installation of package ‘pillar’ had non-zero exit status * installing *source* package 'scales' ....installation of package ‘scales’ had non-zero exit status ERROR: dependency 'scales' is not available...: installation of package ‘ggplot2’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in...: installation of package ‘ggplot2’ had non-zero exit status 从日志可以看到，是因为没有ellipsis这个包，那就单独安装试试。...: installation of package ‘ggplot2’ had non-zero exit status 6.
had non-zero exit status 2: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘openssl...’ had non-zero exit status 3: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘httr’...’ had non-zero exit status 5: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘rio’...had non-zero exit status 6: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘car’ had...non-zero exit status 8: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘ggpubr’ had
Warning in install.packages : installation of package ‘oncoPredict_0.2.tar.gz’ had non-zero exit status...’ Warning in install.packages : installation of package ‘oncoPredict’ had non-zero exit status 虽然这次仍然是报错了...keeps a record of temporary installation path * DONE (oncoPredict) 看懂这些代码，需要 有R语言基础哦： 生信基石之R语言 B站的10...www.bio-info-trainee.com/4385.html 可视化专题30题：http://www.bio-info-trainee.com/4387.html 再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过...，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定
一、问题 今天想使用 R 重新对数据进行差异表达分析，在安装DESeq2的时侯，遇到下面的报错： *Error: package or namespace load failed for ‘GenomeInfoDb...于是我就按照提示安装**RCulr**, 并且也尝试了安装**GenomeInfoDb**，**GenomicRanges**，但是又遇到新的报错如下: *installation of package...RCurl had non-zero exit status* The downloaded source packages are in ‘C:\Users\sxl\AppData\Local...of package ‘RCurl’ had non-zero exit status **通过搜索发现了最终的完美的解决办法，就是直接安装二进制 binary 版本的R包。...“had non-zero exit status”（二） - 知乎 (zhihu.com) -----
‘fastICA’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/fastICA’ 对我们有很多年...R语言经验的来说，这样的报错很明显，介绍我的mac电脑的fortran问题。...不过新手可能会纠结于非零报错，没有经验就会陷入进去，以为重点是下面的报错信息； Warning messages: 1: In install.packages(...) : installation...of package ‘fastICA’ had non-zero exit status 2: In install.packages(...) : installation of package...‘isva’ had non-zero exit status 我其实很早以前就解决过，就是安装好gcc罢了。
最近在更新一个R包的时候，发生了如下所示的报错： 3: In install.packages(update[instlib == l, "Package"], l, repos = repos, :...installation of package ‘ hdf5r ’ had non-zero exit status 4: In install.packages(update[instlib =...= l, "Package"], l, repos = repos, : installation of package ‘ RcppArmadillo ’ had non-zero exit...big_sur.bottle.tar.gz Error: Permission denied @ apply2files - /usr/local/lib/docker/cli-plugins 在这样的报错的纠结中...[a/s/n]: n > library(hdf5r) Attaching package: ‘hdf5r’ 也就是说在最开始面临是否编译的选择，只需要 选择no就好了 ： Do you want
2、问题二：安装包时报错:package "xxx" is not available 代表着你的R版本有点低，你得升级一下，当然这个问题也会出现在windows系统中。...Warning in install.packages : package ‘reshape’ is not available (for R version 3.1.1) 3、问题三：安装包时报错...：had non-zero exit status 这个报错代表着，你安装的这个包，需要一些基础的包，这些基础包好像没按上。...rstudio server installation of package ‘wordcloud’ had non-zero exit status 还有这样的报错： Warning in...github中的包就必须要过rtools这关。
我就翻出来了我以前的代码，给新服务器安装R包！...，新版本的R语言3.6.0已经不再使用 if (!...，一下子就安装了几百个R包，但是呢，我在安装单细胞R包的时候居然报错了： BiocManager::install( 'Seurat', suppressUpdates = FALSE, ask = FALSE...of package ‘Seurat’ had non-zero exit status 确实很诡异，但是只要你认真看报错，就不会有大问题的！...‘rsvd’ ... ** package ‘rsvd’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** using staged installation
保护MySQL服务器 运行mysql_secure_installation脚本以解决默认MySQL安装中的几个安全问题。...Takes a file name as an argument. status (\s) Get status information from the server. system (\!)...优化MySQL MySQL Tuner是一个Perl脚本，它连接到正在运行的MySQL实例，并根据工作负载提供配置建议。理想情况下，MySQL实例应该在运行MySQL Tuner之前至少运行24小时。...实例运行的时间越长，MySQL Tuner给出的建议就越好。 将MySQL Tuner下载到您的主目录。...云关系型数据库是一种高度可用的托管服务，提供容灾、备份、恢复、监控、迁移等数据库运维全套解决方案，可将您从耗时的数据库管理任务中解放出来，让您有更多时间专注于您的应用和业务。
优化MySQL服务器 运行该mysql_secure_installation脚本以解决默认MySQL安装中的几个安全问题。...Takes a file name as an argument. status (\s) Get status information from the server. system (\....\* to 'testuser' identified by 'password'; 退出MySQL。 exit 创建示例表 重新登录testuser。...实例运行的时间越长，MySQL Tuner给出的建议就越好。 从Ubuntu的存储库安装MySQL Tuner。...MySQL Tuner是优化MySQL服务器的一个很好的起点，但是使用Linode上的MySQL为应用程序量身定制的配置执行额外的研究一定要谨慎。
强化MySQL服务器 运行该mysql_secure_installation脚本以解决默认MySQL安装中的几个安全问题。...sudo mysql_secure_installation 您可以选择更改MySQL root密码，删除匿名用户帐户，禁用localhost之外的root登录，以及删除测试数据库。...Takes a file name as an argument. status (\s) Get status information from the server. system (\...实例运行的时间越长，MySQL Tuner给出的建议就越好。 从Ubuntu的存储库安装MySQL Tuner。...输出将显示两个感兴趣的领域：一般建议和要调整的变量。 MySQL Tuner是优化MySQL服务器的一个很好的起点，但对于在Linode上利用MySQL的应用程序定制的配置进行额外的研究是明智的。
[how-to-install-mariadb-on-centos-7.png] MariaDB将MySQL替换为CentOS 7存储库中的默认数据库系统。...注意 允许在公共IP上不受限制地访问MariaDB，但是您可以在/etc/my.cnf中通过修改bind-address参数来更改它侦听的地址。...保护MariaDB服务器 运行mysql_secure_installation脚本以解决默认MariaDB安装中的几个安全问题： sudo mysql_secure_installation 您可以选择更改...status (\s) Get status information from the server. system (\!)...理想情况下，MariaDB实例应该在运行Tuner之前至少运行24小时。实例运行的时间越长，MySQL Tuner给出的建议就越好。
这个值是一个 0 到 255 之间的整数，说明命令执行成功或是失败。按照惯例，一个零值说明成功，其它所有值说明失败。Shell 提供了一个参数，我们可以用它检查退出状态。...有些命令使用不同的退出值，来诊断错误，而许多命令当它们执行失败的时候，会简单地退出并发送一个数字1。手册页中经常会包含一章标题为“退出状态”的内容，描述了使用的代码。然而，一个零总是表明成功。...这里的 expression 是一个表达式，其执行结果是 true 或者是 false。当表达式为真时，这个 test 命令返回一个零退出状态，当表达式为假时，test 命令退出状态为1。...第二个，注意脚本末尾的 exit 命令。这个 exit 命令接受一个单独的，可选的参数，其成为脚本的退出状态。当不传递参数时，退出状态默认为零。...在这个脚本中，我们计算常量 ANSWER。我们首先确定是否此字符串为空。如果为空，我们就终止脚本，并把退出状态设为零。注意这个应用于 echo 命令的重定向操作。
下面是第9期学员的随机投稿 2018年的Nature上公开了一份尿路上皮癌(BLCA)的免疫治疗队列数据，而这份数据就储存在IMvigor210CoreBiologies包中。...但是在安装该包的过程中，笔者遇到了一点小问题，今天根据笔者自己在安装过程中遇到的问题，写下这一份安装小教程。...根据官网的介绍我们需要的DESeq2作为依赖包。但是!!!实际安装过程中，真正需要的是DESeq包。...教程 进入Bioconductor官网下载DESeq安装包 官网地址：http://bioconductor.org/ 搜索DESeq 可以看到有很多种版本的DESeq包版本，根据笔者的经验，下载__...Warning ininstall.packages : # installation ofpackage ‘DESeq’ had non-zero exit status 刚开始笔者不断在网站上搜索
程序员的3个美德，其中之一就是懒惰，凡是不影响大局的代码警告我都懒得去解决，比如每次启动R语言都会有： Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line...，因为不影响R的继续使用，所以我通常是视而不见。...但是在安装一个R包的时候终于开始报错了，而且错误信息表明是之前的这个警告： > devtools::install_github("mskcc/pctGCdata") Downloading GitHub...0.2.0.tar.gz' had non-zero exit status 所以迫使我不得不去搜索解决方案，查到： https://stackoverflow.com/questions/9689104...package can be loaded * DONE (pctGCdata) 很有趣，为什么之前没有啥影响的警告在这个时候就成了致命的错误呢？
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...‘clusterProfiler’ ... ** using staged installation ** R ** data ** inst ** byte-compile and prepare...of package ‘clusterProfiler’ had non-zero exit status 仔细看，关键报错信息为 Error in get(name, envir = asNamespace
参考链接： Java中的System.exit() 1、查看java.lang.System的源代码，我们可以找到System.exit(status)这个方法的说明，代码如下： /** *...Runtime.getRuntime().exit(status); } 注释中说的很清楚，这个方法是用来结束当前正在运行中的java虚拟机， 如果status==0，表示jvm正常退出，如果status...=0非零，表示jvm非正常退出。...关于System.exit(int status)方法 System.exit(int status);//这个语句的功能是结束当前运行的Java虚拟机，其中的参数status是状态代码，当status...一般在Windows底下，不正常退出状态码为-1，这里可写为System.exit(-1); System.exit(int status)方法效果等同于于Runtime.getRuntime().exit
和 if 一样， while 计算一系列命令的退出状态。只要退出状态为零，它就执行循环内的命令。在上面的脚本中，创建了变量 count ，并初始化为1。...while 命令将会计算 test 命令的退出状态。只要 test 命令返回退出状态零，循环内的所有命令就会执行。每次循环结束之后，会重复执行 test 命令。...在这个脚本版本中，我们设置了一个无限循环（就是自己永远不会终止的循环），通过使用 true 命令为 while 提供一个退出状态。因为 true 的退出状态总是为零，所以循环永远不会终止。...一个 until 循环会继续执行直到它接受了一个退出状态零。在我们的 while-count 脚本中，我们继续执行循环直到 count 变量的数值小于或等于5。...循环将使用 read 从重定向文件中读取字段。这个 read 命令读取每个文本行之后，将会退出，其退出状态为零，直到到达文件末尾。到时候，它的退出状态为非零数值，因此终止循环。
使用MariaDB 在本节中，您将学习如何连接到MariaDB并执行基本的SQL命令。 与MariaDB交互的标准工具是MySQL客户端。...MariaDB客户端： quit 有关SQL命令的更多信息，请参阅MariaDB知识库中的SQL命令页面。...(\q) Exit mysql....Takes a file name as an argument. status (\s) Get status information from the server. system (\...调整MariaDB MySQL Tuner是一个有用的工具，它连接到正在运行的MariaDB实例，并根据工作负载提供配置建议。在运行调谐器之前，您应该让MariaDB实例运行至少24小时。
mysql主从配置 前期准备 安装包 下载二进制安装所需的包 链接：https://pan.baidu.com/s/1azoIIZqVw948xLnew2TEJQ 提取码：g7pl 检查 执行rpm...发车 1、把mysql的安装包复制到linux中。...mysql登录 exit #mysql数据库默认是有密码复杂度验证的，如果不需要可以去掉： #关闭密码复杂度验证 set global validate_password_policy=0; #新密码长度大于等于...mysql然后重启mysql exit service mysqld restart; 8、连接navicat 9、其他 #查看防火墙： systemctl status firewalld.service...：active（running） #关闭状态：disavtive（dead）
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