前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub,还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息,从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。..._.*","\\1",bed$V4) #获取转录本号对应的基因名字 symbol=mapping[NM,1] 方法一、使用最原始的gsub函数 #先将bed文件中的内容存放在result1中 result1...参考资料: ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列
excelperfect 在下图1所示的工作簿Data.xlsx的工作表Sheet1中,存放着待使用的数据。 ?...图1 在下图2所示的工作簿GetData.xlsm中,根据列C中的数据,在上图1的工作簿Data.xlsx的列E中查找是否存在相应数据的单元格。 ?...图2 然后,将Data.xlsx中对应行的列I至列K单元格中的数据复制到GetData.xlsm相应的单元格中,如下图3所示。 ?...图3 在工作簿GetData.xlsm中,输入代码: Sub CopyData() '关闭屏幕刷新 Application.ScreenUpdating = False '声明变量...Exit Sub Else '遍历所选的单元格 For Each rng In Selection '在数据工作表中查找相应的值所在的单元格
SUMPRODUCT+MAX+ROW函数 公式如下: =INDEX($B$2:$B$10,SUMPRODUCT(MAX(ROW($A$2:$A$10)*($D$2=$A$2:$A$10))-1)) 公式先比较单元格D2中的值与单元格区域...A2:A10中的值,如果相同返回TRUE,不相同则返回FALSE,得到一个由TRUE和FALSE组成的数组,然后与A2:A10所在的行号组成的数组相乘,得到一个由行号和0组成的数组,MAX函数获取这个数组的最大值...,也就是与单元格D2中的值相同的数据在A2:A10中的最后一个位置,减去1是因为查找的是B2:B10中的值,是从第2行开始的,得到要查找的值在B2:B10中的位置,然后INDEX函数获取相应的值。...图2 使用LOOKUP函数 公式如下: =LOOKUP(2,1/($A$2:$A$10=$D$2),$B$2:$B$10) 公式中,比较A2:A10与D2中的值,相等返回TRUE,不相等返回FALSE...组成的数组,由于这个数组中找不到2,LOOKUP函数在数组中一直查找,直至最后一个比2小的最大值,也就是数组中的最后一个1,返回B2:B10中对应的值,也就是要查找的数据在列表中最后的值。
一、简介 在实际工作中,遇到数据中带有缺失值是非常常见的现象,简单粗暴的做法如直接删除包含缺失值的记录、删除缺失值比例过大的变量、用0填充缺失值等,但这些做法会很大程度上影响原始数据的分布或者浪费来之不易的数据信息...中的matshow,VIM包中的matrixplot将数据框或矩阵中数据的缺失及数值分布以色彩的形式展现出来,下面是利用matrixplot对R中自带的airquality数据集进行可视化的效果: rm...如上图所示,通过marginplot传入二维数据框,这里选择airquality中包含缺失值的前两列变量,其中左侧对应变量Solar.R的红色箱线图代表与Ozone缺失值对应的Solar.R未缺失数据的分布情况...,若m=1,则唯一的矩阵就是插补的结果; method: 这个参数控制了传入数据框中每一个变量对应的插补方式,无缺失值的变量对应的为空字符串,带有缺失值的变量默认方法为"pmm",即均值插补 predictorMatrix...: 因为mice中绝大部分方法是用拟合的方式以含缺失值变量之外的其他变量为自变量,缺失值为因变量构建回归或分类模型,以达到预测插补的目的,而参数predictorMatrix则用于控制在对每一个含缺失值变量的插补过程中作为自变量的有哪些其他变量
python变量赋值的操作 1、对赋值字符串、整型、元组等不能改变数据的变量,只保存值。 改变新变量中的值不会影响原变量中的值。...2、若将列表或字典赋值给一个变量,则保存的变量并非列表,而是原始列表的引用。 相当于通向列表的通道,指向原始列表。...实例 origin = [1,2,3] new = origin print("new = ",new) new[0] = 0 print("origin = ",origin) 以上就是python变量赋值的操作
2.数据类型 在python中数据类型包括:int,bool,float,str,dict,tuble,set,list等等, 首先,我们需要知道在python中哪些是可变数据类型,哪些是不可变数据类型...可变数据类型:列表list和字典dict;不可变数据类型:整型int、浮点型float、字符串型string和元组tuple。...用一句话来概括上述过程就是:“python中的不可变数据类型,不允许变量的值发生变化,如果改变了变量的值,相当于是新建了一个对象,而对于相同的值的对象,在内存中则只有一个对象,内部会有一个引用计数来记录有多少个变量引用这个对象...;可变数据类型,允许变量的值发生变化,即如果对变量进行append、+=等这种操作后,只是改变了变量的值,而不会新建一个对象,变量引用的对象的地址也不会变化,不过对于相同的值的不同对象,在内存中则会存在不同的对象...,即每个对象都有自己的地址,相当于内存中对于同值的对象保存了多份,这里不存在引用计数,是实实在在的对象。
最近在看植物长链非编码RNA的内容,数据分析里有个一内容是预测lncRNA的反式作用元件,通常的做法是利用表达量数据计算皮尔逊相关系数,然后设置一定的阈值进行筛选 比如 Horticulture Research...这里相当于是计算两个数据集中的变量之间的相关性,之前发现correlation这个R包里的函数correlation()可以做 但是这里遇到了一个问题 ? 关掉这个报错界面以后就会提示 ?...但是mRNA的表达量有上万个,用这个函数计算的时候是非常慢的 找到了另外一个函数是Hmisc这个包中的rcorr()函数 这个速度快很多,但是他不能计算两个数据集之间变量的相关性, 这样的话可以先计算,...零基础学习R语言之相关性分析 https://www.bilibili.com/video/BV1vb4y1k7kv psych这个包里的corr.test()函数也是可以直接计算两个数据集变量之间的相关性的...,这个结果里也有显著性检验的p值 但是这个如果数量量比较大的话速度也很慢
F NA 变量赋值 string = "hello,world" string <- "hello,word" 比较运算 比较运算的返回值是逻辑值TURE 、FALSE > 大于 < 小于 >=...0即为TRUE,0则为FALSE 数值型数据转换为字符型"123" 逻辑型数据转换为数值型,TRUE为1,FALSE为0 逻辑型数据转换为字符型"TRUE"or"FALSE" R语言在不同数据转换时,尽可能保留更多的数据信息...数据结构 向量(vector) 数据框(data.frame) 矩阵(matrix) 列表(list) 向量 向量和矩阵的所有元素只能有一种数据类型 数据框的一列就是一个向量 向量内的元素可以重复 #...4位置上的其他元素 任何操作需要赋值才能修改变量 向量之间的操作 #向量之间的运算 x = c(1,2,3,4) y = c(1,3,2,1) x + y #直接进行数学计算 x == y #比较运算可以生成逻辑值...(x,y) #取差集,x中去除y setdiff(y,x) #取差集,y中去除x # %in%的使用 x %in% y #x的每个元素在y中存在吗,返回一组逻辑值 y %in% x #y的每个元素在x中存在吗
• 对象(object)就是内存中专门用来存储数据的一块区域 • 之前学习的对象,像数值,它只能保存一个单一的数据 • 列表中可以保存多个有序的数据 • 列表的使用:1列表的创建,2列表的操作 • 列表的创建...,变量的数量必须和元组中的数量一致 • 也可以在变量前边添加一个*,这样变量会将获取元组中所有剩余的元素,并且返回值为一个列表 • 可变对象 • 每个对象中都保存了三个数据: • id(标识) • type...(类型) • value(值) • 列表就是一个可变对象 • a=[1,2,3] • 改对象:a=[0] #这种方式不是修改变量,而是通过变量去修改对象的值,所以说列表是可变对象 • 当我们去修改对象时...• 获取字典中的值,根据键来获取值 • 语法 : dict[key] • get(key[,default])该方法用来根据键来获取字典中的值 • print(d.get(‘name’)) • 修改字典...• 遍历字典 • keys()改方法会返回字典的所有的key • 改方法会返回一个序列,序列中保存字典的所有的键 • 通过keys()来获取所有的键 • values() • 该方法会返回一个序列,序列中保存字典的左右的值
5.多个数据的组织——数据结构 -向量 一个向量内部只能有一种数据类型,可以有重复值 重复值允许,不同的数据类型不允许!...-数据框 约等于表格:列有要求(同一列只允许同一种数据类型);不是文件(可以导出来成为一个文件) 数据框单独拿出的一列是向量,视为一个整体 -矩阵 -列表 6.向量的生成 -以下代码基本来自小洁老师所给的...table(x) #重复值统计 sort(x) #默认从小到大排序——R语言里的默认思想 sort(x,decreasing = F) sort(x,decreasing = T) 8.对两个向量进行的操作...y里所有的元素比一遍; 9.向量筛选(取子集) x <- 8:12 #根据逻辑值取子集 x[x == 10] x[x < 12] x[x %in% c(9,13)] #根据位置取子集 x[4] x[2:...将TRUE对应的值挑选出来,FALSE丢弃 10.修改向量中的某个/某些元素:取子集+赋值 没有赋值就没有发生过!
一、r语言基础图片二、数据类型数据类型:数值型(numeric),字符型(character,必须加" "or' '),逻辑型(TRUE FALSE NA存在但未知)null 不存在判断数据类型的函数class...,视为一个整体向量里只有一种数据类型,但是可以有重复值向量<数据框<矩阵<列表1.向量的生成#(1)用 c() 结合到一起c(2,5,6,2,9) c("a","f","md","b")#(2)连续的数字用冒号...y中有的结果重点:%in%x %in% y #x的每个元素在y中存在吗y %in% x #y的每个元素在x中存在吗图片4.向量筛选(取子集) []: 将TRUE对应的值挑选出来,FALSE丢弃x <-...,与python区分总结:按照逻辑值:中括号里是与x等长且一一对应的逻辑值向量按照位置:中括号里是由x的下标组成的向量按条件挑选某个向量中两种类型的子集x为向量 y为条件x[x%in%y]5.修改向量中的某个.../某些元素:取子集+赋值#改一个元素x[4] <- 40x#改多个元素x[c(1,5)] <- c(80,20)x变量的修改需要赋值操作6.简单向量作图k1 = rnorm(12);k1k2 = rep
存在返回字典中键对应的值,不存在报错 其他操作 keys -- 获取字典中所有的键 存放在一个高仿列表中 values -- 获取字典中所有的值 存放在一个高仿列表中...# 浅拷贝在修改第一层元素(不可变数据类型)的时候,拷贝出来的新列表不进行改变 # 浅拷贝在替换第一层元素(可变数据类型)的时候,拷贝出来的新列表不进行改变 # 浅拷贝在修改第一层元素中的元素(第二层...)的时候,拷贝出来的新列表进行改变 # 深拷贝开辟一个容器空间(列表),不可变数据公用,可变数据数据类型(再次开辟一个新的空间) # ,空间里的值是不可变的数据进行共用的,可变的数据类型再次开辟空间...1.4.2 is 判断两边的值内存地址是否相等 2.深浅拷贝 2.1 赋值: 多个变量名指向同一个内存地址 一个变量对其进行操作,其他变量查看时都变动 2.2...创建一个新的列表,删除旧的列表 字典删除 -- 循环的时候不能改变源数据的大小 (可以改变值) 创建一个新的字典,删除旧的字典 集合删除 -- 循环的时候不能改变源数据的大小
Day 2作业详解 R特有的变量保存格式(xxx.Rdata) 用处:存储有用变量,下次使用,用于传递变量。...save(g,s,file = "gands.Rdata")#将变量g和s保存到名为gands的Rdata文件中。...:包容万物,可将以上数据类型打包到一起 根据生成函数判断对象的数据类型;用class()函数判断数据类型 数据框来源:代码建、已有数据转换、读取文件、R语言的内置数据 使用内置数据集volcano,tab...数据框的修改 df1[3,3] <- 0#改一个格(一个元素) df1$score <- c(1,2,3,4)#改一整列 df1$p.value <- c(5,6,7,8)#新建一列 rownames(...- hard k 0#逻辑值向量 df1[k,]#取子集-向量k逻辑值为TRUE的行组成的数据框 ## gene chance score p.value ## r1
图片不要把变量添上引号(2)简单数学计算x <- c(2,3,4,4)x+1log(x)(3)根据某条件进行判断,生成逻辑值向量x==3 等于函数,返回TRUE/ FALSE(4)初级统计max(X)...R语言的默认思想英文?...x里,不在y里#差集setdiff(y,x)仅在y里,不在x里重点:%in%(没有快捷键)x %in% y #x的每个元素在y中存在吗x=c(1,3,5,1),y=c(3,2,5,6)F,T,T,Fy...:如何从13个数中筛选大于7的13个数字组成向量,赋值给xx大于7,返回多少个逻辑值——13个挑选TRUE 对应的值————向量筛选(取子集),中括号[]:将true 对应的值挑选处理,false将丢弃图片图片图片下标...sumvector向量——一维表格——二维,矩阵matrix,只允许一种数据类型,data.frames数据框,每列只允许一种数据类型list列表,可装万物根据生存它的函数,用class或is族函数判断所有图片引用自小洁忘了怎么分身
根据PEP的规定,必须使用4个空格来表示每级缩进(不清楚4个空格的规定如何,在实际编写中可以自定义空格数,但是要满足每级缩进间空格数相等)。...出现在字符串中的\(反斜杠)被解释为特殊字符,比如\n表示换行符。表达式前加r指示Python不解释字符串中出现的\。这种写法通常用于编写正则表达式或者Windows文件路径。...改变新的列表不会影响到nums。 nums[1:5:2] == [3, 7] 从下标为1的元素切割到下标为5的元素但不包含下标为5的元素,且步长为2。...与Java、C++相比,这些数据类型有效地减少代码的长度。下面这个列表简要地描述了Python内置数据类型(适用于Python 3.x): ?...C++的结果与Python不一样,首先它会先计算a < b,根据两者的大小获得0或者1两个值之一,然后再与c进行比较。
php数组赋值方式 推荐操作系统:windows7系统、PHP5.6、DELL G3电脑 1、两种赋值 (1)传值赋值 在PHP中,传递赋值是默认的传递方式。...如果某个变量的值被赋予了另一个变量,那么改变其中一个的值对其他变量没有影响。 (2)引用赋值 引用赋值意味着新变量简单地引用原始变量,改变新变量值会影响原始变量值,反之亦然。..."china", "america", "japan", "canada" ] //map结果[ "china", "america", "japan", "canada" ] 以上就是php数组赋值的两种方式...,大家可以根据不同的赋值类型,选择合适的方法来使用。
%in%)、%in%,输出的是逻辑值(x[x%in%y],此时理解函数意义,x有哪些元素在y存在(会每个位置都比较),而x==y对应位置相同,所以会循环补齐)不会去重复、并集union、差集setdiff...(1)按照逻辑值([]里面是逻辑值,与x对应,不必由x生成):中括号里是与x等长且一一对应的逻辑值向量(13个彩色球取出蓝色和绿色,x[x%in%y],13个数取>7,x[x>7]);(2)按照位置:中括号里是由...,列表(list),用class判断数据结构,因为有的函数只接受特定的数据类型,可用as转换(chat查询想要转换的东西对应的函数),可用view查看数据#重点数据框1.虚拟文件,打开R才可见,不是真实电脑文件...Rdata是R特有的数据储存形式,不是表格文件;保存的是变量。...,要改除非整个矩阵一起改## [1] 40.66667#如果要把矩阵中的字符都转换成数字,需改成数据框class(y) #字符矩阵,最后一列为字符,其余为数字字符## [1] "matrix" "array"z
第1章 数据类型: 1.1可变or不可变类型(变量值): 变量的三个特点:id/type/value 可变类型:值改变,但id不变,证明就是在改变原值 不可变类型:值改变,id也跟着变了,证明申请了新的内存空间来存新值...: print(name) else: print('no') 将name变量对应的值中的“1”替换为“p”,并输出结果 name=' aleX' print(name.replace('l','p...')) 将name变量对应的值根据“l”分隔,并输出结果 name=' aleX' print(name.split('l')) 将name变量对应的值变大写,然后输出结果 name=' aleX' print...print(name[1]) 请输出name变量对应的值中“e”所在索引的位置 name=' aleX' print(name.index('e')) 获取子序列,去掉最后一个字符 name=' aleX...,type(name)) 按照索引取值改值: name=['a','b','c'] print(name) name[-1]='A' print(name[-1]) 增加列表的元素: name=['a'
以此为基础,进阶高段,可以自然过渡到Python,Julia等语言的可视化实践活动中。 首先引入本次实践使用的数据集SENIC,该数据集描述了在不同的美国医院测量的结果。...2 读取数据,简单展示 2.1 根据数据集描述整理变量标签 variable_labels <- c("ID", "Length of Stay", "Age", "Infection Risk","...= "")) 这里改列名的时候,用的是X1-X12, 因为变量全名过长,仅用作标签。...展示的用的是DT,专门用于显示表格数据,如下图所示: 3 创建离群值函数 目的在于返回一些离群值,用在后续的可视化内容中。...进行 数据集和变量的确认; 第2行,利用stat_density绘制密度曲线, 第3,4行,利用geom_point将离群值添加,并设置了点的形状; 第5行,为x,y轴添加名称; 第6行,设置极简的主题
不建议用带引号的字符。可以用字母和数字的组合,但是数字要在字母后面。不能用空格,运算符号在名称中。可以使用下划线。不建议用中文作为变量名称。2....将k1作为y轴;k2作为x轴图片图片plot() 默认作散点图,可以指定另外的作图形式(折线图,点线图等,详见帮助文档)boxplot() 用~连接指定需要作图的数学公式中的函数和自变量(可以是组合分组变量...重点与Tips:数据框按照逻辑值取子集,TRUE对应的行/列留下,FALSE对应的行/列丢掉。用于取子集的逻辑值向量,与原集对应即可,不必一定由原集生成。...默认all=FALSE,表示只取共同列或行中相同值的内容进行合并,当指定all=TRUE时,取两个数据框中指定行列的并集进行合并,任一表中的缺失值,则用NA填充。...如上例中,取出的子集是矩阵。若用1个中括号,取出来的子集数据结构仍然是列表,内容虽然一致。
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