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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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RR 方差分析ANOVA

方差分析主要通过F检验来进行效果评测,若治疗方案F检验显著,则说明检验样本组间均值不同。 ? ANOVA模型拟合 从函数形式上看,ANOVA和回归方法都是广义线性模型特例。...因此回归分析章节中提到lm()函数也能分析ANOVA模型。不过,在这个章节,我们基本使用aov()函数。最后,会提供了个lm()函数例子。...此时,我们无法清晰地划分它们对因变量影响。 例如,对于双因素方差分析,若不同处理方式观测数不同,那么模型y ~ A*B与模型y ~ B*A结果不同。...RANOVA表结果将评价: A对y影响 控制A时,B对y影响 控制A和B主效应时,A与B交互影响。 一般来说,越基础性效应需要放在表达式前面。...单因素方差分析 单因素方法分析,你感兴趣是比较分类因子定义两个或多个组别因变量均值。

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R线性回归分析

回归分析(regression analysis) 回归分析是研究自变量与因变量之间关系形式分析方法,它主要是通过建立因变量Y与影响它自变量Xi(i=1,2,3...)之间回归模型,来预测因变量Y...发展趋势。...简单线性回归模型 Y=a+b*X+e Y——因变量 X——自变量 a——常数项,是回归直线在纵轴上截距 b——回归系数,是回归直线斜率 e——随机误差,即随机因素对因变量所产生影响...回归分析函数 lm(formula) formula:回归表达式y~x+1 lm类型回归结果,一般使用summary函数进行查看 预测函数 predic(lmModel,predictData...,level=置信度) 参数说明: lmModel:回归分析得到模型 predictData:需要预测值 level:置信度 返回值:预测结果 data <- read.table('data.csv

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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Rgrep和grepl函数

在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们要找东西,或者向量那几个元素包含我们要查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含要查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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两步法搞定:Pythonh5ad文件 转为Rseurat对象

问题来源 AnnData对象(Python)和Seurat对象(R)分别是两个非常流行单细胞RNA测序数据分析框架核心数据结构。...有很多工具可以完成python对象adata和Rseurat对象转换,但是很多情况下,我们使用别人提供r包来转换都会失败,就算是seurat自带转换r包有时候也会报错。...不支持数据类型:某些特定数据类型或结构可能在一个框架中有良好支持,而在另一个框架则不是。例如,Seurat和AnnData在处理稀疏矩阵或复杂细胞分群信息时可能会有所不同。...通用解决方案 不管是在r还是python ,只是数据存储结构不同而已。但是数据本身没有变化。...pwd 第二步,在R读取导出数据,并创建seurat对象 cellinfo=read.csv("/home/data/t040413/heart_muscle/item1_NF_DCM_HCM/fibroblast

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巧用R各种排名窗口函数

函数对比 SQL窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应函数: ?...1 row_number函数 R语言中row_number函数与sqlrow_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复编码...2 min_rank函数 R语言中min_rank函数与sqlrank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同记录编码是不同,min_rank就是解决这个问题,对相同记录编码相同...同样得到与sql相同输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中ntile函数与sqlntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数函数名几乎与sql4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言排名窗口函数输出结果与sql输出结果有点不同:R语言数据结果不改变原来数据顺序

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translate函数用法_fork函数循环

字符消息被送到调用线程消息队列,在下一次线程调用函数GetMessage或PeekMessage时被读出。 ....参数: lpMsg 指向一个含有用GetMessage或PeekMessage函数从调用线程消息队列取得消息信息MSG结构指针。 ....返回值: 如果消息被转换(即,字符消息被送到线程消息队列),返回非零值。...如果消息没有转换(即,字符消息没被送到线程消息队列),返回值是零。 . 备注: TranslateMessage函数不修改由参数lpMsg指向消息。...Windows CE:Windows CE不支持扫描码或扩展键标志,因此,它不支持由TranslateMessage函数产生WM_CHAR消息lKeyData参数(lParam)16-24取值。

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