成本费用之间的皮尔逊相关系数均接近1,而与管理费用之间的皮尔逊相关系数接近0,说明年销售额与年广告费投入额、成本费用之间均存在较强的线性正相关性,而与管理费用之间基本不存在线性相关性。前面通过直接观察法得出的结论是比较准确的。- 第2行代码中的read_excel()是pandas模块中的函数,用于读取工作簿数据。3.5.2节曾简单介绍过这个函数,这里再详细介绍一下它的语法格式和常用参数的含义。- read_excel(io,sheet_name=0,header=0,names=None,index_col=None,usecols=None,squeeze=False,dtype=None)

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数据库对象事件与属性统计 | performance_schema全方位介绍

上一篇《事件统计 | performance_schema全方位介绍》详细介绍了performance_schema的事件统计表,但这些统计数据粒度太粗,仅仅按照事件的5大类别+用户、线程等维度进行分类统计,但有时候我们需要从更细粒度的维度进行分类统计,例如:某个表的IO开销多少、锁开销多少、以及用户连接的一些属性统计信息等。此时就需要查看数据库对象事件统计表与属性统计表了。今天将带领大家一起踏上系列第五篇的征程(全系共7个篇章),本期将为大家全面讲解performance_schema中对象事件统计表与属性统计表。下面,请跟随我们一起开始performance_schema系统的学习之旅吧~

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事件统计 | performance_schema全方位介绍

在上一篇 《事件记录 | performance_schema全方位介绍"》中,我们详细介绍了performance_schema的事件记录表,恭喜大家在学习performance_schema的路上度过了两个最困难的时期。现在,相信大家已经比较清楚什么是事件了,但有时候我们不需要知道每时每刻产生的每一条事件记录信息, 例如:我们希望了解数据库运行以来一段时间的事件统计数据,这个时候就需要查看事件统计表了。今天将带领大家一起踏上系列第四篇的征程(全系共7个篇章),在这一期里,我们将为大家全面讲解performance_schema中事件统计表。统计事件表分为5个类别,分别为等待事件、阶段事件、语句事件、事务事件、内存事件。下面,请跟随我们一起开始performance_schema系统的学习之旅吧。

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事件统计 | performance_schema全方位介绍

在上一篇 《事件记录 | performance_schema全方位介绍"》中,我们详细介绍了performance_schema的事件记录表,恭喜大家在学习performance_schema的路上度过了两个最困难的时期。现在,相信大家已经比较清楚什么是事件了,但有时候我们不需要知道每时每刻产生的每一条事件记录信息, 例如:我们希望了解数据库运行以来一段时间的事件统计数据,这个时候就需要查看事件统计表了。今天将带领大家一起踏上系列第四篇的征程(全系共7个篇章),在这一期里,我们将为大家全面讲解performance_schema中事件统计表。统计事件表分为5个类别,分别为等待事件、阶段事件、语句事件、事务事件、内存事件。下面,请跟随我们一起开始performance_schema系统的学习之旅吧。

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