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学习小组day5笔记-R语言基础2

sep: 字段分隔符dec: 文件中用于小数点字符。图片read.table,用于从文本文件读取数据。它以表格形式返回数据。...相关参数 :header: 表示文件是否包含标题行sep: 表示文件中使用分隔符值图片图片#数据部分操作,先在工作目录下新建qingnan.txt,并输入示例数据X<-read.csv('qingnan.txt...,sep = "\t",header =T) #从文本文件读取数据,以表格形式返回数据。...(默认格式带由双引号) # 导出数据之后可以工作目录下找到一个yu.txt,# 提取数据元素(与提取向量元素大同小异,这里只记录了一下花花@生信星球总结一些常用提取,没有实操。)...补充,关于 save 函数说明:如图,save函数可以将R对象外部表示法写到指定文件,之后,可以通过load或attach(或data)从文件读取这些对象。

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R语言 数据、矩阵、列表创建、修改、导出

数据数据创建数据来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...tsv改变文件名而来,此时用csv打开会报错,该知识点用于防止部分代码错误应用csv套用tsv等#文件读写部分(文件位于R_02Rproject)#1.读取ex1.txt txt用read.table...,应选用header=T#2.读取ex2.csv 导入后生成一个数据#ex2 <- read.csv("ex2.csv") #读入该文件后会发现原文件第一被错误当作数据而非行名,且列名.变成了-,...Rproject下,读取时候只需按文件目录格式输入文件夹名Tab即可找到#如a<-read.csv("....函数可以避免此前错误a<-fread("soft.txt",data.table = F)class(a)#但其不会有行名,且其会有一个data.table数据结构多出来,可以设置data.table

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Kmeans聚类代码实现及优化

代码分析: 表示sklearn处理kmeans聚类问题,用到 sklearn.cluster.KMeans 这个类。 X是数据集,包括220行,即20个球员助攻数和得分数。...表示输出完整Kmeans函数,包括很多省略参数,将数据集分成类簇数为3聚类。 输出聚类预测结果,对X聚类,20行数据,每个y_pred对应X一行或一个孩子,聚成3类,类为0、1、2。...表示图形题为Kmeans-heightweight Data。 表示图形x轴标题。 表示图形y轴标题。 设置右上角图例。 表示显示图形。...二、Matplotlib绘图优化 Matplotlib代码优化: 1.第一部分代码是定义X数组,实际读取文件进行,如何实现读取文件数据再转换为矩阵进行聚类呢?...2.第二部分是绘制图形,希望绘制不同颜色及类型,使用legend()绘制图标。 假设存在数据集如下图所示:data.txt 数据集包括96个运动员数据

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Day5

github最新版本R包安装有问题:1.安装旧版本,需要github软件2.从别的已安装该包电脑上偷一个:使用 .libPaths() 命令找到与包同名文件夹,编译好R包,压缩打包;发给自己复制到自己...R包安装文件夹,并解压本地安装文件读写直接读取失败,需要指定一些 参数CSV文件读取:read.csv()分隔符:逗号txt文件读取:read.table()将数据文件导出成表格文件write.csv...(要导出数据变量名, file = "给导出文件命名.csv")write.table(要导出数据变量名, file = "给导出文件命名.txt")R特有的数据保存格式:Rdata保存是变量...,不是表格文件,支持多变量保存到一个Rdata save()保存 load()加载文件读入各种问题1.列名位置列名没有相应位置,会导致一内容数据类型发生改变,处理起来有问题从读取函数帮助文档中找到参数解决上述问题...列名中有特殊字符时,引用时会有单引号2.一个规则:数据不允许重复行名3 矩阵和数据只能有一种数据类型,在对数据进行计算时需要注意是否为数值型数据4 列名修改library(stringr

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生信学习-Day5-数据结构

(5)向量是由元素组成,元素可以是数字或者字符串。(6)表格R语言中称为数据。(7)别只复制代码,要理解其中命令、函数意思。...会出现一个对话,让您在文件系统浏览并选择目录。选择目录,RStudio会自动运行setwd()函数来更改工作目录。...1.读取本地数据读取:read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)赋值:a=read.table(file="huahua.txt",sep="\t",...a 应该是R一个数据(data.frame)或其他类似表格结构对象。(2)file = "yu.txt": 这指定了输出文件名称,即将数据写入名为 "yu.txt" 文本文件。...(变量、数据、函数等)到一个名为"bioinfoplanet.RData"文件

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Python处理单元格将中文姓名转为英文拼音(小写,去空格)

本脚本将读取一个excel文件某个sheet页,写入到另一个文件。处理逻辑是:读取B4单元格以及其下面的单元格,将其转拼音、转小写、去空格,保存在I4!...(filePath) # 选择某个sheet sheet = workbook['XXXsheet'] # 注意步骤X是将B4点单元格数据转成英文拼音去去空格,放入到I4,这一步是不能少,否则第一个单元格...B4从上到下开始。...遍历B4 从上到下所有单元格(此方法会导致B4单元格指向I4单元格丢失,所以上文X额外处理了I4) for cell in sheet['B'][4:]: # 拿到单元格value...# 将转换值写入下一对应单元格 columnvalue是A=1,B=2,如果是I就是10 sheet.cell(row=cell.row, column=10, value=

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生信星球Day3 数据结构

a[a%in%b] #左边向量元素是否右边向量,返回布尔值a[a %in% b] #根据TRUE取a[!...赋值:从文件读取read.table() #从文件读取数据,sep表示文件分隔符,header表示第一行是否为标题行read.csv() #读取文件,默认sep为",",header为TX...#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改X<-read.csv(file = "huahua.<em>txt</em>",sep="",header=T,row.names=1) #重新赋值...X,最后row.names意思是修改第一为行名从数据中提取元素X[x,y] #第x行第yX[x,] #第x行,注意逗号前为行,逗号或无逗号为X[,y] #第y,等同于X[y] X[a...:b] #第a列到第bX[c(a,b)] #第a和第bX$列名 #也可以提取,但只能提取一导出数据write.table(X,file="yu.txt",sep=",",quote=F

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生信学习小组Day5笔记—Chocolate Ice

R语言数据类型与对象类型R数据类型主要有三种:a = 1 #数字b <- TRUE #逻辑b = "abc" #字符串R对象类型主要有六种向量(vector)**列表(list)矩阵(matrix...行列之间数据类型可以不一样(矩阵内每个元素都必须是一样数据类型)读取本地数据工作目录下新建文本文件(.txt),粘贴以下内容X1 X2A 1B 2C 4D 3E 7尝试使用...read.table()以及read.csv()读取数据小贴士:默认从工作目录内提取文件,所以最好把数据保存在工作目录下,方便数据提取设置行名列名X<-read.csv('test.txt') #这里变量...,R会自动补为x,用这个命令来修改X<-read.csv(file = "test.<em>txt</em>",sep = "",header =T,row.names=1)#最后row.names意思是修改第一为行名...X$列名#也可以提取(优秀写法,不过只能提取一)课后问题请在作业回答一个问题:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决

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20231220-简单文件格式读取

简单复习上一节内容 1认识csv格式 csv格式是以分割符(逗号,空格,制表符\t)分开内容纯文本文件,EXCLE打开csv文件是识别分隔符,把内容装进格子里,R语言打开csv文件,是把纯文本文件装进一个数据...,R语言中,对数据进行操作,相应改动不会被同步到csv文件 如果想要对原本文件进行修改,把修改内容重新写为csv文件 write.csv(x,file="x.csv") 一个文件本质是由生成它函数决定...="x.R.data") 保存Rdata load("x.Rdata")加载 R.data 3默认参数不适用读取文件所导致隐形错误 (1)读取txt文件,没有正确识别列名 修改办法 read.table...=1,check.names=F) (3)数据不允许重复行名 如果读取失败需要先去重复,来设置行名 (4)有时数据中有一些缺失值,文件读取失败 解决办法:read.table("x.txt",header...=T,fill=T) 把缺失值用NA来代替,但R语言读取TXT文件时,会把所有的空格识别为一个分隔符,直接把数据识别为前一行数据,然后把数据用NA来补充。

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生信技能树学习笔记1

R Markdownknitr::knit("")转换为md文件is.numeric("A") ## [1] FALSE##是否为数值型数据,返回值为TRUE或FALSEas.numeric("4")#...# [1] 4第一讲:认识R" > "R语言中是命令提示符()前面的单词是函数getwd()获取绝对路径路径补充文件桌面上,不在工作目录下,怎样读取绝对路径,换了电脑就读不成功x1 = read.csv.../x.csv") 把x.csv放进了工作目录下test文件夹里x1 = read.csv("test/x.csv")把整个biotrainee换个位置或者发给别人,仍然可以读取成功字符型数据:"a",...数据结构向量(一串数据数据单独拿出一是向量,视为一个整体,一个向量只能有一种数据类型,可以有重复值)数据(约等于表格,一只能有一种数据类型)矩阵列表4.1 向量生成c(2,3,15,5,7...连接函数一个向量中有不同数据类型时有优先级c(1,"a")## [1] "1" "a"c(TRUE,1)## [1] 1 1#C(FALSE,"a",TRUE)变量名取名规则:x_1,x.1,b1,A

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【生信技能树培训】R语言中文件读取

**R语言中读取CSV如:test= read.csv('ex3.csv')即将ex3.csv内容提取出来,传递给变量test,生成一个数据。后续对数据操作,对文件无影响。...二、R语言读取文件函数read.csv() : 通常读取csv格式,但也可以读取其他纯文本文件read.table() : 通常用于读取txt格式文件三、 将数据导出为文件(一)导出为表格文件函数...#当指定fill参数为TRUE时,读取文件时,会自动将空行地方填充成NA。但是,当出现某些行间隔空缺时候,会将空行内容补充到前一空行来,从而造成数据错乱。见下图。...图片单独指定fill参数为TRUE时,E826行开始内容会被移动到D空行。见下图。**原因在于,用纯文本查看文件时会发现,862行之后第4与后面的内容之间有两个制表符分隔。...Excel可以正确识别两个制表符,知道两之间有一个,而R语言中该函数无法识别。

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2023.4生信马拉松day5-文件读写

③ sublime打开(适用于大文件) ④ R语言打开 #1.读取ex1.txt ex1 <- read.table("ex1.txt") 注:文件读取R语言里数据来源之一;表格文件读到R语言之后得到一个数据...,check.names = F) #把第一设置为行名,不改特殊字符 ③ 数据不允许重复行名,否则会报错; 图片 解决办法:先不加row.names参数读进来,然后处理第一重复值(如两取平均...T,sep = "\t") #避免sep把两个制表符识别成一个,把所有看不见东西都识别程一个制表符 3.将数据导出成为表格文件 读取→编辑修改→导出 write.csv(test,file="example.csv...,这一步之后class(x)会发现依然不是数值型 mean(as.numeric(x)) 注意: 矩阵只允许一种数据类型,要改得整个矩阵一起改(不能单独改某一数据类型);或者先把矩阵改成数据再改某...; 要经常检查自己数据; 哑巴地雷-不报错但错了代码: save(test,file="example.csv") 6.用于读取/导出文件R包 如果一个数据用read.table读取有问题的话换一个函数或许会更方便

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R语言︱文件读入、读出一些方法罗列(批量xlsx文件数据库、文本txt文件夹)

可能是R读取路径时,对x86这样文件夹不大好识别吧,第一次装在x86里,读取是失败。 2、R中加载环境,即一行代码,路径要依据你java版本做出更改。...WPS调用VBA需要额外下砸一个插件, 之后应用list.files以List方式读入。...——需要read.xlsx这一步骤 ##批量读入文件xlsx文件 #如何批量读取一个文件各种txt文件 micepath <- "C:/Users/long/Desktop" micefiles...)、然后生成数据(as.data.frame) ##批量读入txt文件,并将文本放入同一个数据 reviewpath <- "F:/R语言/R语言与文本挖掘/情感分析/数据/rawdata/review_sentiment...4、到此,打开合并f:\111.txt,即可看到多个Txt文件都已按顺序合并到F盘111.txt文件

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Day5-李泽平-R数据结构初学

R数据结构一、基础认识(1)R代码都是带括号,括号必须是英文;(2)显示工作路径getwd()(3)向量是由元素组成,元素可以是数字或字符串(4)表格R语言中称为“数据”(5)查看帮助:?...(一)标量和向量元素:指的是数字或者字符串(用chr表示)等标量:一个元素组成变量向量:多个元素组成变量注意:一个向量是一排有序排列元素,之后可用到把一个向量作为数据。...1、获取示例数据并放在自己工作目录下(数据来源公众号生信星球)直接将下载示例数据移动到当前工作目录文件夹中了。..." # 先查看了一下当前工作目录> X X X1 X21 A 12 B NA3 C NA4 D 35 E NA2、读取本地数据示例> read.table...> a[4,2] # a第4行第2[1] 3> X[4,2] # X第4行第2[1] 3> a[1,] # a第1行 X1 X21 A 1> X[,1] # X第1[1] "A" "

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R语言快速入门:数据结构+生成数据+数据引用+读取外部数据

接下来讲一下个人认为R入门知识。...9 19 19 10 20 20 数组与矩阵类似,但其维度大于2.由于R入门基本接触不到3维以上数组概念,目前暂不展开,等入门反过来看。...R语言中数据输入需要设置数据读取路径,一般将数据文件放到工作目录下,这样直接就可以通过read.table等读取数据文档(不许要设置路径)。...常用参数说明如下: (1)file:file是一个带分隔符ASCII文本文件。①绝对路径或者相对路径。一定要注意,R语言中\是转义符,所以路径分隔符需要写成"\\"或者“/”。...(2)header:一个表示文件是否第一行包含了变量逻辑型变量。如果header设置为TRUE,则要求第一行要比数据数量少一。 (3)sep分开数据分隔符。默认sep=""。

1.7K20

文件读写20230204

导出txt格式:write.table(要导出变量名,file="example.txt")⚠️注意事项:导出文件时命名最好不要与原文件相同,不然会覆盖,导致原始数据丢失(3)特殊文件保存和加载:...>soft2 View(soft2)图片总结:用于读取/导出文件R包base包(常用):read.table...("ex2.csv")图片图片data.table包:fread()1) 非常方便,可以准确读取一些“问题文件”,例如刚刚有缺失空soft.txt,最好带上参数 data.table=F,可以确保产生干净数据...eg:首先设置了一个txt文件并把后缀改成mp4,使用普通音频文件打开方式会失败。...>aa$sheet1 #可以通过$sheet读取这个表格文件不同工作簿3)export() 可以把一个由多个数据组成列表输出为带有多个工作簿表格文件

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