当想用一个矩阵的数据 除以另一个矩阵的对应位置的数值时，可以直接用两个矩阵相除，例子如下 >a<-matrix(c(2,0,2,0),nrow = 2) > a [,1] [,2] [1,]...> a/b [,1] [,2] [1,] 4 Inf [2,] NaN 0 > table(a/b) 0 4 Inf 1 1 1 我们可以看到当a矩阵数字不为...0，b矩阵也为0时，会得到Inf，而a，b矩阵均为0时会得到NAN, Inf和NAN可以通过替换为0来进行后续的数据分析。
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https://www.runoob.com/r/r-matrix.html R 语言为线性代数的研究提供了矩阵类型，这种数据结构很类似于其它语言中的二维数组，但 R 提供了语言级的矩阵运算支持。...R 语言的矩阵可以使用 matrix() 函数来创建，语法格式如下： matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE,dimnames = NULL...R 语言矩阵提供了 t() 函数，可以实现矩阵的行列互换。...矩阵的乘法则较为复杂。两个矩阵可以相乘，当且仅当第一个矩阵的列数等于第二个矩阵的行数。...) print(result) # 两个矩阵相除 result <- matrix1 / matrix2 cat("相减结果：","\n") print(result) 执行以上代码输出结果为： [
在机器学习中，最后要计算混淆矩阵，常用的函数有: table confusionMatrix 下面以前馈神经网络为例来说明: > library("RSNNS") 载入需要的程辑包：Rcpp >...2.318266 iter 190 value 2.318228 iter 200 value 2.318209 final value 2.318200 converged > > #####预测和混淆矩阵
最近老有人在qq群或者公众号留言问浪尖如何将Spark Mllib的矩阵或者将一个RDD进行转置操作。...Spark Mllib的矩阵有多种形式，分布式和非分布式，非分布式在这里浪尖就不讲了，很简单，因为他是基于数组的。而分布式存储是基于RDD的，那么问题就又变成了如何将一个RDD进行转置。...首先我们来介绍一下什么是转置操作： 百科上的定义，将一个矩阵的行列互换得到的矩阵就是该矩阵的转置。...100.0,2.0), Vectors.dense(2.0, 20.0, 200.0,2.0), Vectors.dense(3.0, 30.0, 300.0,2.0) ) ) 生成矩阵
矩阵 矩阵（matrix）是一种特殊的向量，包含两个附加的属性：行数和列数，R生存矩阵按列存储 注意：向量不能看成只有一行或者一列的矩阵，二者不能混为一谈 矩阵的创建 利用matrix()函数 例如 matrix...")] c1 c3 r3 3 13 r5 5 15 drop处理意外降维 上面矩阵的引用1~5条，从一个矩阵中提取的结果都为向量，如果说，我取一行或者一列返回结果要求是矩阵，虽然说可以先去后变为矩阵...","r2"),c("c1","c2"))) > U2 <- det(U1) > U2 [1] -2 5.矩阵相乘 使用%*%进行矩阵相乘 > U3 <- matrix(c(5:8),2,2) > K...) #按照行把两个矩阵连接起来 > a r1","r2","r3","r4","r5","列均值") > b <- c("a1","a3","a3","a4","a5","行均值",) Error...) #按照行把两个矩阵连接起来 > a r1","r2","r3","r4","r5","列均值") > b <- c("a1","a2","a3","a4","a5","行均值") > dimnames
——荀子 这篇文章讲述的是R语言中关于向量与矩阵的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助！...如果您有想学习的知识或建议，可以给作者留言~ 一、创建向量和矩阵 1、创建向量：c()，查看长度length()，查看类型mode() 1、创建向量 # 创建向量 x1 <- c(2,4,6,8,0...超过部分 NA自动补齐 > letters[1:30] [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r"...此部分为矩阵的一些写法以及计算技巧 1、matrix()函数 创建矩阵用matrix()函数 > a1 <- c(1:12) # 创建一个三行四列的矩阵 > matrix(a1,3,4...，逆矩阵 solve()函数 # 先使用rnorm函数随机生成16个随机数，并创建矩阵 > a <- matrix(rnorm(16),4,4) > a [,1]
在微博有位朋友问我可达矩阵的计算，于是发了点时间用R语言写出来了。 问题如下： 计算过程： 注意：是矩阵的乘法。
前面我们讲了R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件，那么如何将这些fasta序列读到R里面，方便后面处理呢？今天小编就给大家演示一下如何利用R将fasta序列转成data.frame。...前面我们讲了四种获取fasta序列长度的方法，其实读到R里面之后，也能获取每条fasta序列的长度。...seq_len") row.names(tmp)=tmp[,1] tmp }) 最终得到的all_len也是一个长度为7的list 其中每一个元素也是一个data.frame 参考文献 R批量下载
作者：张丹(Conan) 来源：http://blog.fens.me/r-matrix/ 前言 R 是作为统计语言，生来就对数学有良好的支持。矩阵计算作为底层的数学工具，有非常广泛的使用场景。...用R语言很好地封装了，矩阵的各种计算方法，一个函数一行代码，就能完成复杂的矩阵分解等操作。让建模人员可以更专注于模型推理和业务逻辑实现，把复杂的矩阵计算交给R语言来完成。...本文总结了 R 语言用于矩阵的各种计算操作。 1....K.matrix(r, c=r) ，返回阶数为 p=r*c 的方阵，对于 r 行 c 列的矩阵 A，计算 A 和 t(A) 的直积。 计算公式： ?...， H.matrices(r, c=r) 使得 r 阶 c 阶的子列表的分量，计算从 r 行和 c 列的单位矩阵的列向量的外积导出的方阵。
今天，小编教大家用R语言绘制常用的多维数据展示图——气泡矩阵图。 首先，我们需要准备输入文件。 ?...准备好输入文件后，我们就可以打开R画图啦~ ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data 矩阵图就画好啦~大家赶快试试吧！ 具体细节大家可以搜索ggplot2的相关参数，根据自己的需求调整或者将图片导出为PDF格式，通过Adobe illustrator调整。
R语言中的常用数据结构，包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。关于数据结构的使用，我们将分四篇文章分别介绍每种数据结构的操作方法和代码示例。...为方便大家理解记忆，对每种数据结构的基本操作概括为四大类：创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍矩阵的使用矩阵矩阵是R语言中的一种二维数据结构，它是由一系列相同类型的元素组成的矩形数组...矩阵有两个维度，分别表示行数和列数，可以用dim()函数来获取。矩阵应用举例：创建矩阵创建矩阵的一种常用方法是使用matrix()函数，它可以将一个向量或多个向量组合成一个矩阵。...matrix()函数的参数有：data：表示要组合成矩阵的数据，可以是一个或多个向量。nrow：表示矩阵的行数，必须是一个正整数。ncol：表示矩阵的列数，必须是一个正整数。...修改矩阵修改矩阵中的元素可以使用赋值符号<-或者等号=。
本期我们以表达矩阵为例来做箱式图。 1 原始数据 常规的表达矩阵每一行为一个基因，每一列为一个样本，如果拿到的数据不符合上述规则，首先需要对数据进行调整。...标准的表达矩阵如下所示 sample1 sample2 sample3 gene1 1.82 2.24 0.98 gene2 1.01 1.26 1.25 gene3 -2.31 -3.33 -2.14...接下来我们使用rnorm()生成一个表达矩阵。...rownames_to_column() %>% # 将行名变成一列 mutate(group = rep(c("control","treatment"),each = 4)) # 新增group列 转置后的表达矩阵
“向量”——一维 “表格”——二维 matrix 矩阵-二维，只允许一种数据类型 data.frame 数据框-二维，每列只允许一种数据类型 list列表：可装万物 1.数据框来源 （1）用代码新建 （...2）由已有数据转换或处理得到 （3）读取表格文件 （4）R语言内置数据（没有赋值就可以直接使用的数据，例如iris） 2.新建数据框* 读取文件 df2<-read.csv("gene.csv") df2...df1$gene #"$"前是数据框名称 后是列名；提取该列的向量 #按名字取子集 df1 行，列 图片 5.数据框修改 取子集，赋值 #改行名和列名 rownames(df1) r1...","r2","r3","r4") #修改全部行名 #只修改某一行/列的名 colnames(df1){2} <- "CHANGE" #修改一个列名 6.两个数据框的连接 按照共同的列名取交集，后连接...两个数据框列中有交集时既可以使用，自动连接 矩阵新建和取子集 矩阵画热图 pheatmap::pheatmap(m) #热图结果默认聚类 pheatmap::pheatmap(m,cluster_cols
分享一篇我CSND博客里面的R语言矩阵操作, 可以通过编程理解很多线性代数的概念....round(solve(a)%*%a) 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 3.6 矩阵的广义逆矩阵 对于奇异阵，并不存在逆矩阵，但是可以计算其广义逆矩阵 a <- matrix...A <- matrix(c(1,2,3,3,2,1),2,3) A 1 3 2 2 3 1 B <- matrix(c(1,0,6,1),2,2) B 1 6 0 1 r1 <- dim(A)[...1];c1 <- dim(A)[2] r2 <- dim(B)[1];c2 <- dim(B)[2] direct_sum r2,c2)),cbind...(matrix(0,r1,c1),B)) direct_sum 1 3 2 0 0 2 3 1 0 0 0 0 0 1 6 0 0 0 0 1 欢迎关注我的公众号:R-breeding
著名的科学杂志《Nature》于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果。...该文提出了一种新的矩阵分解思想――非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization，NMF)算法，即NMF是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法。 ?...上图引自网络（有出处请告知），NMF的思想：V=WH（W权重矩阵、H特征矩阵、V原矩阵），通过计算从原矩阵提取权重和特征两个不同的矩阵出来。...今天我们给大家讲下在R语言中是如何实现的。先来看下NMF包的安装。这个有点麻烦，我们首先必须要把我们的R版本升级到3.6及以上，因为有个rngtools的依赖包所需要的环境是3.6及以上。 ?...<- nmf(V.random, 2:6,nrun=10, seed=123456) # plot measures on same graph plot(estim.r, estim.r.random
#矩阵Matrix 三个参数：内容（可省），行数，列数 > x <- matrix(1:6,nrow = 3,ncol = 2) #第一个是内容，第二个，第三个是行列 > x[1,2] [1] 4...> #维度属性 > dim(x) [1] 3 2 > #查看矩阵的属性 > attributes(x) $`dim` [1] 3 2 > #由向量来创建矩阵的方法 > y <-1:6 > dim(y)...[,3] [,4] [,5] [,6] [1,] 1 3 5 1 3 5 [2,] 2 4 6 2 4 6 > #使用列表给矩阵的行列命名
——荀子 这篇文章讲述的是R语言中关于矩阵与数组的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助！如果您有想学习的知识或建议，可以给作者留言~ 矩阵是一个按照长方阵列排列的复合或实数集合。...向量是一维的，而矩阵是二维的，需要有行和列。 在R软件中，矩阵是有维数的向量，这里的矩阵元素可以是数值型，字符型或者逻辑型，但是每个元素必须都拥有相同的模式，这个和向量是一致的。...R语言中比较出名的矩阵 iris3 state.x77 # 美国五十个州八个指标 使用heatmap()函数可以直接绘制热图 ?...C2 C3 C4 C5 R1 1 2 3 4 5 R2 6 7 8 9 10 R3 11 12 13 14 15 R4 16 17 18 19 20 # dim()函数可以显示向量的维数...，访问行 > m[,"C1"] R1 R2 R3 R4 1 2 3 4 5、矩阵的运算 此部分为矩阵的一些写法以及计算技巧 1、t()函数 实现矩阵的转置，行变列，列变行 >
R基本语法 获取帮助文档，查看命令或函数的使用方法、事例或适用范围 >>> ?command >>> ??...a的行数", nrow(a))) [1] "矩阵a的行数 5" > print(paste("矩阵a的列数", ncol(a))) [1] "矩阵a的列数 4" > > #查看或设置行列名 > rownames...TRUE > is.matrix(a) [1] TRUE > is.data.frame(a) [1] FALSE > is.data.frame(as.data.frame(a)) [1] TRUE R中矩阵运算...0.0000000 D 13 1.338366 4 0.6324555 0.0000000 E 4 1.000000 5 1.2649111 1.0916224 R中矩阵筛选合并...The idea is to give reasonable output for any R object.
导语 GUIDE ╲ ggcorr是一个可视化函数，可以用于将矩阵绘制为ggplot2图片 背景介绍 在进行生物信息学分析的过程中，经常需要通过计算得到一些连续变量的相关性矩阵，这种相关系数可以通过...R语言自带的cor函数得到，但是R并没有对矩阵提供可视化方法。...今天小编就将给大家分享一个精美的R语言绘制相关系数矩阵的软件包：ggcorr。ggcorr函数主要用于绘制相关矩阵图，它的主要依赖包是ggplot2。...GGally") library(GGally) library(ggplot2)##依赖包为ggplot2 ggcorr的使用 01 函数介绍 ggcorr( data,##包含连续数据的数据框或矩阵...method = c("pairwise", "pearson"),##一个包含两个字符串的向量 cor_matrix = NULL,##用于计算的命名相关矩阵 nbreaks = NULL
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