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R语言】因子临床分组应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R因子(factor) 今天我们来结合具体例子给大家讲解一下因子临床分组应用。 我们还是以TCGA数据CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾...参考资料: ☞【R语言】R因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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反思管理犯过重大错误

近一年来,管理犯下2个重要错误。该错误导致团队结构不清晰,骨干核心人员不稳定,易流失。...1、资源错配 2、逮着一个人疯狂用 目录 1、背景描述; 2、是如何犯错,以及为什么犯错; 3、这两个错误带来了哪些影响; 4、规避和改进方式; 一、背景描述 成立3年初创公司,10人编制测试团队...团队人员结构分布是 1个经理、2个高级、3级、4初级;组内划分是分成了3个小组,2个业务测试小组,一个测试基础小组。...组内结构划分可见下图所示: 二、是如何犯错,以及为什么犯错 错误一:资源错配 对于组长选择,以及组内骨干选择,如下图所示: 其中标记为组长,是团队内部小组内被任命为小组长,标记为骨干...两个业务小组,初中级员工干中高级员工活,中高级人员为相对边缘角色。这样资源错配,直接引发了核心、骨干员工离职率高后果。 为什么会这样做: 本质上是一个“谁能谁上”还是“谁上谁能”问题。

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5年Python7年R,述说她们差异在哪里

前言 首次接触R语言是2012年读研时候,有一门课程是统计分析与R语言,清晰地记得期末考试时,由于把答案给同学抄,最终落了个重考后果(重考92分)。...,希望分享一篇文章,来描述R语言和Python差异。...所以初学Python朋友(非计算机专业)不太容易接受Python编程思维,而更喜欢拥抱R语言。但当你发现Python语法特点和技巧后,也许会更爱Python(至少是这样)。...功能对比 正如前文所说,R语言和Python几乎可以做数据分析和挖掘所有任务,都可以找到对应第三方包。...再来对比R语言和Python热度指数曲线,如下图所示: ? 2014年之前,R语言热度相对比较平稳,但总体呈上涨趋势;而Python大起大落,成长过程并没有顺风顺水。

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R语言RCT调整基线时对错误指定稳健性

p=6400 众所周知,调整一个或多个基线协变量可以增加随机对照试验统计功效。...调整分析未被更广泛使用一个原因可能是因为研究人员可能担心如果基线协变量影响结果回归模型没有正确建模,结果可能会有偏差。 建立 我们假设我们有关于受试者双臂试验数据。...我们让表示受试者是否被随机分配到新治疗组或标准治疗组二元指标。一些情况下,基线协变量可以是随访时测量相同变量(例如血压)测量值。...错误指定可靠性 我们现在提出这样一个问题:普通最小二乘估计是否是无偏,即使假设线性回归模型未必正确指定?答案是肯定 。...我们进行了三次分析:1)使用lm()进行未经调整分析,相当于两个样本t检验,2)调整后分析,包括线性,因此错误指定结果模型,以及3)正确调整分析,包括线性和二次效应。

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软件工程师生涯犯下七个错误

大家很少会看到人们(包括自己!)公开谈论他们犯过错误。但我觉得我们最好时不时反思一下自己过去犯过哪些错误,这样我们就不会在未来重蹈覆辙了。 成为专业程序员已经有大约五年时间了。...和其他人一样,在这条职业道路上也犯过不少错误。一般来说,不会在犯错的当时就意识到自己做错了什么事情;往往是接触了正确做事方式之后才知道自己之前路走岔了。...但是随着代码库增长,那些自制列表本身就变成了一个个怪物。因为可以很容易地修改代码,所以我会经常介入并改变一个方法行为以适应需求,这又导致了后来诸多混乱和错误。...本可以通过编写自动化脚本来真正“节约”一些时间,但是浪费修复每个错误和支持其他人上时间比我可以“节约”时间要多很多倍。你软件应该支持一键构建;需要操作再多一点都是浪费时间。...6过分依赖视觉检查和调试 做出一个表格并显示你输出是非常容易事情。而且 Visual Studio 是如此强大,以至于人们可以轻松地一步步检查代码并即时检查代码值。

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ThoughtWorks敏捷实践

我们团队,这个角色就是一开始提到BA。她是IPM主要参与人,另外还有Tech Lead会一起参与讨论(团队每一个人成员都是可以参与进来)。...听过一个有趣事情:敏捷开发方法兴起时候,很多传统开发模式团队跃跃欲试,他们选择从Standup切入。然后每天早上上班后,大家聚在一起开个会(站着、坐着都有),然后该怎么做还是怎么做。...而Story本身存在错误并不在讨论范围之内。实际上开发过程,也未发生过这种情况,因为一旦客户需求变更后,Story卡也会及时变更过来。...比较推荐DEVkick off后将Story划分成子任务列表,按照依赖关系和优先级排序,逐个干掉他们。...也经历过客户要求测试覆盖率项目,有专门测试覆盖率工具(coveralls)来检测代码库,有的甚至集成CI上作为一个硬性指标。 所以,TDD必须在一个有测试项目中去讲。

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R」ggplot2R包开发使用

尤其是R编程改变了从ggplot2引用函数方式,以及aes()和vars()中使用ggplot2非标准求值方式。...同样地,导入ggplot2全部450个导出对象到你命名空间会让分离你包和ggplot2包责任变得困难,特别是读者会搞不清这些函数到底来自哪里个人碰到过很多这种情况。...实际上,如上所说,这一方面会让使用者懵逼,另一方面会造成开发病毒式感染,既不方便调试错误, 想要使用你包开发的人又不得不将你包列入Depends。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2通常用于可视化对象(例如,一个plot()-风格函数)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R需要类都有plot()方法,但想要依赖一个单一plot()为你每个用户都提供他们所需要可视化需求是不现实

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vscode配置R开发环境

并且1.21完善了windows系统下extensionbug。...整体看起来效果还是非常不错,开发者整体上还是保留了Rstudio和visual studio对于View()这个函数配置,还在此基础上添加了search功能,此外对Rshiny可视化支持也非常棒...▶ pip install radian 四 R安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数智能识别,R session...配置 Path添加R执行文件路径,当然也可以选择radian.exe路径(该路径存在于pythonscripts文件夹)。...运行的话,则会出现R session watcher不启用状况,data和plotreview窗口则会自动调用自身gui所带review窗口,以windows中选择radian.exe路径为例

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这个语句报了无效语法错误 但是不知道是哪里写错了

一、前言 前几天Python最强王者交流群【群除佬】问了一个Pandas处理问题,提问截图如下: 代码如下所示: songid_tags_df['tblTags'].map(lambda x :..., x) if isinstance(x,str)) 二、实现过程 后来自己给了一个示例代码,如下所示: songid_tags_df['tblTags'].map(lambda x: re.findall...(r"'name': '(.*?)'"...三、总结 大家好,是皮皮。这篇文章主要盘点了一个Pandas处理问题,文中针对该问题,给出了具体解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【群除佬】提问,感谢【皮皮】、【瑜亮老师】、【隔壁山楂】给出思路和代码解析,感谢【Python进阶者】、【孤独】等人参与学习交流。

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总结一些,书写 CSS 时候,经常犯错误

作者:Ahmad shaded 译者:前端小智 来源:sitepoint 当我们非常专注写代码时候,我们往往会无意识写出一些无效CSS代码。 把这种称为 “潜意识错误”。...导致这种错误后,我们经常会反问自己:“为什么写出这样低级错误?” 不过,这些错误都比较好解决,不需要花很多时间,只要纠正一下就行了。 跟着本文看看,我会经常写哪些有趣 CSS 错误。...Font Size font-size和font-weight之间经常犯错误,如下所示: .title { font-size: bold; } Opacity 也不知道啥原因,但有时我会忘记写百分比...: .title { opacity: 50; } 关于 opacity 还经常犯下面错误: .title { /* 现这一点并不容易,你们看出错误哪里吗?...CSS calc() 如果你代码没有高亮提示功能,你也许也会这样写: .elem { font-size: clac(14px + 1vw); } CSS color 记得曾经遇到过这样错误

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yieldWCF错误使用——99%开发人员都有可能犯错误

昨天写了《yieldWCF错误使用——99%开发人员都有可能犯错误[上篇]》,引起了一些讨论。...我们一个Console应用编写了如下一段简单程序:返回类型为IEnumerable方法GetItems以yield return方式返回一个包含三个字符串集合,而在方法开始时候我们打印一段文字表明定义方法操作开始执行...Main方法,我们先调用GetItems方法将“集合对象”返回,然后调用其ToArray方法。调用该方法之前我们打印一段文字表明对集合对象进行迭代。...也就是说,一旦我们一个返回类型为IEnumerable或者IEnumerable方式通过yield return返回集合元素,意味着这个定义方法操作会被“延后执行”——操作真正执行不是发生在方法调用时候...再次回到《yieldWCF错误使用——99%开发人员都有可能犯错误[上篇]》中提到例子,现在来解释为什么针对如下两段代码,前者抛出异常不能被WCF正常处理,而后者可以。

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yieldWCF错误使用——99%开发人员都有可能犯错误

但是如果我们不了解yield 关键字背后实现机制,很有可能造成很大问题。 这是一个WCF相关问题,想99%的人都有可能会犯这样错误——即使你对yield了解得非常透彻。...实现:GetItems方法返回一个包含3个字符串集合,但是返回之前我们需要对参数实施验证。...如果category参数提供字符串为Null或者是空字符串,抛出一个FaultException异常并提示“Invalid Category”,这样客户端输入不合法参数情况下可以得到错误消息。...,如下所示是客户端调用服务时指定一个空字符串参数情况下得到错误。...这实际上就是因为“yield”作祟,不相信的话可以将定义DemoServiceGetItems方法替换成如下定义,即直接返回一个string[]对像。

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深度 | R 估计 GARCH 参数存在问题

这对来说是个新闻,因为书籍经常引用 fGarch,所以这可能是那些寻求 R 中使用 GARCH 模型的人资源——为什么不要使用 fGarch。...原假设下,滚珠轴承平均直径不会改变,而在备择假设制造过程某些未知点处,机器变得未校准并且滚珠轴承平均直径发生变化。然后,检验在这两个假设之间做出决定。...已将结果保存在 Rda 文件。对于涉及并行计算每个代码块都是如此。犹他大学数学系超级计算机上执行了这些计算,在这里保存结果。)...本文中强调问题让更加意识到选择优化方法重要性。最初目标是编写一个函数,用于根据 GARCH 模型结构性变化执行统计检验。...这是一个自认知之甚少主题,如果 R 社区某个人已经观察到了这种行为并且知道如何解决它,希望他们会在评论或电子邮件告诉

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R8Android手Q应用

二、R8整体流程目前在手Q中使用R8版本为2.1.75 ,官网r8版本已经到了3.2.35, 因为AGP版本限制(目前手Q版本为4.1.3),无法单独升级R8,否则会有错误,因此本文对R8分析都是基于...理解根可达性算法前需要先理解四个概念:1、Root: proguard 配置文件明确要keep对象,算法输入。...使用R8过程,我们发现同样代码,构建多次,高概率出现不正常dexDiff,具体表现如下:IDragview clinit方法有时候存在,有时不存在,导致生成补丁不稳定。...主要是分析 1、主dex类扩散过程(原理和上面介绍根可达性算法一样,只是Root不同);2、对比之前正常时候差异,看问题在哪里。...目前我们分析了R8最新版本代码,发现没有改动,于是这边有个初步思路,减少拷贝,将拷贝逻辑改成引用逻辑,经过一些测试,目前看起来可行。

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TidyFriday Excel 用户福音! R 实现 Excel 功能

许多 R 新用户金融、市场、商业分析等领域有丰富行业经验,但是他们并没有太多编程背景,所以日常工作还是选择 Excel、PowerBI 这些传统工具进行工作;tidyquant 作者意识到了这些痛点...(tidyverse) library(tidyquant) library(knitr) R 实现透视表 很多 Excel 用户青睐它数据透视表功能,现在 R 也可以通过 pivot_table...R 实现 VLOOKUP Excel 另一个强大函数是 VLOOKUP,VLOOKUP 主要功能如下: ?...company) [1] "Amazon" 不过我们 Excel 中使用 VLOOKUP 是想在一个表添加列,这列值要去另一个表查找, R 怎么做呢?... R 实现各种「IFS」函数 很多同学喜欢 Excel 是因为它条件筛选功能,比如SUMIFS(), COUNTIFS(), AVERAGEIFS()等; ? R 如何实现呢?

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