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使用Rmerge()函数合并数据

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 使用Rmerge()函数合并数据R可以使用merge()函数去合并数据,其强大之处在于在两个不同数据中标识共同列或行。...如何使用merge()获取数据集中交叉部分 merge()最简单形式为获取两个不同数据交叉部分。举例,获取cold.states和large.states完全匹配数据。...但他们都几类型参数有关: x: 第一个数据. y: 第二个数据. by, by.x, by.y: 指定两个数据匹配列名称。缺省使用两个数据相同列名称。...如何理解不同类型合并 merge() 函数支持4种类型数据合并: Natural join: 仅返回两数据匹配数据行,参数为:all=FALSE....Frost来自cold.states数据,Area来自large.states. 上面代码执行了完整合并,填充未匹配列值为NA。 总结 本文详细介绍Rmerge()函数参数及合并数据类型。

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R语言 数据、矩阵、列表创建、修改、导出

数据数据创建数据来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...,data.frame数据允许不同不同数据类型,但同一列只允许一种数据类型*数据括号内行在列前df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4),...R语言将列名特殊字符-转化了,该编号可能与其他数据编号无法匹配,ex2 <- read.csv("ex2.csv“",row.names = 1,check.names = F) #row.names...xlsx,可以用import_list,此时不同工作簿作为list里不同元素#import高度依赖后缀读写,不能有错export(a,file="b.xlsx") #也可以按工作簿导出数据属性(包括维度...2元素赋值修改数据连接merge函数可连接两个数据,通过指定公共列使具有相同元素合并*merge函数可支持更复杂连接,但通过inner_join等更为简便,后述test1 <- data.frame

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R语言数据结构(三)数据

数据结构是指在计算机存储和组织数据方式,不同数据结构有不同特点和适用场景。R语言中常用数据结构,包括向量、矩阵、数组、列表和数据。...数据每个向量可以是不同类型,但同一列元素必须是相同类型。 创建数据 创建数据一种常用方法是使用data.frame()函数,它可以将多个向量组合成一个数据。...而数据行名和列名分别对应着数据行和列标识符,可以用row.names()和colnames()函数来获取和设置。 行名:数据每一行都有一个行名,用于标识不同行。...列名数据每一列都有一个列名,用于标识不同列。列名是一个字符向量,可以通过colnames()函数获取或设置。...# 2 Bob FALSE 21 London 删除数据 下面示例代码展示了如何使用负数索引和subset()函数在R语言中删除数据行或列,并在每个操作后注释了相应输出结果。

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r语言学习day6

语法为inner_join(x, y, by = NULL, ...),其中x和y是要合并两个数据,by是指定用于合并列名。...merge()函数是基础R函数,其语法为merge(x, y, by = NULL, ...),也是用来合并两个数据,by参数也是指定用于合并列名。...merge()函数是基础R一部分,无需额外加载包即可使用。默认行为:在某些情况下,inner_join()和merge()默认行为可能略有不同。...例如,当两个数据存在重复列名时,inner_join()会自动为其中一个数据重复列名添加后缀以区分,而merge()函数则不会自动处理,需要手动指定后缀。...总体而言,inner_join()函数提供了更为简洁和易读语法,适用于在数据处理大多数情况,但是如果你更熟悉基础R函数或者需要与基础R其他函数进行交互,那么merge()函数也是一个很好选择

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据、矩阵、列表

数据 data.frame 数据 约等于表格:1.数据不是一个具体文件,只是R语言内部一个数据;2.数据每一列只能有一种数据类型 图片 新建和读取数据 #新建和读取数据 df1 <- data.frame...#如何数据最后一列?..."r2","r3","r4") #只修改某一行/列名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" # | 或符号前后不可以连接字符,只能用于数字,逻辑值 两个数据连接 test1 <...,sort = T) #左连接,即新合并数据,保留test1保留选中name列所有元素,新数据没有的数据显示NA,sort表示按列排序 merge(test1,test3,by.x...='name',by.y = 'NAME', all.y = TRUE,sort = T)#右连接,即新合并数据,保留test3保留选中name列所有元素,新数据没有的数据显示NA,

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Day5:R语言课程(数据、矩阵、列表取子集)

学习目标 演示如何从现有的数据结构取子集,合并及创建新数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...我们将filter()在后面的课程更详细地探讨该功能。 2.列表 从列表中选择组件需要略有不同表示法,即使理论上列表是向量(包含多个数据结构)。...从random列表中提取向量 age第三个元素。 从random列表数据 metadata中提取基因型信息。 ---- 3.导出文件 到目前为止只修改了R数据; 文件保持不变。...write.table也是常用导出函数,允许用户指定要使用分隔符。此函数通常用于创建制表符分隔文件。 注意:有时在将具有行名称数据写入文件时,列名称将从行名称列开始对齐。...为避免这种情况,可以在导出文件时设置参数col.names = NA,以确保所有列名称都与正确列值对齐。 将向量写入文件需要与数据函数不同

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生信学习-Day6-学习R

在这个特定例子,向量 vars 包含了两个元素,它们都是字符串:"Petal.Length" 和 "Petal.Width"。这两个字符串通常对应于数据列名。...这样做目的通常是为了在后续函数调用简化代码,特别是在你想要操作数据特定列时。 这会从 your_data_frame 数据中选择列名与 vars 向量字符串相匹配列。...包 inner_join 函数来合并两个数据(data frames)命令。...这个函数执行是一个内连接(inner join),它会将两个数据具有相同键值行组合在一起。这里 "键值" 是用于连接两个数据列。...这意味着函数将查找 test1 和 test2 列名为 "x" 列,并基于这两列匹配值来合并行。只有当两个数据中都存在列 "x" 且某些行在这一列值相等时,这些行才会出现在最终结果

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3.9生信

图片 数据来源: 可由代码新建、已有数据转换或处理、读取表格文件、R语言内置数据 内置数据多用于新手练习,eg:iris、volcano、letters、LETTERS 新建数据: 图片 ##A....按名字 df1【,"gene"】 df1【,c('gene','change')】 d.按条件(逻辑值) df1【df1$score>0,】 图片 图片 如何数据最后一列?...如何数据除了最后一列以外其他列? df1【,-ncol(df1)】 “-”是针对数据使用,“!”...是针对逻辑值使用 C.数据修改 a.改一个格 df1【3,3】 <- 5 b.改一整列 df1$score <- c(12,23,50,2) c.改行名和列名 rownames(df1) = c("r1...","r2","r3","r4") 修改行名 d.只修改某一行/列名 colnames(df1)【2】 = "CHANGE" 将第二列名字改为CHANGE e.两个数据连接merge merge

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 04 文件读写与认知

读取ex1.txt ex1 <- read.table("ex1.txt") #列名不能正确表示,并且内容数值变为了字符串 ex1 <- read.table("ex1.txt",header =...# check.names= 表示检查看列名是否存在特殊符号,F表示保持原文件符号 #注意:数据不允许重复行名 rod = read.csv("rod.csv",row.names = 1) rod...列名是什么 dim(soft) colnames(soft) 将数据导出成表格文件 #5.将soft导出为csv write.csv(soft,file = "soft.csv") #导出成csv格式...图片 将一个项目的不同部分分别存在不同文件夹 图片 图片 图片 # data.table包fread函数 soft = data.table::fread("soft.txt",data.table...csv文件 图片 补充知识 矩阵如何生成 # 1.由数值型数据转换 m1 = as.matrix(iris[,1:4]) # 2.由向量改变维度而来 m2 = matrix(rnorm(18),nrow

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基础知识 | R语言数据分析之表格处理

R语言处理数据R很多内置函数,用于数据基本操作,比如转换、分组、排序、拼接等,常见函数有rbind(),cbind(),dplyr(),tidyr(),reshape2,tidyverse...数据处理是ggplot2绘图基础,同时也是R语言中花费时间较多工作之一,提高数据处理效率能够很快得到可靠美观图片。 01 表格拼接 #构建数据 ?...merge()函数,合并数据x和y列名向量,如果有些数据y列名没有数据,也会默认为是匹配x列名数据。 #构建数据 ? ?...>dm1<-merge(df1,df2,by="x",all=TRUE)#by是合并x和y共享列名向量,默认为两个表之间有共享键列。如果y没有键列,则默认为x键。...all=TRUE是x=TRUE,y=TRUE简写 >dm2<-merge(df1,df3,by.x="x",by.y="f")#by.x与by.y是分别指左边数据匹配列,右边数据匹配列 >dm3

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【生信技能树培训笔记】R语言基础(20230112更新)

本培训使用R 4.2及以上版本。一、前言用R分析数据得出结果,需要解决两个问题:用什么包/函数来处理数据如何整理数据,使得数据可以套进函数里进行处理?...指定列名称取交集,其余列均包含在新数据。...,若仍旧需要按照这两列取交集合并,则可以具体指定两个列名称,如下:(注意指定列名称顺序需与前面指定数据顺序对应)> merge(test1,test3,by.x = "name",by.y = "...:描述:将两个数据按照共同列或行名称进行合并。...默认all=FALSE,表示只取共同列或行相同值内容进行合并,当指定all=TRUE时,取两个数据中指定行列并集进行合并,任一表缺失值,则用NA填充。

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左右用R右手Python9——字符串合并与拆分

接下来跟大家大致盘点一下在R语言与Pyhton,常用字符串分割与合并函数。...R语言: 字符串向量: 针对向量: strsplit #针对字符串向量(拆分) str_split #针对字符串向量(拆分)stringr包内函数 paste #针对向量合并 针对数据...: unite #合并数据某几列 separate #将数据某一列按照某种模式拆分成几列 R语言: library(dplyr) library(stringr) library..."01" "09" "04" "02" "05" "07" "00" "12" [1] "18" "15" "28" "00" "11" "20" "31" "19" "04" "12" 接下来解释在如何直接针对数据进行合并与分列操作...,第一个参数数要操作数据名称,第二个参数是合并列名(或者待拆分列名),第三部分是待合并列名向量(拆分后新增列名),sep是拆分(合并)依据,remove则控制输出数据是否包含原始向量

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rbind坑?

这两天在合并数据时候发现了一个神奇现象,rbind竟然可以合并不同列名矩阵,而且不做任何提醒,在三个版本R上都遇到了这个现象,看来不是个例。这样会明显造成数据错误呀!...举例如下: 构建数据和矩阵 建了个超级简单数据和矩阵。...后面我有换成全是数值试了下,结果是一样。 rbind合并数据 合并就出现我上面描述现象啦! #数据合并报错,没问题!...rbind(df1, df2) Error in match.names(clabs, names(xi)) : names do not match previous names #矩阵和数据合并..."A" "13" [5,] "D" "16" [6,] "c" "20" 如何避免呢 看来以后做矩阵之间rbind要小心了,要么保证顺序一致,要么换种方法啦!

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两个神奇R包介绍,外加实用小抄

新建一个数据并赋值给bioplanet这个变量(赋值符号<-还记得嘛)括号里是“列名”=列值,这里列名要加双引号。这里涉及几个给列填充数值函数有 rep,重复,括号填要重复字符和重复次数。...一列是一列,是魔鬼步伐。不要让sample1,2,3当列名,让他们多重复几遍,合并到一列。 数据由九宫格变成了一列,就可以用来跨包处理啦。 这就是实现了数据变形?。...gather:我就是刚才魔法棒 spread:我能让tidy data一夜回到解放前。 ? gather括号里分别是: 数据名,需合并列名合并key列名,value列名。...(正常来说列名不需要加‘’,大概是因为示例这个列名是纯数字缘故。) 其中,需合并列名也可以列在最后,这样,key=和value=可以省略。...这是根据相同列名进行合并,当在两个表格列名不一样时,需要在括号内加 by=c("col1"="col2") 其中col1和2分别是在两个表格合并列名 semi_join,anti_join

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R-语言学习-230910

R语言包括S3对象和s4对象。s3 包括基本数据结构:向量 矩阵 数据 数组 列表。s4 包括层级结构由s3组成。数据本质:长度相等向量按照列方式排列。c是列 r是行。...rbind cbind merge是合并列表:分量提取用[[]]s4对象提取 白色括号提取(点击绿色箭头)matrix要求向量类型相同,数据没有要求复制data.table包可以读取文本文件。...gene symbol最好不用作列名,因为其有空格,容易报错。标准表达矩阵一般列名是样本名,行名是基因名。预后效果是生存率。...plot函数lty是指line type 线类型 lwd是指line wide 线条宽度。...通过使用 palette 函数,您可以选择不同调色板来自定义图形颜色方案。

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数据分析 R语言实战】学习笔记 第三章 数据预处理 (下)

3.3缺失值处理 R缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值函数有两个,最基本函数是is.na()它可以应用于向量、数据等多种对象,返回逻辑值。...,变量名称就白动变成了新数据列名,也可以用names()重新给其赋值。...by指定合并依据(相同行或列) by.x by.y分别为第一个数据和第二个数据要连接列名 all, all.x, all.y逻辑值,默认为FALSE。...在R,选取数据子集用括号[] > data[data$salary>6] 3.4.3数据排序 R排序函数sort()只能对向量进行简单排序,对含有多变量数据集,需要用order指令来完成,...>t (data) 3.5.1揉数据函数 R中有两个揉数据函数stack()和unstack|(),用于数据长格式和宽格式之间转换. stack()把一个数据转换成两列:一列为数据,另一列为数据对应列名

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R tips:使用lapply和do.call读取并合并多个文件

R数据处理时,数据导入导出是常见操作,对于导入而言,如果源数据保存在多个文件,那么导入后首先就需要进行合并操作。 这个读取及合并操作可以使用lapply和do.call来完成。...先模拟几个数据文件,以用于导入### # 创建6个文件,每个文件有一个数据,为一行三列数据列名a,b,c dir.create("test") lapply(1:6, function(x){...2 2 #3 3 3 3 #4 4 4 4 #5 5 5 5 #6 6 6 6 这个方法很好用,有一个小问题:当数据列名不一样时,rbind会报错,比如: # 更改第一个数据列名为"d" "e"...,也可以将数据转换为matrix,比如: file_mat <- lapply(file_list, as.matrix) do.call(rbind, file_mat) #可以运行 # d...e f #[1,] 1 1 1 #[2,] 2 2 2 #[3,] 3 3 3 #[4,] 4 4 4 #[5,] 5 5 5 #[6,] 6 6 6 当转换为matrix时候,由于matrix内格式都是一样

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生信技能树 Day5 文件读写

,要先转换为R语言对象行名列名数据属性,可以设置,不是数据#1.读取ex1.txtex1 <- read.table("ex1.txt") # 列名变成了表格正式内容,数值列因列名加入变成了字符...x;列名_特殊字符被转化为.ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1,check.names = F) # 设置第一列为行名;不自动检查列名## 注意行名不能重复...,如果报错可以把去除重复值(两行求平均合并R语言转换完要检查一下,看行列名数据有没有变化,及时调整参数改正3....数据导出write.csv(ex2,file = "example.csv")write.table(ex2,file = "example.txt") # 写文件名时候把后缀带上4....#一个函数支持导出很多格式,见帮助文档export(ex1,file = "ex1.xlsx")注意:一定要经常检查数据,注意读取之后是数据还是矩阵,取完列里面是数值还是字符,处理完是什么类型等等R语言能够读取多种文件格式

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