加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) 导入数据 df <- read_tsv("data.txt") 数据可视化 df %>% ggplot(aes(case_control...函数 aes() 指定数据帧中哪些列应用于图表美学。...fill 和 color 美学设置为 case_control，这意味着点的填充和颜色将基于该列的值。参数 pch 指定点的形状，width 指定点的宽度，size 指定点的大小。...❞ stat_summary(geom="crossbar", fun="mean", width=0.2, linetype="solid") ❝向图表添加了一条水平线，以显示每个 case_control...❞ 自定义函数绘图 ❝上方给出了该图像绘制的代码及解释，那么我们也可以将其写成一个函数使其居然通用性，下面针对会员朋友小编将介绍如何定义函数绘制此图，代码见会员群文档。 ❞
最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer) library...、大小，颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r = 10), size = 11, color = "black"), # 设置...y轴标题的边距、大小，颜色为黑色 panel.grid.major.x = element_blank(), # 设置x轴主要网格线为空白 panel.grid.minor.x = element_blank...(), # 设置x轴次要网格线为空白 panel.grid.minor.y = element_blank(), # 设置y轴次要网格线为空白 panel.grid.major.y
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus,...y轴标题的边距、大小，颜色为黑色 panel.grid.major.x = element_blank(), # 设置x轴主要网格线为空白 panel.grid.minor.x = element_blank...(), # 设置x轴次要网格线为空白 panel.grid.minor.y = element_blank(), # 设置y轴次要网格线为空白 panel.grid.major.y...= element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 绘制组间冲积图 plot %>% select(1,3,4) %>% group_by(Genus,group) %>%
❝在R中创建sina图使用geom_sina函数，sina图是一种用于显示单个分类变量的每个观测值的图形。它与箱线图和小提琴图类似，但是它显示了每个单独的数据点，这可以提供关于数据分布的更多信息。...❞ 「sina图的主要优点是它可以清楚地显示每个数据点，而不是简单地显示数据的总体分布。这使得sina图特别适用于小样本大小的数据集，其中每个数据点的值都很重要。」...gas_day_started_on)) 数据可视化 df %>% ggplot(aes(x=mth, y=gas_in_storage_t_wh,group=mth)) + # 使用ggforce包中的...), lab=c("2","4","6","8TWh")), aes(x=x, y=y, label=y),inherit.aes = FALSE)+ # 使用scico包中的...month.abb[1:12]) + scale_y_continuous(breaks=c(seq(0,8,2))) + coord_polar() + # 使用极坐标系 # 使用cowplot包中的
加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <- readr::read_csv('data.csv') 构建标签数据 labs <- data.frame...52), label = c('10', '20', '30', '40', '50'), color = "black") + # 在y轴上以10为间隔添加水平线...geom_hline(yintercept = seq(0, 50, by = 10), colour = "grey70", linewidth = 0.3) + # 添加柱状图，表示总数...geom_col(aes(y = F_count_total, fill = as.factor(Season)), alpha = 0.8, show.legend = FALSE) + # 添加柱状图，...表示RK的计数 geom_col(aes(y = F_count_RK, fill = as.factor(Season)), show.legend = FALSE) + # 添加富文本
如果底层用的是关系数据库，需要将E-R图结构映射到一个二维的关系表中，如“学生选修课程”的E-R图，映射到学生表、课程表和选修表这样的二维关系表中，这是关系数据库设计的基本思路。 3....图数据库-Game Changer 如果采用图数据库作为底层的物理实习，就是把E-R图表示的概念模型映射成图数据库中的节点和边，因为E-R图和图数据库均采用“图”的形式进行表达，因此这样的映射更加直接...Q中的每一个点在单射函数Function（f）作用下唯一映射到G的每个点上去，如上图中Q的1、2、3在G的中的第一个子图匹配是（1、2、3），第二个子图匹配是（2、3、4）。...回答Q在G中的子图匹配查询，则分别先找到匹配查询图Q中的AB边的是T1表、匹配AC边的是T2表和匹配BC边的是T3表，然后T1、T2、T3做自然连接（Join）操作，如果结构非空，就找到Q的子图匹配了。....，2016] 下面提到的是分布式gStore系统，解决的是单机存储不下一个大的RDF图，需要分布式存储在多个机器上，而查询结果跨在多台机器上的问题。 4.
分享嘉宾：邹磊 北京大学 教授 编辑整理：xiaomei 出品平台：DataFunTalk 导读：本次讲座从图数据库中的核心查询算子——子图匹配入题，介绍了图数据库的基本概念、子图匹配的算法，以及在图数据库环境下的子图匹配查询优化等内容...如果底层用的是关系数据库，需要将E-R图结构映射到一个二维的关系表中，如“学生选修课程”的E-R图，映射到学生表、课程表和选修表这样的二维关系表中，这是关系数据库设计的基本思路。 3....图数据库-Game Changer 如果采用图数据库作为底层的物理实习，就是把E-R图表示的概念模型映射成图数据库中的节点和边，因为E-R图和图数据库均采用“图”的形式进行表达，因此这样的映射更加直接...Q中的每一个点在单射函数Function（f）作用下唯一映射到G的每个点上去，如上图中Q的1、2、3在G的中的第一个子图匹配是（1、2、3），第二个子图匹配是（2、3、4）。....，2016] 下面提到的是分布式gStore系统，解决的是单机存储不下一个大的RDF图，需要分布式存储在多个机器上，而查询结果跨在多台机器上的问题。
) b ON a.id = b.id ps：解释下 对于Mysql中的语句，牵扯到左查询时 可以用left join关联 但一般对于不知道什么时候起别名 什么时候用括号的老铁们 真实头疼 所以发个模板...剩下的根据自己的业务具体实施。
在之前的推送中，曾经有过一篇介绍excel图表辅助线的制作方法，其中用到的技巧五花八门、令人眼花缭乱。 而ggplot图表系统中的辅助线添加起来却异常简单，非常易于操作。...以上柱形图中，我们如果想要了解五个公司的销售额均值以及单个公司销售额与均值的对比情况，需要在图表中添加一条平均线。...以上通过geom_hline图层为柱形图添加了均值辅助线，但是大家一定好奇为啥均值线那么低，低于所有公司的销售额，因为均值是季度均值，而销售额是年度累计销售额。 接下来我们制作一个分季度的柱形图。...像素画处理之后，再加上均值十字线，你可以清晰地看到，数据分布形态中，左下角最为密集。 辅助线的另外一种常见的用途就是在时间序列数据中。...start是一个代表日期的字段，也就是说我们可以赋值给geom_vline函数一个字段，从而在折线图中绘制出多个时间点的辅助线。
韦恩图（venn）又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。一般用于展示2-5个集合之间的交并集关系。...=========华丽的分割线============ 对于掌控性要求比较高的同学，可以试着自己写R代码来绘制韦恩图。...今天我们就来重现下面这篇学术论文里面的韦恩图 Fig3为韦恩图 下面我们用R里面的VennDiagram包来重现这个图 我们这里就不用原文作者的数据了，而是随机产生了4个gene list，这四个...fill = rainbow(setnum), #控制圆圈中的数字 cex = 0.3, #字体大小 #fontface = "bold", #粗体 #fontfamily...R的UpSetR包来画Upset plot，如下
面积图是一种基于折线图的图形，可以通过图中的面积来表示数据的大小情况，比如下面两种都是面积图： ? ?...wiki 下面是堆积面积图 (stacked area plot) 的在R中的简单实现，主要是用geom_area画出面积： set.seed(1492) Sector <- rep(c("S01","...gis.stackexchange.com/questions/163143/why-is-my-stacked-area-graph-in-ggplot2-returned-as-stacked-lines http://r-statistics.co.../Top50-Ggplot2-Visualizations-MasterList-R-Code.html http://t-redactyl.io/blog/2015/12/creating-plots-in-r-using-ggplot2
image.png Conda是一个非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下载软件，还可以建立多个虚拟环境来独立运行多个版本的软件。...做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新开发的包又只支持最新的R，这里我们用conda建立多个版本的R环境。...： conda env list 如需要安装特定版本的软件: conda install 软件名=版本号 最新Python的安装： conda create -n py37 python=3.7 #或者...： conda create -n r36 r=3.6 安装特定版本R conda install -c r r=3.6 #或 conda install r=3.6 conda来安装R的packages...https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/ conda install -c r r-dplyr 查看已创建的环境
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 题目：一名研究者用光子吸收法测量了妇女骨骼中无机物含量，对三根骨头主侧和非主侧记录了测量值，数据框“T1bones.txt”中的第2至第7列记录了相应数据。...对各个变量做qq图，在同一个界面画出所有的qq图，不同的qq图用不同颜色表示。...1.422 0.618 0.664 25 0.915 0.936 1.971 1.869 0.869 0.868 方法一：在一个坐标系里画出多个...QQ图 R语言代码： data <-read.table("T1bones.txt",header=TRUE);data d1 <- data[1:25,2];d1 d2 <- data[1:25,3]...，把每个QQ图分布在一个界面中 R语言代码： par(mfcol=c(2,3)) qqnorm(d1,main="d1") qqline(d1) qqnorm(d2,col="green",main="
mpg, disp)) p2 <- ggplot(mtcars) + geom_boxplot(aes(gear, disp, group = gear)) p1 + p2 仅仅靠'+'符号便可以完成子图组合...增加图片画布中的空白 p1 + plot_spacer() + p2 ? -可以通过将部分子图包装在括号中来制作嵌套布局。在这种情况下，画布布局的范围为不同的嵌套级别。...设置子图与图片主题 (p1 + (p2 + p3) + p4 + plot_layout(ncol = 1)) * theme_bw() p1 + (p2 + p3) + p4 + plot_layout...(ncol = 1) & theme_bw() 可以使用＆或将主题添加到所有子图中，而不是单独修改所有图。...两者的不同之处在于只会影响当前嵌套级别的图，＆影像所有子图。 ? ?
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何在R中绘制树状热图，通过「sourmashconsumr」 & 「metacoder」两个R包的案例来进行介绍，更多详细的内容请参考作者官方文档。..., groups = metadata) 设置随机种子 set.seed(1) 绘制树状图热图...metacoder后的结果，其对代码做了简化；下面来通过一个案例来介绍「metacoder」包 ❞ 载入metacoder包 library(metacoder) 解析分类数据 obj <- parse_tax_data...tax_data进行处理 obj$data$tax_data <- zero_low_counts(obj, dataset = "tax_data", min_count = 5) 检查没有reads的行...calc_n_samples(obj, "tax_abund", groups = hmp_samples$body_site, cols = hmp_samples$sample_id) 绘制树状图热图
在对图进行分区时，每个分区都可能包含HALO节点，这些节点被分配给其他分区，但为了提高效率而被包含在本分区中。 ...分区数据存储在多个文件中，组织结构如下： data_root_dir/ |-- graph_name.json # partition configuration file in JSON...分区的图结构以DGLGraph格式存储在文件中。每个分区中的节点都经过*relabeled*，始终以0开头。...函数入参 g : DGLGraph 要分割的输入图 graph_name : str 图的名称。...指定该参数后，Metis 算法将尝试把输入图分割成多个分区，每个分区中每个节点类型的节点数大致相同。默认值为 "None"，这意味着 Metis 只对图进行分区，以平衡节点数量。
树图(TreeMap) 通过矩形面积的大小，以及填充颜色的深浅，来显示节点的统计数据，通过嵌套层次来显示分组的层级的可视化图形。...for example: 某公司产品在世界六大洲的销售情况，矩形的大小表示人口的数量，颜色的深浅表示销售额的多少。 ? 那么如何绘制树图呢？...首先绘制树图需要的包： install.packages(“treemap”) 树图函数： treemap(x,index,vSize,vColor,palette,range,border.col...("treemap", repos='http://cran.r-project.org') library(treemap) data <- read.csv('data.csv', stringsAsFactors...border.col='#63B8FF', palette=c("#FFFFFF00", "#1C86EE00"), range=c(minSales, maxSales) ) 一副完美的tree图就搞定啦
geogebra 动态图可以在网页中显示数学公式，本文记录显示多个geogebra的方法。...实现原理 需要在 hexo 中可以嵌入 geogebra 图像 在 script 语句中建立多个 GGBApplet 对象 在 window.onload 函数中调用多个函数 实现方法 引入 js 文件.../apps/deployggb.js"> 建立 GGBApplet 对象并显示 // 建立自己的 ggb 参数 var parameters = { "id":...geogebra 图像显示 建立多个 parameters 对象，对象中指定不同的 id，定制不同的 geogebra 内容 var parameters1 = { "id": "ggbApplet1...// 展示 geogebra 图像 window.onload = function() {applet1.inject('ggbApplet1'); // 参数与 parameters 中的 id
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友需要绘制环状热图叠加多层注释，本节来通过一个例子来简单介绍一下如何实现，主要通过「ggtreeExtra」来实现，聚类分析使用「ape」包来进行更加适用于生物信息相关的数据...「数据代码已经整合上传到2023VIP交流群」，加群的观众老爷可自行下载，有需要的朋友可关注文末介绍加入VIP交流群。...❞ 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇：凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们，「将自动获得2024年及以后的绘图资料和代码更新，无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+，质量方面各位无需担忧**。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容，2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggnewscale
论文 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇：凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们，「将自动获得2024年及以后更新的绘图文档代码，无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+，质量方面各位无需担忧。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容，2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggtreeExtra
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