R语言中，当我们获取到了基因表达的count矩阵，怎么下载对应的基因长度并将count矩阵转换为FPKM矩阵 **********************************************...count矩阵：适用于差异基因表达分析 FPKM矩阵：适用于绘制heatmap ********************************************** 1....处理后的结果 得到的结果，其中gene_id如需要，可以根据gtf文件，改成gene_symbol gene_id len gene_symbol ENSG00000000003 4535 TSPAN6...读取count矩阵，每行一个基因，每列一个样本，行名为基因，列名为样本，基因不能作为第一列 示例为生成一个count矩阵： # 创建基因表达数据框 gene_names <- c("TSPAN6", "...计算FPKM # Step 1: 从gene_length的字典中，选择与count_matrix行名对应的基因长度 select_gene_length <- gene_length[gene_length
值 规则 ID CA1069 类别 设计 修复是中断修复还是非中断修复 重大 原因 枚举具有多个成员，这些成员显式分配有相同常数值。...规则说明 每个枚举成员都应具有唯一的常数值，或者为其显式分配枚举中的前一个成员以指示共享值的明确意图。...bug： 意外键入错误：用户意外地为多个成员键入了相同的常数值。...复制粘贴错误：用户复制了一个现有成员定义，然后重命名了该成员，但忘记更改值。 合并多个分支中的解决方案：在不同分支中添加了具有不同名称但有相同值的新成员。...如何解决冲突 若要解决冲突，请分配新的唯一常数值，或分配枚举中的前一个成员以指示共享同一值的明确意图。
1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...<- unique(data) 重复值处理函数：unique，用于清洗数据中的重复值。...2、R中缺失值的处理 缺失值的产生 ①有些信息暂时无法获取 ②有些信息被遗漏或者错误处理了 缺失值的处理方式 ①数据补齐（例如用平均值填充） ②删除对应缺失值（如果数据量少的时候慎用） ③不处理 na.omit...<- na.omit(data) 3、R中空格值的处理 trim函数的作用：用于清除字符型数据前后的空格。...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
在这篇文章里，会先介绍 count() 实现的原理及原因，然后是 count 不同用法的性能分析，最后给出需要频繁改变并需要统计表行数的解决方案。...由于 MVCC 的控制，使得 MySQL 具有并发的能力，也就是说对于同一时刻，InnoDB 返回的表的行数是不一定的，事务看到的行数与开启后的一致性视图有关，换句话说，每个事务能看到的数据版本是不一样的...其实 InnoDB 在进行 count(*) 操作时，还是做了优化的，在进行 count(*) 操作时，由于普通索引会保存主键的 id 值，所以会找到最小的那颗普通索引树进行查找，而不是去遍历主键索引树...另外在使用 show table status 时，也可以查询出行数，而且速度很快，但需要注意的是，该命令是通过索引统计的值来采样估算的。官方文档说误差可以有 40%-50%....所以对于 count(1) 的执行会比 count(*) 要快，少了解析数据行以及拷贝字段值的操作。
引擎把一个表的总行数存在了磁盘上，因此执行count(*)的时候直接返回个数,效率很高 而innoDB引擎就麻烦了，他的执行count(*)的时候，是一行行的累加计数 当然我们要知道此事的说的是没有带条件的...，由于redis不能永久的存储在内存中，因此我们可能会想到持久化存储起来，即使这样，万一redis异常重启了，有可能会发生数据丢失，比如数据插入一行数据，redis记录值加1,此时还没有持久化，此时redis...索引count(*),count(1),count(id),都表示返回满足条件的结果集的总行数，而count(字段)则表示满足条件的数据行里面，参数字段不为null的总个数 count(主键id) innodb...会遍历整张表，把每一行的id值都出来，返回给server层，server层拿到id后，判断是不可能为空的，就按行累加 count(1) innodb会遍历整张表，但不取值,server层对于返回每一行...，放一个数字1进去，判断是不可能为空的，按行累加 count(1)的性能要高于count(id)，是由于count(id)返回id会涉及到解析数据行，以及拷贝字段值的操作 count(字段) 如果这个字段是定义为
首先，准备测试数据，11g库表bisal的id1列是主键(确保id1列为非空)，id2列包含空值， ?...前三个均为表数据总量，第四个SQL结果是99999，仅包含非空记录数据量，说明若使用count(允许空值的列)，则统计的是非空记录的总数，空值记录不会统计，这可能和业务上的用意不同。...其实这无论id2是否包含空值，使用count(id2)均会使用全表扫描，因此即使语义上使用count(id2)和前三个SQL一致，这种执行计划的效率也是最低的，这张测试表的字段设置和数据量不很夸张，因此不很明显...总结： 11g下，通过实验结论，说明了count()、count(1)和count(主键索引字段)其实都是执行的count()，而且会选择索引的FFS扫描方式，count(包含空值的列)这种方式一方面会使用全表扫描...，另一方面不会统计空值，因此有可能和业务上的需求就会有冲突，因此使用count统计总量的时候，要根据实际业务需求，来选择合适的方法，避免语义不同。
前言 在[[15-R编程01-基本数据类型及其操作之向量]] 中，我就已经简单的提过，可以通过unique 或duplicated 非常暴力的实现去重。 那么我们可不可以有更好的策略呢？...比我测量的数据中的a 对应了多个连续值，我可不可对这些连续值进行一定的处理呢？ 当然可以。...对重复数据取均值或中位数 太懒了，这里就不造假数据了： > head(gistics_final_1) fdr G_Score Cytoband Unique_Name 1: 14.838026...，按照Unique_Name 中的内容分组，对其对应的fdr 与G_Score 连续数据取中位数。...：[[35-R数据整理07-使用tidyr和dplyr处理数据框2]] 将重复名称进行顺序标记 比如给重复的这三个名称加上1:n,n 是重复的次数： 思路如下： 将表格元素按照是否重复拆分； 将重复元素的表格
}else{ mapnew2.put(k,v); } }); System.out.println("不重复的值...："+mapnew); System.out.println("重复的值："+mapnew2);
来源：blog.csdn.net/LJFPHP/article/details/84400400 一、前言 这个问题是今天朋友提出来的，关于查询一个1200w的数据表的总行数，用count(*)的速度一直提不上去...找了很多优化方案，最后另辟蹊径，选择了用explain来获取总行数。 二、关于count的优化 网上关于count()优化的有很多。...博主这边的思路就是没索引的就建立索引关系，然后使用count(1)或者count()来提升速度。这两个函数默认使用的是数据表中最短的那个索引字段。...我们使用explain之后，会看到返回很多参数，其中： rows：显示MySQL认为它执行查询时必须检查的行数。就是这个东西了，既然我们要获取的是数据表的行数，那么可以使用： ?...2、关于返回值 以前博主也没注意过返回值的问题，都是直接通过phpmyadmin来查看sql的执行效率。这次因为要用到rows的值，所以就打印了一下，原来这个explain函数是会返回一个数组。
div class="antzone"> 点击按钮可以隐藏class属性值为..."antzone"的元素。
如果需要把一台MySQL中的数据定期归档到另外一台MySQL历史库中，那么很可能会发现会有重复值的问题，导致数据导入会失败，而这个问题其实是和自增列的重复值有关，我们来简单看看。...int, primary key (id)) engine=innodb; Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)然后插入3条数据，第一条指定id为1，后面两条id值自增...这个时候使用show create table查看，定义信息中自增列的值为4，即再插入一条记录，id值为4....，它是根据max(id)+1的方式来计算的。...导出数据 mysqldump test t1 > t1.sql 导出的sql文本如下，可以看到里面是指定id值的方式，而非空。 LOCK TABLES `t1` WRITE; /*!
重复，特别是针对一些样本名称的重复问题的处理，是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处，然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢？...一个简单的例子 生成一个非常简单的带重复的序列： r$> data = c("a", "b", "c", "d", "a")...保留唯一值 r$> unique(data)...解决的思路是对重复ID添加标记，可以是前缀或者后缀，这样既能视觉上识别，也能够通过编程的手段识别或者后续对前后缀裁剪。后缀才容易操作，更为推荐。...如果我们仅想要标记出第二次及以后出现的ID，这样能保留大部分的数据不做改动，怎么操作呢？ R自带了make.unique()解决这个问题！
查找重复值、移除重复值，都是Excel中的经典问题，可以使用高级筛选功能，也可以使用复杂的公式，还可以使用VBA。...在VBA中，也有多种方式可以移除重复值，这里介绍RemoveDuplicates方法，一个简洁实用的方法。 示例数据如下图1所示，要求移除数据区域A1:D7中第3列（列C）中的重复值。...= ActiveSheet.Range("A" &Rows.Count).End(xlUp).Row Set rngRange = ActiveSheet.Range("A1:D" & lngLastRow...其中，参数Columns是必需的，指定想要移除重复值的列。注意，可以指定多列。...如果想要指定多个列，使用Array函数： Range("A1:E15").RemoveDuplicates Columns:=Array(3, 5), Header:=xlYes 此时，如果这两列中的值组合是重复的
方法1 生成的值为从 0 开始，每次增加 1。实现如下： function getUniqId(){ getUniqId._id = '_id' in getUniqId ?..._id; } 方法2 生成的值为现在至格林威治时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒(北京时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒)的总毫秒数。...实现如下： function now(){ return (Date.now && Date.now()) || new Date().getTime(); } 方法3 生成的值为 GUID(全局唯一标识符...全局唯一标识符（GUID，Globally Unique Identifier）是一种由算法生成的二进制长度为128位的数字标识符。GUID主要用于在拥有多个节点、多台计算机的网络或系统中。...在理想情况下，任何计算机和计算机集群都不会生成两个相同的GUID。GUID 的总数达到了2128（3.4×1038）个，所以随机生成两个相同GUID的可能性非常小，但并不为0。
在ABAP里我们如果想用代码获得一个数据库表里有多少条记录，常规做法是使用SELECT COUNT。 [1240] 如果您使用的是HANA数据库，现在有一种新的办法可以达到同样的目的。...HANA数据库里有一张名为m_tables的系统视图，里面存放了数据库表的元数据。 [1240] 这个系统视图的详细说明参考SAP帮助文档。...[1240] 我写了一个工具，可以通过查询m_tables来批量获得一系列数据库表的记录条数和占据的存储空间。 [1240] 您可以通过这个链接获得我的工具的源代码。...要获取更多Jerry的原创技术文章，请关注公众号"汪子熙"或者扫描下面二维码: [1240] [1240]
state变量将被类型化为一个具有动态属性和值的对象。...，当我们不清楚一个类型的所有属性名称和值的时候，就可以使用索引签名。...示例中的索引签名意味着，当一个对象的索引是string时，将返回类型为any的值。 当你事先不知道对象的所有属性时，你可以使用这种方法。 你可以尝试用一个索引签名来覆盖一个特定属性的类型。...可选属性既可以拥有undefined值，也可以拥有指定的类型。这就是为什么我们仍然能够将state对象初始化为空对象。...你可以重复上述过程，根据实际情况来包括尽可能多的类型。
bobbyhadz.com/blog/react-optional-props-typescript[1] 作者：Borislav Hadzhiev[2] 正文从这开始~ 总览 在React TypeScript中设置具有默认值的可选...这意味着不管有没有提供这两个属性，组件都是可使用的。 如果可选prop的值没有指定，会默认设置为undefined。没有为prop指定值，和设置值为undefined的效果是相同的。...我们还在Employee组件的定义中为name和age参数设置了默认值。...属性的默认值为Alice，所以如果不提供name prop，它将被赋值为Alice。...我们为Employee组件的所有props设置了默认值，所以如果有任何props被省略了，就会使用默认值。
在ABAP里我们如果想用代码获得一个数据库表里有多少条记录，常规做法是使用SELECT COUNT。 ? 如果您使用的是HANA数据库，现在有一种新的办法可以达到同样的目的。...HANA数据库里有一张名为m_tables的系统视图，里面存放了数据库表的元数据。 ? 这个系统视图的详细说明参考SAP帮助文档。 ?...我写了一个工具，可以通过查询m_tables来批量获得一系列数据库表的记录条数和占据的存储空间。 ?
本次学习主要探讨3个问题： 开始探索缺失值 探索缺失值的机制 模型化缺失值 如何开始探索缺失值 当你面对新的数据时，可能首先会使用各种汇总函数查看数据的基本情况，比如： summary() str()...这幅图会直接把缺失值删掉，并不能知道缺失值的情况。...既然是ggplot2一样的tidy系列，那也肯定是支持其他特性的，比如分面： ggplot(airquality, aes(x = Solar.R, y = Ozone...以下结果说明：有111行没有缺失值，占数据的72%，有40行只有1个缺失值，占数据的26%，有2行含2个缺失值，只占1%。...模型化缺失值 对缺失值建立模型！如果不学习这个R包，我是真的想不到还可以这样搞缺失值！
functools.lru_cache() 把重复计算的值缓存，对于经常调用的某个函数添加该装饰器 递归类的可以使用 import time import functools def clock...arg_lst = [] if args: arg_lst.append(', '.join(repr(arg) for arg in args)) if kwargs: pairs = ['%s=%r'...kwargs.items())] arg_lst.append(', '.join(pairs)) arg_str = ', '.join(arg_lst) print('[%0.8fs] %s(%s) -> %r
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