首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

R 数据整理(二:文本数据转换为数据框或列表

类似py 中的readlines 方法,同样,R 的函数也会逐行(识别) x_line <- readLines("MsigDB/h.all.v7.2.symbols.gmt") ps:发现对于gmt...thttp://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/cards/HALLMARK_HYPOXIA\tPGK1\tPDK1\tGBE1\tPFKL\tA" 'strsplit 函数文本按照换行符切割...接着我们需要将该列表元素再进行一些处理: names(x_split) <- vapply(x_split, function(x) x[1], character(1)) # 每个列表的第一个元素,...也就是通路名,作为列表名 x_split <- lapply(x_split, "[",-c(1,2)) # 删除每个列表中的前两个元素 # 这里 "[" 方法可以理解为 function(x) x[-...HALLMARK_MITOTIC_SPINDLE" [5] "HALLMARK_WNT_BETA_CATENIN_SIGNALING" [6] "HALLMARK_TGF_BETA_SIGNALING" 纯文本-> 数据

3.1K21

规模数据导入高效方式︱数据快速读入R—readr和readxl包

本文由雪晴数据网负责翻译整理,原文请参考New packages for reading data into R — fast作者David Smith。...以后读入都用你了~ Hadley Wickham 和 RStudio团队写了一些新的R包,这些包对于每个需要在R中读入数据的人来说都是非常有用的。readr包提供了一些在R中读入文本数据的函数。...readxl包提供了一些在R中读入Excel电子表格数据的函数。它们的读取速度远远超过你目前正在用的一些函数。 readr包提供了若干函数在R中读取数据。...我们通常会用R中的read.table家族函数来完成我们的数据读入任务。这里,readr包提供了许多替代函数。它们增加了额外的一些功能并且速度快很多。...它还可以读取多种格式的日期时间列,智能的文本数据读取为字符串(不再需要设置strings.as.factors=FALSE)。 对于Excel格式的数据,这里有readxl包。

99530

一句python,一句R列表、元组、字典、数据类型、自定义模块导入(格式、去重)

List(列表) 是 Python 中使用最频繁的数据类型。 列表可以完成大多数集合类的数据结构实现。它支持字符,数字,字符串甚至可以包含列表(所谓嵌套)。...__init__.py文件,该文件使得python解释器子目录整个也当成一个模块,然后直接通过“import 子目录.模块”导入即可。...、写出 1、python的read_csv #数据导入 df = pd.read_csv('....df.to_csv('uk_rain.csv') #write.csv(df,"uk_rain.csv") 约等于R中的write.csv(df,"uk_rain.csv"),其中df是数据的名称...数据保存: # 使用参数16表示doc转换成docx,保存成docx后才能 读文件 doc.SaveAs(r"D:\\test2.docx",16) doc.Close() word.Quit()

6.9K20

一文看懂用R语言读取Excel、PDF和JSON文件(附代码)

下面,我们用PostgreSQL的数据作为代码示例。首先加载三个必备程序包,其中,DBI和PostgreSQL将用来建立与数据库的连接以及发送请求。dplyr则是用来数据库中的数据保存到本地。...最好的办法是读取的内容使用jsonlite包转换成json列表的格式进行显示,以帮助理解文档的架构。...jsonlite包既能够完整地JSON格式的文件完整地解析和读取到R语言中来,也可以任何常见的R对象(object)输出成JSON格式。...详见代码演示部分 simplifyDataFrame:JSON数组中的记录强制转换成数据(data frame) simplifyMatrix:JSON数组中的向量强制转换成矩阵或数组 flatten...:自动嵌套的数据转换成非嵌套的平面数据 …:设置显示方法 首先以JSON常见的数组形式创建一个字符串向量,保存为example。

6.9K21

python3实现将json对象存入Redis以及数据导入导出

RDB:生成数据的时间点快照 手动让Redis进行数据保存:save 打开AOF功能:修改配置文件 appendonly yes Labwork 针对数据库第十次上机作业进行一些总结 作业要求是将以下两个...macOS上Redis的安装与测试 首先我们需要导入redis模块 import redis # 导入redis模块,通过python操作redis 也可以直接在redis主机的服务端操作缓存数据库...参考代码 # -*- coding=utf-8 -*- __author__ = 'XJX' __date__ = '2018.06.09' """ description: json对象存入Redis...redis-load还原数据 db.rdb文件上传到新的redis服务器上,进入到db.rdb目录,执行命令 < db.rdb redis-load; 或者 cat db.rdb | redis-load...如果导出时指定了数据库 cat db.rdb | redis-load –d 15 以上这篇python3实现将json对象存入Redis以及数据导入导出就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考

1.8K20

在 PyTorch 中使用 Detectron2 进行对象检测的指南

我们将使用的模型是在 COCO 数据上预训练的。 首先,我们必须定义对象检测模型的完整配置。我们从detectron2.config 模块中导入了'get_cfg' 函数,我们现在将使用它。...准备数据 我将使用气球数据,目的是检测图像中的气球。这是一个比较简单的例子。 !...我们的函数输入图像目录/文件夹路径作为输入。然后打开并加载 JSON 文件。我们通过JSON文件的记录枚举,得到图片路径。...在每个循环结束时,记录会附加到名为“dataset_dicts”的列表中。 类似地,边界框字典也附加到列表“objs”。该列表依次被分配为记录字典中“annotations”键的值。...定义数据和其他参数,如worker数、批次大小、类数(在本例中为 1)。 我们用预训练的权重初始化模型并进一步训练。最大迭代次数参数根据数据的大小和任务的复杂性而变化。

1.4K10

关于“Python”的核心知识点整理大全49

16.3 小结 在本章中,你学习了:如何使用网上的数据;如何处理CSV和JSON文件,以及如何提取 你感兴趣的数据;如何使用matplotlib来处理以往的天气数据,包括如何使用模块datetime...有了使用CSV和JSON文件的经验后,你将能够处理几乎任何要分析的数据。大多数在线数 据都可以以这两种格式中的一种或两种下载。学习使用这两种格式为学习使用其他格式的数据 做好了准备。...在下一章,你编写自动从网上采集数据并对其进行可视化的程序。如果你只是编程作为 业余爱好,学会这些技能可以增加乐趣;如果你有志于成为专业程序员,就必须掌握这些技能。...5 response_dict = r.json() # 处理结果 print(response_dict.keys()) 在1处,我们导入了模块requests。...与'items'相关联的值是一个列表,其中包含很多字典,而每个字典都包含有关一个Python 仓库的信息。在2处,我们这个字典列表存储在repo_dicts中。

13310

python数据分析笔记——数据加载与整理

3、某一列作为索引,比如使用message列做索引。通过index_col参数指定’message’。 4、要将多个列做成一个层次化索引,只需传入由列编号或列名组成的列表即可。...导入JSON数据 JSON数据是通过HTTP请求在Web浏览器和其他应用程序之间发送数据的标注形式之一。通过json.loads即可将JSON对象转换成Python对象。...(import json) 对应的json.dumps则将Python对象转换成JSON格式。 导入EXCEL数据 直接使用read_excel(文件名路径)进行获取,与读取CSV格式的文件类似。...合并原则与where函数一致,遇到相同的数据显示相同数据,遇到不同的显示a列表数据。...重塑数据 1、旋转数据 (1)重塑索引、分为stack(数据的列旋转为行)和unstack(数据的行旋转为列)。

6K80

R语言数据清洗实战——复杂数据结构与list解析

因为大部分json数据包返回之后都会被转换为R语言中的非结构化数据类型——list。 也就是说,对于list数据结构的处理熟练程度,将会决定着你在数据清洗中所花费的时间与精力。...导入json数据包: library("dplyr") library("jsonlite") library("magrittr") library("plyr") library("rlist")...列表展开 fulldata% lapply(unlist) %>% do.call(rbind,.) %>% as.data.frame() 这份数据所有的课程list...OK,完美,得到了一份非常规整的数据,甚至都没有什么缺失值。这个数据可以放心的作为其他分析数据源或者存入数据库啦。...可是不觉得以上步骤有些繁琐嘛~简单方法当然有啦,任坤大大开发的rlist是专门针对R语言list结构数据处理的,其中封装了很多功能强大的列表操作函数,使得在R语言中操作列表就像使用dplyr操作data.frame

1.5K50

手把手教学构建农业知识图谱:农业领域的信息检索+智能问答,命名实体识别,关系抽取,实体关系查询

requirement.txt 1.导入数据hudong_pedia.csv导入neo4j:开启neo4j,进入neo4j控制台。...导入neo4j作为结点,然后对titile属性添加UNIQUE(唯一约束/索引) (如果导入的时候出现neo4j jvm内存溢出,可以在导入前,先把neo4j下的conf/neo4j.conf中的dbms.memory.heap.initial_size...说明: Statement是/wikidataSpider/TrainDataBaseOnWiki/finalData中train_data.txt中的数据,我们将它转化成json,导入到mongoDB...,利用tensorflow训练PCNN模型 4.1关系自动抽取 农业知识图谱关系抽取 data 处理数据,得到关系抽取需要用到的json文件 步骤: 如果当前文件夹下没有filter_train_data_all_deduplication.txt...,建议用公开数据测试。

67320

Python 文件处理

迭代器下一条记录作为一个字符串字段列表返回。读取器不会将字段转换为任何数值数据类型,另外,除非传递可选参数skipinitialspace=True,否则不会删除前导的空白。...writerow()一个字符串或数字序列作为一条记录写入文件。该函数数字转换成字符串,因此不必担心数值表示的问题。类似地,writerows()字符串或数字序列的列表作为记录写入文件。...例如,复数存储为两个double类型的数字组成的数组,集合存储为一个由集合的各项所组成的数组。 复杂数据存储到JSON文件中的操作称为JSON序列化,相应的反向操作则称为JSON反序列化。...),并使用loads()文本反序列化为对象列表。...f_dump, ensure_ascii=False) # 文件导出为Python对象 with open("/home/xiaosi/data.json", 'r') as f_load:

7.1K30

浅析图数据库 Nebula Graph 数据导入工具——Spark Writer

在函数式语言中,map 表示针对列表中每个元素应用一个方法,reduce 表示针对列表中的元素做迭代计算。通过 MapReduce 算法,可以数据根据某些特征进行分类规约,处理并得到最终的结果。...操作 RDD 就如同操作本地数据集合,而不必关心任务调度与容错等问题。RDD 允许用户在执行多个查询时,显示地工作集合缓存在内存中,后续查询能够重用该数据。... $ {EXEC} 作为数据     {       name: ${TAG_NAME}       type: hive       exec: ${EXEC}       fields: {  ...基于文件导入配置需指定文件类型# 处理边   edges: [     # 从 HDFS 加载数据数据类型为 JSON     # 边名称为 ${EDGE_NAME}     # HDFS JSON ... ${EXEC} 作为数据     # 边权重为可选     {       name: ${EDGE_NAME}       type: hive       exec: ${EXEC}

1.4K00

基于 SAM 的半自动标注新方法,手把手教会你!

用 vscode 打开解压后的文件夹,可以看到标注好的数据,包含了图片和 json 格式的标注文件。...此处提供 label-studio 输出的 json 格式转换为 COCO 格式的转换脚本。 ⚠ 目前仅支持已经标注完所有图片的项目。.../LS_json --out_dir path/to/output/file --json_file_path 输入 Label studio 的输出 json --out_dir 输出路径 生成后脚本会在终端输出一个列表...输出路径下有 annotations 和 images 两个文件夹,annotations 里是 coco 格式的 json, images 是整理好的数据。...Your dataset ├── annotations │ ├── ann.json ├── images 对生成的数据制作 config 并可视化 (可选) 本节介绍如何使用 MMDetection

1.6K30

深度学习实战:2.AlexNet实现花图像分类

(解压的数据文件夹,3670个样本) rain(生成的训练,3306个样本) val(生成的验证,364个样本) 如何吧数据分为训练和验证?.../flower_photos.tgz (3)解压数据到flower_data文件夹下 (4)执行"split_data.py"脚本自动数据划分成训练train和验证val split_data.py...中,我们不能上篇LeNet网络搭建中是使用的torchvision.datasets.CIFAR10和torch.utils.data.DataLoader()来导入和加载数据。...ImageFolder()返回的对象是一个包含数据所有图像及对应标签构成的二维元组容器,支持索引和迭代,可作为torch.utils.data.DataLoader的输入。...) json_file = open(json_path, "r") class_indict = json.load(json_file) # create model

66450
领券