我的思路是 先把5份数据的基因名取交集 用基因名给每份数据做行名 根据取交集的结果来提取数据 最后合并数据集 那期内容有人留言了简便方法，很短的代码就实现了这个目的。...我将代码记录在这篇推文里 因为5份数据集以csv格式存储，首先就是获得存储路径下所有的csv格式文件的文件名，用到的命令是 files<-dir(path = "example_data/merge_data...TRUE，则返回文件<em>的</em>完整路径，如果设置<em>的</em>为FALSE则只返回文件名。...相对路径和绝对路径是很重要<em>的</em>概念，这个一定要搞明白 pattern参数指定文件<em>的</em>后缀名 接下来批量将5份数据读入 需要借助tidyverse这个包，用到<em>的</em>是map()函数 library(tidyverse...之前和一位同学讨论<em>的</em>时候他也提到了tidyverse整理数据，但是自己平时用到<em>的</em>数据格式还算整齐，基本上用数据框<em>的</em>一些基本操作就可以达到目的了。
代码 import re text = "今天我玩了英雄联盟的很多英雄，比如“德玛西亚”、“德玛西亚皇子”、“德邦总管”等等，我玩了穿越火线的许多枪，比如“巴雷特”、“马来剑”等等。"...pattern = r"比如[\“]([\u4e00-\u9fa5])+[\”](、[\“]([\u4e00-\u9fa5])+[\”])*" res = re.finditer(pattern, text
Q：多个数据集，列数不一致，列名也不一致，如何按行合并，然后保留全部文件的变量并集呢？ A：使用 rbind.fill 函数试试！...数据集按列合并时，可以根据merge 或者 dplyr函数包的merge系列函数决定连接方式，达到数据合并的需求。...data1，data2，data3 列数不一致，列名也不一致，现在需要按行合并，可能的问题： 1）rbind： 是根据行进行合并（行叠加）但是要求rbind(a, c)中矩阵a、c的列数必需相等。...2）列数相同的时候，变量名不一致也会合并，导致出错 二 rbind.fill“智能”合并 列数不一致多个数据集，需要按行合并，尝试使用plyr包rbind.fill函数 library(plyr) rbind.fill...呐，就是这样，rbind.fill函数会自动对应数据列名，不存在的会补充列，缺失时NA填充。
TCR是由两条不同肽链构成的异二聚体，由α、β两条肽链组成，每条肽链又可分为可变区（V区），恒定区（C区），跨膜区和胞质区等几部分；其特点是胞质区很短。...序列 注：tcR所有字符串都属于“character”类，而不是“factor”类。...举例：得到“Read.count”<= 100的 reads总和占总的reads的比例 tailbound.proportion(twb, 100) 3....该函数输入参数是数据框或数据列表，目标（是有一列是序列和其他附加列的向量或数据框），一列或多列的返回值，比较两个序列(精确匹配用“exact”；用Hamming距离匹配序列用“hamm”(即当H≤1时2...（exact, hamming or levenshtein）来进行搜索匹配或未匹配V-segment（V基因体片段是免疫球蛋白或T细胞受体基因中的一种DNA序列，因胚系基因组中有多个不同的V基因体片段而呈现变异性
# 返回字符串s中从p开始的后缀部分 substr(s,p,n) # 返回字符串s中从p开始长度为n的后缀部分 } awk判断{...,END块里面处理数组内容 awk '{sum2+=$2;count=count+1}END{print sum2,sum2/count}' # $2的总和 $2总和除个数...4 求第二列的和 5 求第二列的平均值 6 求第二列中的最大值 7 将第一列过滤重复后，列出每一项，每一项的出现次数，每一项的大小总和...7、将第一列过滤重复列出每一项，每一项的出现次数，每一项的大小总和 awk '{a[$1]++;b[$1]+=$2}END{for(i in a){print i,a[i...9][0-9]结尾的行后加5 sed -n ' /^eth\|em[01][^:]/{n;p;}' # 匹配多个关键字 sed -n -r ' /eth
2021-11-24：把一个01字符串切成多个部分，要求每一部分的0和1比例一样，同时要求尽可能多的划分， 比如 : 01010101， 01 01 01 01 这是一种切法，0和1比例为 1 : 1，...0101 0101 也是一种切法，0和1比例为 1 : 1， 两种切法都符合要求，但是那么尽可能多的划分为第一种切法，部分数为4， 比如 : 00001111， 只有一种切法就是00001111整体作为一块...，那么尽可能多的划分，部分数为1， 给定一个01字符串str，假设长度为N，要求返回一个长度为N的数组ans， 其中ansi = str0...i这个前缀串，要求每一部分的0和1比例一样，同时要求尽可能多的划分下...，部分数是多少？...struct { a int b int } func NewR(a int, b int) r { res := r{} g := gcd(a, b) res.a
如何使用本指南： 本指南采用备忘单格式，包含自包含的命令行代码段 跳转到与您要完成的任务相关的任何部分 当您在本指南的命令中看到highlighted text时，请记住，此文本应引用您自己的数据库中的列...LIKE 测试值是否与指定的字符串匹配 IS NULL 测试NULL值 IS NOT NULL 测试除以外的所有值 NULL 使用通配符 SQL允许使用通配符。...COUNT函数用于查找给定列中的条目数。...COUNT(column) FROM table WHERE column=value; 查找列中的平均值 AVG函数用于查找特定列中保留的值的平均值（在本例中为平均值）。...请注意，AVG函数仅适用于包含数值的列; 当在包含字符串值的列上使用时，它可能会返回错误或0： SELECT AVG(column) FROM table; 查找列中的值的总和 SUM函数用于查找列中保存的所有数值的总和
搜索包含关键词"error"的日志文件 grep "error" /var/log/syslog 搜索一个目录中所有文件中包含特定字符串的行。...grep -r "pattern" /path/to/directory 搜索并输出匹配的行号。 grep -n "pattern" file.txt 搜索并输出不匹配的行。...sed -n '5p' file.txt 执行多个编辑操作。...awk '{print $2}' file.txt 计算列的总和。 awk '{sum+=$3} END {print sum}' file.txt 使用自定义分隔符。...然后，它逐行解析日志文件，使用IP地址（在这种情况下，位于每行的第三个字段）作为数组的键，递增相应IP地址的访问次数。 最后，在END部分，awk遍历数组并打印出每个IP地址及其对应的访问次数。
action{}能够有多个语句，以”;”号隔开。 2. [-F域分隔符]是可选的。 filenames是待处理的文件。在awk中，文件的每一行中，由域分隔符分开的每一项称为一个域。...awk ‘{NR > n}’ filename 4.awk内置字符串函数 gsub(r,s) 在整个$0中用s替代r gsub(r,s,t) 在整个t中用s替代r index...(s,t) 返回s中字符串t的第一位置 length(s) 返回s长度 match(s,r) 測试s是否包括匹配r的字符串 split(str,array,fs ) 在...s中从p開始的后缀部分 substr(s,p,n) 返回字符串s中从p開始长度为n的后缀部分 5.BEGIN和END BEGIN表示在处理随意行之前进行的操作...awk中的数组用来从记录中收集信息，能够用于计算总和、统计单词以及跟踪模板被匹配的次数等等。
-B --before-context= # 除了显示符合样式的那一行之外，并显示该行之前的内容。 -c --count # 计算符合范本样式的列数。...-w --word-regexp # 只显示全字符合的列。 -x --line-regexp # 只显示全列符合的列。 -y # 此参数效果跟“-i”相同。 -o # 只输出文件中匹配到的部分。...-m --max-count= # 找到num行结果后停止查找，用来限制匹配行数 规则表达式 ^ # 锚定行的开始 如：'^grep'匹配所有以grep开头的行。...[^] # 匹配一个不在指定范围内的字符，如：'[^A-FH-Z]rep'匹配不包含A-R和T-Z的一个字母开头，紧跟rep的行。...统计文件或者文本中包含匹配字符串的行数 -c 选项： grep -c "text" file_name 搜索命令行历史记录中 输入过 git 命令的记录： history | grep git 输出包含匹配字符串的行数
相当于SQL分组语法group by column_name中的column_name部分。如果根据某字段的值分组，则定义为_id:’$字段名’。...$sum：如果取值为1表示总条数，相当于每个document中都多个count属性，count取值为1，累加和就是总条数。...age是属性名，前面必须有 db.c1.aggregate([{$group:{_id:null,totalAge:{$sum:"$age"}}}]); 分组后取总和 _id取值也是字符串类型，里面必须是属性名前面加上...先查询出age大于等于5的文档对象，在按照name属性进行分组，计算age列总和 db.c1.aggregate([{$match:{age:{$gte:5}}},{$group:{_id:"$name...数组字段拆分 - $unwind $unwind会把数组列进行拆分，原来的document会根据数组属性值个数分为多个document。
相当于SQL分组语法group by column_name中的column_name部分。如果根据某字段的值分组，则定义为_id:’$字段名’。...$sum：如果取值为1表示总条数，相当于每个document中都多个count属性，count取值为1，累加和就是总条数。...age是属性名，前面必须有 db.c1.aggregate([{$group:{_id:null,totalAge:{$sum:"$age"}}}]); 分组后取总和 _id取值也是字符串类型，里面必须是属性名前面加上...先查询出age大于等于5的文档对象，在按照name属性进行分组，计算age列总和 db.c1.aggregate([{$match:{age:{$gte:5}}},{$group:{_id:"$name...,allAge:{$push:"$age"}}}]) 运行结果 数组字段拆分 - $unwind $unwind会把数组列进行拆分，原来的document会根据数组属性值个数分为多个document
数据库基础 数据库 保存有组织的数据的容器，通常是一个文件或者一组文件 表 结构化的文件，用来存储某种特定的数据 列和数据类型 列指的是表中的字段。所有的表都是有一个或者多个列组成的。...通配符通常是用来匹配一部分的特殊字符，只能用于文本字段，非文本数据不能使用通配符搜索。...百分号% 匹配的是0个、1个或者多个字符 select prod_id, prod_name from products where prod_name like 'Fish%'; -- 实现右、左、...功能 avg() 平均值；忽略列值为NULL的行 count() 行数；count(*)：统计所有的行数，包含列是NULL的行count(column)：特定的列进行统计，忽略NULL值 max() 最大值忽略列值为...： 对所有行执行计算，指定all或者不指定参数，因为是默认ALL 只包含不同的列值，指定DISTINCT参数 DISTINCT参数不能用于count(*)，只能用于count(column)指定特定字段
聚合函数： SQL提供了下列聚合函数： COUNT(*) 计算元组的个数 COUNT() 对一列中的值计算个数 SUM() 求某一列值的总和（此列的值必须是数值型） AVG()...列和基本表的改名操作： 使用AS可以给列和基本表进行改名。有时一个基本表在多个SELECT中出现或用户要求输出的列名和基本表中的不一致，就可以给基本表或列改名。...字符串匹配操作： 字符串匹配操作符是“LIKE", 在表达式中可以使用两个通配符： 百分号：与零个或多个字符组成的字符串匹配； 下划线：与单个字符匹配。...//匹配S中以字母D打头的学生姓名SELECT SNAME FORM S WHERE SNAME LIKE'D%'; 为了使字符串中包含特殊字符（%和_），SQL允许定义转义字符。...LIKE 'ab\%cd%' ESCAPE'\' //匹配所有以ab%cd开头的字符串 SQL还允许在字符上使用多种函数，例如连接（”||“），提取子串，计算字符串长度，大小写转换等操作。
合并字符串，参数可有多个，用逗号隔开 （3）INSERT() 替换字符串，从某个位置开始，替换某个长度，如果起始位置超过字符串长度，则返回源字符串，如： INSERT(‘我爱课工场’,1,3,‘很爱’)...) 获取当前日期和时间 （3）YEAR(NOW())、MONTH(NOW())、DAY(NOW())、HOUR(NOW())、MINUTE(NOW())、SECOND(NOW())、分别获取当前日期中的某个部分...4、系统信息函数 常用的有： （1）VERSION() 显示版本信息 （2）USER() 菜单用户信息 5、统计函数（聚合函数） 函数名称 描述 COUNT() 返回满足SELECT条件的记录总和数，...如 SELECT COUNT( * )，不建议使用 *，效率低， （）中也可以使用1，或者列名 COUNT()为非空值计数，不会计算空值 SUM() 返回数字字段或表达式列作统计，返回一列的总和 （）中通常加列名...AVG() 通常为数值字段或表达式列作统计，返回一列的平均值 （）中通常为列名 MAX() 可以为数值字段、字符字段或表达式列作统计，返回最大的值 MIN() 可以为数值字段、字符字段或表达式列作统计
sub 匹配记录中最大、最靠左边的子字符串的正则表达式，并用替换字符串替换这些字符串。...替换只发生在第一次匹配的 时候 gsub 整个文档中进行匹配 index 返回子字符串第一次被匹配的位置，偏移量从位置1开始 substr 返回从位置1开始的子字符串...的功能可以记住正则表达式的一部分，其中，\1为第一个记住的模式即第一个小括号中的匹配内容，\2第二记住的模式，即第二个小括号中的匹配内容，sed最多可以记住9个。...例：echo I am oldboy teacher.如果想保留这一行的单词oldboy，删除剩下的部分，使用圆括号标记想保留的部分。 echo I am oldboy teacher....*合起来就是匹配任意多个字符，本题来说就是匹配oldboy字符串，由于oldboy字符串是需要保留的,因此用括号括起来匹配，后面通过\1来取oldboy字符串。 □tea.
2021-07-02：正则表达式匹配。给定一个字符串s和一个匹配串p。"."匹配单个字符。"*"匹配左边元素的多个字符。判断p是否匹配s。比如s="ab",p="a."，返回true。...比如s="moonfdd",p="k*moonfdd"，返回true,因为"*"表示零个或者多个，这里'k'表示0个。 福大大 答案2021-07-02： 为了更好的处理边界问题。s和p都追加"1"。...匹配的时候。 si指针右移1位，pi指针右移0位。匹配的时候。 si指针右移0位，pi指针右移2位。匹配的时候和不匹配的时候。 2.动态规划。时间复杂度是O(MN)，空间复杂度是O(MN)。
字符串函数 函数名称 作用 LENGTH 计算字符串长度函数，返回字符串的字节长度 CONCAT 合并字符串函数，返回结果为连接参数产生的字符串，参数可以使一个或多个 INSERT 替换字符串函数 LOWER...比较两个表达式的顺序 REGEXP 字符串是否匹配正则表达式 LOCATE 返回第一次出现子串的位置 INSTR 返回第一次出现子串的位置 日期时间函数 函数名称 作用 CURDATE 和 CURRENT_DATE...DATE 获取指定日期时间的日期部分 TIME 获取指定日期时间的时间部分 MONTH 获取指定日期中的月份 MONTHNAME 获取指定日期中的月份英文名称 DAYNAME 获取指定曰期对应的星期几的英文名称...，可以看看这篇博客：https://www.cnblogs.com/poloyy/p/12868773.html 函数名称 作用 MAX 查询指定列的最大值 MIN 查询指定列的最小值 COUNT 统计查询结果的行数...SUM 求和，返回指定列的总和 AVG 求平均值，返回指定列数据的平均值 流程控制函数 函数名称 作用 IF 判断，流程控制 IFNULL 判断是否为空 CASE 搜索语句
1.3 常见聚合函数 常见的聚合函数包括： COUNT：计算行数。 SUM：计算数值列的总和。 AVG：计算数值列的平均值。 MIN：找出数值列的最小值。 MAX：找出数值列的最大值。...SEPARATOR： 可选参数，用于指定合并结果中值之间的分隔符，默认为逗号。 注意事项 GROUP_CONCAT 通常用于合并文本数据，适用于需要将组内多个值合并为一个字符串的情况。...4.2 CONCAT_WS CONCAT_WS 是一种字符串函数，用于将多个字符串连接在一起，并使用指定的分隔符分隔它们。...str1, str2, …, strN： 要连接的字符串。 注意事项 CONCAT_WS 中的第一个参数是分隔符，之后是要连接的字符串，可以是列、常量或表达式。...CONCAT_WS 函数是 SQL 中一个方便的工具，特别适用于需要将多个字符串连接在一起并使用指定分隔符进行分隔的场景。通过灵活使用分隔符，可以生成符合特定格式要求的字符串。
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