大家对通路富集分析应该很熟悉,今天给大家介绍下那些漂亮的可视化展示。...我们需要用到包ReactomePA,这个包主要是基于Reactome数据库进行通路富集,此包支持including ‘celegans’,‘fly’, ‘human’, ‘mouse’, ‘rat’,...:
##数据载入
library(ReactomePA)
de <- c("4312","8318","10874","55143","55388","991")
fold=c(1.6,2,4,3,1.9,4,7...##单通路的富集结果展示
gseaplot(y, geneSetID ="R-HSA-69242")
?...至此整个的功能介绍结束,在此需要注意的是可视化的网络图尽量直接生成在文件中,否则可能网络的边不会显示。