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R语言lasso改进逻辑回归变量选择分析高血压、易感因素、2型糖尿病LDL可视化

3个模型:Logistic模型、成组Lasso Logistic模型、由Lasso选出协变量的Logistic模型,有3个易感因素、高血压、2型糖尿病LDL,得出误差率变量数目的图。...Lasso Logistic模型通过结合Lasso回归逻辑回归的思想,旨在同时实现特征选择分类任务。...通过结合Lasso回归的特征选择能力逻辑回归的分类能力,Lasso Logistic模型能够提供更准确可解释的分类结果。...根据Lasso筛选出最优的变量的过程可以概括为以下几个步骤: 数据准备:将数据集分为训练集测试集,用于模型的训练评估。 模型建立:使用训练集数据,通过Lasso算法建立回归模型。...总之,根据Lasso筛选出最优的变量是通过使用Lasso算法建立回归模型,并根据变量系数的收缩情况来确定哪些变量被选中,从而得到最优的变量组合。

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在 Excel 工作簿中定义决策表(Oracle Policy Modeling-Define decision tables in Excel workbooks)

在此示例中,文本变量“国籍”“哪国人”已经在项目的属性文件中声明。  a.将第二列中的文本条件替换为“国籍”。此单元格已采用正确的条件标题样式。...假设已声明以下变量,文本变量“国籍”、“哪国人”“国家/地区的货币”,可以编写以下规则表: ?...这意味着,生成的规则表中并非存在两来证明同一结论值(按从上到下的顺序求值),而是只存在一来证明 结论值,同时具有多个可按任何顺序求值的选项。规则需要考虑到有些条件值为未知时这很有用。 ?...允许规则条件按任何顺序求值处理缺少值 Oracle Policy Modeling 根据 Excel 中的决策表生成的内部规则表从上到下逐行求值。...这个新结构允许按任何顺序对证明结论的条件进行求值,因此现在即使第一的值未知,第二也允许对规则进行求值。 ?

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R语言计算两数据变量之间的相关系数P值的简单小例子~应用于lncRNA的trans-act

这里相当于是计算两个数据集中的变量之间的相关性,之前发现correlation这个R包里的函数correlation()可以做 但是这里遇到了一个问题 ? 关掉这个报错界面以后就会提示 ?...<-data.frame(Var4=rnorm(10), Var5=rnorm(10), Var6=rnorm(10)) 计算相关系数P...但是mRNA的表达量有上万个,用这个函数计算的时候是非常慢的 找到了另外一个函数是Hmisc这个包中的rcorr()函数 这个速度快很多,但是他不能计算两个数据集之间变量的相关性, 这样的话可以先计算,...) flattenCorrMatrix(res.cor$r,res.cor$P) ?...零基础学习R语言之相关性分析 https://www.bilibili.com/video/BV1vb4y1k7kv psych这个包里的corr.test()函数也是可以直接计算两个数据集变量之间的相关性的

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R编程(二:基本数据类型及其操作之因子、矩阵、数据框列表)

不同之处在于,frame work 可以对列进行定义(分类函数)。所以可以借助于变量名查询(名或列名)。...可以直接将提取的列或直接按照向量的用法进行条件取值。...当通过名称对数据框进行选择的子集不存在时,R会帮我们创建一个新的内容。 排序 order() 会将其中的元素按照大小顺序排列,并按照大小顺序返回元素所在的位置数据。...,分类变量是存储有条件数目的分类的;而连续变量则可以储存及对应一系列数目(可以无穷大)。...R lists 一个R的列表包括了各种类型的变量,并将他们放置在同一个列表当中,这些变量可以是矩阵、向量、数据集,甚至是其他的列表。

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30 个小例子帮你快速掌握Pandas

6.使用lociloc添加缺失值 我正在做这个例子来练习lociloc。这些方法根据索引或标签选择列。 loc:带标签选择 iloc:用索引选择 先创建20个随机indices。...df.isna().sum().sum() --- 0 9.根据条件选择 在某些情况下,我们需要适合某些条件的观察值(即行)。例如,下面的代码将选择居住在法国并且已经流失的客户。...它使探索数据集揭示变量之间的潜在关系变得更加容易。 我们将为groupby函数写几个例子。让我们从一个简单的开始。下面的代码将根据地理位置性别的组合对行进行分组,然后为我们提供每组的平均流失率。...符合指定条件的值将保持不变,而其他值将替换为指定值。 20.排名函数 它为这些值分配一个等级。让我们创建一个根据客户余额对客户进行排名的列。...method参数指定如何处理具有相同值的。first表示根据它们在数组(即列)中的顺序对其进行排名。 21.列中唯一值的数量 使用分类变量时,它很方便。我们可能需要检查唯一类别的数量。

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Linux入门到精pao通lu

【删除文件】 rm –r【删除目录】 rm –f【强制执行】 3.文件处理命令 touch【创建空文件】 cat【查看文件内容】 cat –n【显示行号】 tac【显示文件内容(反向列示)】...文件搜索命令 1.文件搜索命令 find【文件搜索,find 搜索范围 匹配条件】 find 搜索范围 -name或-iname(不区分大小写) 匹配条件根据文件名称搜索,匹配条件(abcd)=*...(-a=大于80M小于100M的文件,-o=两个条件满足一个即可)】 find 搜索范围 -user 用户名【根据用户名搜索文件,搜索范围=/home】 find 搜索范围 -group 所属名【...>命令结束,lamp用户的身份返回为lamp. ②.SetGID针对目录的作用 >普通用户必须对此目录拥有rx权限,才能进入此目录. >普通用户在此目录中的有效会变成此目录的属....,不过if多分支条件语句不同的是,case语句只能判断一种条件关系,而if语句可以判断多种条件关系.

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区间选点

java.util.*; public class Main{ static int N = 100010,INF = 0x3f3f3f3f,n; // 结构体创建数组需要定义成全局变量.../*问题分析*/ 该题目要求将n个区间划分为m个,使中的区间不能接壤 该题第一题不同之处在于:第一题在排序之后每个区间后面的区间有关联,不会越界;但该题后面的区间仍旧可以放在前面的中使用...p表示区间,用s表示) 2.若p[i].l > s[j].r:说明两者不接壤,可以将该点放到该中 3.若所有都不符合上述条件,就重新创建一个即可 我们给出具体实现代码: import...因为相等也是有交点 if(minheap.isEmpty() || minheap.peek() >= r.l){ // 若不满足条件,自己创建一个.../*输入格式*/ 第一包含两个整数 s t,表示给定线段区间的两个端点。 第二包含整数 N,表示给定区间数。

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linux

其实使用Vim编辑器把Linux命令按照顺序依次写入到一个文件中,就是一个简单的脚本了 举例: 在上面的这个example.sh脚本中实际上出现了3种不同的元素: 第一的脚本声明(#!)...变量展示上一条命令执行后的返回值。如果为0,则目录存在。如果非0,则意味着不是目录。或目录不存在。 举例:执行顺序:先判断当前登录的user 用户是否是root 。然后取!...if  条件测试语句可以根据实际情况执行相应的命令。 if语句分为单分支结构,双分支结构,多分支结构。  如果......条件成立.......那么...........下面使用双分支的if条件语句来验证某台主机是否在线,然后根据返回值的结果。要么显示主机在线信息,要么显示主机不在信息。...适用于处理的数据有循环 举例: 从文件中读取多个用户名,然后创建用户名密码。

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R语言入门

单细胞数据分析相关R包安装 一、R的使用 R是一种区分大小写的解释型语言。你可以在命令提示符(>)后每次输入并执行一条命令,或者一次性执行写在脚本文件中的一命令 。 R语句由函数赋值构成。...二、R中的数据结构 数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,表示观测,列表示变量。类似于数据库中的记录(record)字段(field)。...可通过函数matrix()创建矩阵,阵中仅能包含一种数据类型 。 如上所示,创建了一个45列的矩阵,矩阵中的元素按照填充,分表定义了名、列名。...连续型变量可以呈现为某个范围内的任意值,并同时表示了顺序和数量。年龄Age就是一个连续型变量。 类别(名义型)变量有序类别(有序型)变量R中称为因子(factor)。...=Type2 (具体赋值根据字母顺序而定)。

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【22】进大厂必须掌握的面试题-30个Informatica面试

在路由器中,分为两:一称为“原始”,另一称为“重复”。 原始写入count_rec = 1,重复写入count_rec> 1。 ? 下图描述了过滤条件。 ?...创建一个并集转换,将来自两个源的匹配端口添加到两个不同的输入,并将输出发送到目标。 这里的基本思想是使用Joiner或Union转换将数据从两个源移动到单个目标。根据要求,我们可以决定使用哪个。...给出如下查询条件: ? 然后,将其余的列从源发送到一个路由器转换。 ? 在路由器中创建两个,并给出如下条件: ? 对于新记录,我们必须生成新的customer_id。...如果您有多个源限定符转换连接到多个目标,则可以指定集成服务将数据加载到目标中的顺序。 目标装载订单: 目标加载顺序是映射中链接的源限定符,转换目标的集合。...目标装载顺序设置: 您可以在映射设计器中设置目标加载顺序或计划。请按照以下步骤配置目标加载顺序: 1.登录到PowerCenter设计器,并创建一个包含多个目标装载订单的映射。

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从零开始学习Linux笔记

其他人 -(rwx)(r-x)(r-x )说明这个文件:所有者可以读,写,执行;所属可以读执行,但是不能写;其他人可以读执行,但是不能写。...=7 r+w=4+2+0=6 r=4+0+0=4 chmod -R [rwx的,rwx的,rwx的][文件或目录] 这条命令与mkdir -p递归创建目录一样 这个命令把一个目录下的所有子目录的操作权限全部修改为同样的...默认创建文件的所有者的缺省 umask -S 以rwx形式显示新建文件缺省权限 改变文件或者目录所有者所属 chown [所有者]:[所属] [文件或者目录] 但是在mkdir 一个目录之后...find [搜索范围] -group [所属名] 根据所属查找 find [搜索范围] -amin [时间] 查找时间以内被访问过的文件目录 a:access find [搜索范围] -cmin...6运行级别中文件的启动以及关闭顺序,启动顺序以S打头,关闭顺序以K打头,只需要找一个没有被占用的数字即可,不能现有的顺序重叠。

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统计师的Python日记【第七天:数据清洗(1)】

第2天学习了python的函数、循环条件、类。 第3天了解了Numpy这个工具库。 第4、5两天掌握了Pandas这个库的基本用法。 第6天学习了数据的合并堆叠。...创建变量 ---- 统计师的Python日记【第7天:数据清洗(1)】 前言 根据我的Python学习计划: Numpy → Pandas → 掌握一些数据清洗、规整、合并等功能 → 掌握类似与SQL...以上是按照“有两行数据,这两行数据的所有变量值都一样,这么这两就算重复数据”,但有时候我们会只根据一个变量来剔除重复,比如值根据Areas这个变量,那么A/B/C/D四个地区只会保留第一条,传入take_last...以Areas为例,Areas取四个地区:A/B/C/D,这四个地区在分析的时候并没有什么意义,但A/B/C为城市,D为农村,这个很有意义,所以我要根据areas创建变量CType:U-城市、R-农村,...方法就是写一个映射字典,把A/B/C变成U,把D变成R: areas_to_ctype={'A':'U','B':'U','C':'U','D':'R'} 然后使用 map(映射字典) 去创建变量CType

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【03】JAVASE-分支语句【从零开始学JAVA】

关键字快速生成 /** * 通用快捷键设置 * psvm:快速创建main方法 * main:也可以快速创建main方法 * sout:可以快速的生成 输出语句 * "xxx".sout:...可以快速生成输出语句内容 * 变量.soutv:可以快速生成输出语句变量=值的格式 */ public class HelloWorld { public static void main...Java中的语句结构 ​ Java中我们执行main方法中的代码的时候是有执行的先后顺序的,之前所写的代码都从上往下一执行了,没有遗落,除非报错,这种执行顺序我们叫顺序结构,最简单的结构。...2.1 顺序结构 ​ 程序从上到下一的执行代码,没有判断中转,写在前面的代码先执行,写在后面的代码后执行 2.2 分支结构 ​ 分支结构又称为选择结构,根据判断的结果判断某些条件根据判断的结果来控制程序的流程...else{ // 代码N } 执行顺序: 判断条件1,结果为true或者false 如果为true,直接执行代码1,然后结束 如果为false,那么看条件2是否为true 如果为

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数据库原理笔记「建议收藏」

参照完整性规则 若属性(或属性)F是基本关系R的外码它与基本关系S的主码Ks相对应(基本关系RS不一定是不同的关系),则对于R中每个元组在F上的值必须为: 或者取空值(F的每个属性值均为空值...HAVING短语与WHERE子句的区别: 作用对象不同 WHERE子句作用于基表或视图,从中选择满足条件的元组 HAVING短语作用于,从中选择满足条件。...数据库角色:被命名的一与数据库操作相关的权限 角色是权限的集合 可以为一具有相同权限的用户创建一个角色 简化授权的过程 角色的创建 CREATE ROLE 给角色授权...(A1, A3) 2.根据合并规则分解规则,可得引理6.1 引理6.l X→A1 A2…Ak成立的充分必要条件是X→Ai成立(i=l,2,…,k) 函数依赖闭包 定义6.l2 在关系模式...然后根据用户处理的要求,安全性的考虑,在基本表的基础上再建立必要的视图(VIEW)形成数据的外模式 在物理设计阶段根据DBMS特点处理的需要,进行物理存储安排,设计索引,形成数据库内模式 数据库编程

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scRNA-seq—读入数据详解

用于测试其算法的数据由八名狼疮患者的外周血单核细胞(PBMC)组成,分为对照干扰素β治疗(刺激)条件。 ?...第二等分试样未经处理 6小时后,将每个条件下的8个样本混合在两个最终池(刺激细胞对照细胞)中。我们将使用这两个混合样本 对照刺激混合样本分别鉴定了1213812167个细胞(去除双峰后)。...HMS数据管理工作深入讨论了数据创建和分析之外需要考虑的一些问题。 数据管理的一个重要方面是组织。对于您进行分析数据的每个实验,最佳实践是通过创建计划的存储空间(目录结构)来组织。...这些基因的顺序对应于矩阵文件中行的顺序(即,这些是名)。 ? gene_id matrix.mtx 这是一个包含计数值矩阵的文本文件。与上面的基因ID相关联,列与细胞条形码相对应。...Seurat对象分配给新变量 最后一个命令assign是将创建的Seurat对象(seurat_obj)添加到新变量

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这篇 Linux 总结的很棒啊!

ACL权限 硬链接引用计数 所有者 所属 文件大小 最后修改时间 文件名 文件类型权限 -rw-r--r-- 文件类型 - 文件、d 目录、l 软链接文件 u(所有者)、g(所属)、o(其他人...source ~/.bashrc unalias 别名 删除别名 3.5 命令的生效顺序 绝对路径或者相对路径 别名 bash内部命令 按照$PATH环境变量定义的目录查找顺序找到的第一个命令 3.6...反引号一样 # 在shell脚本中,#开头的代表注释 $ 用于调用变量的值 \ 转义符号 -  a=`ls`  -  b=$(ls) 4. vi 编辑器 VI visual interface 可视化接口...,def 名称:密码占位符:编号:中用户名列表 root 编号为0 1-499系统预留的编号 预留给安装的软件和服务的 用户手动创建的用户从500开始 密码占位符都是x 5.1.2 /etc...它根据配置文件(Debian系统是/etc/initab)产生init进程。

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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

,可以根据一个或多个变量对数据进行升序或降序排列,帮助用户重新整理数据框中的观测顺序。...Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个的频数,可以对指定变量进行计数,得到每个类别的观测数目,支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Join two tables join 函数用于根据指定的键将两个数据框连接起来,可以根据共同的变量将数据框进行合并,支持多种连接操作,如内连接、左连接、右连接外连接等。...Dplyr Mutate create, modify, and delete columns mutate 函数用于添加新变量或修改现有变量,能够基于已有数据创建新的变量列,支持对数据框进行实时的变量操作和修改...Dplyr Filter keep rows that match a condition filter 函数用于根据条件筛选数据,能够仅保留满足条件的观测,支持根据指定的条件表达式对数据框进行灵活的筛选操作

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