读取xlsx文件可以用xlsx 包，但是因为xlsx依赖java很容易出现各种问题，有时会爆内存而且速度较慢。因此可用其他包代替。...推荐readxl的read_excel，兼容.xls 和 .xlsx 基本用法：https://zhuanlan.zhihu.com/p/35608173 read_excel(path, sheet...包可以用来将数据框保存为Excel格式。...用法： write_xlsx(x,path = tempfile(fileext = ".xlsx"),col_names = TRUE,format_headers = TRUE) library(...(sheets, "file.xlsx") 此外，除了readxl和writexl扩展包， XLConnect, xlsx, tidyxl也可以进行与Excel文件或者Excel软件的交互。
之前的推文零散笔记：R安装xlsx包遇到报错以及github下载指定文件夹的内容 记录了安装xlsx包时的报错，今天记录解决办法 第一次安装遇到的报错是 Error: package or namespace...load failed for ‘xlsx’: .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details: call: fun(libname...Try re-installing Java and make sure R and Java have matching architectures....我现也不知道，反正换成这个以后加载xlsx这个包就没有报错了 最开始安装的那个版本的java我也忘记了 这次好像也不用单独再给java添加到环境变量了，直接用就没有问题，是不是这个java默认就添加到环境变量里去了呢.../ 一个是韦恩图 https://www.datanovia.com/en/blog/beautiful-ggplot-venn-diagram-with-r/
ERROR: configuration failed for package ‘gsl’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/gsl’ 解决方案（全靠程序员之友...） 在Ubuntu下使用系统管理员： sudo apt install libgsl-dev
「前言：」 ❝今天我用openxlsx包中的read.xlsx读取xls文件时，竟然报错了。我记得有一个包是可以读取Excel2003的，搜索了一下，发现不太容易查找，就写一遍博客记录一下。...❞ xlsx文件，是2007,2013,2016版本的Excel文件，R语言中可以通过openxlsx包进行读取。 1. 读取xlsx文件 > dd = read.xlsx("...../hebing_pedigree.xlsx")> head(dd) ID Sire Dam1 65107859 435 010422 65112819...("计算遗传力.xls")Error in read.xlsx.default("计算遗传力.xls") : openxlsx can not read .xls or .xlm files!...汇总 openxls通过函数read.xlsx读取xlsx文件 readxl通过函数read_xls读取xls文件 软件安装方法：install.packages("openxlsx") 以及 install.packages
R语言读取txt，csv和xlsx文件 刚刚数据分析的上机课自己学了一下怎么在R环境下读取文件，本来是很简单的事情，但是因为各种原因踩了很多坑，现在来总结一下，防止以后忘记。...txt",header=T)//有表头就写T，没有表头就是F 读取csv文件 直接使用read.csv方法 read.csv("D:\\rexample\\2\\1.csv",header=T) 读取xlsx...文件 下载readxl包 install.packages("readxl") library(readxl) 使用read_excel()方法读取 read_excel("D:\\rexample\\...1\\1.xlsx",sheet=1)
介绍 R是一种流行的开源编程语言，专门研究统计计算和图形。它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名，这使其适用于许多领域。...在本教程中，我们将讨论如何安装devtools并使用它直接从GitHub安装R包。...准备 要继续学习本教程，您需要一台Ubuntu 18.04服务器： 一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器，并且已开启防火墙。...第3步 - 从GitHub安装R包 在这一步中，我们将直接从GitHub安装Shiny的最新开发版本，这是一个R的Web应用程序框架。...更多Ubuntu教程请前往腾讯云+社区学习更多知识。 参考文献：《How to Install R Packages using devtools on Ubuntu 18.04》
p=14174 使用Ubuntu 虚拟机。安装某些软件包时可能会出现一些问题。一个窍门是打开终端 然后使用sudo命令安装一些软件包， （输入密码后）。...apt-get install r-cran-plyr r-cran-xml r-cran-reshape r-cran-reshape2 r-cran-rmysqlsudo apt-get install...r-cran-rjavasudo apt-get install r-cran-glmnetsudo apt-get build-dep r-cran-bootsudo apt-get build-dep...r-cran-classsudo apt-get build-dep r-cran-clustersudo apt-get build-dep r-cran-codetoolssudo apt-get...("RCurl")install.packages("xml")install.packages("rJava")install.packages("rgdal")install.packages("xlsx
查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。...Ubuntu倒是很稳定的更新，我的其实已经是Ubuntu18了 ，其它版本需要修改Ubuntu源文件，使用VIM编辑器修改文件：/etc/apt/sources.list 假如系统R版本不够，就需要升级...会删除软件包而保留软件的配置文件r # apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件 #然后更新Ubuntu源文件 ## 这里，不同Ubuntu系统有点不一样： cat /etc/issue...install -y r-base r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包 这里只是举例，我比较常用的包，安装非常耗时，一般来说小半天就过去了。...BiocManager::install("scater") BiocManager::install("Seurat") BiocManager::install("monocle") 至于这R包用法
R包 多个函数的打包存放 相应的R包可实现特定的分析功能 R包包含函数、数据、帮助文件、描述文件 安装 R包来源有CRAN、Bioconductor、GitHub install.packages(tidyr...jmzeng1314/idmap1") library("tidyr")#加载 devtools::install_local(“xxxx.zip”)#本地安装 安装后每次使用都要先加载，也可用来检验是否成功安装 载入包时回答提示信息尽量...no* 已经安装的包，可直接调用其中的函数 pheatmap::pheatmap(volcano)#包名::函数名 library(pheatmap) pheatmap(volcano) 学习R包的使用...browseVignettes("limma") #作者一手教程，不是每个包都有 ls("package:limma")#列出包中的函数等 引用自生信技能树 小洁老师
image.png 如果我只想下载代码 code那一个文件夹，点进去这个文件夹，然后将链接复制到开头提到的网址就可以了 R语言安装xlsx包遇到的报错 之前读取数据我都是将excel中的数据另存为csv...格式然后再读入，今天试着使用R语言直接读取excel格式数据，查到可以使用xlsx这个包，直接使用install.packages('xlsx')安装，加载的时候却遇到报错 Error: package...or namespace load failed for ‘xlsx’: .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details: call...Try re-installing Java and make sure R and Java have matching architectures. ?
stringr包是Hadley Wickham大神贡献的R包之一，主要用于字符串的处理。对于经常需要对数据进行预处理的分析人员来说，简直是一把“利器”，可谓是上能屠龙，下能剔牙。...其用法相比于R自带的函数，更加简单明了。stringr包在我工作中，是属于频繁使用的R包之一。简单的用法也是深入我心，强烈推荐使用该包进行字符串的预处理。...接下来，根据我在工作中使用到的stringr包的场景，介绍一下这些函数的用法。 字符拼接 场景：在读入csv或者xlsx格式文件时，根路径一般不一致，然后我一般使用全名路径。...#提取filepath 字母大小写转换 场景：在Excel中，查找匹配不区分大小写，但是在R中区分大小写，常出现在Excel中能查到到但是R中匹配不到的情况，故先预处理统一大小写再做匹配。...#大小写转换r.letter 检测 场景：常跟ifelse函数配合使用，对某一列字符串进行判断是否匹配。
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com.../s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
笔者寄语：批量读取目前看到有以下几种方法：xlsx包、RODBC包、批量转化成csv后读入。...与之相反，R对csv等文本格式支持的很好，而且有fread这个神器，要处理一定量级的数据，还是得把xlsx转化为csv格式。...以此为思路，在参考了两个资料后，我成功改写了一段VBA，可以选中需要的xlsx，然后在其目录下新建csv文件夹，把xlsx批量转化为csv格式。...（可多选） 选中以后，等一段时间，再回到xlsx文件下，会多一个csv文件夹，里面就是我们要导入R的文本文件了。...—————————————————————————————————————————————— 读入R数据库可以用lappy来读取： #lapply读取法 filenames <- list.files(
R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。...本次以dplyr为例安装和加载R包镜像设置运行这两行代码options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options...(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")安装R包安装命令：install.packages()或者BiocManager...，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数函数和R包的学习方式快速查看函数帮助文档?...dplylr可以用问号连接任何想知道使用方式的函数名称找R包介绍页面（善用搜索引擎，或者找帮助）##Vignettes这个单词硬翻译会翻译成“小插图”，其实就是作者写的网页版教程，不是每个R包都有的，可以运行代码试试看
在这篇文章中，我们将学习如何操控R中的字符串，主要用的是Biostrings包。...Getting started 如果你是第一次使用，请先用以下命令安装Biostrings包： source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite...如果你想要查看这个包的说明文档，请点击链接http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/Biostrings/man/Biostrings.pdf...我们将通过实际操作一些Biostrings包提供的函数去熟悉它做的是什么，又是如何实现的。 Generating DNA alphabets R 提供了函数生成大写和小写的字母表。...如果你还没有下载好bioconductor包，可以使用下面的命令： source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
安装加载R包R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)。取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor。...使用一个包，是需要先安装再加载options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) options(BioC_mirror...# 3 virginica 6.05 0.354管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)（加载任意一个tidyverse包即可用管道符号...y项中除非交集外的其他部分anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')## x y## 1 a 1## 2 c 3## 3 d 46.简单合并在相当于base包里的
这几天收到师兄的任务，熟悉iGRaph包的使用，通过查资料，外加自己的实践，在此做个简单的学习笔记。 以下例子均是在R 3.0.1版本下测试的。
背景: 想要实现一个功能, 将不同的数据写入一个Excel中, 不同的数据对应不同的sheet表, 看了一下R语言, 找到的解决方法如下....(sheets,"d:/ex.xlsx") 结果 ?...感想: 最近发现, R语言中的list更好用, 我的R语言水平感觉要进步一个台阶了......运用R语言的list示例: 需求描述: 现在有3个Excel, 想把这些Excel合并到一个Excel中的不同sheet表中, 如何实现?...(a[i])}names(nlist) =awrite.xlsx(nlist,"hebing.xlsx") 打开结果: ?
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包，通过BiocManager::install("pkg_name")来安装。 3....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
> m2d=function(x){+mean(x)+2*sd(x)} #sd()是标准差 不会是一个值 > m2d(rnorm(10)) [1] 1.738949 R包 介绍 R包都在哪里 ####...1) CRAN网站 >install.package( ) #包名要加“” #### 2) Bioconductor 网站 >BiocManager::install( ) #### 3) github...#表格文件读到R语言中，就得到了一个数据框，对数据框进行的修改不会同步到表格文件，需重新导出 分隔符 常见的分隔符：逗号、空格、制表符（\t) 将表格文件读取到R语言中 read.table() #...可以读取任何形式，但有问题的文件仍有问题,根据文件的后缀读取,特殊 >import() >import_list() >export() >rio::export(a,file="a.xlsx") >b...=rio::import("a.xlsx") 图片 -----来自生信技能树----
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
云直播
