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R」数据操作(五):dplyr 介绍与数据过滤

这里我们使用dplyr包操作2013年纽约市的航班起飞数据集(2013)。 准备 这部分我们聚焦于如何使用dplyr包,除ggplot2的另一个tidyverse核心成员。...## lag(): dplyr, stats 注意一下你导入tidyverse包时给出的冲突信息(Conflicts),它告诉你dplyr覆盖了R基础包中的函数。...,只含TRUE和FALSE fctr代表因子,R用它来代表含固定可能值的分类变量 date代表日期 dplyr基础 这部分我们学习5个关键的dplyr函数,它可以让我们解决遇到的大部分数据操作问题:...使用filter()过滤行 filter()允许我们根据观测值来对数据集取子集。第一个参数是数据框的名字,第二和随后的参数是用于过滤数据框的表达式。...dplyr从不修改输入数据,所以如果你想要保存数据,必须使用<-进行赋值: jan1 <- filter(flights, month == 1, day == 1) R要么输出结果,要么将结果保存到一个变量

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R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

网络上充斥的是data.table很好,很棒,性能棒之类的,但是从我实际使用来看,就得泼个水,网上博客都是拿一些简单的案例数据,但是实际数据结构很复杂的情况下,批量操作对于data.table编码来说,...(参考来源:R高效数据处理包dplyrdata.table,你选哪个?) ?...R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyrdata.table) 同时,data.table与data.frame数据呈现方面,还有有所不同的。...data.table中,还有一个比较特立独行的函数: 使用:=引用来添加或更新一列(参考:R语言data.table速查手册) DT[, c("V1","V2") := list(round(exp(V1...参考文献: 些许案例,代码参考自以下博客,感谢你们的辛勤: 1、R语言data.table简介 2、超高性能数据处理包data.table 3、R语言data.table速查手册 4、R高效数据处理包

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懒癌必备-dplyrdata.table让你的数据分析事半功倍

接下来,我就为大家分享几个我在工作当中最常用来做数据分析用到的包,dplyrdata.table,我保证你get到这两个包后,就再也不想用R里面自带的基础包函数进行数据分析了!!...(贼笑中) dplyrR语言中最为重要的包(之一)! 它可以让数据分析功能更加强大,代码更加简洁。你可以随心所欲的操作它,使用它获取你想要的数据,而且它的语法非常简单,非常直白。...data.tabledplyr已经可以满足我们数据分析工作中大部分的需求,后来该包的作者又开发了一个炫酷吊炸天的包“data.table” 如果你的日常处理数据在几万到十几万行,那么用dplyr...官网上面有关于data.table包对于dplyr的提升和改进: ?...作为课代表的我来帮大家简单的总结一下: 我们都知道R有个令人诟病的缺点就是跑起来耗内存,data.table相对于dplyr 更快、更节省内存了!

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「Workshop」第二期:程序控制与数据操作流

涉及编程的数据和代码都会放到 https://github.com/XSLiuLab/Workshop 推荐图书 《R for Data Science》[1] 《R 语言编程指南》 《R 实战》 其他推荐见...:https://shixiangwang.gitee.io/geek-r-tutorial/expand-reading.html R 编程基础 https://shixiangwang.gitee.io...:: lag lead 聚合 dplyr:: cumall cumany cummax cummean cummin cumprod cumsum 排序 dplyr:: cume_dist dense_rank...拓展表格 expand complete 分割和连接 separate separate_rows unite 数据导出 write_* data.table 与 base 数据导入 fread 数据导出...fwrite data.table 语法 dt[i, j, by] 数据过滤与合并等操作与 R 基础语法一致,也可以使用 tidyverse 处理 整数索引 逻辑索引 命名索引 进一步的学习参考小抄、

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R tips:使用!!来增加dplyr的可操作性

的这种易用性是有代价的,假如想要对分析工作稍微增加一些编程属性时,就会发现dplyr的异常情况,比如将分组变量赋值给一个变量,使用变量来进行分组: ### 分组变量group_var无法完成工作 group_var...R中代码的运行过程 在介绍!!运算符之前,有必要先了解一下R中的代码是如何运行的。 在R console中输入一个代码,R就会返回代码的结果。...一个代码在R console中是直接运行到结束的,如果想要获得其中间态:语句,可以使用expr函数来捕获它。...为了可以让它执行,我们可以需要告诉dplyr,先对group_var求值,获得真正的分组名:gear,使用gear进行后续操作,这个先求值的操作可以通过!!运算符来完成。...也不局限于dplyr,它是R MetaProgram的一部分 比如对于ggstatplot包而言,它是一个统计及绘图的包,常规使用如下: ### 两种写法都可以 mtcars %>% ggstatsplot

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经验总结 | 最有效的R学习路径(一)

那么R中有哪些适合数据处理的工具呢?首先大猫告诉大家:不要使用内置的data.frame,不要使用内置的data.frame,不要使用内置的data.frame!重要的事情说三遍!...大猫在这里建议大家在以下两个包中选择: data.table vs. dplyr 简单而言,data.tabledplyr的功能类似,但是根据世界上最大的程序(同)员(性)交(交)流(友)网站stackoverflow...上的讨论,data.table在语法灵活性和performance上面更深一筹,dplyr则在易学性和SQL语句转换方面有独到之处。...注1:图中,Arun是data.table的coauthor,Hadley是dplyr的author。...大猫不建议去cousera.org上看R的相关教程,因为他们1)太基础;2)没有侧重介绍data.table或者dplyr的课程。

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从一件数据清洗的小事说起

” 本期“大猫的R语言公众号”由“村长”供稿。村长,数据科学、指弹吉他及录音工程爱好者,浙大金融学博士在读,在data.table包和MongoDB的使用上有较多经验。...实际上,for循环“只会在不恰当使用时”降低性能。 然而大佬毕竟是大佬,用科学的态度做了实验并给出了结论: ?...其实这一期这么扯淡的讲这么多事情,只是为了说明一点,data.table真的有很好的性能,尤其在处理海量数据方面(在分组特别多的时候,相比dplyr和pandas有2x~10x的提升,来自官方文档)。...那么data.table的框架优秀在哪儿呢? data.table之所以比dplyr要快,在于两者设计的哲学不同。...关于如何学习data.table包,大家可以查看本公众号前几期的文章。R语言的data.table包是一个被大多数人远远低估的存在,在这里想强烈推荐给大家!!

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rdplyr 里的 join 与 base 里的 merge 存在差异

今天在使用连接操作时发现:虽然都是合并操作函数,dplyr 包里的 *_join() 和基础包里面的 merge() 存在差异,不同的数据结构,结果也会存在偏差。...::data.table(r1 = c("S1", "S2"), r3 = c("S2", "S1")), b = data.table::data.table(r1 = c("S1", "S2")...所以使用 dplyr 提供的连接函数报错是正常的,但有意思的是,基础包提供的 merge() 函数可以完成连接操作,真是优秀(感兴趣的朋友可以看下测试下 merge 函数源代码)!...data.table 构造的数据集结果: purrr::reduce(x2, dplyr::full_join) #> Joining, by = "r1" #> Error: `by` must be...2 S1 S2 S2 S1 S2 更新 在后面的一些使用过程中发现基础包的 merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题的结果,所以建议使用的小伙伴仔细检查结果。

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R数据科学整洁之道:使用dtplyr处理大文件

有群友问如果文件比较大,读入 R 比较慢怎么办?我告诉他用 data.table 包的 fread 读取。...其实,如果习惯了 tidyverse 系列工具,用 dtplyr 也是不错的,简单理解:dtplyr = dplyr + data.table dtplyr 将 dplyr 作为前端,data.table...作为后端,这样做的好处是显而易见的: 前端书写 dplyr 语法,简单、优雅 后端自动转换为 data.table 代码,提升速度 安装 install.packages("dtplyr") 使用...要使用 dtplyr,需要加载下列三个包: library(data.table) library(dtplyr) library(dplyr, warn.conflicts = FALSE) 然后使用...dplyr 动词对数据进行操作 最后,用函数将结果转换成数据框 最后需要指出的是,dtplyr 通常没有 data.table 快,如果追求极致速度,那么应该直接使用 data.table

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谁是PythonRJulia数据处理工具库中的最强武器?

Python/R/Julia中的数据处理工具多如牛毛「如pandas、spark、DataFrames.jl、polars、dask、dplyrdata.table、datatable等等」,如何根据项目需求挑选趁手的武器...7种Python工具 dask pandas datatable cuDF Polars Arrow Modin 2种R工具 data.table dplyr 1种Julia工具...data.table、Julia中的DataFrame.jl等在groupby时是一个不错的选择,性能超越常用的pandas,详细, 0.5GB数据 groupby 5GB数据 groupby 50GB...数据 groupby join 同样可以看到Python中的Polars、R中的data.table在join时表现不俗,详细, 0.5GB数据 join 5GB数据 join 50GB数据 join...小结 R中的data.table、Python中的Polars、Julia中的DataFrame.jl表现连续出色,后续可以用起来,常用的pandas并无亮点~ REF:https://h2oai.github.io

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

参考:李东风老师的R 语言实战 1. tidyverse 系统简介 假设数据以 tibble 格式保存。...我们可以使用tidyverse 系统来操作,其中包括了magrittr 包,readr 包,dplyr 包和 tidyr 包等。...% pivot_wider( names_from = "variable", values_from = "value" ) %>% knitr::kable() 关于更详细用法,参见李东风的R...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。...R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0) 其他函数 slice dplyr 包的函数 slice(.data, ...) 可以用来选择指定序号的行子集,正的序号表示保留,负的序号表示排除。

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R数据框如何取交集

前面给大家介绍过了 ☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-ENCORI篇 ☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-TargetScan篇 有小伙伴拿自己的数据试了一下,反馈预测结果太多了。...你可以在查询miRNA靶基因的时候限定使用哪些预测软件(如下图红圈所示),这样得到的结果就是多个预测软件预测结果的交集。...那么我们怎么利用R代码来对miRNA预测结果取交集呢? 我们知道一般在R里,对向量取交集,直接用intersect函数就可以了。...包里的intersect函数 #加载dplyr包 library(dplyr) #直接利用dplyr包里面的intersect函数对数据框取交集 result2=intersect(df1,df2) #...包里的fintersect函数 #加载data.table包 library(data.table) #将数据框转换成data.table格式,然后利用fintersect函数取交集 result3=fintersect

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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

合理选择一套自己的数据处理工具组合算是挺艰难的选择,因为这个涉及到使用习惯和迁移成本的问题,比如你先熟知了R语言的基础绘图系统,在没有强大的驱动力的情况下,你可能不太愿意画大把时间去研究ggplot2,...data.table 1、I/O性能: data.table的被推崇的重要原因就是他的IO吞吐性能在R语言诸多包中首屈一指,这里以一个1.6G多的2015年纽约自行车出行数据集为例来检验其性能到底如何,...dplyr::fliter() %>% select() %>% group_by() %>% summarize() 虽然可以借助管道函数进行代码优化,但是仍然无法与data.table的简洁想抗衡。...data.table列索引 列索引与数据框相比操作体验差异比较大,data.table的列索引摒弃了data.frame时代的向量化参数,而使用list参数进行列索引。...当聚合函数与data.table中的分组参数一起使用时,data.table的真正威力才逐渐显露。 mydata[,.

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