R: readHTMLTable返回空列表_R- GetNodeSet返回空列表 - 腾讯云开发者社区

列表 list，是R的数据类型中最为复杂的一种。一般来书，列表就是一些对象（或成分，component）的有序集合。列表允许整合若干（可能无关的）对象到单个对象名下。...（1）列表允许以一种简单的方式组织和重新调用不相干的信息。（2）许多R函数的运行结果都是以列表形式返回的。函数需要返回两个以上的变量时需要采用list形式返回。...列表元素的索引有多种，意识索引列表某组件，二是索引列表中某组件里的内容一、索引列表某组件，可以通过标签索引一个组件整体，方法与向量，矩阵的访问差不多 > A <- "our one list" #...非常好" $c [1] "好极了" 注意，结合之前仿照向量使用负索引也可以的 > ourlist7 <- list(a = c("很好","非常好"),b = c("good","nice")) > R3...<- ourlist7[-2] > R3 $a [1] "很好" "非常好" > ourlist7 $a [1] "很好" "非常好" $b [1] "good" "nice" 获取标签

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左手用R右手Python系列之——表格数据抓取之道

对于表格而言，R语言和Python中都封装了表格抓取的快捷函数，R语言中XML包中的readHTMLTables函数封装了提取HTML内嵌表格的功能，rvest包的read_table()函数也可以提供快捷表格提取需求...，和链接元素，这些快捷函数都是： readHTMLTable() #获取网页表格 readHTMLList() #获取网页列表 getHTMLlinks() #从HTML网页获取链接...readHTMLTable readHTMLTable(doc,header=TRUE) #the HTML document which can be a file name or a URL or...函数或者read_table() 在XML包中，还有另外两个非常好用的高阶封装函数：一个用于抓取链接，一个用于抓取列表。...同样适用以上R语言中第一个案例的天气数据，直接利用pd.read_html函数也无法获取表格数据，原因相同，html文档中有数据隐藏设定。

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是的

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「R」获取R包中的函数和对象列表

方案在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...provideDimnames psigamma pushBack pushBackLength q qr qr.coef qr.default qr.fitted qr.Q qr.qty qr.qy qr.R...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version...t T #> #> ================================================ #> Objects: #> kronecker Position R.version

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寻找与疾病相关的SNP位点——R语言从SNPedia批量提取搜索数据

readHTMLTable(doc) #doc 是XML或者HTML格式文本，可以是文件名，也可以是刚刚parse的html对象，该函数返回XML或HTML中的表格正则表达式这里阐述基本的正则表达式使用...，包括每个字符串的匹配长度和是否匹配） #实例这里直接上代码，代码里面有着详细解释，许多函数以后可以直接复制使用，或者放进一个自己做的R包 !...,'//title')[[1]])," -")[[1]][1]) #"rs... - SNPedia"进行split 写入"Geno Mag Summary "table GMS_table <- readHTMLTable...，返回存在匹配的字符串列表index pattern:匹配模式 stringlst:待匹配字符串列表 return:存在返回匹配的字符串在列表中的index findlist <- gregexpr...prefix,x,sep="")) } adresses } greg <- function(pattern,istring){ greg函数查看单个字符串istring,并且返回匹配的部分，不匹配返回空

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2-4 R语言基础列表

#列表list > l1 <- list("a",2,10L,3+4i,TRUE) #每个元素没有名字 > l1 [[1]] [1] "a" [[2]] [1] 2 [[3]] [1] 10 [[4]]...[1] 3+4i [[5]] [1] TRUE > l2 <- list(a=1,b=2,c=3) #列表中每个元素名字分别为abc > l2 $`a` [1] 1 $b [1] 2 $c [1] 3...> l3 <- list(c(1,2,3),c(4,5,6,7)) #生成一个列表,列表中每一个元素大于1 > l3 [[1]] [1] 1 2 3 [[2]] [1] 4 5 6 7 > x <-...matrix(1:6,nrow = 2,ncol = 3) #自动创建列表 > dimnames(x) <- list(c("a","b"),c("c","d","e")) #使用dimnames定义标题

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R语言入门 Chapter03 | 列表

——荀子这篇文章讲述的是R语言中关于列表的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助！...如果您有想学习的知识或建议，可以给作者留言~ Chapter03 | 列表 1、列表顾名思义就是用来存储很多内容的一个集合，在其他编程语言中，列表一般和数组是等同的，但是在R语言中，列表确实R中最复杂的一种数据结构...2、列表就是一些对象的有序集合。队列中可以存储若干向量、矩阵、数据框、甚至其他列表的组合。向量和列表： 1、在模式上和向量类似，都说是一维数据组合。...2、向量只能存储一种数据类型，列表中的对象可以是R中的任何数据结构，甚至列表本身。...<- iris # 使用两个中括号正确 # 清空列表的值 mlist[5] <- NULL # mlist[[5]] <- NULL # 清空列表元素的值

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网站抓取引子 - 获得网页中的表格

R的XML包中有个函数readHTMLTable专用于识别HTML中的表格 (table标签)，从而提取元素。...wegpage address url <- "http://www.hmdb.ca/bmi_metabolomics" # header=T, 使第一行或thead属性的内容为标题 df1 <- readHTMLTable...page=" # 获得URL集合 url_all <- paste(url, pages, sep="") a = sapply(url, readHTMLTable, header=T, stringsAsFactors...这需要我们自定义一个函数，封装下readHTMLTable。 HMDB数据库提供了全数据下载功能，相比于抓取，下载下来数据，自己筛选合并是更好的方式。 ?...问题解决可能是因为网速或其它问题，有时直接把url提供给readHTMLTable不一定可以获取结果，下面提供了2额外的方式，供使用。

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R语言-03数据框、矩阵和列表

“向量”——一维 “表格”——二维 matrix 矩阵-二维，只允许一种数据类型 data.frame 数据框-二维，每列只允许一种数据类型 list列表：可装万物 1.数据框来源（1）用代码新建（...2）由已有数据转换或处理得到（3）读取表格文件（4）R语言内置数据（没有赋值就可以直接使用的数据，例如iris） 2.新建数据框* 读取文件 df2<-read.csv("gene.csv") df2...","r2","r3","r4") #修改全部行名 #只修改某一行/列的名 colnames(df1){2} <- "CHANGE" #修改一个列名 6.两个数据框的连接按照共同的列名取交集，后连接...矩阵画热图 pheatmap::pheatmap(m) #热图结果默认聚类 pheatmap::pheatmap(m,cluster_cols = F,cluster_rows = F) #修改默认聚类列表新建和取子集...（列表可装万物） x[1] x$m1 #列表取子集元素的“名字”-names（）后置的难点数据框按照逻辑值取子集 #将逻辑值赋值给k，按逻辑值在df1中取子集**实战中会经常遇到删除变量数据结构总结

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一个函数抓取代谢组学权威数据库HMDB的所有表格数据

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这个包绝对值得你用心体验一次！

这一段时间在研究R里面的数据抓取相关包，时不时的能发掘出一些惊喜。...似不似，有点儿惊讶，rdom后台调用了plantomjs浏览器渲染了整个html目标文档（包含里面的所有script标签里面的js动态脚本），所以readHTMLTable函数才有机会提取里面的表格（而这个过程...这篇文章对于R语言网络数据抓取而言意义重大，这是我第一次在R里面看到竟然有一个自带请求器的解析器，而且还是调用的plantomjs无头浏览器，专治各种wed端js动态脚本的隐藏数据。...http://phantomjs.org/ 关于异步加载的逻辑以及为何带有异步加载的网页里，XML包的readHTMLTable函数和rvest包的html_table函数统统对束手无策，项目主页里作者都有提到...希望最近这些小文，能给今后大家学习R语言数据抓取带有更多便利，让大家少走弯路。

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如何删掉R列表里面的空元素

前面我们讲过 ☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-ENCORI篇 ☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-TargetScan篇 ☞miRNA数据库简介及miRNA靶基因批量预测思路就是将所有...对于包含空元素的列表去做stack（☞R中的stack和unstack函数）的时候，就会出现下面这个warning。这个警告并不会影响我们最后的结果，但是有些小伙伴可能有强迫症，不想看到任何警告。...那么今天我们就来给大家介绍两种去除列表里面空元素的方法我们先来生成一个列表，这个列表有三个元素，名字分别为a,b和d。...参考资料： 1.R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-ENCORI篇 2.R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-TargetScan篇 3.miRNA数据库简介及miRNA靶基因批量预测 4....R中的stack和unstack函数

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...","r2","r3","r4") #修改所有行名colnames(df1)[2] <- "CHANGE" #列出所有行名后取出下标为2的元素赋值修改数据框的连接merge函数可连接两个数据框，通过指定公共列使具有相同元素的行的列合并...colnames(m) <- c("a","b","c") #加列名或行名均可以此实现#取子集方法同数据框t(m) #转置行与列，数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵...，而l[2]取出来的是一个list，pheatmap不支持l$m1 #取出名为m1的成分变量的删除rm(l) #删除列表lrm(df1,df2) #删除变量df1与df2rm(list = ls())...rownames(a)<-paste0("flower",1:5);a##是rownames不是rowname，可见tab的重要性#再次说明1：5可以换为1:nrow(a)# 4.探索列表取子集l[2]

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DshanMCU-R128s2芯片外设支持列表

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R语言列表输出到本地简单粗暴的方法

今天分享的是一个保存R语言不规则数据到本地的方法，感觉比较有用，希望也对你有用吧！...有时候，我们R语言的结果是一个list，不能转化为data.frame数据框，强行用数据框函数输出，结果就变化了，比如： fwrite write.table write.csv write.xlsx...R 1.00000 NA NA F 0.0 $y2 component std.error z.ratio bound %ch...R 1.0000 NA NA F 0.0 $y3 component std.error z.ratio bound %ch...R 1.0000 NA NA F 0 我想把这个结果，保存到txt文件中，格式不要变。

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R语言：lengths计算列表list中元素的个数

lengths 一看，还以为是length函数，我们要介绍的函数后面多了一个s，专门用于计算列表list的长度，下面用例子来呈现我们的函数。...length Get or set the length of vectors (including lists) and factors, and of any other R object for...which a method has been defined 帮助文档内容：x是向量，因子，列表 > length(diag(4)) # = 16 (4 x 4) [1] 16 > length...x为列表、向量 > require(stats) > l <- split(airquality$Ozone, airquality$Month) > l $`5` [1] 41 36 12

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R语言数据清洗实战——世界濒危遗产地数据爬取案例

最近重复新翻阅R语言领域唯一一本关于网络数据采集的参考书——《基于R语言的自动数据收集》，开篇就是一个数据爬取的案例。...<-"https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_World_Heritage_in_Danger" 经过自己尝试，作者书中的代码已经无法运行，这里我借助RCurl结合readHTMLTable...heritage_parsed % readHTMLTable(stringAsFactors=FALSE) 仔细查看第一部分内容的结构...，每个列表对象是长度为2的向量。...如何使用管道操作符优雅的书写R语言代码列表是R里面最为自由、最为包容和灵活的数据对象，是R与外部非结构化数据通讯的唯一窗口，所以熟悉列表操作，是进阶R语言的必经阶段。

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R语言基础-向量、矩阵、数据框、列表相关操作

三个a分别对应了k1，12个随机数中的前三个值，那条线是三个值的中位数（不是平均值哦）3.向量、数据框、矩阵、列表#先简单介绍下这些名字吧。# 1.向量是组成数据框以及矩阵的基本单位。...3.1 数据框来源# （1）用代码新建# （2）由已有数据转换或处理得到# （3）读取表格文件# （4）R语言内置数据3.1.1 新建和读取数据框df1 <- data.frame(gene = paste0...','r2','r3','r4')colnames(df1)[2] = 'CHANGE' 3.1.6 两个数据框的链接#随便建两个数据框test1 <- data.frame(name = c('jimmy...as.data.frame(m)## a b c## 1 1 4 7## 2 2 5 8## 3 3 6 9#随便画个热图pheatmap::pheatmap()pheatmap::pheatmap(m)图片3.3 列表...3.3.1 列表新建和取子集#简单了解下吧x = list(m1 = matrix(1:9,norw = 3), m2 = matrix(2:9,nrow = 2))## Error in

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R语言XML包获得html文件中的表格小实例

14517732/how-to-get-table-data-from-html-table-in-xml How to get table data from html table in xml 使用R语言的...XML包使用到的R语言代码 library(XML) doc<-htmlParse("snpEff_summary.html") total_table<-getNodeSet(doc,"//table...") # 以上代码是固定的写法 # 下面的代码想获得第几个表格，中括号中的数字就改成几 df3<-readHTMLTable(total_table[[3]]) df3 class(df3) 结果以数据框的形式存储

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R语言基础教程——第3章：数据结构——列表

列表列表（List）是R中最复杂的数据类型，一般来说，列表是数据对象的有序集合，但是，列表的各个元素（item）的数据类型可以不同，每个元素的长度可以不同，是R中最灵活的数据类型。...列表项可以是列表类型，因此，列表被认为是递归变量，与之相对，向量，数组，矩阵，数据框被认为是原子变量。...列表由list()函数创建，每个参数使用逗号分割，用于指定列表项的内容，列表中的元素数量不限，类型不限。...列表项的名称是可选的，可以创建无名的列表项；列表的每一个item，都可以显示命名，例如，name1=item1, name2=item2。...列表是可以递归的，意思是列表的组件可以是列表。

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社交网络分析的 R 基础：（三）向量、矩阵与列表

在第二章介绍了 R 语言中的基本数据类型，本章会将其组装起来，构成特殊的数据结构，即向量、矩阵与列表。.../web/packages/RcppEigen/vignettes/RcppEigen-Introduction.pdf 列表列表的创建列表（list）在 R 语言中是由一个个对象所构成的集合，这些对象可以是不同的数据类型...如果为列表元素定义名称的话，列表更像是 Python 中的字典，但 R 语言中的列表中的元素是有序的。在 R 语言中使用 list() 函数来创建列表。...将其输入到 R 终端中，细心的你会发现这与矩阵计算特征值和特征向量的函数 eigen() 返回的类型一致。这种定义了名称的列表对于包含多个返回值的函数非常方便。...试着对任意一个非空列表使用 unlist() 函数，看看会发生什么。参考 An Introduction to R R 数据类型 | 菜鸟教程 R 矩阵 | 菜鸟教程 R 列表 | 菜鸟教程

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