一个小技巧分享，假如有人写了很多绘图脚本，比如文献：《Preoperative immune landscape predisposes adverse outcomes in hepatocellular...里面就有很多R代码 ： 代码文件很多 如果把这些R代码文件一个个打开，然后一个个运行，工作量也不小，所以我们推荐一个技巧： fs=list.files('..../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) 这个技巧有一个小问题，就是有一些脚本可能是缺包或者里面有小...其实理论上应该是在运行每个脚本的时候加上try catch，不过咱们的目标是批量运行每个代码并且保证成功，所以跳过那些运行失败的解决不了问题，反而应该是勇往直前解决问题。...，然后批量运行成功为止。
今天，我们利用健明老师推荐的批量运行多个R脚本代码，见证一下该代码的优势。...patients with liver transplantation》的 GitHub (https://github.com/sangho1130/KOR_HCC) ，我们发现其共包含19个R脚本...然后，我们一个一个打开脚本检查了一下其所用到的R包，下载好所要用到的所有R包。但是在下载R包过程中我们发现RGtk2和rsgcc这两个包一直报错，没有解决掉这个问题。...所以，我们把包含这两个包的5个脚本剔除，把剩下的14个R脚本进行批量运行。 #这两个R包下载失败了,如果你们下载成功了，也欢迎分享以下方法！.../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) #正常运行结果 [1] "Figure_1A.R
曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》，介绍了批量运行R脚本的思路，同时也提出了一些问题，今天就这个学徒作业，我们来探究一下。 首先前往github[1]下载R脚本。...打开以后可以发现这里有19个R脚本，如果把这些R代码文件一个个打开再运行，无疑增加了很多工作量。...首先在「KOR_HCC-main/code」文件夹中新建一个R project，然后在「KOR_HCC-main」文件夹下新建一个「results」目录。...实测在我的R环境下，运行到第3个代码遇到了报错，此时Fig 1A和Fig 1B的结果已经产生。 这个时候我们希望脚本继续运行，同时打印各个脚本的运行情况。...cleanup-code} 第一次学习tryCatch，经过反复调试，修改代码为 fs=list.files('.
显示快捷键帮助 ctrl+b 空格键 采用下一个内置布局，这个很有意思，在多屏时，用这个就会将多有屏幕竖着展示 ctrl+b !...然后按enter键后就会恢复到shell终端状态 ctrl+b d 脱离当前会话；这样可以暂时返回Shell界面，输入tmux attach能够重新进入之前的会话 tmux的常规运维命令...即从终端环境进入会话。 第一个参数a也可以写成attach。后面的aaa是会话名称。
d退出虚拟终端，但不是结束 screen -ls 查看虚拟终端列表 screen -r id 进入指定的终端 screen -S aming screen -r aming screen screen...，虚拟的一个屏幕，也可以理解为一个虚拟的终端 需求，执行一个脚本，需要一天一夜，而且脚本会输出一些东西出来，这就意味着这个脚本不能中途断开，保证脚本不中断，有两种方法： 方法一：把这个任务丢到后台去...方法二：screen工具，可以把要执行的命令，放到这个终端里，然后在退出pts/0之前，可以把screen丢到后台去，随时用， 随时查看 安装screen包——>yum install -y screen...在安装完成后，直接敲screen命令，回车，会进入到screen，进入到一个窗口，这个窗口就是一个虚拟终端 在虚拟终端，执行vmstat 1命令，然后 ctrl+a键 同时按，随后再按 d键 ，就把...[root@hf-01 ~]# screen命令，多个虚拟终端同时运行 screen可以执行多个虚拟终端，同时运行 若想进入到其中一个，指定id即可 [root@hf-01 ~]# screen [
文章目录 一、报错信息 二、问题分析 三、解决方案 一、报错信息 ---- 在 Android Studio 的 Terminal 终端执行 gradlew 报错 , 报错信息如下 : PS Y:\002...gradlew app:dependencies --configuration releaseRuntimeClasspath gradlew : 无法将“gradlew”项识别为 cmdlet、函数、脚本文件或可运行程序的名称...请检查名称的拼写，如果包括路径，请确保路径正确，然后再试一次。...所在位置 行:1 字符: 1 PS Y:\002_WorkSpace\001_AS\Coroutine> gradlew gradlew : 无法将“gradlew”项识别为 cmdlet、函数、脚本文件或可运行程序的名称...Windows 终端发生了改变 , 原来的中断是 Windows cmd 命令行中断 ; 最新的 Android Studio 中 , 使用的是 Windows PowerShell 终端 ; 在 Windows
cmd + shift + o 当前文件所有符号列表 @: 符号列表@后输入冒号，符号分类排列 cmd + t 在多个文件进行符号跳转 cmd + F12 跳转到函数的实现位置 shift + F12...函数引用列表 ctrl + - 跳回上一次光标所在位置 ctrl + shift + - 跳回下一次光标所在位置 代码自动补全 快捷键 描述 ctrl+ space 调出建议列表 cmd + shift...task 任务 debug 调试功能 term创建和管理终端实例 view 打开各个 UI 组件 窗口管理 快捷键 描述 ctrl + w 窗口切换 ctrl + r 切换文件夹 ctrl+r cmd+...Terminal 在集成终端中运行当前脚本 cmd+shift+p Run Selected Text In Active Terminal 在集成终端中运行所选文本 任务管理 快捷键 描述 cmd...） 鼠标操作 文本选择 双击鼠标，选中单词 三击鼠标，选中一行 四击鼠标，选中整个文档 单击行号，选中行 文本编辑 选中后可以拖动文本到指定区域 拖动过程中按option，变成复制文本到指定区域
只要再次登录到主机上执行screen -r就可以恢复会话的运行。同样在暂时离开的时候，也可以执行分离命令detach，在保证里面的程序正常运行的情况下让Screen挂起（切换到后台）。...查看窗口和窗口名称 打开多个窗口后，可以使用快捷键C-a w列出当前所有窗口。如果使用文本终端，这个列表会列在屏幕左下角，如果使用X环境下的终端模拟器，这个列表会列在标题栏里。...这时可以使用下面命令强制将这个会话从它所在的终端分离，转移到新的终端上来： 清除dead 会话 如果由于某种原因其中一个会话死掉了（例如人为杀掉该会话），这时screen -list会显示该会话为dead...发送命令到screen会话 在Screen会话之外，可以通过screen命令操作一个Screen会话，这也为使用Screen作为脚本程序增加了便利。...关于Screen在脚本中的应用超出了入门的范围，这里只看一个例子，体会一下在会话之外对Screen的操作： screen -S sandy -X screen ping www.baidu.com 这个命令在一个叫做
只要再次登录到主机上执行screen -r就可以恢复会话的运行。同样在暂时离开的时候，也可以执行分离命令detach，在保证里面的程序正常运行的情况下让Screen挂起（切换到后台）。...会话共享 Screen可以让一个或多个用户从不同终端多次登录一个会话，并共享会话的所有特性（比如可以看到完全相同的输出）。它同时提供了窗口访问权限的机制，可以对窗口进行密码保护。...假设你在和朋友在不同地点以相同用户登录一台机器，然后你创建一个screen会话，你朋友可以在他的终端上命令： [root@TS-DEV ~]# screen -x 这个命令会将你朋友的终端Attach到你的...3.发送命令到screen会话 在Screen会话之外，可以通过screen命令操作一个Screen会话，这也为使用Screen作为脚本程序增加了便利。...关于Screen在脚本中的应用超出了入门的范围，这里只看一个例子，体会一下在会话之外对Screen的操作： [root@TS-DEV ~]# screen -S sandy -X screen ping
我从对 Linux 一无所知到现在能够熟练使用（主要是 Ubuntu）总共花了两个月的时间，现将学习 Linux 过程中一些细碎的知识点记录如下。...tab 没有补全，则说明有多个待补全的名称，需要再按一次 tab CTRL+SHIFT+T 新建标签页（编程时有重要应用） Bash 常用快捷键 快捷键 作用 ctrl + c 强制终止当前的命令...我输入了一行很长的命令，不使用退格键一个一个字符的删除，使用这个快捷键会更加方便 ctrl + y 粘贴 ctrl + u 剪切的内容 ctrl + r 在历史命令中搜索，按下 ctrl + r 之后，...就会出现搜索界面，只要输入搜索内容，就会从历史命令中搜索 ctrl + d 退出当前终端或键盘输入结束（EOF） ctrl + s 暂停当前程序，暂停后按下任意键恢复运行 ctrl + z 将当前程序放到后台挂起...shift + PgDn 将终端显示向下滚动
screen 用于命令行终端切换 补充说明 Screen是一款由GNU计划开发的用于命令行终端切换的自由软件。用户可以通过该软件同时连接多个本地或远程的命令行会话，并在其间自由切换。...它提供了统一的管理多个会话的界面和相应的功能。 会话恢复 只要Screen本身没有终止，在其内部运行的会话都可以恢复。...只要再次登录到主机上执行screen -r就可以恢复会话的运行。同样在暂时离开的时候，也可以执行分离命令detach，在保证里面的程序正常运行的情况下让Screen挂起（切换到后台）。...查看窗口和窗口名称 打开多个窗口后，可以使用快捷键C-a w列出当前所有窗口。如果使用文本终端，这个列表会列在屏幕左下角，如果使用X环境下的终端模拟器，这个列表会列在标题栏里。...这时可以使用下面命令强制将这个会话从它所在的终端分离，转移到新的终端上来： 清除dead会话 如果由于某种原因其中一个会话死掉了（例如人为杀掉该会话），这时screen -list会显示该会话为dead
当我们用VSCode或者直接在终端用python命令去执行一个.py文件的时候就是用的Python解释器来运行的，这么一说大家应该比较清晰这个概念了吧。...敲击回车后终端直接显示了运行了结果，最后我们通过exit()跳出解释器，三个右尖括号也随之消失。...在class12.py脚本文件中，我们定义了三个函数，我们先用python命令进入解释器，然后用importclass12把这个脚本文件调进解释器里面，注意不要把.py加上。...像例子中用import命令调用一个脚本文件的方式我们以后会在有多个脚本文件的时候频繁使用，请大家拭目以待。 练习题 1，进入Python解释器，自行运行一些简单代码。...2，自己写一个脚本文件，里面写几个函数，然后在解释器中分别运行。 3，写两个脚本文件，在其中一个文件的开头用import命令调用另一个，尝试运行里面的函数。
Linux expect详解 2018-07-11 分类：Linux Shell / 系统运维 / 编程开发 阅读(6670) 评论(0) 随处可见的expect 第一次见expect这个命令还是我第一次参加全量上线的时候...，那是公司的一个牛人用Shell脚本写的一套自动部署、MD5 比对、发布的全量上线工具，没事的时候，看了下其中的几个脚本，好多的expect命令。...在实际工作中，我们运行命令、脚本或程序时，这些命令、脚本或程序都需要从终端输入某些继续运行的指令，而这些输入都需要人为的手工进行。...如果没有这一句登录完成后会退出，而不是留在远程终端上。...这就是对上述这段简单简单脚本的分析，在上述的示例中，涉及到expect中一个非常重要的概念——模式-动作；即上述expect "*password*" {send "$password\r"}这句代码表达出来的含义
假如你的机器有多个IP，就可以指定由其中一个启动rsyncd服务，如果不指定该参数，默认是在全部IP上启动。 []：指定模块名，里面内容自定义。 path：指定数据存放的路径。...yum install -y screen screen直接回车就进入了虚拟终端 ctral a组合键再按d退出虚拟终端，但不是结束 screen -ls 查看虚拟终端列表 screen -r id...进入指定的终端 screen -S aming screen -r aming screen screen，虚拟的一个屏幕，也可以理解为一个虚拟的终端 需求，执行一个脚本，需要一天一夜，而且脚本会输出一些东西出来...在虚拟终端，执行vmstat 1命令，然后 ctrl+a键 同时按，随后再按 d键 ，就把screen丢到后台了 执行screen ls 命令，列出当前所有的session 执行screen -r 再加查看到的...[root@hf-01 ~]# screen命令，多个虚拟终端同时运行 screen可以执行多个虚拟终端，同时运行 若想进入到其中一个，指定id即可 [root@hf-01 ~]# screen [
R中的命令行界面（后台）在哪? 就在大家经常忽略的地方：写着terminal！ 问题来源 昨天我们发现需要更新BioManager至3.18的话，就需要更新600多个r包。R包安装失败怎么办？...解决办法 在命令行中实现BiocManager::install(version = "3.18")，即在R的命令行界面之外安装Bioconductor版本或R包，可以通过调用R脚本执行。...在命令行（比如终端、命令提示符或PowerShell）中，切换到包含你的R脚本的目录，然后运行： nohup Rscript install_bioconductor.R >myout.log 2>&...1 & 这是一条在Linux/Unix系统下的命令，用于在后台运行一个命令并将输出重定向到一个文件中。...&: 这个符号是将整个命令放入后台运行，以便你可以在终端中继续输入其他命令，而不用等待该命令执行完毕。
前言 正如标题所说，此技术很早以前就有了，但是其中一些利用思路也值得我们借鉴，因为网站运维人员或管理员，经常会备份网站，以及设置一些定时任务来优化网站管理，所有这项攻击技术，我们也会经常用到。...基础知识 在shell终端中，我们经常用通配符来偷懒，来匹配我们想要的内容，无论是文件还是目录，都适用。 认识部分通配符： * 匹配任意多个字符 ?...通配符劫持的第一次利用-chown命令扩展(chown劫持) 如果你对Linux/Unix系统稍微了解过，就知道，在系统下，一切皆文件，而文件也会属于某个用户，某个组，也会相应的文件操作的权限，可读可写可执行...那么接下来我们的利用就来了，网站运维人员和管理员有时会遇到很多文件和很多目录的需要更改所有者，所属组，那么聪明的运维大大，就会偷一波懒，在终端敲以下命令，并为此很满意，不错不错！...通配符劫持的第二次利用-tar命令的扩展(tar劫持） tar命令是我们在linux系统中常用的一条命令，无论是解压文件还是压缩文件，都很nice！
前言 正如标题所说，此技术很早以前就有了，但是其中一些利用思路也值得我们借鉴，因为网站运维人员或管理员，经常会备份网站，以及设置一些定时任务来优化网站管理，所有这项攻击技术，我们也会经常用到。...在shell终端中，我们经常用通配符来偷懒，来匹配我们想要的内容，无论是文件还是目录，都适用。 认识部分通配符： * 匹配任意多个字符 ?...通配符劫持的第一次利用-chown命令扩展(chown劫持) 如果你对Linux/Unix系统稍微了解过，就知道，在系统下，一切皆文件，而文件也会属于某个用户，某个组，也会相应的文件操作的权限，可读可写可执行...那么接下来我们的利用就来了，网站运维人员和管理员有时会遇到很多文件和很多目录的需要更改所有者，所属组，那么聪明的运维大大，就会偷一波懒，在终端敲以下命令，并为此很满意，不错不错！...通配符劫持的第二次利用-tar命令的扩展(tar劫持） tar命令是我们在linux系统中常用的一条命令，无论是解压文件还是压缩文件，都很nice！
一些控制脚本的方式：向脚本发送信号、修改脚本优先级，在脚本运行时切换到运行模式 16.1 处理信号 linux利用信号与运行在系统中的进程进行通信。...所以可以将后台运行的程序的STDOUT和STDERR进行重定向。 16.2.2 运行多个后台作业 同时启动多个后台作业就可以了。...在终端会话中使用后台进程要注意，ps命令的输出中，每一个后台进程都和终端会话（pts/0）终端联系在一起。如果终端会话退出，那么后台进程也会退出。...16.3 在非控制台下运行脚本 需求：在终端启动脚本，让脚本一直运行到结束，即使退出了终端会话。 nohup命令可以做到。它运行了另外一个命令来阻断所有发送给该进程的SIGHUP信号。...比如： $atrm 3 16.6.2安排需要定期执行的脚本 可以设置每天指定时间运行一次，或者每周一次，每月一次。 cron程序可以安排定期执行的作业。
5、交互窗口，在查看->交互窗口，会在下面显示交互的窗口，在空白处点击右键，选择将交互发送至所有标签，这样在交互窗口输入的命令，会同时在多个标签中同 时执行，有时候为了验证配置情况，需要各自show run...，有了这种方法，就可以一次性搞定所有的输入了。...6、脚本录制，脚本->开始录制脚本，在配置之前打开脚本录制，结束后停止脚本录制，保存成一个脚本文件，关闭软件后，重新打开执行之前的脚本，相当于由机器自动完成了之前的所有配置。...可以用锁定会话，在个人离开后，避免被别人误操作。可以锁定一个或多个session。...中用鼠标选中一段字符，就可以直接复制到剪切板，按鼠标右键完成粘贴。
@linuxprobe ~]# free -h 1．在RHEL 8及众多的Linux系统中，最常使用的Shell终端是什么？...12．在使用rm命令删除文件或目录时，可使用哪个参数来避免二次确认呢？ rm -r rm -f 答：可使用-f参数，这样即可无须二次确认。...并通过10多个实战脚本的实操练习，达到在工作中灵活运用的水准 linux系统中一切都是文件，而配置一个服务就是在修改其配置文件的参数。...； 第三、四行的可执行语句也就是我们平时执行的Linux命令了 除过运用Bash来运行Shell脚本以外，还可以通过直接运行文件执行。...答：在Shell脚本中，$0代表脚本文件的名称，$3则代表该脚本在执行时接收的第3个参数。 5．if条件测试语句有几种结构，最灵活且最复杂的是哪种结构？
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