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R语言可视化——ggplot图表配色技巧

今天跟大家分享ggplot图表的配色原理与基本技巧。 图表配色是一个很深奥的话题,多亏了R语言平台的众多开发者贡献的配色包,让图表的配色不再深不可测。...这里我暂且将所有的配色场景划分为两类: 离散变量配色与连续变量配色 ggplot函数的配色机制相对来说比较智能,当你给colour或者fill属性指定给变量映射的时候,该函数就会自动的区分变量属性...该配色系统方案给予我们三种关于分类变量的配色场景: 同色系方案,即在同一个色系中均匀取出若干个色段,用于分类变量填充,最终呈现的效果,看起来非常清爽,图中最上面的一排颜色均为此类。...以上色卡以及配色包是由一个著名的专做地图可视化配色方案的团队所开发的,网址如下,提供在线配色并免费下载服务。...=depth))+geom_point()+scale_colour_gradient2(low="#8E0F2E", mid="#BFBEBE", high="#0E4E75") 以上就是R中最常用到的配色技巧

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R语言ggplot2作图好玩的配色包~宫崎骏动画配色

R包的github主页 https://github.com/ewenme/ghibli R包的名字是ghibli,查了下这个单词是吉普力工作室的意思,吉普力工作室和宫崎骏之间的关系我不是铁杆粉,我也搞不明白...github主页提到了颜色参考了这个链接 https://moviesincolor.com/,这个链接里还有一些其他动画电影的配色 这个配色包里涉及到8部动画的配色 image.png Marnie...baike.baidu.com/item/%E5%90%89%E5%8D%9C%E5%8A%9B%E5%B7%A5%E4%BD%9C%E5%AE%A4/7389798 接下来是介绍代码 首先需要安装这个R包...df1<-data.frame(x=letters[1:7], y=5) library(ggplot2) ggplot(data=df1,aes(x=x,y=y,fill...", direction = -1) -> p4 library(patchwork) p3+p4 image.png 应该仔细研究下这个R包的代码,看看能不能搞一个火影忍者的配色

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R语言ggplot2作图配色相关R包备选

R语言ggplot2作图的时候配色如果不知道如何选择,可以参考如下链接https://r-charts.com/color-palettes/ image.png image.png image.png...这里分别提供了连续型数据和离散型数据的配色,应该能够满足我们日常的科研作图需求了。...colorBlindness,提供了一些色盲患者也能够分辨的安全配色 通过函数help(package="colorBlindness")查看帮助文档,发现还有好多提供色盲患者也能识别的配色R包 image.png...推文开头提到的链接中的颜色如果在ggplot2作图的时候想要使用的话需要安装R包paletteer,需要用到的函数是scale_color_paletteer_d()或者scale_fill_paletteer_c...() 以下用一个热图做示例 参考链接 https://www.r-graph-gallery.com/79-levelplot-with-ggplot2.html library(ggplot2)

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R语言】热图绘制-heatmap+gplots配色方案

前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制热图 ☞【R语言】热图绘制-heatmap函数 ☞R语言中的颜色(一)-自带的调色板 今天我们接着来聊heatmap这个函数绘制热图...,这次我们使用gplots这个R包里面的配色方案R语言中的颜色(二)-gplots包 首先我们还是先读取需要的数据,这里用到的数据跟【R语言】热图绘制-heatmap函数用到的数据是一样的 #读取所有...,因为需要用到里面的配色方案 #如果没有安装gplots这个包,需要先去掉下一行中的#,再运行进行安装 #install.packages("gplots") #加载gplots包 library(...gplots) 最后我们就可以来利用heatmap和gplots里面的配色方案来绘制火山图了 1.采用gplots包中的redblue配色方案,蓝色高表达,红色低表达 heatmap(data, cexCol...="row",col = bluered(100)) 3.采用gplots包中的redgreen配色方案,绿色高表达,红低表达 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row"

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R语言】热图绘制-heatmap+RColorBrewer配色方案

前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制热图 ☞【R语言】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案R语言中的颜色(一)-自带的调色板 也给大家介绍了如何使用R自带的...heatmap函数+gplots的配色方案来绘制热图 ☞【R语言】热图绘制-heatmap+gplots配色方案R语言中的颜色(二)-gplots包 也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数...+grDevice的配色方案来绘制热图 ☞【R语言】热图绘制-heatmap+grDevice配色方案R语言中的颜色(三)-grDevice包 今天我们接着来聊heatmap这个函数绘制热图,这次我们使用...RColorBrewer这个R包里面的配色方案R语言中的颜色(四)-RColorBrewer包 首先我们还是先读取需要的数据,这里用到的数据跟【R语言】热图绘制-heatmap函数用到的数据是一样的...】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案 ☞【R语言】热图绘制-heatmap+gplots配色方案 ☞【R语言】热图绘制-heatmap+grDevice配色方案R语言中的颜色(一)-自带的调色板

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R语言】热图绘制-heatmap+grDevice配色方案

前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制热图 ☞【R语言】热图绘制-heatmap函数 ☞R语言中的颜色(一)-自带的调色板 也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap...函数+gplots的配色方案来绘制热图 ☞R语言】热图绘制-heatmap+gplots配色方案R语言中的颜色(二)-gplots包 今天我们接着来聊heatmap这个函数绘制热图,这次我们使用grDevice...这个R包里面的配色方案 R语言中的颜色(三)-grDevice包 首先我们还是先读取需要的数据,这里用到的数据跟【R语言】热图绘制-heatmap函数用到的数据是一样的 #读取所有miRNA的表达矩阵...miRNA的名字 miRNA=rownames(deg) #提取差异表达miRNA对应的表达矩阵 data=as.matrix(expr[miRNA,]) 接下来我们使用grDevice包里面的两个函数来生成配色方案...】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案 ☞【R语言】热图绘制-heatmap+gplots配色方案R语言中的颜色(一)-自带的调色板 ☞R语言中的颜色(二)-gplots包 ☞R语言中的颜色

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R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子

偶然间在github 上发现的这个链接,示例数据和代码都有,很好的R语言学习素材 链接是 https://github.com/blmoore/blogR ,主要内容有 image.png 光看这个可能有些枯燥...library(ggplot2) 最基本的热图 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile() image.png 调整热图方块的一些内容...ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour="white", #linewidth=2,...width=.9, height=.9) image.png 这里原来热图对应的小单元格高和宽是都可以调整的 调整热图的颜色和图例 ggplot(mdf...hjust=0, size=I(3)) image.png 这个热图最终还挺漂亮的 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和

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R语言ggplot2科研数据作图配色的一些小技巧

以下是正文内容 大家好,在这里给大家介绍一下使用ggplot2绘图调色的几种小方法。正所谓绘图十分钟,调色一小时。图片的配色直接决定了图片质量的好坏。下面讲一下我平时绘图用到的调色工具。...image.png 友情提示:使用这个在线配色网站需要科学上网 配色小技巧之三:R语言包 RImagePalette “我于人间全无敌,不与天战与谁战”——柳白 ?...配色小技巧之四:R语言包 ggsci——一剑破万法! ggsci我最喜欢的调色R包了,里面包含nature,science,柳叶刀等知名杂志的调色风格。...有时候感觉自己配出的颜色还是不好看,ggsci包的出现完美解决了这个问题,与ggplot2包联用可以绘制各式符合杂志要求的配色方案,我最喜欢包里面Nature风格的配色。...ggsci配色方案表引用自“教你用科学杂志喜欢的配色作图——R包ggsci”作者:stanford_strive。

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R语言ggplot2作图时好玩的配色包~使用泰勒斯威夫特专辑的封面颜色

tayloRswift 安装方式 install.packages(c("tayloRswift")) 总共涉及到11个专辑的封面 离散型变量或者连续型变量都可以使用 下面用鸢尾花的数据集演示 library(ggplot2...) library(tayloRswift) colnames(iris) p1<-ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+ geom_point...(aes(color=Species),size=5)+ theme_bw()+ scale_color_taylor(palette = "lover") p2<-ggplot(iris,aes..., discrete = F, guide="none") library(patchwork) p1+p2 配色函数是...scale_color_taylor()或者scale_fill_taylor() 默认是离散型配色,如果是连续型数据可以指定参数discrete=F 这个配色风格用到科研上也未尝不可,哈哈哈,大家感兴趣的可以自己试试这个代码

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12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化

www.rdocumentation.org/packages/ggthemes 简介:ggthemes主要作用是提供一些额外的themes、geoms、scales可以让我们快速画出不同主题、背景和配色方案的图片...学术图表基本配色方法 ?...本身没有强大的拼图语法,这时利用patchwork扩展包,使用几个简单的如/、+、*、^等符号就可以轻松实现拼图这件事。...Weblogo 生物AI插图素材获取和拼装指导 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色) 图像处理R包magick学习笔记 SOM基因表达聚类分析初探 利用gganimate可视化全球范围...R-Ladies(R社区性别多样性组织)发展情况 一分钟绘制磷脂双分子层:AI零基础入门和基本图形绘制 AI科研绘图(二):模式图的基本画法 你知道R中的赋值符号箭头(<-)和等号(=)的区别吗?

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R tips:debug并修复一个ggplot2绘图错误的例子

最近将使用的R版本升级到4.0+之后,遇到了一个以前从未遇到的报错,报错信息如下所示: Error in UseMethod("rescale") : "rescale"没有适用于"AsIs"目标对象的方法...出现bug的代码是在使用clusterProfiler的cnetplot函数绘制一个富集分析图,正常情况下,它应该是出图如下: bug重现 出现问题的R对象是一个clusterProfiler的富集分析对象...UseMethod("print"))(x) 可以看到,ggplot2对象p在绘制图形时发生了错误:第一个调用方法是print泛型方法,然后方法分发到print.ggplot方法上(#2),再然后是调用...如何使用RStudio进行debug代码以及如何自由的查看R中的函数源码,在以前的R tips推文中都曾经说过。...解决方案 既然data这个数据有问题,可以在出错代码前,先将data中的AsIs对象给还原了,AsIs可以使用unclass复原,比如如下示例: # I 数值 I(1) # [1] 1 class(

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12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化

ggplot2 Extension 转自:生信宝典(Bio_Data),不一样的生信学习平台。 “ ggplot2自从2007年推出以来,成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。...如下面这个例子以动态图展现了历年来诺贝尔获奖者出生地的变化情况,《利用gganimate可视化全球范围R-Ladies(R社区性别多样性组织)发展情况》一文中有更详细的事例展示如何使用此包。 ?...www.rdocumentation.org/packages/ggthemes 简介:ggthemes主要作用是提供一些额外的themes、geoms、scales可以让我们快速画出不同主题、背景和配色方案的图片...学术图表基本配色方法 ?...本身没有强大的拼图语法,这时利用patchwork扩展包,使用几个简单的如/、+、*、^等符号就可以轻松实现拼图这件事。

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