R ggplot2的六边形绘图图形错误？ - 腾讯云开发者社区

ggplot2基本要素ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,...y = Petal.Length))ggplot2默认没有引号，第一行为全局设置，以下分别为分图层。...(x = Sepal.Length, y = Petal.Length), color = "blue") #分图层设置点的颜色...iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length), size = 5, # 点的大小...5mm alpha = 0.5, # 透明度 50% shape = 8) # 点的形状#通过分组设置不同颜色，同时自定义颜色ggplot(data

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R绘图-ggplot2 (2)

4、标尺（Scale）画图就是在做映射，不管是映射到不同的几何对象上，还是映射各种图形属性。...#这一小节介绍标尺，在对图形属性进行映射之后，使用标尺可以控制这些属性的显示方式， #比如坐标刻度，可能通过标尺，将坐标进行对数变换；比如颜色属性，也可以通过标尺，进行改变。...coord_polar()实现： ggplot(small)+geom_bar(aes(x=factor(1), fill=cut))+coord_polar(theta="y") #这也是为什么之前介绍常用图形画法时没有提及饼图的原因...require(ggplot2) f1data.frame(x=x,y=y) d -3*sqrt(33)/7,] return(d) } x1data.frame(x2=x2, y2=y2)...+误差图为实例，展示ggplot2非常灵活的图层。

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R绘图-ggplot2 (3)

自不用说，ggplot2提供了ggtitle(), xlab()和ylab()来实现。...ggplot2提供一些已经写好的主题，比如theme_grey()为默认主题，我经常用的theme_bw()为白色背景的主题，还有theme_classic()主题，和R的基础画图函数较像。.....level..), geom="polygon")+ scale_fill_continuous(high='darkred',low='darkgreen') ggplot2.fig22 11、ggplot2...实战果壳知性里有帖子介绍了个猥琐邪恶的曲线，引来无数宅男用各种工具来画图，甚至于3D动态图都出来了。...这里用ggplot2来画。3D版本请猛击此处。

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R绘图-ggplot2(1)

), 1000), ] ##查看数据情况 head(small) summary(small) #画图实际上是把数据中的变量映射到图形属性上。...#geom_point()完成的就是几何对象的映射，ggplot2提供了各种几何对象映射，如geom_histogram用于直方图，geom_bar用于画柱状图，geom_boxplot用于画箱式图等等...y=price, shape=cut, colour=color)) ###重要：ggplot2支持图层，我通常把不同的图层中共用的映射提供给ggplot函数，而某一几何对象才需要的映射参数提供给geom_xxx...数目在这里不用提供，因为ggplot2会通过x变量计算各个分类的数目。...ggplot2提供了很多的geom_xxx函数，可以满足我们对各种图形绘制的需求。

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ggplot2绘图（R_03）

2.搜画图代码 3.仿制示例数据 4.套代码，调细节 plot() 多种图形 hist()频率直方图 boxplot()箱式图 stripchart()点图 barplot()柱状图 dotplot(...)点图 piechart()饼图 matplot()数学图形 lines()添加线 curve()添加曲线 abline()添加给定斜率的线 points()添加点 segments()折线 arrows...text(6.5,4, labels = 'hello')#在(6.5,4)坐标处添加“hello” dev.off() #关闭画板 #2.ggplot2 中坚力量，语法有个性 library(ggplot2...(多种图形叠加） ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length))+ geom_smooth()+ geom_violin...test1 control gene1 0.1 test2 treat gene2 0.2 library(ggplot2) p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+

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R语言绘图之ggplot2

当我们看到很多优美的绘图时，你是否会有据为己有的冲动？我反正是有的。那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。...1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离，并按图层作图。...3. ggplot2的函数介绍： ggplot2里的所有函数可以分为以下几类：用于运算（我们在此不讲，如fortify_，mean_等）初始化、展示绘图等命令（ggplot，plot，print等）...，比如柱状图、点图、线图等） geom_errorbarh 水平误差线 geom_freqpoly 频率多边形（类似于直方图） geom_hex 六边形图（通常用于六边形封箱） geom_histogram

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R绘图 | 快速入门ggplot2

前言 ❝在正式介绍ggplot2绘图之前，我们先来介绍一下ggplot2的绘图框架，以便后面介绍时更容易理解。一般来说，ggplot2绘图框架分为：图层、几何对象、映射、标度和主题。...本次以散点图为例简略带领大家快速了解ggplot2的绘图逻辑，更详细内容后面我们会一一推送。 ❞ 1. 加载与安装包安装并加载绘图所需的R包ggplot2。...载入绘图数据本次演示我们以R自带的数据集diamonds为例进行绘图，由于数据量比较大我们使用tidyverse随机抽取1000条数据进行演示。...，ggplot2中内置了很多标度；在这里我们使用ggsci包中的标度scale_color_d3()来控制color属性，改变cut的默认颜色。...= price)) + geom_point(aes(color = cut)) + scale_color_d3() + theme_bw() 3.4.2 使用标度控制点 R中常用的点的形状如下图所示

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R tips：debug并修复一个ggplot2绘图错误的例子

最近将使用的R版本升级到4.0+之后，遇到了一个以前从未遇到的报错，报错信息如下所示： Error in UseMethod("rescale") : "rescale"没有适用于"AsIs"目标对象的方法...出现bug的代码是在使用clusterProfiler的cnetplot函数绘制一个富集分析图，正常情况下，它应该是出图如下： bug重现出现问题的R对象是一个clusterProfiler的富集分析对象...UseMethod("print"))(x) 可以看到，ggplot2对象p在绘制图形时发生了错误：第一个调用方法是print泛型方法，然后方法分发到print.ggplot方法上(#2)，再然后是调用...不过对于要修复这个问题来说，目前的信息已经足够了。如何使用RStudio进行debug代码以及如何自由的查看R中的函数源码，在以前的R tips推文中都曾经说过。...执行了ggplot_build.gg的定义代码后，现在的绘图代码在需要调用ggplot_build方法时会被自动分发到自定义创建的ggplot_build.gg方法，于是下述代码就会正常出图毫无问题了。

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R语言绘图之ggplot2包「建议收藏」

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 6月份一直在忙期末考试，今天来迅速的学习下ggplot2包的简单绘图。...R的基础包里面也有很多画图函数，例如plot();barplot();qqplot(); 但是还有大名鼎鼎的ggplot2包，用这个包的函数画出的图比较漂亮，而且使用灵活。...最后，绘画在某个坐标系中（coordinate system, 记为coord），而分面（facet，将绘图窗口分成若干个子窗口）是用来生成数据中不同子集的图形先介绍下它的基本元素：数据与映射...以下用的数据是一份毕业生数据，来自王斌会主编的《数据分析与R语言建模》的练习数据，一共48个样本点，9个属性一、数据在ggplot2中，接受的数据集必须是以data.frame格式的。...)) 最后一句出现了错误，是因为在aes中, color = “blue”的实际意思是把”blue”当为一个变量, 用这个变量里的数据去关联图形属性中的参数, 而”blue”只含有一个字符变量

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R语言ggplot2绘图时如何在图形中使用数学表达式作为标注文本

图形中的文本有时需要使用数学表达式，如的2.5需要使用下标，单位涉及到希腊字母和上标，以及一些比较复杂的大型符号，如求和符号、积分符号等。...对此，R语言的基础包提供了完善的处理办法： grDevices工具包提供了这些数学表达式的语法； base工具包的expression()函数用于将这些语法在图形中转换成实际的效果。...下面举例说明：语法x^2对应的实际效果是，输出代码是expression(x^2)； pi表示圆周率，代码expression(x^2)在图形中输出的就是圆周率的符号；一些文本需要使用特殊格式，...以上例子对应的R代码如下： par(plt = c(0.05,0.95,0,1), ps = 20, adj = 0.5, family = "mono") plot(1:6, type = "...其他需要注意的是，以上语法虽然由R语言的基础绘图系统工具包grDevices提供，但它属于通用语法，也可以在ggplot2绘图系统中使用。

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R语言从入门到精通：Day17 (ggplot2绘图)

在之前的教程中，我们在学习各类数据分析方法的过程中学习创建了各种各样的普通图形和特殊图形，它们大部分都是利用R的基础绘图系统创建的。...经过这么长时间对R语言的学习，相信对于R中的四种独立图形系统，你肯定也不会感到惊奇。...除了基础图形，grid、lattice和ggplot2软件包也提供了图形系统，它们克服了R基础图形系统的低效性，大大扩展了R的绘图能力。...四种常见的作图系统中，ggplot2包基于一种全面的图形“语法”，提供了一种全新的图形创建方法。这个包极大地扩展了R绘图的范畴，提高了图形的质量。...ggplot2很强大，能够创建各种各样的信息图。可惜，强大也带来了复杂性。不像其他的R包，ggplot2凭借其自身就可以被认为一种综合图形编程语言。

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R语言绘图 | 调整ggplot2坐标轴标签排列顺序

"ggplot2"是我们常用的绘图包，但是使用ggplot2绘图时，输出的坐标轴标签总是按照字母排序，无法使用我们输入文件中排列的顺序。今天小编就教大家解决这一问题。...生成示例数据 x <- c("B","A","D","C","E") y <- c(5,6,7,8,9) df <- data.frame(x = x , y = y) ## 绘制条形图 library("ggplot2...我们可以看到，虽然我们生成的数据是按照"B","A","D","C","E"排序的，但是ggplot2输出的图依然是按照字母进行排序的。...如图所示，X轴标签的顺序被调整过来啦！

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R语言统计与绘图：给组合图形添加ABCD小标签

前面我们学习了ggplot2中组合图形的绘制，在科研论文中，组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签，如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以在PS或者AI中添加，也可以在R中直接添加。...今天我们来学习组合图形中怎么添加ABCD标签。组合图形的标签添加可以使用ggpubr包的ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....绘制图形先绘制好需要的图形，在这里为求方便，我每张小图都是一样的。...", color = "red", face = "bold", size = 14), bottom = text_grob("公众号: R语言统计与绘图", color...对象列表 plotlist # 要显示的绘图列表 ncol、nrow # 图形组合的列数和行数 labels # 要添加到图形中的标签列表，可以设置lable="AUTO"或"auto"自动生成大写标签或小写标签

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科研绘图系列：tidyplots取代ggplot2的科研绘图利器

介绍tidyplots----取代ggplot2的科研绘图利器。tidyplots的目标是简化为科学论文准备出版的情节的创建。它允许使用一致和直观的语法逐渐添加，删除和调整情节组件。

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一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D

一个震撼的交互型3D可视化R包 - rayshader 作者：张虎协和编辑：陈同生信宝典 ? 虽然3D的plot见得比较多了，但是看见这样的R包，我的心还是砰了一下，这个简直不能再好看了！...敲黑板，这个R包超简单！！！对于刚学习R语言的同学们来说，会被圈粉哒！该包的主要功能就是将ggplot2画出来的2D图像变为3D图像，不说废话，直接上代码。...# Lines pp = ggplot(data, aes(x=x, y=y)) + geom_hex(bins = 20, size = 0.5, color = "black") + # 绘制六边形图...#该数据是我们常见的R中的模拟数据 head(mtcars) mtcars_gg = ggplot(mtcars) + geom_point(aes(x=mpg,color=cyl,y=disp)...该网站包含所有`rayhader`功能的文档和示例，可以在`Github`页面上找到实际的存储库。就让你静静的看我有多美！ ? ? 想把其它图也用3D展示，可以拿下面的ggplot2系列绘图做例子。

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原创 | R的基础及进阶数据可视化功能包介绍

R 作为入门级编程语言，被经常运用在数据整理、数据可视化、以及机器学习中。本篇文章将主要介绍在R中如何可视化数据 (基础+进阶)。 R绘图的原理使用R绘图，我们需要在脑海中明确几个必要元素。...R数据可视化工具在R语言里，除了R自带的可视化工具plot(),还有很多精彩的工具包，比如ggplot2, 以及gganimate。 ggplot2 ggplot2 是R中被广泛应用的绘图包。...我们将使用R Studio中自带的数据集mpg来进行ggplot2可视化演示根据R绘图原理，我们需要在ggplot2中将一个图表拆分成若干个子元素并进行叠加绘制。...几何对象(geom_*): 图表的几何图像类型 4. 标度(scale_*):变量以何种参数(何种颜色、形状)映射到图形上 5. ...geom_hex(),geom_point()（分别为柱状图，条形图，六边形，散点图）叠加生成不同的可视化图表。

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R的基本绘图功能

尽管如此，有时候我还是想用一些比ggplot更简洁的方法。这时候，我会选择用R里基本的绘图功能。...来，放松一下，我们要开始玩转R的基本绘图功能了！数据源我们将会用到iris数据集。这是一组可靠的经典数据集，虽然不是这个世界上最令人激动的数据，但这是R自带的（所以你不需要下载）并且很容易理解。...这将让我们有机会展示一些R在处理时间序列数据方面很便利的内置功能。就用plot 好，重要的事情先做：绘图的命令是¼¼ 你猜对了，就是plot。...因为R本身就有时间序列的数据类型，所以绘图工作是轻而易举的事。下面的例子中，我会把USAccDeaths数据集传递给plot函数。你能看到我们可以用xlab 和 ylab来给x轴和y轴添加标签。...我们可以用lines 函数为每一个分布加上不同的颜色。小结以上就是今天要分享的关于R的基本绘图功能

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R中的循环绘图

❝本节来介绍在 R中如何使用ggplot2结合for循环绘图并保存，下面通过一个案例来看具体操作 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(data.table) library...library(patchwork) 设置文件路径 file_name <- "loop_data.tsv" 读入数据 dat <- fread(file_name, sep="\t") 获取唯一的城市名称进行循环...cities = unique(dat$city) 创建一个空列表来保存创建的图 city_plots = list() 循环遍历并绘图保存 for(city_ in cities) { city_plots...".pdf"), width =3.04, height =3.10, units = "in", dpi=300) } 上面我们将每一张图都单独输出了，下面来介绍如何将其全部组合起来，分别介绍两种R包的方法

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「R」R 的基本图形绘制

par()函数能够让你对R的默认图形作出大量修改，这里只给出一个示例： par(mar=c(5, 8, 4, 2)) # 增加y边界大小 par(las=2) # 旋转条形的标签...可以使用如下函数创建直方图： hist(x) x是一个由数据值组成的数值向量。参数freq=FALSE表示根据概率密度而不是频数绘制图形。参数breaks用于控制组的数量。默认等距切分。...density_default_plot.png 可以比较的核密度图核密度图可以用于比较组间，使用sm包中的sm.density.compare()函数可向图形叠加两组或更多的核密度图。...density_compare_plot.png 箱线图箱线图同样是一种用来可视化分布和组间差异的绝佳图形手段（非常常用）。...box_plot.png 默认情况下，两条须的延伸极限不会超过盒型各端加1.5倍四分位距的范围，超过的都会用点表示。执行boxplot.stats(mtcars)即可输出构建图形的统计量。

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ggplot2分面图形自定义添加回归曲线R值

❝本节来介绍如何自定义给分面图形添加R值与P值，通过两个案例来进行展示❞ 加载R包 library(tidyverse) library(gapminder) library(ggpmisc) library...continent %in% c("Oceania","Americas"),year >=1982) 数据可视化 ❝在这个案例中我们介绍使用「stat_quant_eq」函数自动添加拟合曲线的R值与...legend.key = element_blank(), legend.title = element_blank()) ❝可以看到使用「ggpmisc::stat_poly_eq」函数很轻松的添加上了...R值与P值，但是实际中也许会存函数无法自动添加的情况，那么就需要使用代码自定义去添加，如果图表只有一个那样操作很是轻松，但若是图表采用分面的形式绘制那么就需要自定义函数来添加文本 ❞ 自定义注释函数 annotation_custom2...Inf, data) { layer(data = data, stat = StatIdentity, position = PositionIdentity, geom = ggplot2

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R绘图——ggplot2

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