2、作用：实现特定的功能，你需要什么功能，安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机，需要使用微信与人聊天，你就按照微信APP，需要上腾讯视频看电视剧，你就安装腾讯视频APP。...R包，使用 “BiocManager::install()来安装 （3）github网站，是R包作者写的，没有经过审核，使用”devtools::install_github...几乎不使用，使用时需要写明R包的作者，就是指明选择谁写的R包。...说人话，智能手机安装的腾讯视频，只要你不卸载，就一直在你的手机里，需要看电视剧是打开APP，看完电视了你退出APP，再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。...5、如何实现快速下载 如果官网速度慢，请使用镜像网站 图片 图片 官方网站CRAN网站的镜像使用方法1，Bioconductor网站的镜像使用方法2，方法2也适用CRAN 三、安装R包会遇到问题
R语言是一个强大的数据分析工具，其强大之处在于有各种各样的R包帮助其实现各种各样的功能。...通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github...，github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名，否则无法进行下载安装。
安装R语言的包的方法： 1....自动安装（在线安装） 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl...手动安装（离线安装） Windows: 下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” 选择package.zip...文件 Linux上安装R包（离线安装）: 下载package.tar.gz文件 在Shell终端（注意不是R）输入: sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 注意：需要sudo...查看全部安装的R包： .packages(all.available=T) 查看某个安装的R包： library("XML") help(package="XML")
r语言的包中，集成了众多函数，大大扩展了r的功能且降低了使用难度。本篇文章就来介绍r语言中包的两种安装方式：install.packages和从github安装包。...install.packages() install.packages()是从镜像安装包，在括号中输入包的名称字符串就可以完成包的安装。...语句中的 AnomalyDetection为包名，twitter为仓库名。很明显，安装包时还需要知道仓库名，为我们带来了不便。...本方法的缺点在于，因为要进行搜索，所以运行耗时较长。 除上述方法，通过本地安装包也是常用的方法之一。...但实际操作中，经常会遇到要安装一个包要先安装很多包的情形，因此本地安装方法有时可操作性较差，因此不在这里详细介绍。
为了大规模安装所需要的R包，你可以使用几种不同的方法。...以下是两种常见的方法：常用安装install.packages函数是我们常用的安装R包的方式，需要注意的是这些R包必须是在CRAN仓库中，否则安装将会失败。...该项目是存放了大量用于生物研究的R包，很多做生物信息分析的人都会使用里面提供的R包。它的安装包是通过BiocManager包提供的install函数实现的。...构建函数，使其具有如下功能：判断未安装R包；使用 install.packages或BiocManager::install函数安装来源你不同的R包；用lapply分别加载R包，并不输出加载过程中产生的信息...R包外，还可以通过已经构建好的R包内置函数安装，例如现在比较友好的R pacman，它提供的p_load函数其实可以看成是上述InstallPackageFun的升级版本。
自杀式R包 只能安装成功一次，再次重复安装就会报错。 R包的依赖处理非常奇怪，随着安装R包的数量变多，有较大概率会遇到R包依赖崩溃的情况。...如果是在Windows平台下，那么应该首先检查R包安装路径是否有问题（使用.libPaths()函数查看），尽量不要安装到".RLibrary"之类的无版本依赖的文件夹中。...而如果是linux平台下或者包安装路径并没有“.RLibrary”之类的文件夹， 那么注意R包的安装或者载入过程中是否出现如下warnning或error： Error in completeSublasses...如果大家搜索过这个错误会发现遇到这个问题的人还挺多的，而且看起来他们的解决方案相对是没有切合问题本质或者是比较偶发的解决方案：如重新安装一个R包，修改R包的载入顺序等等。...Suggests依赖项的包可以缺失，而Depends和Imports中的依赖项是需要先于当前包安装的。当前包载入后，所有Depends中的R包也会被载入。
本文介绍对 R 的安装与配置，以 Windows 系统为对象进行操作，其他操作系统过程类似。本文算是一个老司机的经验之谈，初学者按照操作配置可以减少以后不必要的麻烦，对于其他读者，希望也有所启发。...，下载https://download1.rstudio.org/desktop/windows/RStudio-1.2.1335.exe （可选）安装Rtools，这个是用来编译源码包的，一般是含有其他语言写的包需要该步骤...配置 Windows R 默认使用用户文档目录作为家目录（等同于 Linux 中的 ~），使用系统指定的临时目录作为临时目录，使用安装路径下的 R版本/library 目录作为 R 包存储目录。...如果你什么都选择默认的， 当你一时安装包过多，或者装了电脑管家之类的管理软件时，系统的临时目录经常会把 RStudio 锁死，导致不能进行读写。...当你想要更新 R 版本时，你不得不面临重装所有包的举动（如果你使用几个月，装了几百个包~~），或者想其他办法解决。 下面就是教你自己创建自定义的临时目录与包目录，这样上面情况都不会发生了。
ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...ChAMP的功能确实是更加的强大和完整，同时也意味它的依赖包会特别的多，从而出现dll文件达到上限的错误。本文记录的解决方案，适合于任何操作系统，希望可以帮助到大家。
install_version()： require(devtools) install_version(“ggplot2”, version = “2.0.0”, repos = “https://cran.r-project.org.../src/contrib/Archive/ggplot2/”) 除此之外，还可以直接从源代码安装： packageurl r-project.org/src/contrib...现在打算不定期更新记录一些笔记，公众号也会将简书的内容整理一下发布~
，不用查说明文档了…… R语言包，就是别人编写好的程序、函数放到一起，你直接用就可以，不用重新编写，大部分的R包在CRAN中，用install.packages进行安装，还有一些在bioconductor...下面介绍一下如何查看已经安装的R包，应用场景很多，主要就是你想在另外电脑上配置同样的环境时，直接按图索骥就行了。当然，更简单的是把包直接copy进去，安装相同的版本，直接用就行了。...下面介绍几种R包的管理，包括如何查看已经安装的R包，如何查看已经加载的R包，如何安装R包，如何删除R包，如何查看R版本，如何查看R包的版本，所谓的一答解千文，就是说的本篇呀！ 1....查看已安装的包 installed.packages() 它会给出来，所有已安装的R包的详细信息，包括包名，路径，版本，优先级，建议等，提取已安装的包名： as.data.frame(installed.packages...安装和卸载R包 安装R包，如果是在CRAN中，直接用install.packages()， install.packages("ggplot2") 加载一下，看看是否成功： > library(ggplot2
大家应该很熟悉windows下的R语言，并且也知道如何安装R包。但是呢，如果对于我们这种Linux小白很好奇那些只有在Linux下才能用的包怎么能让我们在windows下体验下呢。...那么，作为神一样的R语言简直无所不能，他们开发了Rtool，这个工具不仅是为创建R包用的，同时也可以让那些以gz结尾的R包可以安装在windows环境下。...今天我们就来介绍下R语言与Rtool结合后是如何玩转R包的。...接下来就是R语言的安装了，这个我就直接略过。接下来进入核心知识。...接下来将是见证奇迹的时刻了，填充好title后再次运行编译程序： ? 那么我们的R包建好了，当然R包也是gz结尾的，意味着只有Linux下是好用的。
---title: "R包的三种安装方法"output: html_documentdate: "2023-03-11"---R包可以理解为是多个函数的打包存放，R语言中特定的分析功能需要用相应的R包实现...，那么R包应该怎么安装呢？...1.下载前我们可以先设置镜像网站加快R包的下载速度，再安装R包清华镜像http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...2.检查R包是否安装成功R包安装成功的唯一标准library（）没有error！library(tidyr) require(tidyr)3.避免R包重复安装的方法if(!...require(stringr))install.packages("stringr")# 在包未加载成功的情况下则执行if后面的函数，即安装R包# 包加载成功的情况下，则不执行安装该包的命令
安排新来的实习生整理最简单的GEO数据库的表达量芯片数据处理代码，有一个拼图的需求，不知道为什么实习生找到了一个customLayout包，但是无法安装和使用它，所以求助了我。...我看了看，直接安装customLayout确实会报错： 报错 简单的搜索一下customLayout的官网 ： customLayout的官网 可以看到每个包都可以通过这样的URL查询： https...://cran.r-project.org/package=customLayout 会根据包的情况自动跳转，这个包就进入了：https://cran.r-project.org/web/packages..._0.3.2.tar.gz' install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source") 大概率是缺这个退出历史舞台的R包的相关依赖包，比如我电脑就缺了一个...，需要先单独安装它依赖的包即可 ： 单独安装 是不是很简单啊！
可以在开始菜单看到安装好的RStudio和R软件。...可点击Console字符串旁边箭头的来更新，如下图。 4.2 Plots：画好的图将在这里显示。 4.3 Packages：显示已经安装好了的包，打勾代表已经加载。...安装Package点击Install，然后输入包名；也可在Console中输入相应代码来安装包，比如install.packages(‘data.table’)将安装“data.table”这个包。...老版本的R安装包下载链接，Windows：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/，Mac： https://cran.r-project.org...包安装镜像切换 由于网速慢的原因，有时安装包会安装失败。
"E:/Program Files/Microsoft/R Open/R-4.0.2/library" 虽然贡献并不大，但这里我还是决定修改一下默认的安装位置： 现在已经安装好的R 我就暂时不管了。...因为我们可以为R 读取包的路径设置多个，接下来我还做了一些其他设定： 增加一个机械硬盘中的目录，专门给那些大的R 包准备，比如基因组数据等等； 增加一个固态下的目录，并同步到坚果云等同步盘中，文件名设置为操作系统...-R版本的格式，专门存放那些经常使用且内容并不太大的R 包，比如哈德雷老哥全家套等等。...那么该如何在特定情况下，将R 包安装到指定位置呢？...(qq.com) 这里再多一嘴destdir 参数，它表示下载的R 包压缩数据存放的位置，默认为NULL，表示将默认下载到R 启动所在的工作目录，比如你用的Rproj 则在Rproj 下。
本文主要结构： 一、下载最新版本的R 二、最新版本R的下载与安装步骤 三、下载指定版本的R 一、通过清华镜像网址下载：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN...二、R语言下载与安装的步骤： 1.进入官方网址：https://www.r-project.org,点击download R ? 2.点击任一中国镜像网址均可 ?...下载完R安装文件后，运行安装文件并按照提示进行安装，安装完成后，可以点击R图标启动R软件。安装时建议安装在有一定闲置空间的硬盘中，后续安装R包后，R的安装文件夹会占据数G硬盘空间。...安装方法： Windows系统：下载后运行下载的安装包，按照安装向导进行安装。默认情况下，R会安装在C盘的Program Files文件夹下。...以上是安装的最新版的R程序，因为一些R包并不支持最新版的R，所以我们可以再下载一个旧版本的R进行安装，如下图点击Previous releases。电脑支持安装多个版本的R程序。 ?
这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...安装新版本的 Bioconductor R 包 Bioconductor 是与特定版本的 R 绑定的，正常来说当 Bioconductor 的包都来自同一版本时，它们的效果最佳。...Bioconductor 开发的，在低版本的 Bioconductor/R 中直接执行BiocManager::install("package")，安装得到的 package 版本默认是与当前版本...源码方式安装 如果想要在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中安装 DiffBind==3.4.0，可以直接通过源码包的方式安装： > packageurl 安装体积比较大的 R 包 安装 CRAN 或者 Bioconductor 中一些体积比较大的 R 包，如果网络不太好，经常可能会出现包下载不完（Timeout of 60 seconds was reached
1. rpm包的管理 介绍： 一种用于互联网下载包的打包及安装工具，它包含在某些Linux分发版中，它生成具有RPM扩展名的文件，RPM是RedHat Package Manager（RedHat软件包管理工具...2. rpm包的简单查询指令： 查询已安装的rpm列表 rpm –qa | grep xx（q表示query，a表示查询所有，grep表示过滤） 例如：查询Linux中是否安装有firefox rpm...rpm软件包 rpm -qa | more ：查询所安装的所有rpm软件包 并且分页显示 rpm -qa | grep X [rpm -qa | grep firefox ] ：查询是否安装有某个软件（...火狐的软件） rpm -q 软件包名 ：查询软件包是否安装 rpm -q firefox rpm -qi 软件包名 ：查询软件包信息 rpm -ql 软件包名 ：查询软件包中的文件的安装位置 rpm.../ （所有的rpm包都在这里） 点击然后拷贝到/opt目录下 cp firefox（ rpm包的文件名） 需要拷贝到的目录 （可以输入rpm包名字的前几个字母然后使用Tab键补全） ② 安装 切换到
R and GGobi》，不过，也只是适宜入门，更多更全面的还是去ggobi的主页吧，上面有各种资料以及包的更新信息！...然后，是《Applied Econometrics with R》，该书对应的R包是AER，可以安装之后配合使用，效果甚佳。计量经济学中很大一部分是关于时间序列分析的，这一块内容在下面的地方说。...此外，是风险度量与管理类。...7数据挖掘 现在相关的书籍已经比较多了,可见R语言经典书籍推荐>一文中推荐的几本书。 8附注 与数据挖掘有关或者有帮助的R包和函数的集合。...采用等价类，RST深度搜索和集合的交集： eclat 4、序列模式 常用的包： arulesSequences SPADE算法： cSPADE 5、时间序列 常用的包： timsac 时间序列构建函数
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
腾讯会议
云直播
对象存储
