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spgwr | R语言与地理加权回归(Ⅰ-1):线性地理加权回归

地理加权回归(Geographically Weighted Regression, GWR)经过多年发展,已经具备了多种形式,在R语言中也对应着多个工具包,其中spgwr是一个开发较早、比较经典工具包...library(spgwr) 在该包,运行线性地理加权回归函数是gwr()。...距离加权函数 距离加权函数是一个随距离增加而逐渐衰减函数,该包提供了4种地理加权函数:gwr.gauss、gwr.Gauss(默认)、gwr.bisquare、gwr.tricube。...以d = 100为例: 完整形式 线性回归: model.lm <- lm(formula = form, data = NY8@data) summary(model.lm) ## ## Call...: 0.1932, Adjusted R-squared: 0.1844 ## F-statistic: 22.1 on 3 and 277 DF, p-value: 7.306e-13 线性地理加权回归

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局部加权线性回归(LWLR)

线性回归一个问题是很可能出现欠拟合现象。局部加权线性回归可以解决线性回归欠拟合现象。在该算法,我们对更靠近待预测点点赋予更高权重。...权重类型可以自由选择,最常用是使用高斯核:W是一个对角矩阵,其中第i项表达式为 ? 则预测y值回归系数θ如下: ? 其中k是需要用户给定参数,k越小,则远离待预测点权重衰减越厉害。 ?...局部加权线性回归完整代码如下: #@author: Peter from numpy import * import matplotlib.pyplot as plt def loadDataSet...ax.plot(array(XTest)[:,1], yHat,color ="r", label="预测值") plt.xlabel("X") plt.ylabel("Y") plt.legend(...loc="lower right") plt.title("局部加权线性回归 k= %f\n(Locally Weighted Linear Regression)" % k,fontsize =16

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R线性回归分析

回归分析(regression analysis) 回归分析是研究自变量与因变量之间关系形式分析方法,它主要是通过建立因变量Y与影响它自变量Xi(i=1,2,3...)之间回归模型,来预测因变量Y...简单线性回归模型 Y=a+b*X+e Y——因变量 X——自变量 a——常数项,是回归直线在纵轴上截距 b——回归系数,是回归直线斜率 e——随机误差,即随机因素对因变量所产生影响...回归分析函数 lm(formula) formula:回归表达式y~x+1 lm类型回归结果,一般使用summary函数进行查看 预测函数 predic(lmModel,predictData...,level=置信度) 参数说明: lmModel:回归分析得到模型 predictData:需要预测值 level:置信度 返回值:预测结果 data <- read.table('data.csv...newData.csv', header=T, sep=',', fileEncoding = 'utf8'); fix(pData) predict(lmModel, pData, level=0.95) 多重线性回归

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使用局部加权线性回归解决非线性数据拟合问题

对于回归而言,有线性模型和非线性模型两大模型,从名字线性和非线性也可以直观看出其对应使用场景,但是在实际分析线性模型作为最简单直观模型,是我们分析首选模型,无论数据是否符合线性,肯定都会第一时间使用线性模型来拟合看看效果...第二种,局部加权线性回归 局部加权线性回归,英文为local wighted linear regression, 简称为LWLR。从名字可以看出,该方法有两个关键点,局部和加权。...局部加权回归,属于一种非参数学习方法,非参数意思就是说回归方程参数不是固定。...同时,相比普通线性回归,局部加权回归计算量也是非常大,需要对每一个样本进行遍历,计算样本权重矩阵,并求解回归系数,再拟合新预测值,样本越多,计算量越大。...对于非线性数据,使用局部加权回归是一个不错选择,比如在NIPT数据分析,就有文献使用该方法对原始测序深度数值进行校正,然后再来计算z-score。 ·end·—如果喜欢,快分享给你朋友们吧—

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机器学习算法实践-标准与局部加权线性回归

当然还是从最简单线性回归开始,本文主要介绍无偏差标准线性回归和有偏局部加权线性回归理论基础以及相应Python实现。...也就是引入偏差来降低预测均方误差,本部分总结下局部加权线性回归方法。...LWLRPython实现 本部分对局部加权线性回归进行Python实现,对于给定数据求取相应回归系数: ?...3) 当k = 0.03, 拟合曲线较多考虑了噪声数据导致过拟合现象 ? 总结 本文总结了标准线性回归以及局部加权线性回归基础知识,并对两张回归方式给与了Python实现。...可见局部加权线性回归在取得适当 k ,便可以较好发现数据内在潜质,但是局部加权线性回归有个缺点就是类似kNN一样,每计算一个点预测值就需要利用所有数据样本进行计算,如果数据量很大,计算量会是一个问题

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R语言线性模型臭氧预测: 加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型

p=11386  在这篇文章,我将从一个基本线性模型开始,然后从那里尝试找到一个更合适线性模型。...加权泊松回归 p.w.pois  如我们所见,该模型结合了使用泊松回归(非负预测)和使用权重(低估离群值)优势。确实,[R2[R2该模型最低价(截断线性模型为0.652 vs 0.646)。...为了更准确地预测离群值,我们训练了加权线性回归模型([R2= 0.621[R2=0.621)。接下来,为了仅预测正值,我们训练了加权Poisson回归模型([R2= 0.652[R2=0.652)。...为了解决泊松模型过度分散问题,我们制定了加权负二项式模型。尽管此模型表现不如加权Poisson模型([R2= 0.638 ),则在进行推理时可能会更好。...就决定系数而言,[R2[R2,这是加权Poisson回归模型。因此,出于预测臭氧水平目的,我将选择加权Poisson回归模型。 您可能会问:所有这些工作值得吗?

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R语言入门之线性回归

‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍先回顾一下线性回归模型成立四个条件(LINE): (1)线性(linear):自变量X与因变量Y之间应具有线性关系;...R语言提供大量函数用于回归分析,在平时学习和工作,最常用就是多元线性回归,下面我将简单介绍如何在R中进行多元回归分析。 1....模型对比 在R你可以使用anova()函数来比较不同拟合模型,在这里我们比较去掉自变量drat后模型与原模型优劣。...在R,常用函数就是“MASS”包里stepAIC()函数,它是依照赤池信息准则(AIC)进行筛选。...最后,利用AIC准则,我们将原回归模型变量drat剔除,使模型得以优化。 好了,关于线性回归得内容就讲到这儿,大家一定要牢记并熟练使用lm()这个函数,咱们下期再见!

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局部加权线性回归 | 冰水数据智能专题 | 3rd

数据分析——局部加权线性回归 局部加权线性回归(Locally Weighted Linear Regression,LWLR),针对于线性回归存在欠 拟合现象,可以引入一些偏差得到局部加权线性回归对算法进行优化...在该算法,给待测 点附近每个点赋予一定权重,进而在所建立子集上进行给予最小均方差来进行普通 回归,分析可得回归系数 w 可表示为: w = (xTWx)-1xTWy,其中 W 为每个数据点赋予权重...可以看出,当 k = 1 时,结果和线性回归使用最小二乘法结果相似,而 k=0.001 时噪 声太多,属于过拟合情况,相比之下,k = 0.01 得到结果更理想。...虽然 LWLR 得到了较为 理想结果,但是此种方法缺点是在对每个点进行预测时都必须遍历整个数据集,这样无 疑是增加了工作量,并且该方法宽度参数取值对于结果影响也是蛮大。...同时,当数据特征比样本点还多当然是用线性回归和之前方法是不能实现,当特征比样本点 还多时,表明输入矩阵 X 不是一个满秩矩阵,在计算(XTX)-1 时会出错。

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R语言进阶之广义线性回归

广义线性回归是一类常用统计模型,在各个领域都有着广泛应用。今天我会以逻辑回归和泊松回归为例,讲解如何在R语言中建立广义线性模型。...在R语言中我们通常使用glm()函数来构建广义线性模型,glm实际上是generalized linear model(广义线性模型)首字母缩写,它具体形式如下所示: glm(formula, family...第一部分 逻辑回归 逻辑回归主要应用于因变量(y)是二分类变量而自变量(x)是连续型变量情形,当然这里自变量和因变量也可以都是分类变量。...从输出结果来看,花瓣长度是可以较好区分这两类鸢尾花,但是这个模型是原始和粗糙,我们应该通过回归诊断方式来修正此模型,使之更加精确,关于回归诊断请参见R语言入门之线性回归,这里就不赘述。...关于广义线性回归模型应用就先分享到这里,希望大家持续关注【生信与临床】!

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R语言教程之-线性回归

线性回归中,这两个变量通过方程相关,其中这两个变量指数(幂)为1.数学上,线性关系表示当绘制为曲线图时直线。 任何变量指数不等于1线性关系将创建一条曲线。...线性回归一般数学方程为 - y = ax + b 以下是所使用参数描述 - y是响应变量。 x是预测变量。 a和b被称为系数常数。...使用R语言中lm()函数创建关系模型。 从创建模型中找到系数,并使用这些创建数学方程 获得关系模型摘要以了解预测平均误差。 也称为残差。...为了预测新人体重,使用Rpredict()函数。...语法 线性回归中lm()函数基本语法是 - lm(formula,data) 以下是所使用参数说明 - 公式是表示x和y之间关系符号。 数据是应用公式向量。

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地理加权分析_地理加权回归拟合度

(看你选择是可变还是固定,如果是可变,就是带宽,固定,就是相邻点数目),以前一而再再而三强调过,核估计,核函数对结果影响很小,但是带宽对结果影响很大,所以这个参数是“地理加权回归最重要参数...首先,地理加权回归很倚赖于带宽(或者说,依赖于临近要素),那么如果我带宽无穷大时候,整个分析区域里面的要素都变成了我临近要素,这样地理加权就没有意义了,变成了全局回归也就是OLS……这样,每个系数估计值就变成...那么对于大带宽来说,所有的要素都被包含进回归方程里面,那么回归方程系数有效数量接近实际数量(地理加权权重都是1)。...AICc(关于赤则信息,查看上面给出白话空间统计二十四:地理加权回归(五)) AICc是模型性能一种度量,有助于比较不同回归模型。...R2Adjusted:由于上述 R2 值问题,校正 R 平方值计算将按分子和分母自由度对它们进行正规化。这具有对模型变量数进行补偿效果,因此校正 R2 值通常小于 R2 值。

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R语言用于线性回归稳健方差估计

p=6274 在这篇文章,我们将看看如何在实践中使用R 。...为了说明,我们首先从线性回归模型模拟一些简单数据,其中残差方差随着协变量增加而急剧增加: n < - 100 x < - rnorm(n) residual_sd < - exp(x) y...< - 2 * x + residual_sd * rnorm(n) 该代码从给定X线性回归模型生成Y,具有真正截距0和真实斜率2.然而,残差标准差已经生成为exp(x),使得残差方差随着X增加而增加...无论如何,如果我们像往常一样拟合线性回归模型,让我们看看结果是什么: 估计标准 误差t值Pr(> | t |) -0.08757 0.36229 -0.242 0.809508...0.1 '' 1 残余标准误差:3.605 98自由度 多R方:0.1284,调整R方:0.1195 这表明我们有强有力证据反对Y和X独立零假设。

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基于R语言lmer混合线性回归模型

混合模型在很多方面与线性模型相似。它估计一个或多个解释变量对响应变量影响。混合模型输出将给出一个解释值列表,其效应值估计值和置信区间,每个效应p值以及模型拟合程度至少一个度量。...如果您有一个变量将您数据样本描述为您可能收集数据子集,则应该使用混合模型而不是简单线性模型。 什么概率分布最适合数据? 假设你已经决定要运行混合模型。...接下来你要做是找到最适合你数据概率分布。 ?...如何将混合模型拟合到数据 数据是正态分布 如果你数据是正态分布, 你可以使用线性混合模型(LMM)。您将需要加载lme4软件包并调用lmer函数。...如果你数据不正态分布 用于估计模型效应大小REML和最大似然方法会对数据不适用正态性假设,因此您必须使用不同方法进行参数估计。

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R方和线性回归拟合优度

特别是,R平方高值并不一定意味着我们模型被正确指定。用一个简单例子说明这是最简单。 首先,我们将使用R模拟一些数据。为此,我们从标准正态分布(均值为零,方差一)随机生成X值。...正确线性回归模型,其中X作为协变量: summary(mod1) Call: lm(formula = y ~ x) Residuals: Min 1Q Median...因此,和以前一样,我们可以从拟合简单线性回归模型开始,该模型假设Y期望是X线性函数: Call: lm(formula = y ~ x) Residuals: Min 1Q...,我们获得参数估计(1.65,1.54)不是“真实”数据生成机制参数无偏估计,其中Y期望是exp(X)线性函数。...此外,我们看到我们得到R平方值为0.46,再次表明X(包括线性)解释了Y相当大变化。我们可能认为这意味着我们使用模型,即期望Y在X线性,是合理

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R语言用局部加权回归(Lowess)对logistic逻辑回归诊断和残差分析

p=22328 目前,回归诊断不仅用于一般线性模型诊断,还被逐步推广应用于广义线性模型领域(如用于logistic回归模型),但由于一般线性模型与广义线性模型在残差分布假定等方面有所不同,所以推广和应用还存在许多问题...为了更好地理解,让我们考虑以下数据集 glm(Y~X1+X2,family=binomial) 如果我们使用R诊断图,第一个是残差散点图,对照预测值。...我们运行一个局部加权回归,看看发生了什么。 lowess(predict(reg),residuals(reg) 这是我们在第一个诊断函数中所得到。但在这个局部回归中,我们没有得到置信区间。...观点是 图形可以用来观察可能出错地方,对可能线性转换有更多直觉判断。 图形不是万能,从理论上讲,残差线应该是一条水平直线。但我们也希望模型尽可能简单。...本文选自《R语言用局部加权回归(Lowess)对logistic逻辑回归诊断和残差分析》。

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线性回归 均方误差_线性回归模型随机误差项意义

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 刚开始学习机器学习时候就接触了均方误差(MSE,Mean Squared Error),当时就有疑惑,这个式子是怎么推导,但是因为懒没有深究。...今天看到了唐宇迪老师机器学习课程,终于理解他是怎么推导了。一定要一步一步看下去,别看他公式这么多,随便认真看一下就能理解! 问题描述 我们有工资和年龄两个特征,要预测银行会贷款给我们多少钱?...似然函数 似然函数用于参数估计,即求出什么样参数跟我们给出数据组合后能更好预测真实值,有: (6) 取(6)式对数,将连乘转化为加法,这也是一般似然函数求解方法: (7) 将(7...)式展开并化简有: (8) (8)式等式右侧第一项为一个常量,似然函数要取最大值,因而第二项越小越好,有: (9) (9)式相当于最小二乘法式子,即是均方误差表达式。...下一步我们要解出 θ θ θ表达式 4.

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