R使用DataTable进行闪亮的移位列名 - 腾讯云开发者社区

大家好,上周我着重研究了对于聚类分析的一些基础的理论的知识学习,比如包括公式的推导,距离求解的方法等方面,这一周我结合资料又对系统聚类分析法和动态聚类分析法进行了一些学习,希望通过这一篇文章可以来对这两种方法来进行比较...一:系统聚类分析 1:系统聚类一次形成以后就不能再改变,所以这就需要我们在第一次分析的时候就要比较的准确,因此我们也需要准确率更高更优秀的分类方法. 2:相应的计算量可能会很大,比如说Q型系统聚类法的聚类的过程就是在样本间距离矩阵的计算上进行加深从而进行的...三:所使用的R语言函数: 在这里我们使用的是R语言当中提供的动态聚类的函数kmeans()函数,kmeans()函数采用的是K-均值计算法,实际上这是一个逐一进行修改的方法. kmeans()的主要形式是...输入这些数据是一个痛苦的过程,请大家自行体验: 接下来,将使用scale函数对数据进行中心化或者标准化的处理,这样做的目的是为了消除这些小数量级别影响以及一些单位的影响 ?...第二步:使用kmeans()函数进行动态的聚类分析,选择生成类的个数为5个: ? 产生这样的结果: ?

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使用R包SomaticSignatures进行denovo的signature推断

比如：0元，10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》这个文献，研究者就是使用R包SomaticSignatures进行denovo的signature推断，拿到了11个自定义的...，然后读入R，并且制作成为 SomaticSignatures 包的输入数据的代码如下： library(data.table) b=fread('.....不同的特征有不同的生物学含义【2】，比如文章【3】就是使用了这些signature区分生存！...主要是R包deconstructSigs可以把自己的96突变频谱对应到cosmic数据库的30个突变特征。...，所以使用SomaticSignatures 包的identifySignatures函数哦，代码如下： # 预先设定待探索的 signature 数量范围，文章最后选定11个 if(F){ n_sigs

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使用R包deconstructSigs根据已知的signature进行比例推断

R包SomaticSignatures进行denovo的signature推断，比如：0元，10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》这个文献，研究者就是使用R包SomaticSignatures...R包SomaticSignatures进行denovo的signature推断。...这个时候，就会根据自己的11个signature进行分解，而不是原来的R包内置的signatures.cosmic 和 signatures.nature2013两种分解模式。...但是可以对比两次的11个signature分解的差异。首先看看教程：使用R包deconstructSigs根据已知的signature进行比例推断，的比例情况： ?...然后看看教程：使用R包SomaticSignatures进行denovo的signature推断，的比例情况； ?

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R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一行命令就可以完成诸多任务，另一方面是处理快，内部处理的步骤进行了程序上的优化，使用多线程，甚至很多函数是使用C写的，大大加快数据运行速度。...； drop 需要取掉的列名或者列号，要其它的； colClasses 类字符矢量，用于罕见的覆盖而不是常规使用，只会使一列变为更高的类型，不能降低类型； integer64 读如...，R层次的C代码 data.table TRUE返回data.table，FALSE返回data.frame 可见1.8GB的数据读入94秒，读入文件速度非常快 fwrite 对数据框数据进行处理后...； verbose 如果TRUE，在工作台产生交互信息，默认options(datatable.verbose=TRUE) 对于前面的DT，我现在将f和d开头的列名的列作为测量变量，如下 pattern...也有不同之处，一是use.names参数，可以指定是否使用相同列名bind，二是rbindlist可以使用在不知道对象名字的情况下，比如lapply(fileNames, fread) 。

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C#二十七 Dataset和DataAdapter

查：从DataTable里面获得某一列也是使用索引器的方式： DataColumnc=dtPerson.Columns[＂psnName＂]; //按列名获得该列对象 DataColumnc=dtPerson.Columns...) { Console.WriteLine(＂列名：{0}＂,dc.ColumnName); } 4.3.3 DataTable的Rows集合：增：向DataTable里面增加数据行使用...改: 因为数据集的实际数据就保存在行里，所以修改行数据是数据集里面最常用的一个操作，修改行也是先使用表的索引器先获得行，然后再使用行的索引器进行修改： DataRow r=dtPerson.Rows...[0]; r[＂psnSex＂]= ＂女＂; //按列名修改该行的值 r[0]=＂＂; //按列索引修改行，这里是修改该行的第一列数据查: 获得某个表的某一行使用表的索引器，获得行的某一列值使用行的索引器...，使用方式我们在介绍修改行的时候已经介绍过了，你可以通过数据集直接使用索引获得某行某列的值，要注意返回的值是object类型的，要想获得具体的值还需要进行类型转换：获取Person表第二行psnName

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R tips：使用最近邻算法进行空间浸润带的计算

本文使用最近邻算法进行浸润带的计算。空间组学中，有的时候需要对免疫浸润带进行特定距离的划分，形成一层一层的浸润区域。...圈选ROI并计算浸润边界下载的数据使用Xenium explorer打开，然后找到需要进行计算浸润带的位置，并根据方向将相应的全部选中。...如下图所示，假设中间的位置是需要进行浸润带计算的位置，而需要计算浸润带的方向是向下，则在Xenium explorer中选择套索工具仔细的圈画浸润边界，并将浸润带计算方向上的所有细胞选中。...cell_idx, ] %>% mutate(x = x_centroid, y = y_centroid ) 获得了浸润边界的两组细胞之后，就可以进行浸润边界的计算： # 根据tumor_area...使用最近邻算法往下寻找浸润区域假设需要以250um为单位，分别找到250um 500um及750um的浸润区域，则可如下操作：先定义一个最近邻的工具函数： # reduceFindNN find all

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R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一行命令就可以完成诸多任务，另一方面是处理快，内部处理的步骤进行了程序上的优化，使用多线程，甚至很多函数是使用C写的，大大加快数据运行速度。...当使用dt_names = names(DT)的时候，修改dt_names会修改原data.table的列名，如果不想被修改，这个时候应copy原data.table，也可以使用dt_names <-..."), # default: TRUE data.table=getOption("datatable.fread.datatable") # default: TRUE ) input输入的文件，或者字符串...,默认FALSE,如果TRUE，跳过空白行 key，设置key，用一个或多个列名，会传递给setkey showProgress,TRUE会显示脚本进程，R层次的C代码 data.table,TRUE...with 默认是TRUE，列名能够当作变量使用，即x相当于DT$"x",当是FALSE时，列名仅仅作为字符串，可以用传统data.frame方法并且返回data.table，x[, cols, with

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使用R语言进行机制检测的隐马尔可夫模型HMM

p=9686 ---- 在本文中，将对“牛市”和“熊市”两个独立机制下的市场收益进行模拟。隐马尔可夫模型识别处于特定状态的概率。...是否有两个，三个，四个或更多个“真正的”隐藏市场机制？这些问题的答案在很大程度上取决于要建模的资产类别，时间范围的选择以及所使用数据的性质。 ...第一个任务是安装depmixS4和quantmod库，然后将它们导入R。...： plot(returns, type="l", xlab='', ylab="Returns") [R 在此阶段，可以使用Expectation Maximization算法指定隐马尔可夫模型并进行拟合...使用quantmod库下载：绘制gspcRets时间序列显示2008和2011时期： plot(gspcRets) [ 使用EM算法拟合隐马尔可夫模型。

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如何使用R的sweep函数对表达矩阵进行标准化

做归一化的方法也很多，有根据中位数进行归一化，即将每个样本中所有基因的表达值的中值转换到同一水平。...如下图所示除了中位数标准化之外，我们还可以使用z-score的方法来对表达谱数据进行标准化： z-score=(表达量-均值)/标准差那么下面小编就给大家演示一下如何使用前面讲到的☞R中的sweep...函数，使用z-score的方法来对表达谱矩阵进行标准化 #为了保证随机数保持一致，这里设置一下种子序列 set.seed(123) #随机生成100个数，构造一个10X10的矩阵 data=matrix...) #每一行基因表达值除以这一行的标准差 data2=sweep(data1,1,rowsd,'/') data2 得到的结果如下如果对R里面scale这个函数比较熟悉的小伙伴，可能已经发现了，scale...=t(scale(t(data))) data3 得到的结果如下，有兴趣的小伙伴可以去对比一下跟使用sweep函数得到的结果。

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AjaxPro2完整入门教程

，在开始使用的时候必须输入这个类文件的完整命名空间很麻烦，后来研究了一下，发现是可以重新命名的具体的方法如下：省了我们不少功夫。...3.关于接收返回值上面的实例中我们使用的是最普通的方式，只有当这个值返回之后才能继续执行下面的代码，可能部分有经验的开发者可能会问有没有异步方式，当然是有的。...访问具体哪一行通过Rows[index]的方式即可，如果要方位其中的一个数据可以直接通过 Rows[index].列名来访问。...当然你也可以通过这种方式来访问，最后的结果是一致的：Rows[index][列名] 2.保存来自客户端的DataTable 上面我们看到方法addColumn以及addRow或许你会觉得这些功能有什么用...这里注意看每行的数据，我们采用的是对象字符串的形式进行封装的，这就是为什么我们在获取到DataTable类型数据之后可以直接通过 *.Rows[index].列名的方式能够访问的来源。

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你需要学会100个使用R语言进行的统计检验例子吗

看到了微信聊天群有人推荐了《100 STATISTICAL TESTS IN R》，该书籍介绍了基于R的100个统计检验小例子。我简单的看了看目录，全英文的，很生疏，感觉没有多大意思。...所以，我让chatGPT帮我罗列了最常见的10个使用R语言进行的统计检验例子，如下所示，以供参考： t检验：比较两组样本均值是否显著不同，例如比较两组学生在某一门考试成绩的差异。...生存分析：用于比较不同组的生存时间，例如比较两组患者在治疗前后的生存曲线。 McNemar检验：用于比较配对二分类变量的分布是否存在差异，例如比较两种诊断方法的准确性。...而且chatGPT还给我了R语言代码案例： # 两组样本的t检验 # 假设数据存储在两个向量x和y中 result <- t.test(x, y) print(result) # 多组样本的单因素方差分析...在使用这些检验前，请确保对统计检验有足够的理解，并根据实际情况进行适当的数据处理和分析。另外，R语言中有许多相关的包和函数可以实现更多类型的统计检验，您可以根据具体需求搜索相关文档和资料。

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将Excel转换为word_excel如何将横排变成竖排

下面主要讲一下思路： 1.将表格读取为DataTable类型 2.逐行读取DataTable的内容 3.根据读取到内容生成对应的XML表即可。...下面讲述一下具体的实现：在ReadTable中进行路径设置 public class ReadTable { string tablepath = ""; public...null) { int rowCount = sheet.LastRowNum + 1;//+1 包括列名的行...public void DtoXml(string path) { CreateXml(path); } } } 里面的所有变量都需要在实例化的时候进行赋值...在.net中这样调用即可在Unity中可将编译后的dll放置在unity 的Plugins文件夹下使用，同样能达到效果，具体如下：最后我已经将所有需要的dll打包，放置在CSDN了，5个币就可下载

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函数周期表丨其他丨表丨DATATABLE

DATATABLE函数 DATATABLE函数属于“其他”函数，隶属于表函数。可能从名称上看，小伙伴差不多能猜到这个函数的用途，其作用有点类似于其他编程语言中的创建语法，可以添加新的数据。...注释：白茶只介绍此函数的基本用法，实际应用中不推荐使用此函数。...语法 DAX= DATATABLE (列名, 类型, 列名, 类型..., {{值, 值...}, {值, 值...}...}) 参数列名：顾名思义，这一列的名称。类型：对应列的数据格式。...{ "牙膏", "正常", "12" }, { "毛巾", "停产", "3" }, { "杯子", "正常", "15" } } ) 结果如下：因为此函数的使用相对比较简单...，再加上使用频率不是很高，白茶这里就不做过多的描述了，仅作为了解即可。

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asp.net core导出导入excel

使用NPOI导入导出excel,已经封装好Action可以直接调用导出效果图使用方法定义导出实体 class Student { public int Id { get; set; }...导出到Excel文件excelConfig中FileName设置为全路径 #region DataTable导出到Excel的MemoryStream /// .../// DataTable导出到Excel的MemoryStream Export() /// /// DataTable...new int[dtSource.Columns.Count]; string[] arrColName = new string[dtSource.Columns.Count];//列名...workbook.GetCustomPalette(); NPOI.HSSF.Util.HSSFColor XlColour = XlPalette.FindColor(SystemColour.R,

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C#实现Excel合并单元格数据导入数据集

实际的情况，客户经常会提供一些合并单元格的Excel表格，如下图中的“所在部门名称”列：再畅想一下，假设有跨列的情况如下：解决导入，一种方法，是让客户进行单元格拆分或技术服务人员进行拆分后再导入。...均代表各自的表集合 3、Worksheet与Table进行对应，产生和导入实际的数据范例运行环境操作系统： Windows Server 2019 DataCenter 操作系统上安装 Office...} } 创建DataTable 如果首行是列数据，则以该行的值创建表结构，否则自动创建以“C”为前缀的列名，如C1、C2...Cn以此类推。...），这也是Cell.Value和Cell.Value2的区别 2、创建表列名字段过度依赖于单元格的值，可能会创建失败，建议定义参数指定是否重写列名 3、是否只导入指定的sheet或活动的sheet。...这些选项都可以根据实际的业务进行扩展，我们在此仅讲述了一些操作Excel相关的关键方法和属性，这里仅作参考，欢迎大家评论指教！

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datatable删除行

1.如果只是想删除datatable中的一行，可以用DataRow的delete，但是必须要删除后让DataTable知道，所以就要用到.AcceptChanges()方法，原因是这种删除只是标识性删除...datatable的RemoveAt()会在删除后更新dataTable的index，所以你要删除的index可能已经不是你的符合Convert.ToInt32(dt.Rows[i][“RowID”])...DataRow中主要包括一下几种信息：1、行中每一列的当前值，2、行中每一列的原始值，3、行状态，4、父行与子行间的链接初始化一个DataRow： DataTable dataTable＝dataSet.Tables...： row[“列名”]，row[列号]均可引用其中的一个属性 DataColumn a=dataTable.Columns(“列名”); //可以获得一个列对行进行批处理更改： BeginEdit()...开始更改，EndEdit()结束更改，同时将更改结果写入DataSet，CancelEdit()，取消更改例如： row.BeginEdit(); 对row进行更改 row.EndEdit(); 发布者

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实战：第十七章：xlsx文件导入数据入库

.getStringCellValue().replaceAll(" ", ""))){ throw new RuntimeException("客户名称不存在与之匹配的列名...2).getStringCellValue().replaceAll(" ", ""))){ throw new RuntimeException("别名不存在与之匹配的列名...).getStringCellValue().replaceAll(" ", ""))){ throw new RuntimeException("责任人不存在与之匹配的列名....getStringCellValue().replaceAll(" ", ""))){ throw new RuntimeException("客户类型不存在与之匹配的列名....getStringCellValue().replaceAll(" ", ""))){ throw new RuntimeException("客户级别不存在与之匹配的列名

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使用NPOI导出，读取EXCEL（可追加功能）

使用NPOI导出，读取EXCEL，具有可追加功能看代码 1 using System; 2 using System.Collections.Generic; 3 using System.Text...="blnAppled">是否是追加模式 22 /// DataTable的列名是否要导入...的列名 69 { 70 IRow row = sheet.CreateRow(0); 71...> 113 /// 第一行是否是DataTable的列名 114 /// ...返回的DataTable 115 public static DataTable ExcelToDataTable(string fileName, string sheetName

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【8】数据浏览表格的快速输出

，不再指定特定的列名，而是对dt的所有列进行显示。...： dt：数据表 KeyField：关键字段名 tableid：表格的html节点id，便于使用样式进行控制 HideColumn：隐藏列，不显示该列，用“|”进行定界。...如："ID=编号;出版单位=出版社;" ShowDel：是否显示删除链接 ShowEdit：是否显示编辑链接 LinkColumn：需要进行链接的列名 LinkStyle：链接的样式 DelPage..., string NameChange) 这些简化的方法，在不需要复杂表格的地方使用。...3、新的数据列如果需要展示一些动态的数据列，可以对DataTable进行处理，插入新列，填充新值，再传递给生成函数。

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使用R语言的Mfuzz包进行基因表达的时间趋势分析并划分聚类群

本篇简介一个R包，Mfuzz（http://mfuzz.sysbiolab.eu）。...本篇不涉及Mfuzz的详细计算细节，主要简介如何在R语言中使用Mfuzz包执行聚类分析。...一篇使用到Mfuzz包聚类的相关文献案例首先来看一篇文献的部分内容，我当初也是在这篇文献中第一次看到了使用Mfuzz包对时间序列划分聚类群。...使用Mfuzz包执行时间序列的聚类分析根据帮助文档的操作过程，加载Mfuzz包后，将数据表读取到R中，执行数据转换、标准化、聚类等一系列操作，将具有相似的时间表达特征的蛋白聚在一类。...由于直接使用的Gao等（2017）的蛋白质组数据，我们期望重现原作者的分析，您可以将分析结果和原文献进行比较，发现结果是基本一致的。

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使用R语言进行聚类的分析

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