❝今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上「自定义修改轴文本颜色」，也许恰好您正好有此特殊需求，希望对各位观众老爷有所帮助；下面来看具体案例； ❞ 加载R包 library(tidyverse...geom_text」在图形内部添加文本并定义颜色，那如果我们要在图形外部修改轴文本颜色该如何操作，当然有更加简单的方法请往下看 ❞ 构建数据 df % arrange(id) %>...legend.key.width=unit(0.3,'cm'), legend.key.height=unit(0.3,'cm'), legend.position="top") 一个基础的条形图而已...(axis.text.y = element_text(colour=x_cols)) 可以看到每一组只对应一种颜色，如果我们想自定义任意文本颜色那，继续往下看 自定义个数 x_cols ggplot2会显示如下警告信息，是不是发现了什么；感觉挺有趣的 ❝Warning message: Vectorized input to element_text() is not
一个示意图如下图所示，其实此图中的GO Terms长度相对是可以接受，实际情况下可能会遇到非常长的GO Terms，导致整个图的比例非常失调。...由于dotplot绘图的图像是一个ggplot2对象，其实使用scale系列函数就可以达到目的。...有的时候，ggplot2图是经过坐标轴变换的，如使用coord_flip进行x、y轴反转。此时竖直的坐标轴实际上是x轴，需要使用scale_x系列函数控制。...= TRUE) 这个图直接使用scale_color_discrete进行修改是不会有任何改变的，因为这个图的color映射并不是ggplot2的默认情况，而是使用ggraph的geom_edge...图层定义的，需要使用ggraph特别定义的一个scale函数： cnetplot(ego, colorEdge = TRUE, circular = TRUE) + ggraph::scale_edge_color_discrete
image.png 对照论文然后看数据和代码，能够更好的理解论文的设计和分析思路，非常好的学习素材。论文的主要研究内容还没有看太懂，好像是研究了越南和坦桑尼亚的一些厕所的微生物多样性。...数据集的部分截图，总共是81行，52列，行是物种，列是地点，数值代表物种丰度 ?...row.names=1指定第一列作为数据集的行名 check.names 参数我平时很少用，，查了一下帮助文档，作用是检查每列的名字是否符合规范 ?...(Samples),transform,rescale=sqrt(Value)) ggplot2画图 library(ggplot2) p ggplot(df, aes(Species, Samples...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本
image.png 今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式，查了一下如何实现 记录一下代码 首先是构造一份数据集 df<-data.frame(x=1,y=1) R语言ggplot2...散点图并添加文本 library(extrafont) fonts() library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_text(label=...对应关系可以在链接 https://www.rapidtables.com/code/text/unicode-characters.html 查看 设置横坐标的标题 library(ggstar) ggplot...-axis-labels-ionic-chemical 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；...2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！
在绘制柱形图的时候， 我们经常会遇到Y轴部分数据范围很广的情况。有些数值很大，但是有些有非常小，不在一个尺度范围内。...如果直接使用最大值作为y轴的范围，那么那些数值很小的柱子就会显得很矮，画出来的图会很难看。遇到这种情况我们该如何处理呢？今天就给大家分享一下截断Y轴的柱形图。...axis.break(4,from*(1+0.02),breakcol="black",style="slash") axis(2,at=from,las=2,bty="n") # 如果想要去掉上、右框，...可以去掉gap.barplot(y,gap=c(from,to),las=2)中的 las=2或者最后一行加上 par(bty="n")
目前计划推出基础图表的绘制教程推文(会同时推出R和Python两个版本)，原因在于有时苦苦找不到数据，不仅导致想绘制的图表完成不了，而且也白白浪费了时间，再者也有小伙伴私信要求多些基础教程的推文，当然...geojson数据格式读取 ggplot2 可视化展示 openxlsx 实现R灵活读取excel文件 ggtext包实现文本定制化操作 geojsonio包对geojson数据格式读取 这里使用的数据和上期推文的数据一样...，读取geojson格式文件的代码如下： HK <- geojson_read("香港特别行政区.json",what='sp') 即可实现R语言对geojson格式地图文件的读取。...ggplot2 可视化绘制 简单绘制 我们只是对处理过的数据进行简单的绘制，代码如下： # Plot it library(ggplot2) HK_map ggplot() + geom_polygon...包 library(ggtext) #需要定制文本的地方 labs( title = "香港在售二手房分布图", subtitle="数据来源: <span style
参考链接 1、https://ggplot2.tidyverse.org/reference/sec_axis.html 2、https://www.r-graph-gallery.com/line-chart-dual-Y-axis-ggplot2...版本遇到的报错，没有找到解决办法，换成R4.1.0之后运行成功了 我将示例数据保存下来了，如果以上代码没有运行成功，可以在公众号获取数据，保存数据的代码 save(df_day,df_hour,df_normal...df_normal这个数据集 df_normal dim(df_normal) 首先是一个柱形图，但这里的柱形图是通过geom_segment()函数实现的 library(ggplot2) library...yend = -30), size = 8, colour = gray(0.5)) 对x轴操作的代码...，添加双坐标轴的代码 ggplot() + theme_bw() + geom_segment(data = df_normal, aes(x = date,
这种图叫玫瑰图或者花瓣图，如果使用R语言的ggplot2来做的话， 比较常规的实现办法是先做柱形图，然后再用极坐标，比如 df的图。...，我们试着用R语言的ggplot2试一下 假设我们有10个数据 x<-1:180 x y<-sin(10*x*pi/180) df<-data.frame(x=x,y=abs(y)) df$yz的代码 library(tidyverse) library(ggplot2) set.seed(123456) df的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用packcircles来计算圆圈大小通过ggplot2来绘制圈图，下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用，添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢...❞ 加载R包 library(tidyverse) # install.packages("packcircles") # 如果没有安装packcircles包，可以先安装 library(packcircles...npoints = 50) # 为每个圆圈指定一个title，用于绘制文字标签 df$title <- df_plot$title[match(df$id, df_plot$id)] 数据可视化 ggplot...scales::comma(github_language_repos)),size = 3) + coord_equal() + # 设置坐标轴等比例 theme_void() + # 设置空白主题...，即无背景和坐标轴 scale_pattern_filename_discrete(choices = image) + # 设置图案的选择 theme(legend.position = "none
云雨图的样子如下 ?...是一半的小提琴图加散点图的组合，看起来有些像云朵加雨滴的形式，所以得名云雨图，主要的作用还是用来展示数据的分布情况 之前看到过相关推文进行介绍，大部分的推文介绍的实现办法都是使用gghalves包，这个包中的函数可以将...ggplot2的常规图形只画其中的一般，比如 geom_half_boxplor() geom_half_violin() 最近在一个介绍ggplot2扩展包的链接里发现了一个包叫see，这个包里有一个函数是...geom_violindot()函数，画云雨图非常方便，下面简单介绍一下代码 首先是安装see这个R包 install.package("see") 使用鸢尾花的数据集作图 library(ggplot2...试了其中的几个，发现这个配色还挺好看的 ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length,
R语言不仅提供了基本的可视化系统graphics包，简单的图+修饰，例如：plot、 hist(条形图)、 boxplot(箱图)、 points 、 lines、 text、title 、axis(坐标轴...)等；还提供了更加高级的图形系统lattice和ggplot2. base基本图形系统相关内容可参照：《R语言 图形初阶：hist、plot和图形布局layout | 第6讲》，作为R语言图形绘制的入门一节...绘图系统 ggplot2初识 更多下期详解 引言 不同类型变量常用的图表 连续数值变量 一个数值变量可以用：柱状图，点图，箱图 两个数值变量可以用：散点图 分类变量 一个分类变量的可视化：频率表，条形图...主要变量即为图形的两个坐标轴，其中y在纵轴上，x在横轴上。变形：单变量绘图，用 ~ x 即可；三维绘图，用z ~ x*y；多变量绘图，使用数据框代替y ~ x即可。...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离，然后按图层叠加的方式作图，通过+进行叠加。
代码 library(ggplot2) ggplot()+ geom_point(aes(x=1,y=1))+ theme(axis.title.x = element_text...(margin = margin(2,1,0,1,'cm'))) image.png 欢迎大家关注我的公众号...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
之前的推文介绍了画柱形图展示富集分析的结果R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果，今天的推文介绍一下画气泡图展示富集分析结果的代码。气泡图就是散点图的一个变种。...多了一个变量映射给点的大小，富集分析里通常是用来映射基因的数量。比如下图 image.png 示例数据集还是之前的KEGG富集分析结果。...library(tidyverse) dat %>% filter(Corrected.P.Value dat01 dim(dat01) dim(dat) 最基本的图 library...(ggplot2) dat01$GeneRatio<-dat01$Input.number/200 ggplot(dat01,aes(x=GeneRatio,y=Term))+ geom_point...("paletteer") library(paletteer) #paletteer_c("ggthemes::Orange-Blue Diverging", 50) ggplot(dat01,aes
最近在使用ggplot2对箱线图叠加点图是发现奇怪的现象，只要我改变点的形状，绘图就出问题了。 下面我通过一个简单的示例展示这个问题。...我们先生成一组简单的数据，并绘制一个正常的叠加图： library(ggplot2) library(dplyr) head(mtcars) ## mpg cyl...= shape), position=position_jitterdodge()) 如果我们对比上面这个图和第一个图，很容易发现点的坐标变化了！...最后我把问题抛到了stack overflow，很快Jon Spring 进行了解惑： 在这种情况下，我们希望位置抖动“意识到”存在填充美学映射的两个分类。...因为这里的形状没有填充美学映射，在应用抖动之前，该层不会自动分离两个填充分类值。
image.png 之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法，这个是气泡图，用ggplot2很方便能够实现，但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片，当然出图以后用其他软件来编辑是可以实现的，但是对齐之类的可能会比较麻烦...如果能用代码实现就能节省一些时间，正好最近看到一个ggplot2的扩展包 叫做 ggimg 对应的github的主页是 https://github.com/statsmaths/ggimg 下面我们就来试试能不能用这个包来实现推文开头的图...(ggimg) library(ggplot2) ggplot()+ geom_point_img(data=df, aes(x=x,y=y,img=img),...vjust = 1)+ coord_cartesian(clip = "off") dev.off() 结束语：不知道威少搭配詹姆斯最后能出一个什么效果，之前记得有一个记录是 同一个队一场比赛中两个人同时拿三双...这个记录应该能被威少和詹姆斯预定了吧 哈哈哈哈 示例数据和代码直接在后台回复 20210730就可以获取了 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R
"))#在国外的话可以跳过这一步2.安装画图所需要的包#安装R包if(!...)library(ggpubr)library(eoffice)library(patchwork)第二步·开始学习画图常用的R包画图：“base”，“ggplot2”，“ggpubr”拼图：“patchwork...alpha = 0.5, # 透明度 50% shape = 8) # 点的形状#mapping可以省略，aes必须写2.2映射：按照数据框的某一列来定义图的某个属性ggplot...#所以scale_color_brewer没有设置成功snipaste软件可以在截图的时候查询为十六进制颜色编号Q2 区分color和fill两个属性Q2-1 空心形状和实心形状都用color设置颜色ggplot...3.几何对象的局部设置与全局设置统一范围内的两个点坐标没有区别#局部设置和全局设置ggplot(data = iris) + geom_smooth(mapping = aes(x = Sepal.Length
之前分享过一篇推文介绍过这个内容 R语言ggplot2包画曼哈顿图的一个简单小例子，但是当时自己不太懂曼哈顿图，实现是直接借助ggplot2的geom_jitter()这个函数实现的。...这个函数并不会考虑每个变异位点的位置，而实际的曼哈顿图是需要根据变异位点的位置来画的。今天的推文重新介绍一下ggplot2绘制曼哈顿图的代码。...R语言中也有现成的包和函数可以直接画曼哈顿图，我这里选择用ggplot2来画是因为出图后可以非常方便的组合其他的图，比如可以叠加一个基因结构的图，然后再拼一个展示不同基因型表型差异的图。...这些如果是用ggplot2来做，都可以用代码实现，省去了手动拼图的过程。...，我这里的示例数据是每条染色体的长度多加了10M chr.lenR_4_1_0_working_directory/env001/data/20230912/at_gwas.xlsx
gg.gap诞生记 “站长，小站工具qPCR在线分析功能非常好，但有些基因的表达量太高了，图做出来值非常大，能否想prism那样把y轴做个截断呢？”...面对的疑问，站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富，原以为在网络搜索一下肯定有解决方案，但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...一顿野路子代码操作，beta版出来了：gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割，而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神（微信ID:一棵树）精通R包制作，为了让野路子出来的代码更完善，拉上树神一起干，不仅实现截取多个截断，还可以对任意ggplot2对象进行截断，再不断测试修补bug之后，gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线...install.packages("gg.gap") 都能切什么图，切几段 理论上，ggplot2的图都能切，想切几段切几段。
5.8 ggplot2简介 5.8.1 什么是ggplot2 ggplot2是由Hadley Wickham设计的R软件包，它有助于数据绘图。在本实验中，我们将简要介绍该软件包的一些功能。...5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据，则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式，例如。...散点图，条形图，箱形图等。 5.8.3 使用aes映射功能 该aes函数指定数据框中的变量如何映射到绘图上的要素。...ggplot并向下滚动帮助页面。底部是ggplot包索引的链接。滚动索引，找到geom选项。 5.8.5 从两个以上的细胞中绘制数据 到目前为止，我们一直在考虑数据框中2个细胞的基因数。...但是我们的数据框中实际上有10个细胞，比较所有细胞会更好。如果我们想同时绘制来自所有10个细胞的数据怎么办？ 目前我们不能这样做，因为我们将每个单独的细胞视为变量并将该变量分配给x轴或y轴。
偶然间在github 上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材 链接是 https://github.com/blmoore/blogR ，主要内容有 image.png 光看这个可能有些枯燥...大家感兴趣的话可以自己研究研究 我们直接运行画图代码 加载ggplot2 library(ggplot2) 最基本的热图 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c...)) + geom_tile() image.png 调整热图方块的一些内容 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour...调整热图的颜色和图例 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour="white", #linewidth...欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记
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