在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...不应该停止你创建自己的函数可视化对象！ 创建一个新的主题 当创建一个新的主题时，从已有主题出发总是好的实践（例如，theme_grey()），然后使用%+replace%替换需要该包的元素。...如果出于一些原因你想要将其保留在Suggests，那么可以利用vctrs::s3_register()仅当ggplot2被安装时才注册你的泛型函数。
R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状 如果想用其他形状，有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes...ggstar这个R包的整体结构暂时还看不明白，但是定义形状的部分自己能够修改。...在 primitive.R 代码中 plxy 就是一个形状的数据，第一列是x，第二列是y 比如上图中28的形状 square diamond 把中心掏出一正方形的空白 data.frame(x=c(0,...) source("ggstar02/geom_star.R") source("ggstar02/primitive.R") source("ggstar02/utilities.R") library...，就能够把这个形状用于ggplot2的散点图中
有读者询问如何对散点图拟合非线性的曲线。实际上我们通常看到的无论是直线拟合还是各种曲线拟合都属于广义线性模型。 这里我们构造一组数据来看看如何使用 ggplot2 来拟合数据。...<- data.frame( x = x, y = y ) 使用 ggplot2 绘制散点图： library(ggplot2) p <- ggplot(df, aes(x, y)) +...geom_point() p 我们先直接利用 geom_smooth() 对散点进行平滑拟合，默认使用的是 loess 方法。...，我们可以通过 R 支持的公式来设定如何拟合散点。...，然后使用线条添加在图上也是可以的。
patchwork是基于ggplot2的拼图包，因为ggplot2本身没有强大的拼图语法，而一般使用的gridExtra与cowplot的拼ggplot2图形都存在不少问题。...我关注这个包蛮久了，现在Github上的Star数已经远超大部分的R包，但似乎还没有发布到CRAN。我的工作看似跟作图相关，写的博文大多数也如此，但实际对图形的掌控力并不咋的，所以还是要多多学习。...下面进入正题，掌握好ggplot2与patchwork的基本用法，一般的图形都可以搞定了，并必要搞的很复杂。解决问题是关键，认真工作也是关键，画图看起来是，其实不是。.../patchwork") 导入： p_load(patchwork) # 或 # library(patchwork) 例子 patchwork的使用灰常简单，使用+把要拼的图加在一起就可以了。...我们不用创建对象，也可以像ggplot2本身使用一样相加。
包的名字是 tayloRswift 对应的github链接是 https://github.com/asteves/tayloRswift 安装方式 install.packages(c("tayloRswift...")) 总共涉及到11个专辑的封面 离散型变量或者连续型变量都可以使用 下面用鸢尾花的数据集演示 library(ggplot2) library(tayloRswift) colnames(iris...scale_color_taylor()或者scale_fill_taylor() 默认是离散型配色，如果是连续型数据可以指定参数discrete=F 这个配色风格用到科研上也未尝不可，哈哈哈，大家感兴趣的可以自己试试这个代码
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！...解决办法是有的，我们可以使用order选项设定。...如果我们要改变图例顺序，按下面的操作，将color变成1，然后fill使用默认排序： # And we can reverse the order p + guides( color = guide_colorbar...当然，如果你理解了上面的英文文档，怎么设定怎么排都是可以的。
因此，我们只需要根据这些类分配不同的宽度。我们在下面使用 mutate 来创建宽度，并使用case_when来分配宽度。后者在SQL用户中是众所周知的。...边界框 在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东，因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...我们将使用蓝色阴影来绘制我们的河流类。此外，我们将大小限制定义为从 0 到 0.3 的数值范围。我鼓励你玩这个范围，看看你会得到什么。...最后，我们使用一系列 alpha 值来使较大的河流在地图上突出显示。 # 4....在本教程中，您学习了如何导入河流空间文件以及如何在 R 中制作欧洲的炫酷河流地图。随时检查完整代码这里，克隆存储库并根据需要重现、重用和修改代码。
图形中的文本有时需要使用数学表达式，如 的2.5需要使用下标，单位 涉及到希腊字母和上标，以及一些比较复杂的大型符号，如求和符号 、积分符号 等。...对此，R语言的基础包提供了完善的处理办法： grDevices工具包提供了这些数学表达式的语法； base工具包的expression()函数用于将这些语法在图形中转换成实际的效果。...下面举例说明： 语法x^2对应的实际效果是 ，输出代码是expression(x^2)； pi表示圆周率，代码expression(x^2)在图形中输出的就是圆周率的符号； 一些文本需要使用特殊格式，...以上例子对应的R代码如下： par(plt = c(0.05,0.95,0,1), ps = 20, adj = 0.5, family = "mono") plot(1:6, type = "...其他 需要注意的是，以上 语法虽然由R语言的基础绘图系统工具包grDevices提供，但它属于通用语法，也可以在ggplot2绘图系统中使用。
ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机，但是往往在我们用ggplot2画图时候，需要根据需求更改坐标，图例等，最常见的就是更改x，y坐标系的名称。...在ggplot2中，坐标系与比例尺和参考线是自动生成的，并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板，今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺，调整中断和标签，修改轴和图例等。...强大的 Scale包，可以实现在ggplot基础上，对图形进行微调及更改。...for discrete axes demo_datetime for data / time axes # install.packages devtools::install_github("r-lib
因为之前自己已经学习过R语言基础的一些内容，包括：数据类型与数据结构、函数与R包、R语言作图基础等，今天的学习内容主要是《R数据科学》这本书的第一章——使用ggplot2进行数据可视化。...1.1准备工作ggplot2是tidyverse的一个核心R包，首先需要加载tidyverselibrary(tidyverse)此处用到内置数据mpg（mpg是一个数据框）复习数据框的概念：变量（列）...见上图（2）在使用facet_grid(drv ~ cyl)生成的图中，空白单元的意义是什么？它们和以下代码生成的图有什么关系？...facet_grid()只会是单列或者单行，不需要nrow和ncol这两个参数。（6）在使用函数facet_grid()时，一般应该将具有更多唯一值的变量放在列上。为什么这么做呢？...（statistical transformation, stat）:绘图时用来计算新数据的算法stat_count()可以替换geom_bar()每个几何对象函数都有一个默认统计变换每个统计变换函数都有一个默认几何对象
最近在学习R语言包的开发流程，看了之前分享过的关于吉普力工作室电影的配色包的代码，觉得里面的代码并不复杂，没准我也可以搞一个。...模仿这个包的代码，我尝试把NBA各个球队logo配色整理成了R语言ggplot2包作图的时候可以使用的配色函数。...颜色来源于链接 https://usteamcolors.com/nba-colors/ 首先将颜色整理成为一个yml格式的文件，基本文件格式如下 image.png 这里颜色最多的是太阳队，有7个可选...(name = name,direction = direction),...) } scale_color_nbalogo_d<-scale_colour_nbalogo_d 使用这些颜色 首先是读取颜色.../Rpackagedev/ggNBAlogo/",pattern = "*.R",full.names = T) lapply(x,source) 接下来使用太阳队和雷霆队的配色来举个例子 library
加载R包 pkgs = c('tidyverse', 'forcats', 'gtools', 'ggplot2', 'ggpubr', 'cowplot', 'scales',...~season) # 条形图分面宽度相同，只展示使用的因子水平 p + facet_grid(....~season, scale="free") # 条形图分面宽度自动调整 p1 <- p + facet_grid(....and ggplot2(https://r-graph-gallery.com/line-chart-dual-Y-axis-ggplot2.html) Combine ggplot2 Line & Barchart...with Double-Axis in R (2 Examples)(https://statisticsglobe.com/combine-ggplot2-line-barchart-double-axis-r
R适用于统计分析，绘图的一款编程软件，R属于开源，自由，免费的软件。随着生物信息学的发展，R语言在数据分析和绘制图形上都有着十分重要的优势。尤其是现在大部分科研绘图，都使用R语言来完成的。...那么下面我就用所学R知识不多的情况下教大家绘制这幅SCI配图。 本次绘图工具：RStudio。 RStudio是R的集成开发环境，界面更加丰富实用，使用起来更加方便。...本次绘图所使用的R包：ggplot2和ggpointdensity ggplot2是R语言绘制图形一个十分重要也是非常基础的一个包，使用ggplot2再加上R自带的base画图基本可以完成所有图形的绘制...1.获取和设置工作路径 使用setwd()和getwd()来获取和设置自己的工作路径。...ggpointdensity) 3.导入数据 data = read.csv("1_zd_aodPM25.csv") 4.使用ggplot2开始画图 p2 = ggplot(data, aes(x=
(mapping = aes(x = cut, y = freq),stat = identity) #使用场景2：不统计count，统计prop（比例） ggplot(data = diamonds...总之，aes()函数是ggplot2包中非常重要的一个函数，它可以帮助我们将数据可视化，并控制图形属性，使得我们能够更好地理解数据。...ggplot ggpubr的画图可以赋值给变量 可以用于图上加p值 p <- ggboxplot() my_comparisons <- list() ggplot2::ggsave 图片保存 ggsave...dev.off() dev.new() dev.off()是一个用于关闭图形设备的函数。在R中，我们可以使用不同的图形设备来绘制图形，例如屏幕、PDF文件、PNG图像等。...切换图形设备：在R中，可以使用pdf()、png()、jpeg()等函数打开多个图形设备。使用dev.off()函数可以切换到之前开设的某个设备上，以便继续在该设备上进行图形绘制。
abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p <-...x轴，则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library(ggplot2) p <- ggplot...~variable) p 2.5 density()与density2d() 很多时候当我们获取的数据集样本数量足够时，通常我们可以绘制密度估计图来大致描述数据集数据的分布，ggplot2中当然提供了这类方法...，我们先从一维的说起： geom_density()： 和R基本绘图系统中的密度曲线绘制方法很接近： library(ggplot2) data <- data.frame(matrix(rnorm
除了基础图形，grid、lattice和ggplot2软件包也提供了图形系统，它们克服了R基础图形系统的低效性，大大扩展了R的绘图能力。...四种常见的作图系统中，ggplot2包基于一种全面的图形“语法”，提供了一种全新的图形创建方法。这个包极大地扩展了R绘图的范畴，提高了图形的质量。...ggplot2包的使用。...小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。ggplot2包在定义组或面时使用因子(factor)（主要涉及函数facet_grid()）。 ggplot2很强大，能够创建各种各样的信息图。...在基础图形中可以实现的图形“组合”在ggplot2中自然也不是难事，可以使用函数facet_wrap()和函数facet_grid()创建。
R具有强大的统计计算功能和便捷的数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统：基础图形（base）、网格图形（grid）、lattice图形和ggplot2。...其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观，逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...书中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R包ggplot2实现的，充分展现了ggplot2生动、翔实的一面。...本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数（图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色）。...facet_wrap( ~ class) # class为变量 facet_wrap()默认使用相等数量的行和列，比如说分面为4时，行与列为2x2；分面为5时，为3x3。
然而，图形语法的翻译在ggplot2中没有对应关系（它的作用是由内置的R功能发挥的）。...4.3.2 使用gglot()创建绘图时的简单概念 Ggplot2的算法很简单：您提供数据，告诉ggplot2如何将变量映射到几何，使用什么图形，它负责细节。...因为即使我们使用了许多缺省值，ggplot2的显式语法语法也相当冗长，这使得快速尝试不同的绘图变得困难。它还模仿plot()函数的语法，使ggplot2对于熟悉Base R图形的用户更容易使用。...要实际绘制散点图或折线图，我们必须使用geom图层显式地请求gglot()。对象p是类ggPlot的R S3对象，由数据和其他包含关于该图的信息的组件组成。...我们举例说明了facet_grid(x~.)。和facet_grid(.~y)网格分面，分别使用来自iris数据集的萼片宽度与萼片长度的先前散点图。
，为了方便后续的开发，需要使用pycharm集成的mongo可视化插件， 这其中我们遇到了一些"不使用默认端口的坑"（大佬一笑而过。。。）...指定使用的端口也没用 ? 2、pycharm的mongo插件无法连接，mechanism尝试default,报错如下， ?...解决： 1、首先搞清 mongo与mongod 要先启动mongod（有d的一般是守护进程，或服务本身），再mongo（连接服务） 2、发现巡风的数据库xunfeng配置时，指定了端口 65521，而不是默认的...27017； 而巡风的配置文件Config.py里会写明，所以用巡风的脚本Run.sh启动时，完全没有问题； ?...成功 这里记着要用使修改后的conf生效（但为啥：每次都要指定，或用配置文件启动 ），这样才会连接成功； 总结： 其实就是数据库的服务启动时的问题， 1、没有启动服务 2、在没有使用默认端口的情况下没有指定使用的端口
1.数据介绍 使用R包自带的mpg数据集，前几行展示如下。 library(ggplot2) head(mpg) ? 2.使用图形属性 比如说：散点图点的形状/透明度/颜色用第三个属性表示。...ggplot2的分面有两种方式，分别使用 facet_wrap 或 facet_grid 函数。...使用facet_grid(drv~cyl)生成的图中，空白单元的意义说明drv与cyl在该单元没有关系。以下代码可以看出两者之间的关系。...参考资料 ggplot2作图详解4：分面（faceting） https://blog.csdn.net/u014801157/article/details/24372507 《R数据科学》 这是今天...R可视化的学习笔记，我们下次再见。
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