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    R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果

    今天的主要内容是实现下面这幅图 ?...image.png 做完聚类分析通常可以选择树形图来展示聚类分析的结果,之前公众号也分享过一篇文章 R语言聚类树图小例子 如果样本数不是很多,可以选择矩形的树状图。...但是样本数如果比较多,比如今天一位公众号的读者留言说他有160多个样本,这样矩形的树状图就会比较宽或者比较长。这个时候就可以选择用圆形的柱形图来展示。 那么圆形的树状图如何实现呢?...Y叔开发的ggtree包时用来可视化进化树的,我隐约记得好像也可以用来画聚类分析的树状图。...应该是需要更新到最新的ggtree版本。如何更新R包这里我没有仔细研究。

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    你没见过的树状图和旭日图

    在2016版的EXCEL里,有很多以前版本没有的图表,比如旭日图和树状图,这两个图我相信很多小伙伴几乎没有用过,今天我们来讲讲这两个图。...首先旭日图和树状图都是表示数据成分关系的图表,他们可以用视觉化的形式来表示一系列数据所占比例的成分,当然他和饼图比起来更加的直观,饼图相对来说能表达的数据有限,超过6个数据,用饼图来表示就会感觉比较的复杂...,但是树状图和旭日图可以应用到大量的类别的数据成分里,通过不同的颜色和不同的形状进行表示,我们先来看一下树状图。...我们客户尝试用树状图。...这个里面我们有2个层级的数据,一个是门店,一个是每个门店卖的手机的型号和每个手机的销量,这个时候如果要去做分析,当然一种方法是用数据透视表和数据透视图,但是我们也可以尝试用旭日图来表述,我们看下面的图:

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    python爬取基金股票最新数据,并用excel绘制树状图

    爬取网易财经各板块股票数据 excel树状图 简单的树状图 带有增长率的树状图 一、爬取网易财经各板块股票数据 目标网址: http://quotes.money.163.com/old/#query=...excel树状图是在office2016级之后版本中新加的图表类型,想要绘制需要基于此版本及之后的版本哦。...简单的树状图绘制流程:框选数据—>插入—>图表—>选中树状图 即可。 以下图为例,在树状图中,每个色块代表一个省份,色块面积大小则由其GDP值大小决定。...三、带有增长率的树状图 我们发现,在基础的树状图中,色块颜色除了区别色块之外并没有其他特殊含义。拿GDP来说,除了值之外我们一般也会去看其增长率,那么是否可以让色块颜色和增长率有关联呢?...1、思路: 我们希望色块颜色能代表增长率,比如红色是上涨,绿色是下降且颜色越深代表绝对值越大 再对每个色块进行对应的颜色填充即可 由于 树状图顶多支持多级,色块颜色也只能手动单一填充,怎么办呢?

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    python爬取股票最新数据并用excel绘制树状图

    爬取网易财经各板块股票数据 2. excel树状图 2.1.  简单的树状图 2.2. 带有增长率的树状图 1....excel树状图是在office2016级之后版本中新加的图表类型,想要绘制需要基于此版本及之后的版本哦。...简单的树状图 简单的树状图绘制流程:框选数据—>插入—>图表—>选中树状图 即可。 ? 树状图绘制流程 以下图为例,在树状图中,每个色块代表一个省份,色块面积大小则由其GDP值大小决定。 ?...带有增长率的树状图 我们发现,在基础的树状图中,色块颜色除了区别色块之外并没有其他特殊含义。拿GDP来说,除了值之外我们一般也会去看其增长率,那么是否可以让色块颜色和增长率有关联呢?...思路: 我们希望色块颜色能代表增长率,比如红色是上涨,绿色是下降且颜色越深代表绝对值越大 再对每个色块进行对应的颜色填充即可 由于 树状图顶多支持多级,色块颜色也只能手动单一填充,怎么办呢?

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    R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化

    = "variance among simulation 物种进化 然后,我们尝试用布朗运动模拟物种进化树状图。...因此,后续还有更多的应用值得进一步研究。 ---- 本文选自《R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化》。...模型和金融时间序列案例 R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言COPULA和金融时间序列案例 matlab使用Copula仿真优化市场风险数据VaR分析 matlab...使用Copula仿真优化市场风险 R语言多元CopulaGARCH模型时间序列预测 R语言Copula的贝叶斯非参数MCMC估计 R语言COPULAS和金融时间序列 R语言乘法GARCH模型对高频交易数据进行波动性预测...R语言股票市场指数:ARMA-GARCH模型和对数收益率数据探索性分析 R语言多元Copula GARCH 模型时间序列预测 R语言使用多元AR-GARCH模型衡量市场风险 R语言中的时间序列分析模型

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    R语言布朗运动模拟股市、物种进化树状图、二项分布可视化

    本文模拟了在连续和离散时间布朗演化一些简单的方法。 布朗运动的数学模型(也称为随机游动)也可以用来描述许多现象以及微小颗粒的随机运动, 如股市的波动和在化石中的物理特性的演变。...从而可以看出布朗运动的变化的分布是不变的,并且不依赖于时间的状态。...= "variance among simulation 物种进化 然后,我们尝试用布朗运动模拟物种进化树状图。...这是因为布朗运动意味着不同物种之间的协方差之间的预期差异。 关于布朗进化的一些其他特点: 在某些情况下,在树的不同部分的布朗进化有可能存在不同的速率。因此可以简单的模仿不同部门的不同的速率布朗运动。...这里是一个模拟(使用如上述相同的一般方法)趋势的一个例子。

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    Python|Plotly数据可视化(代码+应用场景)

    : 雷达图各个维度的数值 theta : 雷达图各个维度的标签 line_close : 是否将曲线闭合,False时生存和输出不会进行连线 ''' fig = px.line_polar(df, r...='score', theta='data', line_close=True) # 颜色填充 fig.update_traces(fill='toself') fig.show() 树状图 树状图...树状图的常见参数说明: path:树状图的父子层级顺序,[父,子....] # 绘制树状图 import plotly.express as px df = px.data.tips() fig =...node用于给出基本的配置项: pad:图中空白分隔空隙的大小; thickness:图中节点的宽度(每个连接处的长方形); line:每个节点的边框线的颜色和粗细; label:每个节点的名字(包含一层...() 瀑布图 瀑布图通常用于表示两个数据点之间的演变过程,在瀑布图中,底部贴着坐标轴的条图表示阶段性统计值(汇总值),其余的表示增长或者减少(相对值)。

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    R语言广义线性模型索赔频率预测:过度分散、风险暴露数和树状图可视化

    保险费率制定中的风险敞口可以看作是审查数据的问题(在我的数据集中,风险敞口始终小于1,因为观察结果是合同,而不是保单持有人),利息变量是未观察到的变量,因为我们必须为保险合同定价一年(整年)的保险期。...也可以考虑其他协变量 或汽车品牌, 也可以将驾驶员的年龄视为分类变量 让我们更仔细地看一下不同年龄段的人, 在右边,我们可以观察到年轻的(没有经验的)驾驶员。那是预料之中的。...但是有些类别  低于  第一个对角线:期望的频率很大,但方差不大。也就是说,我们  可以肯定的  是,年轻的驾驶员会发生更多的车祸。...相反,它不是一个异类:年轻的驾驶员可以看作是一个相对同质的类,发生车祸的频率很高。...接下来我们开始讨论建模索赔频率时的过度分散。在前面,我讨论了具有不同暴露程度的经验方差的计算。但是我只使用一个因素来计算类。当然,可以使用更多的因素。

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    一行 Python 代码轻松构建树状热力图

    这些嵌套的矩形代表树的分支,因此得名。除了尺寸外,每个矩形都有代表独特类别的独特颜色。树状图广泛用于从金融机构到销售组织的行业。...使用附加参数 借助 .plot() 方法的参数,可以在树状图中添加更多的修饰。可以通过明确指定属性来控制树形图的颜色、标签和填充。 1....指定树状图的颜色 import matplotlib.pyplot as plt import squarify sizes = [500, 250, 120, 60] color = ['red',...树状图中的pad 可以在树状图中添加pad,将树状图中的每个具体彼此分离,这将有助于更好地区分矩形。当有大量类别或矩形时,这很有用。可以通过将pad参数设置为True来调用。...有时,树状图中可能会出现歧义。如果有多个具有相同数量(或矩形大小)和相同颜色深浅的类别,则导致用户最终很难区分它们。所以在构建树状图时,必须始终考虑所涉及的类别数量和颜色映射。

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    R语言绘制圈图、环形热图可视化基因组实战:展示基因数据比较

    如果矩阵被分割成组,必须用split参数指定一个分类变量。注意spilt的值应该是一个字符向量或一个因子。如果它是一个数字向量,它将被转换为字符。 颜色是矩阵中数值的重要美学映射。...用户必须用用户定义的颜色模式指定col参数。如果矩阵是连续数字,如果矩阵是字符,col的值应该是一个命名的颜色向量。 下面的图是之前热图的圆形版本。...---- 点击标题查阅往期内容 R语言k-means聚类、层次聚类、主成分(PCA)降维及可视化分析鸢尾花iris数据集 左右滑动查看更多 01 02 03 04 # 注意,因为在前一个图中调用了...col = dend\_col\[si\]) 或者如果矩阵没有被分割,我们可以给子树状图分配不同的颜色。...ret.data("r sector.indexoup2) # 这是DMR2在\`group2\`热图中的位置。

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    R语言广义线性模型索赔频率预测:过度分散、风险暴露数和树状图可视化

    保险费率制定中的风险敞口可以看作是审查数据的问题(在我的数据集中,风险敞口始终小于1,因为观察结果是合同,而不是保单持有人),利息变量是未观察到的变量,因为我们必须为保险合同定价一年(整年)的保险期。...圆圈的大小与组的大小有关(面积与组内的总暴露量成正比)。第一个对角线对应于泊松模型,即方差应等于均值。也可以考虑其他协变量 ? 汽车品牌 ? 也可以将驾驶员的年龄视为分类变量 ?...在右边,我们可以观察到年轻的(没有经验的)驾驶员。那是预料之中的。但是有些类别 低于 第一个对角线:期望的频率很大,但方差不大。也就是说,我们 可以肯定的 是,年轻的驾驶员会发生更多的车祸。...相反,它不是一个异类:年轻的驾驶员可以看作是一个相对同质的类,发生车祸的频率很高。 使用原始数据集(在这里,我仅使用具有50,000个客户的子集),我们获得了以下图形: ?...接下来我们开始讨论建模索赔频率时的过度分散。在前面,我讨论了具有不同暴露程度的经验方差的计算。但是我只使用一个因素来计算类。当然,可以使用更多的因素。

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    R语言广义线性模型索赔频率预测:过度分散、风险暴露数和树状图可视化

    保险费率制定中的风险敞口可以看作是审查数据的问题(在我的数据集中,风险敞口始终小于1,因为观察结果是合同,而不是保单持有人),利息变量是未观察到的变量,因为我们必须为保险合同定价一年(整年)的保险期。...也可以考虑其他协变量 或汽车品牌, 也可以将驾驶员的年龄视为分类变量 让我们更仔细地看一下不同年龄段的人, 在右边,我们可以观察到年轻的(没有经验的)驾驶员。那是预料之中的。...但是有些类别  低于  第一个对角线:期望的频率很大,但方差不大。也就是说,我们  可以肯定的  是,年轻的驾驶员会发生更多的车祸。...相反,它不是一个异类:年轻的驾驶员可以看作是一个相对同质的类,发生车祸的频率很高。...接下来我们开始讨论建模索赔频率时的过度分散。在前面,我讨论了具有不同暴露程度的经验方差的计算。但是我只使用一个因素来计算类。当然,可以使用更多的因素。

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    R语言数据可视化之——TreeMap

    今天这一篇跟大家分享R语言数据可视化之——TreeMap。 在R语言中制作树状图需要独立的树状图工具包——TreeMap的支持。...该包中提供特有的treemap函数结合各参数对树状图进行一系列元素进行个性化定制、调整。 数据集使用本人虚构的某公司在中国各个大区、省份的销售额、利润增长率指标(假设各省份都有业务)。...vSize:该参数代表树状图最底层的单个矩形面积大小,也即index中最后一层次(最底层次)的指标数据大小。...vColor:该参数控制最底层(也即单个矩形)的颜色范围,是树状图所表达的第二个维度数据。...type:颜色映射方式,该参数控制颜色在树状图中的映射方式(如单色渐变、双色渐变或者在独立的层级结构内使用各自的单色渐变等)。

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    曼哈顿图如何指定不同染色体不同的颜色

    大家好,我是邓飞,最近星球(飞哥的知识星球)有老师问了一个问题: GAPIT软件,染色体的颜色是5个一循环,他有12个染色体,想每条染色体一个颜色绘制一条染色体: 我的回答:GAPIT大概率没有参数设置...,提取12条染色体作为演示: 2,默认绘制曼哈顿图 # 默认颜色循环 CMplot(dd1[,1:4],plot.type = "m",threshold = c(0.05/nrow(dd)),file.output...3,设置十二个颜色用于表示十二条染色体 CMplot包中的col参数,可以定义不同的颜色。...# 自定义每条染色体的颜色 colors = c("red", "blue", "green", "purple", "orange", "pink", "brown", "yellow", "cyan...,直接在编程界面显示出来了,666 所以,结论是什么,就是设置12条染色体的颜色,赋值给col参数即可。

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