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使用barcodeplot可视化你的基因排序

gsea分析这方面教程我在《生信技能树》公众号写了不少了,不管是芯片还是测序的表达矩阵,都是一样的,把全部基因排序即可: 比如你有2万个基因,你根据自己的条件分组后算差异情况,根据差异把基因排序,然后看缺氧相关...另外,基因的排序也不仅仅是条件分组后算差异来排序,也可以仅仅是表达量高低排序。...然后呢,我们人为的把第11到20个数值减去1,这样的它们数值会偏小,但是并不会垫底。...亲爱的读者,发挥你聪明的小脑瓜,思考一下,假如你在前面把 人为的把第11到20个数值减去10,这样的话,第二个基因集合,是不是就可以看到很明显的垫底情况了?...上面的代码大量涉及到R基础知识: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 需要把R的知识点路线图搞定,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子

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IO约束(下)

其中,-max后的数值是板级延时的最大值与下游器件的Tsu想加而得出,-min后的数值则是板级延时的最小值减去下游期间的Th而来。...方法二长做Skew Based Method,此时需要了解FPGA送出的数据相对于时钟沿的关系,根据Skew的大小和时钟频率来计算如何设置Output约束。...具体约束时可以根据已知条件的不同,选用不同的约束方式。一般而言,FPGA作为输出接口时,数据相对时钟的Skew关系是已知的,所以方法二更常见。...[3:0] ü 接收端的上升沿建立时间要求(tsu_r):0.7ns ü 接收端的上升沿保持时间要求(thd_r):0.3ns ü 接收端的下降沿建立时间要求(tsu_f):0.6ns ü 接收端的下降沿保持时间要求...上升沿采样数据的-max是板级延时的最大值加上接收端的上升沿建立时间要求(tsu_r) 对应的-min就应该是板级延时的最小值减去接收端的上升沿保持时间要求(thd_r) 下降沿采样数据的-max是板级延时的最大值加上接收端的下降沿建立时间要求

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MySQL技能完整学习列表3、SQL语言基础——3、SQL运算符和函数

一、SQL运算符: 算数运算符:用于执行数值计算。 加法(+):用于将两个或多个数值相加。 减法(-):用于从一个数值减去另一个数值。 乘法(*):用于将两个或多个数值相乘。...安全等于(比较时忽略NULL)例如: SELECT 10 > 5; -- 结果为真(1) SELECT 'apple' 'banana'; -- 结果为真(1) 逻辑运算符:用于组合多个条件。...逻辑与(AND或&&):当所有条件为真时,返回真。 逻辑或(OR或||):当至少一个条件为真时,返回真。 逻辑非(NOT):反转条件的真假。...例如:sql SELECT CAST(age AS CHAR) FROM users; 将age字段从数值转换为字符类型 条件函数 如 `IF()`, `CASE`, `COALESCE()` 等,用于根据条件返回值...例如: SELECT IF(age >= 18, 'Adult', 'Minor') FROM users; 根据年龄判断是否为成年人。

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2023-07-31:用r、e、d三种字符,拼出一个回文子串数量等于x的字符串。 1 <= x <= 10^5。 来自百度。

2.初始化一个字符变量cur,初始值为'r',用于轮流使用字符'r'、'e'和'd'构建回文串。 3.进入循环,直到输入的整数x变为0。...4.在循环中,使用near函数找到最接近x且满足条件数值number。 • near函数采用二分法搜索,从1开始逐渐增加m的值,直到找到满足条件的m值。...• 满足条件是通过ok函数判断,即判断n乘以n+1再除以2是否小于等于x。 • 将满足条件的m值赋给ans,并继续搜索更大的m值。...6.计算处理完当前的number后,需要减去的值,即number乘以(number+1)再除以2,记为delta。 7.将delta从x中减去。...8.根据当前的cur字符,顺序更新cur为下一个字符。 • 如果cur是'r',则更新为'e'。 • 如果cur是'e',则更新为'd'。 • 如果cur是'd',则更新为'r'。

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使用maSigPro进行时间序列数据的差异分析

/release/bioc/html/maSigPro.html 这个R包首先基于多元线性回归模型来拟合时间,实验条件等因素和基因表达量之间的关系,然后运用逐步回归法寻找最佳的自变量组合,具体步骤示意如下...make.design.matrix( sample.group , degree = length(unique(sample.group$Time)) - 1) degree代表自由度,取值为时间点减去...在挑选最佳的自变量组合时,通过每种自变量组合对应的回归模型的拟合优度值R2来进行判断,R2取值范围为0到1,数值越大,越接近1,回归模型的效果越好。...4. get.siggenes 对于每个基因,根据其自变量的组合,是有对应的多个回归模型的。...对于多个集合的差异基因列表,还可以方便的绘制venn图,代码如下 suma2Venn(sigs$summary[, c(2:4)]) ? 5.

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C语言操作符(简单解释版)

算术操作符: +:用于将两个数值相加。例如:3 + 5 = 8。 -:用于从一个数值减去另一个数值。例如:5 - 3 = 2。 *****:用于将一个数值乘以另一个数值。.../:用于将第一个数值除以第二个数值。例如:10 / 2 = 5。 %:取模运算符,返回两个数相除的余数。例如:10 % 3 = 1。 ++:自增运算符,使一个变量的值加1。例如:x++ 或 ++x。...:逻辑非运算符,用于对一个条件进行取反。例如:!true = false。 &:取地址运算符,返回变量的内存地址。 *(间接访问):通过指针访问变量。...条件操作符(三目运算符):根据条件返回两个值中的一个。例如:condition ? value_if_true : value_if_false。...逗号表达式:逗号用于分隔多个表达式,并返回最后一个表达式的值。例如:a = 1, b = 2, a + b 结果为3。 下标引用(数组索引):通过使用索引来访问数组中的元素。

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刚刷了3道某大厂的机试题,居然满分过了

解决这一问题,实际上可拆解为以下3个子问题: 根据给定输入数值序列构建一颗平衡二叉树; 获取平衡二叉树中的非叶子节点部分; 后序遍历完成这部分节点的数值输出 对于第一个小问题,实际相当于完成二叉树层序遍历的过程...例如给定正整数序列[1, 2, 3, 4, 2]和目标数值6,由于仅有1+2+3=6和4+2=6两个子序列满足条件,所以最长子序列的长度为3。当不存在目标结果时,返回-1。...nums): if sum_ < target: # 当前累和小于目标值,移动右端点,并增加新右端点数值 r += 1 if r >=...,移动左端点,并减去原左端点数值 sum_ -= nums[l] l += 1 else: # 找到一组结果,更新最大长度,同时移动左右端点...,并减去原左端点数值,增加新右端点数值 max_len = max(max_len, r - l + 1) sum_ -= nums[l]

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WEB安全新玩法 防范竞争条件支付漏洞

服务器端业务逻辑,特别是涉及数据库读写时,存在着关键步骤的时序问题,如果设计或代码编写不当就可能存在竞争条件漏洞。...本文将讨论如何简单地使用 iFlow 应用安全加固平台的可编程特性,对竞争条件产生的支付漏洞进行防护。...一、原始网站 这是一个在支付环节存在竞争条件漏洞的站点:用户输入一个支付数值,系统将这个数值与余额比较,如果支付数值小于余额则允许支付,并从余额中减去支付数值。...由于未能正确处理竞争条件问题,系统为多个请求同时扣除了余额。我们回到浏览器中刷新页面,可以发现余额变为了 -10 元,如下图所示。...iFlow 会检查全局 (GLOBAL) 存储变量 pay_time_flag 是否存在:如存在,则重定向到页面 /retry.html (向正常用户提示稍后重试);如不存在,则设置一个生命时长为2秒 (数值根据实际请求处理所需时间调整

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【组合数学】生成函数 ( 正整数拆分 | 重复有序拆分 | 不重复有序拆分 | 重复有序拆分方案数证明 )

1}^{N}=2^{N-1} ( 根据基本组合恒等式计算出来 ) 二、不重复有序拆分 ---- 先进行 不重复无序拆分 , 再进行 全排列 ; 1、无序拆分基本模型 无序拆分基本模型 : 将 正整数...n 元集 S , 从 S 集合中选取 r 个元素 ; 根据 元素是否允许重复 , 选取过程是否有序 , 将选取问题分为四个子类型 : 元素不重复 元素可以重复 有序选取 集合排列...; 假设 N=a_1 + a_2 + \cdots + a_r 是满足条件的拆分 , 该拆分 重复 , 有序 ; 将上述方案 , 做成部分序列 , 拆分方案 与 拆分序列 : 根据拆分方案写出拆分序列...给定一个序列 , 可以 还原出一个拆分方案来 , 如给出序列 S_1 = 1 , S_2=3, S_3=6 , 对应的拆分方案 : 最后一个序列式所有数之和 , 被拆分的正整数就是最后一个序列的数值...6 第一个正整数 就是第一个序列 1 第二个正整数 是第二序列减去第一序列 S_2 - S_1 = 3-1=2 第三个正整数 是第三序列减去第二序列 S_3-S_2=6-3=3 拆分方案是

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二分查找与二分答案(2)

(r-l)/2,这样就不会有溢出的风险了 其他问题  我们解决了最简单的二分查找问题:a数组单调递增,并且其中没有重复的数值。...我们遇到的实际问题可能就没有这么简单,可能会有重复的数值。比如a数组里有3个5。这时我们查找5就有一个问题:到底返回哪一个5的下标?  ...但是实际的问题中,即便x不在数组中,我们可能需要知道与x大小接近的数值在数组中处于什么位置。不能只返回一个-1了事。  ...upper_bound的返回值减去a是这些数里最小的一个的下标。  其实对于lower_bound和upper_bound还有一个等价的解释。...如果a[m]<x,那a[l], a[l+1], … a[m]一定都小于x,都不满足”大于等于x”这个条件。所以我们只需要在a[m+1], a[m+2], … a[r]中再查找x。

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Python 操作redis有序集合(sorted set)

Zadd 命令用于将一个或多个成员元素及其分数值加入到有序集当中。...,让分数减去相应的值,比如 ZINCRBY key -5 member ,就是让 member 的 score 值减去 5 。...=False) #输出的结果是['1', '3', '2', '4'] 5.Zinterstore Zinterstore 命令计算给定的一个或多个有序集的交集,其中给定 key 的数量必须以...当有序集合的所有成员都具有相同的分值时,有序集合的元素会根据成员的 值 (lexicographical ordering)来进行排序,而这个命令则可以返回给定的有序集合键 key 中, 元素的值介于...Zrem Zrem 命令用于移除有序集中的一个或多个成员,不存在的成员将被忽略。 当 key 存在但不是有序集类型时,返回一个错误。

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科学瞎想系列之六十八 捋一捋异步电机的各种转矩

再说负载,一个机械装置被动力机械拖动必然要“费些力气”,也就是说,要想拖动它,必须要给它输入一个转矩它才能转起来,转起来以后它就会有一个阻力矩,这个阻力矩就是负载转矩,根据负载性质的不同,负载转矩随转速的变化也不一样...411-48-07 起动(过程)转矩 startingtorque 在额定电压和额定频率下,转速由零到负载转速的起动期间电动机产生的电磁转矩减去风摩转矩所得值。...堵转转矩的结果是“...最小测得值”,它是一个确定的数值;而起动(过程)转矩的结果是“在...期间....所得值”,它不是“一个”数值,而是许多数值,甚至是无限多个数值,它是伴随着整个起动过程,随时间(...或转速)而变化的一组(无穷多个数值的集合。...而起动转矩说的是“电动机产生的电磁转矩减去风摩转矩所得值”,由于风摩转矩很小,常可忽略,因此对应转速为0的起动转矩就等于堵转转矩了。

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WGCNA如何挖掘潜在的共表达基因

实际操作中,考虑到基因数目较多等情况,肯定需要算法来自动化的进行分类,WGCNA采用的是dynamicTreeCut这个R包。...对于加权网络而言,就是该节点的边对应数值的总和,比如在网络中基因A与3个基因相连,基因A的连接度就是对应3条边的数值之和。两个基因间的l值代表的是两个基因所有边的权重乘积的总和,公式如下 ?...公式只是帮助我们理解计算的过程,其实只需要理解TOM是表征节点的相似度就行,我们要的是距离,所以直接用1减去相似度即可,公式如下 ?...可以看到有8个modules都满足条件,在合并时,会将原本属于同一分支的modules直接合并为一个,从图上可以看出,合并后会减少4个modules。...最后总结一下,WGCNA在挖掘共表达基因时,首先通过TOM统计量将邻接矩阵转换为距离矩阵,然后聚类,利用dynamicTreeCut的算法识别modules, 最后根据modules之间的相关性,合并modules

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ACM刷题之路(十五) 分治法 + 找规律 ZOJ4085

2在字典序排列中处于第4位,符合条件,所以N=11就是答案。...首先,比X字典序小的数字分为两类: 1.比X字典序小 && 数值比X小 2.比X字典序小 && 数值比X大 那么我们把两个都求出来,答案不就出来了吗?...是不存在的 情况3: 我们需要补M - X - 1 个数进去  , 使满足条件 。...例1: K = 2 M = 4 第一块求得f(K) = 1;即比X字典序小 && 数值比X小个数为1   就是1 M必须先减去这个1 再减去本身的1 就是需要填补的数量 M - 1 - 1 = 2; 我们先把...K乘10 ;  2 * 10 = 20; 再减去10    ;   20 - 10 = 10 ;这个10  就是两位的时候最多可以填补的数字量 即10~19; 如果不够  m减去这个量,继续遍历三位的情况

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X86汇编语言的分支和控制跳转指令

程序其实由一系列控制流组成,当代码运行时如果某个条件满足,它会执行既定代码,如果不满足或者另一个条件满足,它又会执行另一部分代码。...这种跳转由于无需判断先决条件,因此也叫无条件跳转。 问题在于程序在逻辑设计上通常需要满足固定条件的跳转,例如提到的if..else就属于这种类型。在汇编语言层面就需要使用标志位来进行跳转前的条件判断。...在汇编语言层面可以实现多达三十多种的条件跳转方式。..., 10 rep movsb rep指令告诉CPU重复执行指令movsb,每执行一次,寄存器ECX的值就减去1,直到它的值为0为止。...在前面代码中,如果指令mvsb变成cmpsb,那么CPU会将edi指向内存地址所存储的数值减去esi所指向内存地址的数值,然后根据结果来设置标志位。

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