本次展示shiny的功能有: 1、读取本地数据; 2、交互展示数据(view) 3、动态交互作图(自动读取上传数据的列名) 体验网址:https://yanshenli.shinyapps.io.../Desktop/ library(shiny) library(ggplot2) ui <- fluidPage( navbarPage("User Interface:",tabPanel("...x = input$variableNames_x, title = "ggplot") } }) } shinyApp(ui, server) 一个完整的shiny..., 在ui中通过*input调整数值参数、上传数据等,并将数据传递给server进行相应计算; 然后,Server对数据进行计算、绘图,并将计算结果(图片、表格等)返回给ui 最后,通过ui中的*output...来展示server计算返回的结果(图片、表格等)
模仿的是 https://github.com/sk-sahu/sig-bio-shiny 基本功能是用户输入 gene id pvalue qvalue 然后分别把 BP CC MF 以表格输出, 汇总结果下载...(压缩文件) go富集结果的dotplot 代码 代码中 cc和mf结果表格输出的逻辑没有写,和bp是完全一样的 library(shiny) ui<-navbarPage("Pomegranate",...}, contentType = "application/zip" ) }) }) } shinyApp(ui,server) 界面是这样子的...image.png 用于做测试的 id (人) 4312 8318 10874 55143 55388 991 6280 2305 9493 1062 3868 4605 9833 9133 6279
为了达到这个目的,最好的结果是将R中的Shiny App转换为一个独立运行的exe文件,也就是一个这样的桌面应用: image.png 10065741-1d8037cb4acec453.png 对,我实现了...那么一个最为方便且易于实现的思路是这样的: 安装R-Portable作为开发、部署、分发的R环境 在上述环境中开发ShinyApp(推荐使用golem) 通过electron-quick-start将R-Portable.../dev中的三个脚本01_start.R,02_dev.R,03_deploy.R以及./R中的三个脚本app_ui.R,app_server.R,run_app.R。...:mod_csv_file_ui 定义模块UI,mod_csv_file_server 定义模块功能,如果要使用这个模块只需在Shiny App的app_ui中调用前者,app_server中调用后者就可以了.../dev/run_dev.R脚本中测试一下我们的Shiny App: > # Detach all loaded packages and clean your environment > golem:
上面是shiny团队的稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) 的R包 一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素的...,做一些计算然后画成对应柱子数量的直方图 其中renderPlot 包含了大部分脚本,之后会详细解释,目前看不懂也没关系 试试把上面两块拼进一个shiny app的app.R脚本,记住要以library...runApp和其他R中的许多函数(read.csv, read.table)一样,第一个参数的是从工作目录到app的目录的文件路径,以上代码假设my_app文件夹包含在你的工作路径,因此,只需要输入文件夹的名字...当shiny app启动后,R的会话框会变成忙碌状态,不能运行任何其他代码,R会监控app并处理app的反应。...Shift+Enter) 点击灰色的向下展开小箭头还有更多惊喜哦 一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名的路径(文件夹) 保存app.R到myapp文件夹中 使用runApp
HTML 内容 可以通过*Panel 函数添加内容到app,例如,上面的app中展示的文字。...app代码中 网页面板的对应位置就会显示设置的文本,通过逗号分隔,同一个面板能插入多个元素 ui <- fluidPage( titlePanel("My Shiny App"), sidebarLayout...格式化文本 shiny 提供了许多标签函数格式化文本,跑例子是最简单的了解他们的fangfa 试试把下面的代码粘贴到app中的合适位置 ui <- fluidPage( titlePanel("My...shiny 用 img 函数将图片放入app中 src参数用于指定图片的来源,比如,img(src = "my_image.png",这是必要的参数,不然不知道传递哪张图片到app呢 也有其他参数能够定义图片的属性...www的文件夹中,shiny会通过特殊的处理,将这个文件夹中的文件与浏览器共享,www就是存放图片,样式表等东西的大本营,里面的文件用于浏览器构建app的网页部分。
,每个都可以用直白命名的R函数创建,例如函数actionButton 用来创建 动作按钮 (Action Button),函数 sliderInput 创建 一个 滑块 (slider bar) 下表是常见的小部件...一个label:这个标签将和app中的小部件一起出现,应该是字符串,但是也可以是空的"" 此例中,name参数是"action", 标签是 "Action" actionButton("action"...app中 访问这个网站,图库中展示了每个小部件,并演示了每个小部件的值根据你的输入而变化 选择一个小工具,并点击See Code。...图库会跳转到一个描述这个小工具的示例app,只需要复制其中代码到自己的app中即可。...from your R console:"), code('install.packages("shiny")'), br(), br(), br(),
一般的图非常简单,和平常写R代码一样,不过不在.R中写,而是在.Rmd中写,将你的代码写入如下的代码框中,使用Control+Alt+i可以直接插入一个代码框。...创建Shiny交互式应用程序 shiny由RStudio开发,不同于前面的动图,它可以在web浏览器中运行。...一个shiny应用程序基本由两个重要部分组成:一个是Web浏览器交互的HTTP服务器,另一个是HTTP服务器交互的R会话。...下面我们写一个最小的shiny应用程序,写一个R脚本定义它的用户界面和服务器逻辑,用户界面是一个boostrapPage,它包含一个numericInput用于接收一个整数表示样本容量,一个textOutput...服务器背后的逻辑是根据输入input的样本容量n生成随机数,计算随机样本的均值,并将结果放在output中。
告诉shiny如何在server函数构建对象,该对象会在它的代码构建一个小工具的值的时候反应 第一步:加一个R对象到UI shiny提供了一个函数家族,将R对象转换成在UI中的输出,每个函数创建特定类型的输出...接下来,需要告诉shiny如何构建对象 就是在server函数中提供构建对象的R代码 server函数在shiny的处理中扮演一个特别的角色,他会构建一个类似列表(list)的对象,被命名为output...,包含所有用来更新app中R对象的代码,每个R对象在list中要有自己的条目(名字) 在server函数中,可以通过在output定义一个新元素来创建条目,如下,元素名字应该与ui中反应元素使用的参数一致...当用户改变小工具,shiny会使用新的值重建依赖于那个小工具的所有的输出,重建对象达到更新的目的 这就是如何用shiny创建反应,通过连接input列表中的值到output中的对象。...能反应的)app 在server中使用render*函数告诉Shiny如何构筑你的对象 在每个render*函数中,用{}抱住R表达式 将render* 表达式的结果保存到output列表,每个反应对象对应其中的一个条目
作为R脚本分享 任何使用R的人都可运行你的shiny app,他们需要你的app.R的一个副本,还有其他支持材料(比如www文件夹或者帮助脚本) 发送你的文件到另一个用户,email或者github等...托管这个zip文件到网页连接,任何获取这个连接的人都可以从R中启动这app library(shiny) runUrl( "") runGitHub 如果没有自己的网站,免费的代码托管网站...然后将您的app.R文件以及该应用程序使用的所有补充文件存储在存储库中。...但是,Shiny创造了绝佳的机会,可以与没有R(也无意安装它)的人们共享输出。您的Shiny应用恰好是世界上使用最广泛的通信工具之一:网页。...Connect,这是您的团队在R中创建的工作的发布平台。
文件夹中 使用命令runApp("stockVis")启动app StockVis 用R的quantmod包,如果没有应该安装install.packages("quantmod") 一个新的app-stockVis...,反应表达式会返回保存的值,不做任何计算 此举能够被用作防止shiny重新运行不必要的代码 思考如下stockVis app中,反应表达式如何生效 server <- function(input, output...shiny会重建对象,一旦: 对象的render*函数中,input值改变了 对象的render*函数中,反应表达式过期了 将反应表达式作为一条链中的连接,把input值和output对象连了起来。...output中的对象会响应链中任何下游的更改(你可能会塑造一个长链,因为反应表达式可能包含其他反应表达式) 为何仅仅从reactive或者render*调用反应表达式,只有这些R函数能处理反应输出,没有警告的改变...,让用户能切换价格是否适应通货膨胀 helper.R 中的adjust函数使用由圣路易斯联邦储备银行提供的Consumer Price Index 数据,将历史价格转为当前价格,是如何用代码实现呢?
中是不一样的 当shiny运行server中的函数时,会把所有文件路径的起始位置视为server.R所在的路径,换而言之,shiny app会把server.R所在的路径作为工作目录。...app性能,应为app.R中的某些部分会被更频繁的运行。...小小节回顾 当启动app,shinyApp 会运行一次 server函数会在每个用户访问时跑一次 render*函数中的R表达式跑很多次,shiny在用户改变小工具的值时就会运行他们 通过以上信息,思考怎么写出高效的脚本...shiny只会运行这些代码一遍,包含了所有你在server函数中的表达式要调用的东西。 在server函数中定义用户特定的对象,当时不包含在render*函数之中,这种对象是每个用户都需要个人副本的。...每次启动,shiny会运行app.R中的代码,server函数之前的部分只会在这个app启动时运行一次 server之中的代码会运行多次,可能会拖慢app速度 switch是多选项小工具的实用辅助函数
整理自:https://github.com/nanxstats/awesome-shiny-extensions 主题 与众不同的主题让您的 Shiny App 更显逼格。...•shiny.semantic https://github.com/Appsilon/shiny.semantic - 在 Shiny 中使用 Fomantic UI,仅添加几行简单的代码,即可使您的...•texPreview https://github.com/metrumresearchgroup/texPreview - 在 RStudio,R Markdown 和 Shiny 中预览并保存 LaTeX...•excelR https://github.com/Swechhya/excelR - 在 Shiny 中实现类似 Excel 的表格操作,包括添加/删除行列,合并,检索等。 ?...•vembedr https://github.com/ijlyttle/vembedr - 在 Shiny App 中嵌入视频。
我这个月在写一些更加长的文章,所以你们可以在几周后再来看看。本月,我想简要地提下我自己一直在玩的一个很棒的R库。 我的一个亲密朋友最近在用R编写东西。...我一直都对它很感兴趣,也一直在试图挤时间,学习更多关于R的知识以及可用它做的事情。探索R的超强数字处理能力对我而言有些困难,因为我并不如我朋友那样有一个数学头脑。...包括在Shiny中的Bootstrap有了大量样式和主题,所以在学习了一点后,就能用R创建大量功能丰富的web程序。使用附加包可以将功能扩展到更高级的JavaScript程序、模板等。...对于想要发布到网络上的程序,你可以在RStudio的Shiny网站上共享它们,运行开源版本的Shiny服务器,或通过按年订阅服务从RStudio处购买ShinyServerPro。...经验丰富的R大牛可能已经知道Shiny了;它已经存在大约几年了。对于像我这样来自一个完全不同的编程语言,并且希望学习一点R的人来说,它是相当有帮助的。
画图其实不难,先为每种胆汁酸设置对应的颜色(我后续要拼图),然后再作图。这里代码就不 show 了,下面 shiny 的代码也会提到。 改造成 Shiny App 成品展示 这是主界面: ?...把这个小勾勾打上程序就会根据你的类别数据出现相应数量的取色器(示例数据中是 4 类): ? 然后再点击绘图按钮,就会出现自定义分类颜色的第三张图啦: ? 这就是这个网站的主要功能。...下面给大家简单讲讲我的设计思路。 设计思路 网页界面(ui.R) 因为这个网站的主要目的是作图,那么其实不难想到我们大概要分成四个板块,分别完成上传,预览数据,设置作图参数和绘图的功能。 ?...,包括: •X 轴字体大小•Y 轴名称•Y 轴字体大小•第二张图的配色方案,这里用了 RColorBrewer 中的 qual 色板•输出图片的长宽•第三张图的自定义配色方案(使用了 uiOutput(...uiOutput("ui"),uiOutput("textanno") ui.R library(shiny)library(RColorBrewer)library(reshape2)library(
在计算机视觉中,滤波(filtering)是指 Image filtering: compute function of local neighborhood at each position. —...Padding 滤波操作不可避免的一个问题是边界如何处理,当滤波器的中心压在图像边界处时,滤波器会有一部分落在图像外,但图像外并没有像素,该如何处理?...椒盐噪声会随机地将像素置为黑或白,在实践中,会大幅改变像素值的噪声一般采用中值滤波都是有效的。 非椒盐噪声,均值为0的随机噪声(高斯噪声),可通过moving average滤波。...滤波的加速可以考虑:滤波器是否行列可分离、缓存不必要的重复计算、近似计算、SIMD等。 差分算子对噪声敏感,所以差分前通常要先平滑。...比如,模板匹配中的模板为filter,相似度函数为滤波的计算方法;稀疏表示中字典的每一列都是filter,像gabor小波字典,通过相关运算计算与每个filter的相似程度,从而知道每个图像局部“长什么样子
数据可视化仪表盘是将数据直观呈现并提供交互性的强大工具。R语言与Shiny框架的结合,使得创建交互式数据可视化仪表盘变得轻松而灵活。...在这篇博客中,我们将深入介绍如何使用R和Shiny创建一个简单而实用的数据可视化仪表盘。步骤1:安装和加载必要的包首先,确保你已经安装了以下R包:shiny、ggplot2、dplyr。...(shiny)library(ggplot2)library(dplyr)步骤2:创建Shiny应用创建一个新的R脚本(例如,app.R),用于编写Shiny应用。...应用在R中运行Shiny应用:RCopy codeshinyApp(ui, server)这将启动Shiny应用,你可以在浏览器中访问http://127.0.0.1:XXXX(XXXX为端口号),查看创建的数据可视化仪表盘...随着你的深入学习,你可以探索更多的Shiny功能和图形库,创造出更加复杂和功能丰富的仪表盘。祝你在数据可视化的旅程中取得成功!我正在参与2023腾讯技术创作特训营第四期有奖征文,快来和我瓜分大奖!
CIC滤波器有三个参数: R:抽取倍数 M:差分延迟,在工程中一般取1或者2 N:滤波器级数,一级CIC的阻带有13.46dB的衰减,N级就是有13.46*N dB的衰减。...若R=8,M=1,N=5,那么CIC滤波器的频响如下所示: ? Matlab中CIC滤波器的使用 在Matlab中,有两个函数可以生成CIC滤波器。...下面代码中hcic即为构造的CIC滤波器,抽取倍数为4,差分延时为1;cic_comp为CIC补偿滤波器;其中Ap表示通带衰减,Astp表示阻带衰减。...(至于为什么要分成不同的帧本人也不是很清楚,只是按照Mathworks提供的例程来完成) 下面的例子中,我们要完成的是对输入的1024点的信号进行抽4的CIC滤波,在dsp.SignalSource...中我们指定一帧为64个点,因此总共有1024/64=16帧,在抽4之后,每帧的长度就是64/4=16;所以定义的y是一个16x16的矩阵,其中每一行为一帧的滤波结果,将16行拼接起来,就是输出的1024
滤波是一种消除 PLC 中接收信号中不需要的尖峰的方法。它的作用是消除波动,只在特定时间将适当的信号变化传递给 PLC。...3.2 软件滤波 软件滤波则是在 PLC 程序中通过算法对数字量信号进行处理,过滤由时间因子定义。假设您设置的滤波时间为 3 秒。筛选器的作用是仅接受高于 3 秒的输入变化。...4.2 解决方案 工程师针对该问题采用了软件滤波的方法,在 PLC 程序中增加了时间滤波方案。...5 结论 在处理 PLC 中的数字量信号时,滤波是确保系统稳定运行的关键步骤。工程师可以根据实际情况选择合适的滤波方法,并结合硬件和软件手段来提高系统的抗干扰能力,确保数字量信号的稳定性和可靠性。...通过本文的介绍和案例分析,相信读者对在 PLC 中滤波数字量信号有了更深入的理解,并能在实际工程应用中更加灵活地运用滤波技术来解决相关问题。
R中的因子用于存储不同类别的数据,可以用来对数据进行分组,例如人的性别有男和女两个类别,根据年龄可以将人分为未成年人和成年人,考试成绩可以分为优,良,中,差。...R 语言创建因子使用 factor() 函数,向量作为输入参数。...levels:指定各水平值, 不指定时由x的不同值来求得。 labels:水平的标签, 不指定时用各水平值的对应字符串。 exclude:排除的字符。 ordered:逻辑值,用于指定水平是否有序。...这个顺序也是有讲究的,一般是按字母顺序来排列。我们也可以按照自己的需要来排列因子的顺序。...关于这个参数后面我们还会给大家举个更实际的,跟临床数据相关的例子。 R中的因子使用还是更广泛的,例如做差异表达分析的时候我们可以根据因子将数据分成两组。
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