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R语言ggplot2绘图时如何在图形中使用数学表达式作为标注文本

图形中的文本有时需要使用数学表达式，如 的2.5需要使用下标，单位 涉及到希腊字母和上标，以及一些比较复杂的大型符号，如求和符号 、积分符号 等。...对此，R语言的基础包提供了完善的处理办法： grDevices工具包提供了这些数学表达式的语法； base工具包的expression()函数用于将这些语法在图形中转换成实际的效果。...以上例子对应的R代码如下： par(plt = c(0.05,0.95,0,1), ps = 20, adj = 0.5, family = "mono") plot(1:6, type = "...3.5,3, expression(pi)) text(4.5,3, expression(f(x))) text(5.5,3, expression(bolditalic(f(x)))) 下面汇总一下R语言中各类数学表达式的语法...其他 需要注意的是，以上 语法虽然由R语言的基础绘图系统工具包grDevices提供，但它属于通用语法，也可以在ggplot2绘图系统中使用。

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R-ggplot2 空间绘图 - 房价气泡图的绘制

目前计划推出基础图表的绘制教程推文(会同时推出R和Python两个版本)，原因在于有时苦苦找不到数据，不仅导致想绘制的图表完成不了，而且也白白浪费了时间，再者也有小伙伴私信要求多些基础教程的推文，当然...上篇原创推文使用了geopandas进行了房价分布的地图推文教程，本期我们将使用绘图功能更加强大的ggplot2 以及其推展包进行地图绘制和图表美化工作，主要涉及的知识点如下： geojsonio包对...geojson数据格式读取 ggplot2 可视化展示 openxlsx 实现R灵活读取excel文件 ggtext包实现文本定制化操作 geojsonio包对geojson数据格式读取 这里使用的数据和上期推文的数据一样...接下来我们进行点图层的添加，绘图代码如下： # Plot it library(ggplot2) library(ggrepel) library(ggtext) HK_map <- ggplot()...定制化设置 以上的代码将主要的绘图结果绘制出来，这部分要做的就是将图表进行美化处理：如配色、图例等绘图元素的定制化设置。

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R tips：debug并修复一个ggplot2绘图错误的例子

最近将使用的R版本升级到4.0+之后，遇到了一个以前从未遇到的报错，报错信息如下所示： Error in UseMethod("rescale") : "rescale"没有适用于"AsIs"目标对象的方法...出现bug的代码是在使用clusterProfiler的cnetplot函数绘制一个富集分析图，正常情况下，它应该是出图如下： bug重现 出现问题的R对象是一个clusterProfiler的富集分析对象...class(dat) #[1] "enrichResult" #attr(,"package") #[1] "DOSE" dat是一个enrichResult类，可以使用clusterProfiler包的一系列绘图函数...不过对于要修复这个问题来说，目前的信息已经足够了。 如何使用RStudio进行debug代码以及如何自由的查看R中的函数源码，在以前的R tips推文中都曾经说过。...执行了ggplot_build.gg的定义代码后，现在的绘图代码在需要调用ggplot_build方法时会被自动分发到自定义创建的ggplot_build.gg方法，于是下述代码就会正常出图毫无问题了。

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数据视化的三大绘图系统概述：base、lattice和ggplot2

)等；还提供了更加高级的图形系统lattice和ggplot2. base基本图形系统相关内容可参照：《R语言 图形初阶：hist、plot和图形布局layout | 第6讲》，作为R语言图形绘制的入门一节...后续将分别就lattice和ggplot2可视化绘图系统进行简要介绍。...目录 引言 1 Lattice绘图系统 1.1 lattice常见函数集表达式对照表 1.2 lattice绘图系统相关参数对照表 1.3 面板函数 1.4 图形参数 1.5 页面布局 2 ggplot2...Split/position 数值型向量，在一页上绘制多幅图形 Type 字符型向量，设定一个或多个散点图的绘图参数，（如p=点，l=线，r=回归，smooth=平滑曲线，g=格点） xlab/ylab...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离，然后按图层叠加的方式作图，通过+进行叠加。

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ggplot2-图形微调（1）

绘图过程中，通过给图形中添加适量的注释（图形、公式、注释）以及图形整体的外观，可以使读图者更快速、更准确的了解图形表达的含义。...ggplot2包中的annotate()函数帮助用户给图形的指定位置添加注释，一般注释可以从点、线和面的角度进行修饰，对应的geom参数是text、segment、pointrange、rect。...plotmath查看数学表达式；parse设为TRUE annotate('text', x = 2017, y = 50, label = 'f(x) == frac(x+y,sqrt(2*pi,3)...二 图形坐标轴信息修改 坐标轴显示范围 p3 <- p2 + scale_x_continuous(limits = c(2014,2022)) ;p3 ## 一般使用倍数来限定大小，最小值有个0 p3...##详见ggplot2-theme 三、旋转坐标轴 只需添加coord_flip()函数就可以实现 p5 <- p4 + coord_flip();p5 基本图形的注释及坐标信息的更改，待补充 。。。

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R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

---- R语言绘图系列： R语言可视化及作图1--基础绘图（par函数，散点图，盒形图，条形图，直方图） R语言可视化及作图2--低级绘图函数 R语言可视化及作图3--图形颜色选取 R语言可视化及作图...4--qplot和ggplot2美学函数 R语言可视化及作图5--ggplot2基本要素和几何对象汇总 R语言可视化及作图6--ggplot2之点图、条形图、盒形图、直方图、线图 * 1....geom_label(aes(fill=factor(cyl)),color='white',fontface='bold',family='Times New Roman') parse参数意思是前面传入的是一个数学表达式...(x=4,y=40),label='y==1.2+x^2',parse = TRUE,size=7) #如果parse=FAKSE,图形上显示的就直接是y == 1.2 + x^2，而不是图上的公式。...在theme函数中，与图例有关的主要参数有： 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例的边缘范围

5.4K10

R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

3.6K20

R语言绘图练习——ggplot2画tSNE的聚类点图（带圈带阴影）

绘图： 首先加载数据，然后用查看一下数据长什么样子 rm(list=ls()) load("for_tSNE.pos.Rdata") dim(dat) ## [1] 619 4 head(dat)...这里可以看出，如果cluster是数值型，那么不转为因子的情况下用来分组就会出现大问题：R会把每一个数值都看成是一个分组，用深浅来代表不同分组。...如果cluster是一个字符串，就不会出现这个问题，得到的结果和因子是一样的。 回到正题，给cluster添加一个圆圈在ggplot2中通过stat_ellipse()实现。...把填充的透明度改一改 ggplot(dat,mapping = aes(x=tSNE_1, y=tSNE_2,...这次练习所get到的几个新的知识点： 画图时按照因子/数值/字符分组产生的区别 ggplot2画点图时可以使用stat_ellipse()画圆圈 坐标系微调的一些细节，更多内容参考https://blog.csdn.net

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R语言之可视化（25）绘制相关图（ggcorr包）

介绍 ggcorr函数是一个可视化函数，用于将矩阵绘制为ggplot2图片。 为何使用ggcorr包 相关矩阵显示相对大量连续变量之间的相关系数。...然而，虽然R提供了一种通过cor函数创建这种矩阵的简单方法，但它没有为该函数创建的矩阵提供绘图方法。ggcorr函数提供了这样的绘图方法，使用ggplot2包中实现的“图形语法”来渲染绘图。...后两个只是ggplot2主题中相同参数的快捷方式，由于该图是一个ggplot2对象，所有其他相关的主题和指南方法也适用： ggcorr(nba[, 2:15], name = expression(rho...特别是，将中点设置为NULL将自动选择中值相关系数作为中点，并将向用户显示该值： ggcorr(nba[, 2:15], midpoint = NULL) 控制色标颜色的最后一个选项是通过palette...其他参数 颜色范围，在某些情况下，修改相关系数的显示（-1，+ 1）范围可能是有用的。

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基础知识 | R语言绘图保存的pdf图片无法显示中文怎么办？

R语言绘图基础之图形保存 在用ggplot2绘图时，经常发现图片中的中文无法显示或者中文字体格式不对，这种情况下，展现的图片是残缺不全的，为了解决R语言图片保存时，无法显示中文的问题，现对showtext...,fill="red",alpha=1) #若想使得ggplot绘制的图片中的中文能够显示 一定要先运行quartz()，否则无法实现效果。...pink",alpha=1) #开始绘图之间一定要设置pdf保存文件，否则图片中仍然无法显示中文。...小结 showtext：在许多情况下，特别是对于PDF设备,在R图中使用非标准字体不是一件容易的事情....showtext使得在R图中使用各种类型的字体(TrueType、OpenType、Type 1、web字体等)变得更加容易。

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绘制圆环图雷达图星形图极坐标图径向图POLAR CHART可视化分析汽车性能数据

我发现的两个主要问题是，极坐标的变化会使你的路径弯曲成圆形，而且雷达无法与geom_bin结合使用来填充背景。 这就是为什么我通常在笛卡尔坐标系统中使用。更像是一种数学解决方案。...映射您的数据和绘图需求，使其最终成为圆环。作为一个额外的好处，我还发现它的构建/加载速度更快。对我来说很重要，因为我让它们在 Shiny Apps 中交互。 我在示例中使用了 mtcars 数据。...该图显示了集合中的 12 辆汽车： 背景中的气缸。4、6 和 8 缸的浅色、中色和深色。 用蓝色标出每辆车每加仑的里数。 这篇文章是逐步展示如何将所需的元素添加到圆形图中。...# 数据点 rotate_data 我想展示绘图范围数据，所以我伪造了一系列 qsec 数据。基本上，您为每辆车（标签）上的 qsec 生成一个具有多个值（行）的数据框。...r % mutate r$xed <- 0 r$yed <- 0 #用自己的数据和美学来绘制每一层的图案 ggplot() + geom_segment +

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「R」cowplot（三）添加注释

cowplot包提供了很多函数用于注释图形，包括图形下方的注释，图内数学表达式，组合图的总标题等。因为ggplot2 v2.2.0本身就支持这些特性，所以推荐优先使用ggplot2本身的方法。...未来两种相同的功能将从cowplot移除。 使用数学表达式注释 我们通常想要使用数学表达式注释图形，比如我们想要在图形中显示一个统计分析结果。...为此，cowplot定义了函数draw_label()，它可以给一个图形添加任意检验或数学表达式。 依赖于应用，我们可能想要以绝对坐标（独立于绘图数学）或以数据的坐标指定标签位置。...图形下方的注释 函数add_sub()可以用来为图形添加下方的注释。该功能特性与ggplot2的labs()函数的caption参数重叠了，不过该功能会依旧保留。...注意p2不是一个ggplot对象，而是一个gtable，它需要使用ggdraw()绘制。 我们可能多次重复操作，比如可以添加一个数学表达式和纯文本。

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原创 | R的基础及进阶数据可视化功能包介绍

首先，需要有一张空白的画布， 如下图所示。其次，我们需要根据数据确定X轴、Y轴，以及X轴Y轴的取值范围，因为一个平面直角坐标系在R绘图过程中是必不可少的。...R数据可视化工具 在R语言里，除了R自带的可视化工具plot(),还有很多精彩的工具包，比如ggplot2, 以及gganimate。 ggplot2 ggplot2 是R中被广泛应用的绘图包。...我们将使用R Studio中自带的数据集mpg来进行ggplot2可视化演示根据R绘图原理，我们需要在ggplot2中将一个图表拆分成若干个子元素并进行叠加绘制。...很多功能包的使用，比如ggplot(), gganimate(), 其中的元素便是根据R绘图原理，将一个宏观的图表进行元素拆分，并进行分别叠加声明。另外，在绘图时，千万不要急于对图表进行美观。...至于绘图时的语法，我们只要熟悉了R绘图原理，明白了绘图时需要定义的元素有哪些，不论哪个工具包，就都可以手到擒来了。 卞褚奇 UCLA数学、统计本科毕业生 校对：林亦霖

3.7K30

新手绘图一站式R包之ggpubr

非常有意思的是，虽然我们介绍了海量的R语言绘图资源，包括手把手视频教学和配套书籍，以及海量的绘图参考代码。 但绝大部分小伙伴仍然是选择躺平，不愿意动手实战，提高自己。...对这样的小白来说，各种拥有操作界面的软件可能是更适合，比如orgin和prism等等，其实R里面也有类似的骚操作，比如新手绘图一站式R包 ggpubr ，你就可以看成是一个商业化拥有操作界面的软件： 链接...✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。...绘图菜谱 链接：http://www.cookbook-r.com/Graphs/ 这个有中文翻译版本，务必直接下单购买，放在书桌旁边随时翻阅。...（向量，矩阵，数组，数据框，列表） 文件读取和写出 简单统计可视化 无限量函数学习 参考：《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》

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新手绘图一站式R包ggstatsplot

非常有意思的是，虽然我们介绍了海量的R语言绘图资源，包括手把手视频教学和配套书籍，以及海量的绘图参考代码。 但绝大部分小伙伴仍然是选择躺平，不愿意动手实战，提高自己。...对这样的小白来说，各种拥有操作界面的软件可能是更适合，比如orgin和prism等等，其实R里面也有类似的骚操作，比如新手绘图一站式R包ggstatsplot，你就可以看成是一个商业化拥有操作界面的软件...✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。...绘图菜谱 链接：http://www.cookbook-r.com/Graphs/ 这个有中文翻译版本，务必直接下单购买，放在书桌旁边随时翻阅。...（向量，矩阵，数组，数据框，列表） 文件读取和写出 简单统计可视化 无限量函数学习 参考：《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》

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