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马尔可夫转换模型研究交通伤亡人数事故时间序列预测

p=12227 摘要 本文描述了R语言中马尔克夫转换模型分析过程。首先,对模拟数据集进行详细建模。接下来,将马尔可夫转换模型拟合到具有离散响应变量真实数据集。用于验证对这些数据集建模不同方法。...模拟实例 示例数据一个模拟数据集,用于展示如何检测两种不同模式存在:一种模式中响应变量高度相关,另一种模式中响应仅取决于外生变量x。...两者R平方均具有较高值。最后,转移概率矩阵具有较高值,这表明很难从接通状态更改为另一个状态。该模型可以完美地检测每个状态周期。残差看起来像是白噪声,它们适合正态分布。...该数据目的研究死亡人数与气候条件之间关系。由于在周末和工作日变量之间存在不同行为,因此我们说明了在这种情况下使用广义马尔科夫转换模型情况。 在此示例中,响应变量计数变量。...,但降水变量仅在这两种状态之一中显着

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R语言马尔可夫转换模型研究交通伤亡人数事故预测

用于验证对这些数据集建模不同方法。 模拟实例 示例数据一个模拟数据集,用于展示如何检测两种不同模式存在:一种模式中响应变量高度相关,另一种模式中响应仅取决于外生变量x。...图1中线性模型残差图表明,它们自相关很强。残差诊断图(图2)确认它们似乎不是白噪声,并且具有自相关关系。接下来,将自回归马尔可夫转换模型(MSM-AR)拟合到数据。自回归部分设置为1。...两者R平方均具有较高值。最后,转移概率矩阵具有较高值,这表明很难从接通状态更改为另一个状态。该模型可以完美地检测每个状态周期。残差看起来像是白噪声,它们适合正态分布。...该数据目的研究死亡人数与气候条件之间关系。由于在周末和工作日变量之间存在不同行为,因此我们说明了在这种情况下使用广义马尔科夫转换模型情况。 在此示例中,响应变量计数变量。...,但降水变量仅在这两种状态之一中显着

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马尔可夫转换模型研究交通伤亡人数事故时间序列预测|附代码数据

模拟实例 示例数据一个模拟数据集,用于展示如何检测两种不同模式存在:一种模式中响应变量高度相关,另一种模式中响应仅取决于外生变量x。...图1中线性模型残差图表明,它们自相关很强。残差诊断图(图2)确认它们似乎不是白噪声,并且具有自相关关系。接下来,将自回归马尔可夫转换模型(MSM-AR)拟合到数据。自回归部分设置为1。...两者R平方均具有较高值。最后,转移概率矩阵具有较高值,这表明很难从接通状态更改为另一个状态。该模型可以完美地检测每个状态周期。残差看起来像是白噪声,它们适合正态分布。...该数据目的研究死亡人数与气候条件之间关系。由于在周末和工作日变量之间存在不同行为,因此我们说明了在这种情况下使用广义马尔科夫转换模型情况。 在此示例中,响应变量计数变量。...,但降水变量仅在这两种状态之一中显着

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经典方差分析:手把手教你读懂、会用1

假如不同小组之间个体相互独立,例如不同药物注射小鼠,则是独立测量方差分析;如不同小组之间个体相同,例如注射药物小鼠不同阶段,或者微生物物种在不同样品组分布,则是重复测量方差分析。...LSD.test()函数进行分析,此方法最敏感,易检验出样品差异显著; Dunnett-t检验:与LSD检验计算公式完全相同,结果也相同,主要使用在有对照试验设计中,用于多个实验组均数与对照组均数间比较...S-N-K检验:StudentNewman Keuls,q检验法(与秩和检验法类似,将两个样本数据一起排序,通过两端非重叠数据个数计算Q值进行检验),在R中使用agricolaeSNK.test(...)函数可以进行分析,S-N-K法多重比较方法中检验尺度较严格方法,易使样品间检验不显著; 图基检验:Tukey检验法,也称作Tukey HSD,q检验法,特别适合样本量小于10多重样本比较,在R中使用...不同,单因素协方差分析假设了回归斜率同质性,也即每一同剂量小组幼崽体重关于怀孕时间斜率相同,也即幼崽体重与怀孕时间关系不依赖于药物剂量,可以通过下面方式检验: fit2=aov(weight

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NC:数据泄漏会夸大基于连接机器学习模型预测性能

图1 本研究中使用预测管道总结1.1 无泄露管道表现我们对4条无泄漏管道进行了评估,发现不同分析选择导致了不同预测性能(图2),通过Pearson相关r和交叉验证R2(也称为q2)进行了评估。...对注意问题(r = 0.01, q2 =−0.13)无预测能力,对年龄(r = 0.80, q2 = 0.63)有较强预测能力,对矩阵推理(r = 0.30, q2 = 0.08)有中等预测能力。...排除现场校正后性能几乎与金标准模型相同。然而,没有回归出变量夸大了r,但对所有三种表型q2有不同影响,包括注意力问题,年龄和矩阵推理。...另一种忽视家族结构,构成泄露。与使用整个数据集情况不同,孪生数据集泄漏在预测性能上有轻微到中度提高(图6)。年龄膨胀为Δr = 0.04,矩阵推理和注意力问题膨胀为Δr = 0.02。...例如,对于矩阵推理ABCD预测,10次迭代中位数导致所有形式泄漏(N = 400)Δr值范围略小,包括特征泄漏、泄漏位点校正、泄漏变量回归、家族泄露,20%个体泄露。

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R语言用贝叶斯层次模型进行空间数据分析|附代码数据

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon ] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵 范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义  slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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使用贝叶斯层次模型进行空间数据分析

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon \] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵 范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义 slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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重复事件(表现形态:活跃、留存、复购)建模(生存分析)案例学习笔记

基础风险函数相同与否则必须根据实际研究背景决定,不同结局基础风险函数肯定不同,但相同结局基础风险函数也可能不同,例如以孕妇出现流产为结局研究中对象多次流产后导致习惯性流产,此时发生相同结局(...MSM适合处理个体在一个有限数量(通常是少量特定健康状况(包括死亡)所定义状态间转移情况(如下图)。复发事件可看做个体在“健康”和“患病”两种状态间转移,从而可以应用MSM方法。...MSM一个优势,除了可以获得通常关注危险因素和某个事件发生(如“健康➜患病”)关系,还可以同时计算危险因素对多个不同事件(如“健康➜患病”,“患病➜康复”这两种状态转移)不同影响。...它同样假设不同事件基础风险函数相同,且同一危险因素对不同事件影响也相同。...因此,如果事件之间关联可以认为由于已测量变量引入,即在调整了这些变量之后事件发生独立,就可以用AG模型来解决。

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R语言用贝叶斯层次模型进行空间数据分析|附代码数据

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。邻接矩阵可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据:广义线性模型(具有空间随机效应)。空间计量经济学模型。...线性混合模型一种常见方法(对于高斯数据)使用具有随机效应线性回归:\ [Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon]随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布:\ [u...\(\ rho \)空间自相关参数。\(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。\(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义为了定义模型,我们需要:X:变量矩阵W:行标准化邻接矩阵Q:系数\(\ beta \)精确矩阵范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义 slm潜在作用是通过参数传递 args.sm。

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r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现|附代码数据

s相同,如前所述,预测λ值。...用户可以根据拟合对象进行预测。除中选项外 coef,主要参数 newx新值矩阵 x。type 选项允许用户选择预测类型:*“链接”给出拟合值 因变量与正态分布“链接”相同。...结果,每个λ值系数也是一个矩阵。 在这里,我们解决以下问题: 这里,βjp×K系数矩阵β第j行,对于单个预测变量xj,我们用每个系数K向量βj组套索罚分代替每个单一系数绝对罚分。...βk指第k列(对于结果类别k),βj指第j行(变量jK个系数向量)。最后一个惩罚项||βj|| q ,我们对q有两个选择:q∈{1,2}。当q = 1时,这是每个参数套索惩罚。...用户可以加载自己数据并遵循类似的过程。在这种情况下,x必须变量值n×p矩阵-每行对应一个患者,每列对应一个变量。y一个n×2矩阵

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R语言使用贝叶斯层次模型进行空间数据分析

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon \] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵  范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义  slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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R语言使用贝叶斯层次模型进行空间数据分析

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon \] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵 范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义 slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现

s相同,如前所述,预测λ值。...除中选项外 coef,主要参数 newx新值矩阵 x。type 选项允许用户选择预测类型:*“链接”给出拟合值 因变量与正态分布“链接”相同。...设Y为N×K指标因变量矩阵,元素yiℓ= I(gi =ℓ)。然后弹性网惩罚负对数似然函数变为 ? β系数p×K矩阵。βk指第k列(对于结果类别k),βj指第j行(变量jK个系数向量)。...最后一个惩罚项||βj|| q ,我们对q有两个选择:q∈{1,2}。当q = 1时,这是每个参数套索惩罚。...在这种情况下,x必须变量值n×p矩阵-每行对应一个患者,每列对应一个变量。y一个n×2矩阵

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R语言从入门到精通:Day11

例如,对于双因素方差分析,若不同处理方式中观测数不同, 那么模型y ~ A*B与模型y ~ B*A结果不同。...(对于任意表达式而言,有三种理解方式,分别是序贯型、分层型、边界型。其中R默认调用序贯型,而有些统计软件(如SPSS)默认调用边界型。...也不用担心必须应用其它两种理解方式情形,R中提供了很多函数来应对(如car中函数Anova())。) ?...以MASSUScereal数据集为例,研究谷物中的卡路里、脂肪和糖含量是否会因为储存架位置不同而发生变化。卡路里、脂肪和糖含量因变量,货架三水平(1、2、3)自变量。...(单因素多元方差分析有两个前提假设,一个多元正态性,一个方差协方差矩阵同质性,可以用Q-Q图来检验假设条件。还可以使用mvoutlier中函数ap.plot()来检验多元离群点。

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挖掘数据内部联系:相关性分析

此外,当具有变量时(需要控制干扰变量),可以使用ggmpcor()函数计算偏相关系数,其使用方法如下: pcor(u, S) 其中u为一个向量,S为变量协方差矩阵(可以通过函数cov()计算...相关系数检验 与距离不同,相关性需要进行统计检验,假如两个变量独立,那么相关系数R应该是很接近0,那么我们认为R服从均值为0正态分布,那么对于实际观测值r可以构造统计量使用t检验进行分析。..."spearman"), ...) pcor.test(r, q, n) 其中r为偏相关系数,q变量个数,n为样品数目。...但是这两个函数每次只能检验一个相关系数,Hmiscrcorr()函数可以同时计算相关性矩阵并进行检验(具体见下一小节),同时获得相关系数矩阵与对应p值矩阵。...ltmrcor.test()函数在计算相关系数检验同时还提供p值校正,其校正方法与p.adjust()函数相同,用法如下所示: rcor.test(mat,p.adjust=FALSE, p.adjust.method

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R语言使用限制平均生存时间RMST比较两条生存曲线分析肝硬化患者

本文说明了如何使用该函数来比较两组限制平均生存时间。 2 样本数据 在这个文章中,我们使用了梅奥诊所进行原发性胆汁性肝硬化(pbc)研究中部分数据,该研究包括在R语言生存中。...本文实现了Tian等人[4]提出ANCOVA类型调整分析,此外还有上一节中提出未经调整分析。设Y为限制性平均生存时间,设Z为治疗指标。同时,让X表示一个q基准变量向量。...如下图所示,对于实现TianRMST调整分析,唯一区别是用户是否向函数传递变量数据。下面一个执行调整后分析示例代码。...covariates=x 其中covariates基准特征数据向量/矩阵参数,x。为了说明问题,让我们试试以下三个基准变量,在pbc数据中,作为调整变量。...与中位生存时间不同即使在严重删减情况下,它也是可以估计。关于限制性平均生存时间,有相当多方法学研究可以替代风险比方法。然而,这些方法在实践中似乎很少被使用。

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R语言用贝叶斯层次模型进行空间数据分析|附代码数据

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon ] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵 范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义  slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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R语言用贝叶斯层次模型进行空间数据分析|附代码数据

出现空间依赖性是因为相邻区域将显示相似的目标变量值。 邻接矩阵 可以使用poly2nbpackage中函数来计算邻接矩阵 spdep。...除了 变量,我们可能还需要考虑数据空间结构。 可以使用不同类型回归模型来建模晶格数据: 广义线性模型(具有空间随机效应)。 空间计量经济学模型。...线性混合模型 一种常见方法(对于高斯数据)使用 具有随机效应线性回归: \ [ Y = X \ beta + Zu + \ varepsilon ] 随机效应向量\(u \)被建模为多元正态分布...\(\ rho \)空间自相关参数。 \(X \)变量矩阵,系数为\(\ beta \)。 \(e \)具有方差\(\ sigma ^ 2 \)高斯iid误差。...模型定义 为了定义模型,我们需要: X:变量矩阵 W:行标准化邻接矩阵 Q:系数\(\ beta \)精确矩阵 范围\(\ RHO \) ,通常由本征值定义  slm潜在作用是通过参数传递 args.sm

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R语言stan进行贝叶斯推理分析

p=6252 RStan 可以从许多统计软件中运行Stan。到目前为止,我一直在从R运行Stan,首先按照快速入门指南中说明安装并运行所有内容。...,它声明了将作为输入传递给Stan标量,向量和矩阵。...估计,与Stan后验平均值相差2位小数,标准误差为0.11,这与Stan后验SD相同。...正如多年前WinBUGS和其他人作者所描述和展示那样,贝叶斯方法在解决不同不确定性来源问题时非常自然,这些不确定性来源超出参数不确定性,例如缺失数据或用误差测量变量。...实际上,对于缺失数据流行多重插补方法在贝叶斯范式内发展,并且实际上可以被视为对完整贝叶斯分析近似。

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