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R语言入门之频率和列联

‍‍ ‍‍‍‍‍‍在这一期我们将要学习如何针对分类变量数据创建频率和列联,之后在此基础之上进行独立性检验、关联度测量以及相关数据的可视化。 ‍...创建频率和列联 R语言提供了许多方法来创建频率和列联,在这里我们主要介绍三种常用的函数,它们虽有各自的特点,但大同小异,大家在学习中能细细体会出来。 1....函数table() #首先自己创建训练数据(这里的数据是随手编写的,不具有科学性) #所有的数据都是分类变量(这里选择的是二分类变量) #建立2维频率 A <- c(rep("male",15),rep...当然table()函数也可以生成高维的数据(3个及以上的变量),不过这时候使用ftable()函数可能会得到更好的展示效果: # 创建3维频数表 mytable <- table(A, B, C) table...但是由于这些功能我们也可以通过R的基本函数来实现,所以这里就不对CrossTable()这个函数进行过多讲解,感兴趣的朋友可以使用方法?CrossTable()自行了解和学习。 ‍‍‍ ‍

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R语言 分组计算,不止group_by

最近在研究excel透视图,想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅,顺便学习分享一下。R自带数据集比较多,今天就选择一个我想对了解的mtcars数据集带大家学习一下R语言中的分组计算(操作)。...group_by和summarise多变量分组计算 2 ddply 2.1 ddply语法 2.2 ddply分组计算示例 3 aggregate 3.1 aggregate语法 3.2 aggregate...分组计算示例 3.3 aggregate分组计算补充(formula形式) 4 splite ---- 正文 首先给大家看一下mtcars数据集的基本情况,data.frame类型,32个观测对象,11...,可以是一个也可以是多个,多个的话以逗号分割group_by(mtcars, vs, am) 1.2 summarise语法 data为数据集,如果data被group_by定义分组,则根据分组变量分组计算...(group, sex)" 3 aggregate 3.1 aggregate语法 aggregate(x, by, FUN)x为数据集by为分组变量列表FUN为计算函数 3.2 aggregate分组计算示例

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R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...☞R生成临床信息统计 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...duplicated(clin$case_submitter_id) #提取非重复的样本的临床信息 clin=clin[index,] 可以得到如下临床信息 前面给大家讲过☞肿瘤TNM分期,我们知道组织病理分期分成...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...】R中的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计 ☞玩转TCGA临床信息

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R语言】dplyr对数据分组取各组前几行

下面这张就是GO富集分析得到的结果,我们可以根据ONTOLOGY这一列来分组,就可以得到BP,CC和MF三个组。然后取每一个组的前10个条目或者前5个条目来绘制柱形图或者气泡图。...那么问题来了,如何分组取前几行。今天小编就跟大家分享一个专业处理数据框的函数dplyr。然后基于这个R包,我们用6种不同的方法来实现。...) 我们先来看看直接head的效果 #直接head,结果不对 GO_result %>% group_by(ONTOLOGY) %>% head(n = 5) 虽然,我们使用了group_by进行了分组...,但是head并没有应用到三个分组上面,而是直接应用到了整个数据框上,事与愿违。...> all_equal(r1,r2) [1] TRUE > all_equal(r1,r3) [1] TRUE > all_equal(r1,r4) [1] TRUE > all_equal(r1,

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跟着Nature学作图:R语言ggplot2频率分布直方图

empowers tomato breeding https://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8 没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据...,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图 今天的推文重复一下论文中的Figure2c 频率分布直方图 image.png 部分示例数据截图 image.png 作图数据用到的是R2那一列...(\textit{R}$^2$)"), y="Frequency (%)")+ geom_vline(xintercept = 0.7,lty="dashed") -> p1 p1...image.png 这里我个人认为把直方图的边框加上然后颜色深一些可能会好看一点 ggplot(data=dat.fig2c,aes(x=R2))+ geom_histogram(aes(y=...()函数好用 比如这里设置 横坐标轴标题的斜体和上标的代码x=TeX(r"(\textit{R} 示例数据和代码可以自己到论文中获取

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R语言简单随机分组区组随机分层随机

当然还有其他种类,关于随机分组问题,我推荐大家看医咖会的这篇文章:10篇文章全面了解随机分组,赶快收藏![1] 本文主要介绍如何使用R语言完成随机分组。...简单随机(simple randomization)又称为完全随机,是最简单的一种随机分组方法。医学统计学中经常会遇到完全随机设计的xxx,指的就是简单随机分组!...上述方法通过SPSS可以实现,大家可以参考这篇文章:SPSS实现简单随机分组[2] 根据这个思路,R语言也是可以实现的。...R语言在临床研究设计中的使用非常成熟,在cran task views中有两个专题都是关于研究设计的,大家感兴趣的可以自己去看一看哦。...18 0.79647582 18 C ## 19 19 0.62653890 12 C ## 20 20 0.22537775 2 T 除此之外,还有非常多的R包可以实现随机分组

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​Power BI透视怎么快速做分组?| 实战技巧

导语:数据分组汇总比较在日常数据快速分析过程中非常有用,在Excel里可以直接在透视上进行操作,但Power BI里的操作有一点点儿不同。...其实操作也很简单,只是他的操作并不是直接在透视(矩阵)上操作,而是针对需要分组的字段(列)进行操作而已。...(双击右边框内的组名即可): 此时单击确定,分组即完成,然后将“组”添加到矩阵中,并展开,结果就和Excel里透视一模一样了: 当然,很多时候,我们做分组,通常会将不分组的内容作为其他,和分组的内容进行做对比...,然后,点击“分组”: 此时,“机械”也将分到“金属钢材”的组里: 如果需要取消分组,那就选中右侧相应的内容,然后点击“取消分组”即可。...,有时候,对于数字的分组,可能不是按照等距进行的,这时,就不得不说一下分组的基本原理——其实也很简单,分组其实就是在Power BI数据表里新建了一个列,这个可以在数据视图里查看:

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WIFI 2.4G及5G信道划分(附无线通信频率分配

1 802.11ac 2014年1月发布 各种调制类型的数据率;200mbps、400mbps、433mbps、600mbps、867mbps、1.3Gbps(请查看下面的2) 802.11n无线标准在...2 不管是802.11b/g还是802.11a/b/g/n/ac一般都支持13个信道。它们的中心频率虽然不同,但是因为都占据一定的频率范围,所以会有一些相互重叠的情况。...中只列出信道的中心频率。每个信道的有效宽度是 20MHz,另外还有2MHz的强制隔离频带(类似于公路上的隔离带)。...世界各个地区WIFI 2.4G及5G信道一览 2.4 GHz(单击查看清晰原图) ? 5 GHz (单击查看清晰原图) ? 史上最全最详细无线通信频率分配 ?...备注: P-GSM,基准GSM-900频带 E-GSM,扩展GSM-900频带(包括基准GSM-900频带) R-GSM,铁路GSM-900频带(包括基准和扩展GSM-900频带) T-GSM,集群无线系统

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