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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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R语言中并行BioParallel

我们在前面曾经写过一个教程《R语言实现并行》,在其中我们测试了下几个基础功能函数。今天给给大家带来另一个建立在基础包以上整合并行R包BiocParallel。...: ##查看系统存在并行环境 registered() Windows: Linux: ##查看任务情况 show(x) 根据上面的信息我们可以看到在linux和macMulticoreParam...接下来我们通过实例看下在这个包核心函数: ##将输入参数赋值并进行并行计算 fun <- function(v) { message("working") ## 10 tasks...result <- bpmapply(fun, greet, who, BPPARAM = param) ##ITER主函数提供数据块,各进程函数独立设置运算,另外还可以设置合并结果函数REDUCE...大家可以直接在包查看。当然结合batchtools包可以实现更加灵活并行计算。大家感兴趣可以深入研究。

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RR 函数

首先构造一个函数,它有一个参数x。这个函数参数列表还包含了一个省略号,因此这个省略号将成为我们调用summary函数参数。...这有点类似于shell通过$引用相应参数。看来很多编程语言都存有相同参数传递机制。 函数属性 R包含了一系列函数用于提取函数类型对象信息。...NULL 如果我们想要在R代码函数参数列表进行操作,formals函数是一个很好工具,它会返回一个配对列表对象(对应参数名和设定默认参数值)。...注意,formals函数仅能运行在R函数上(类型为closure对象),而不能在内嵌函数(bulti-in function)上运行。...解释器将这样递归地在各个环境寻找直到找到该符号或到达全局环境。加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var,那么R会在全局环境中指定var值为value。

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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Rgrep和grepl函数

在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们要找东西,或者向量那几个元素包含我们要查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含要查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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TPU指令并行和数据并行

本文主要探讨从架构设计上看,TPU时如何做高性能和高效能设计。高性能多来自于并行,因此本文分别讨论了指令并行和数据并行设计方法。...卷积计算数据并行 3.1 单指令多数据(SIMD) 单指令多数据,故名思意是指在一条指令控制多组数据计算。...显然,TPU core设计采用了这样一种数据并行方式——一条instruction控制了256*256个乘加计算单元(MatirxMultiply/Convolve)。.../卷积计算,在单个处理器内部设计上,SIMD是数据并行最优选择。...这些数据会并行进入到计算阵列完成计算(可以认为是多条车道)。由于SimpleTPU数据读取延时是固定(指从SRAM),因此向量化设计较一般处理器还更为简单。

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cpp继承那些事(上)

{% note warning modern %}这里结构体是在c++语法体系,c语言语法并没有结构体继承这种说法。...return 0; } 0x03 关于继承重定义问题 当两个类存在继承关系时: 基类和派生类有同名成员变量或者成员函数,在派生类实例化对象时候,访问到是派生类自己成员。...如果基类和派生类存在同名成员函数,但是参数列表不同,那么只能访问子类成员函数 {% note info modern %}无论是函数名同名,还是变量名同名,还是函数和变量名同名,或是函数参数不一样...,都会发生重定义,基类标识符都会被隐藏,只能访问派生类自己成员,如果想要使用基类同名成员,那么需要使用域作用符来指定作用域。...,又有类成员时候,先调用基类构造,再调用成员变量,最后调用自己构造函数 析构函数: 析构函数调用顺序则刚好相反,如果父类或类成员只有有参构造,那么需要在子类构造函数给他们赋值,使用初始化参数列表即可

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巧用R各种排名窗口函数

函数对比 SQL窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应函数: ?...1 row_number函数 R语言中row_number函数与sqlrow_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复编码...2 min_rank函数 R语言中min_rank函数与sqlrank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同记录编码是不同,min_rank就是解决这个问题,对相同记录编码相同...同样得到与sql相同输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中ntile函数与sqlntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数函数名几乎与sql4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言排名窗口函数输出结果与sql输出结果有点不同:R语言数据结果不改变原来数据顺序

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学习笔记︱深度学习以及R并行算法应用(GPU)

CPU ALU只有四个,虽然大,但是control与cache占比较大;而GPU又很多,虽然小,但是control,cache占比小,所以更有优势,有长尾效应。用非常大量小单元来加快运行速度。...CUDA 二、GPU计算应用到R语言之中 R速度慢,是解释性语言,一条命令,先编译成指令,然后传输到CPU进行计算; 编译性语言可以直接访问CPU等, 内存不够,先读入R内存,然后再进行计算,对于R存储有要求...R与GPU结合 一般有GPU package,一般有三种方法:library、cuda ? Cuda库,可用性很强, 两个例子: BLAS、FFT包 ?...1、blas包 矩阵计算,需要R先预编译,下面的网址有编译手法。只能在linux下运行。 ?...accelerate-r-applications-cuda/ 调用已有GPU库,中高级使用者;遇到性能问题可以选 要写interface function ?

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Effective_Cpp55个建议

2.如果客户需要对类某个函数抛出异常做出反应,那么这个类应当给用户提供一个普通函数,在里面调用那个会抛出异常函数。...9:绝对不要在构造和析构过程调用虚函数 当构造子类时候,需要先去调用父类构造函数,这时候子类还不存在,是无法去自动调用子类函数。...3.还有如果一个子类继承了你这个类,那么这个子类在调用拷贝函数时,就不会自动调用父类你写拷贝函数了,需要你手动调用。...4.不要尝试以某个拷贝函数实现另一个拷贝函数,应该将共同功能代码放入第三个函数,然后在这两个拷贝函数调用。...3.函数提供“异常安全保证”通常最高只等于其所调用之各个函数“异常安全保证”最弱者。

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R并行计算以及提高运算效率方式(parallel包、clusterExport函数、SupR包简介)

终于开始攻克并行这一块了,有点小兴奋,来看看网络上R语言并行办法有哪些: 赵鹏老师(R并行计算)做总结已经很到位。...显然,这种模式对于大多数用户来说是最喜闻乐见。 显性并行:显式计算则要求用户能够自己处理算例数据划分,任务分配,计算以及最后结果收集。...值得庆幸是,现有R并行计算框架,如parallel (snow,multicores),Rmpi和foreach等采用是映射式并行模型(Mapping),使用方法简单清晰,极大地简化了编程复杂度...R用户只需要将现有程序转化为*apply或者for循环形式之后,通过简单API替换来实现并行计算。...,需要用clusterExport函数,导入到并行环境

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AJAX串行与并行

AJAX串行 串行特点:只有上一个请求成功,才能执行第下一个,串行,上一个请求数据会做下一次请求依赖。...需求 希望得到日门语文成绩全世界排名,首先第一次请求获得到他个人基本信息,然后第二次请求,获得他全部分数列表,最后第三次请求,获取到日门语文成绩排名。...AJAX并行 并行特点:多个请求可以同时发送,但是需要等到所有请求都成功才会做一件事。多个请求之间没有相互依赖。...math, success: result => { mathpaiming = result count++ flag() } }) 以上就是AJAX并行...通过对于AJAX串行和并行示例,我们发现,串行导致回调地狱,并行时设置计数器,其实是不方便,但是这串行和并行设计思路和模式是对实际项目处理复杂逻辑有很大帮助,因此引入了Promise设计模式

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