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R语言TCGA-Assembler包下载TCGA数据

第一是SAMPLETCGA条形码,第二指示是RAW_COUNT还是SCAPED_EASTABLE,而其他每行对应于一个基因。...第一是SAMPLETCGA条形码,第二指示是RAW_COUNT还是SCAPED_EASTABLE,而每一对应于一个isoform。第一是isoform ID。...从第二开始,每两对应一个样本。 当assayPlatform为exonRNAseq时,数据文件包含外显子RPKM值。第一是样本TCGA条形码,其他每行对应于一个外显子。...第一是样本TCGA条形码,其他每行对应于一个外显子。第一栏是外显子基因组坐标。从第二开始样本数据。...说明: 在数据文件中,第一是样品TCGA条形码,而另一每行对应于一种蛋白质抗体。第一显示编码蛋白质蛋白质抗体名称(在“|”之后)和相应基因符号(在“|”之前)。

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数学和统计方法

因为加权平均值根据权数不同进行平均数计算,所以又叫加权平均数。...,axis=1代表列 所有的数学和统计函数都有这个参数,都可以使用 我们想按或按使用时使用这个参数 import numpy as np a = np.array([[1,3,6],[9,3,2],...[1,4,3]]) print(f'数组:\n{a}') print('-'*30) print(np.sum(a,axis=0)) # 每行每个对应元素相加,返回一维数组 print('-'*30...axis=1求每行和。 • 每行对应一个样本数据 • :每代表样本一个特征 数组对应到现实中一种解释: • 对于机器学习、神经网络来说,不同量钢是相同,收敛更快。...• 比如在Excel里,单价一个,销售数量一个不同代表不同特征,所以用axis=0做计算 • 标准化一般使用:通过均值和方差实现 数组 = (数组 - mean(数组,axis=0))/ std

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生信学习-Day6-学习R

Sepal.Length平均值和标准差 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length平均值和标准差 group_by(test, Species) summarise(group_by...summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)):在每个分组内,这一步计算了Sepal.Length平均值(mean)和标准差(sd)。...内连接特点是只包含两个数据框中键值匹配。如果 test1 中某行在其 "x" 值在 test2 "x" 中没有对应值,则这行不会出现在结果中,反之亦然。...y = test2:表示要与test2数据框进行semi-join操作,即保留test1中与test2匹配。 by = 'x':指定要根据哪个进行匹配。在这里,使用x来进行匹配。...y = test1:表示要与test1数据框进行anti-join操作,即从test2中删除与test1匹配。 by = 'x':指定要根据哪个进行匹配。在这里,使用x来进行匹配。

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Python干货,不用再死记硬背pandas关于轴概念?

通过本文你将学到以下内容: - 怎么理解不同方法中 axis 参数含义 不要死记硬背 有小伙伴会说,axis 这很简单啊,不就是**0表示,1表示**,还需要学啥呢?...我们继续,不妨你在看答案之前,自己尝试思考一下 axis 值是啥。 "为每一平均值" ,代码如下: 咦?为什么是 axis = 1 呢?根据直觉,你可能第一时间想到是 axis = 0 吧。...做操作方法,这些方法都需要提供 axis 参数,用于指示操作。...而 pandas 中计算方法对于 axis 参数含义,**实际与 numpy 是一致:"表示范围扩展轴方向"**。 还是拿之前 "为每一平均值" 需求来说。...在官方网站文档中,明确说明 axis 参数含义:"从中删除其标签"。 也就是说,axis 指示了在哪个轴上寻找对应标签,然后将其删除。

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Matlab数据处理

dim取1时,该函数功能和max(A)完全相同;dim取2时,该函数返回一个向量,其第i个元素是A矩阵第i最大值。...其中[]不可省略 %例二 求矩阵A每行及每最大元素,并求整个矩阵最大元素 max(A) %求每最大值 max(A,[],2) %将矩阵转置求每行最大值 max(max(A)) %两次调用...求标准差与相关系数 std( ):计算标准差函数。 调用格式: std(X):计算向量X标准差。 std(A):计算矩阵A标准差。...调用格式: corrcoef(A):返回由矩阵A所形成一个相关系数矩阵,其中,第i第j元素表示原矩阵A中第i和第j相关系数。...数据插值计算机制 interp1( ):一维插值函数。 调用格式: Y=interp1(X,Y,X1,method) 根据X、Y值,计算函数在×1处值。

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《Python for Excel》读书笔记连载12:使用pandas进行数据分析之理解数据

为此,首先按洲对行进行分组,然后应用mean方法,该方法将计算每组均值,自动排除所有非数字: 如果包含多个,则生成数据框架将具有层次索引,即我们前面遇到多重索引: 可以使用pandas提供大多数描述性统计信息...index和columns分别定义数据框架哪一将成为透视表标签。...最后,margins与Excel中总计(GrandTotal)相对应,即如果不使用margins和margins_name方式,则Total和行将不会显示: 总之,数据透视意味着获取(在本例中为...Region)唯一值,并将其转换为透视表标题,从而聚合来自另一值。...然后,提供id_vars来指示标识符,并提供value_vars来定义“非透视表(unpivot)”。如果希望准备数据,以便将其存储回需要此格式数据库,则熔解(melting)非常有用。

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MySQL(五)汇总和分组数据

②获得表中行组和 ③找出表列(或所有或某些特定最大值、最小值和平均值 聚集函数(aggregate function):运行在行组上,计算和返回单个值函数(MySQL还支持一些标准偏差聚集函数...1、avg()函数 avg()通过对表中行数计数并计算特定值之和,求得该平均值;avg()可用来返回所有平均值,也可用来返回特定平均值; select avg(prod_price) as...,聚集函数和distinct可以搭配使用,比如: ①对所有的执行计算,指定all参数或不给参数(all是默认所有行为,不需要指定,如果不指定distinct,则假定为all); ②只包含不同值,指定...vend_id=1003对应price平均价格,因为使用了distinct参数,因此平均值只考虑不同值(唯一值) 7、组合聚集函数 select语句可以包含多个聚集函数,比如: select count...products group by vend_id; 这条SQL语句指定了2个,group by指示MySQL按照vend_id排序并且分组(如果使用group by,则不必指定要计算每个组) group

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Pandas之实用手册

pandas 核心是名叫DataFrame对象类型- 本质上是一个值表,每行和每都有一个标签。...:使用数字选择一或多行:也可以使用标签和行号来选择表任何区域loc:1.3 过滤使用特定值轻松过滤。...最简单方法是删除缺少值:fillna()另一种方法是使用(例如,使用 0)填充缺失值。1.5 分组使用特定条件对行进行分组并聚合其数据时。...聚合是也是统计基本工具之一。除了 sum(),pandas 还提供了多种聚合函数,包括mean()计算平均值、min()、max()和多个其他函数。...通过告诉 Pandas 将一除以另一,它识别到我们想要做就是分别划分各个值(即每行“Plays”值除以该行“Listeners”值)。

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GraphPad Prism 9中文版(医学绘图软件),prism 9 中文版下载安装

除了绘制基本图表外,Prism还具备一些高级功能,例如数据统计分析和可视化展示。用户可以轻松地进行平均值、标准差、标准误等常见统计指标的计算,并且可以通过图表形式展示这些统计结果。...Prism还支持数据拟合和曲线拟合,用户可以将所需数据导入软件中,进行相关分析和拟合,并生成对应图表。...如果您尚未准备好输入自己数据,请选择一个样本数据集。如果您想输入数据,请注意有两种选择。您可以输入原始数据或汇总数据(平均值、SD或SEM以及n)。输入堆叠成重复值将每个组数据输入单独中。...输入并绘制在别处计算误差值Prism可以计算单因素方差分析(但不能计算重复测量方差分析,也不能进行非参数比较),输入数据为平均值、SD(或SEM)和n。如果从另一个程序或出版物输入数据,可能有用。...通过重复测量数据,每行代表一个不同受试者或实验。使用标题标识每一(可选)。从Prism 8开始,可以保留一个或几个值为空(缺失)。只有在值为随机丢失时,结果才有意义。

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R语言梯度提升机 GBM、支持向量机SVM、正则判别分析RDA模型训练、参数调优化和性能比较可视化分析声纳数据

“ Kappa”是 Cohen (未加权)Kappa 统计量在重采样结果中平均值。 train 适用于特定模型。对于这些模型, train 可以自动创建一个调整参数网格。...该 预测器_k 个_训练集值平均值 用作原始数据替代。在计算到训练集样本距离时,计算中使用预测变量是该样本没有缺失值且训练集中没有缺失值预测变量。...替代性能指标 用户可以更改用于确定最佳设置指标。默认情况下,为回归计算RMSE、 R 2 和平均绝对误差 (MAE),而为分类计算准确度和 Kappa。...可以使用用户定义函数,只要它们具有以下参数: x 是一个包含调整参数及其相关性能指标的数据框。每行对应一个不同调整参数组合。...maximize 是一个单一逻辑值,指示性能指标的较大值是否更好(这也直接从调用传递到 train)。 该函数应输出一个整数,指示x 选择了哪一

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Excel公式练习46: 获取最大年增长率对应

:F12}) 而不是通常: SUMIF(B3:B12,B3:B12,{D3,E3,F3}) 这样,将返回一个103数组,其每元素等于下面三个公式单独计算结果: SUMIF(B3:B12,...每行3个元素分别代表列B中每个区域相对应D、E、F中数据之和,例如第一{1345097171,1351670528,1358363416}是“East Asia &Pacific”...对应D、E和F中数据和,依此类推。...要确定同比变化,只需生成与上述值相对应值矩阵,但这一次是针对C、D和E,然后将上面的数组中每个值除以新数组中相应元素。...为了确定这十个区域中哪个区域同比平均值最高,只需要对代表每个区域上述数组中三个比例求和,并确定其中最大值(如前所述,实际上无需计算这里数学平均值)。

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安卓开发_九宫格布局

,这里指定了宽度,一个对象,对应一个 “可重复子项”,这个子项就是我们 图片项和图片下方文字显示部分。...如果不指定这个宽度的话,默认是每行(展示,界面)仅仅只显示一个 “可重复子项”,而当指定了宽度时,本文指定为90dp,如果每行实际尺寸大于90,他就会继续将下一个“可重复子项”,放置在本行。...于是就呈现一种 一显示多个子项情况。numColumns属性,指定一个自动填充值,指示了自动填充。 然后是一个布局,放重复显示小布局 1 <?...new int[]{R.id.ItemImage,R.id.ItemText}); //对应RId 35 36 //添加Item到网格中 37...如果想要显示不同图片和文字  则可以把图片,文字放到数组里 1 int[] itemimage = new int[]{R.drawable.image_people_shu_zhangfei,

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R语言梯度提升机 GBM、支持向量机SVM、正则判别分析RDA模型训练、参数调优化和性能比较可视化分析声纳数据|附代码数据

“ Kappa”是 Cohen (未加权)Kappa 统计量在重采样结果中平均值。 train 适用于特定模型。对于这些模型, train 可以自动创建一个调整参数网格。...该 预测器_k 个_训练集值平均值 用作原始数据替代。在计算到训练集样本距离时,计算中使用预测变量是该样本没有缺失值且训练集中没有缺失值预测变量。...替代性能指标 用户可以更改用于确定最佳设置指标。默认情况下,为回归计算RMSE、  R 2 和平均绝对误差 (MAE),而为分类计算准确度和 Kappa。...可以使用用户定义函数,只要它们具有以下参数: x 是一个包含调整参数及其相关性能指标的数据框。每行对应一个不同调整参数组合。...maximize 是一个单一逻辑值,指示性能指标的较大值是否更好(这也直接从调用传递到 train)。 该函数应输出一个整数,指示x 选择了哪一 。

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分布式隐私保护可审计账本zkLedger

绑定性:在关于v承诺c生成之后,承诺方难以将已承诺敏感数据解释成另一不同数据v'。...由于元祖(g,h,q)是公开,验证方可以根据盲因子r1来构造一个承诺 comm'(v1,r1) ,验证与接收到comm(v1,r1)是否是相等。...银行添加和删除 zkLedger可以支持动态添加或删除银行。 参与者(或其他机构)将已签名交易追加到分布式账本,以指示应添加或删除银行,以及对应列。...对于每一,银行将根据其是否参与交易来对b值做出承诺,b为1或0,并创建证明该银行已正确完成重新承诺证明。 至关重要是,审计师无法区分这些承诺,因此不会透露银行交易。...审核员通过验证承诺是否正确完成来验证 步骤,并通过确认位承诺矢量乘积 来验证 步骤和非零交易数。 Compute answer.审核员根据银行列值总和和非零交易数计算平均值

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MySQL必知必会汇总

; 每个都有对应数据类型; 数据类型: 所容许数据类型,每个表列都有对应数据类型,它限制或容许该类中存储数据; 优点: 防止在数值字段中录入字符值; 帮助正确排序数据,...在优化磁盘使用方面有重要作用; : 表中一个记录; 别称记录,从技术上讲:才是正确术语; 主键: 一或一组,其值能够唯一区分表中每一; 唯一标识表中每行这个(或这组...第10章:创建计算字段 计算字段相关概念: 计算字段与不同计算字段并不实际存在与数据库表中,计算字段是运行时在select语句中创建; 字段:基本与意思相同,经常互换使用,不过数据库一般称为...NULl; 聚集不同值: 计算不同值需要指定DISTINCT参数; mysql> select avg(distinct prod_price ) as avg_price from products...NULl; ## 聚集不同值: 计算不同值需要指定DISTINCT参数; ```mysql mysql> select avg(distinct prod_price ) as avg_price

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Mysql| Mysql函数,聚集函数介绍与使用(Lower,Date,Mod,AVG,...)

: 1.所有的聚集函数在对指定进行计算时,会忽略值为NULL. 2.特别的COUNT函数在对所有的进行计算时允许使用*, 对行进行计数时,不会忽略一数据中每个列为null值....这些函数是高效设计,它们返回结果一般比你在自己客户机应用程序中计算要快得多. 2.聚集函数可移植性不强,取决于不同数据库厂商和不同版本. ①AVG()函数用法: 只用于单个 AVG()只能用来确定特定数值平均值...为了获得多个平均值,必须使用多个AVG()函数。 关于空值: NULL值 AVG()函数忽略值为NULL。 ...-用法: 以上5个聚集函数都可以如下使用:(在MYSQL5版本中有小在5以下无效)  ①对所有的执行计算,指定ALL参数或不给参数(因为ALL是默认行为);  ②只包含不同值,指定DISTINCT参数...(也就是prod_price值相同值)后再计算平均值.

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【干货】计算机视觉实战系列03——用Python做图像处理

result = np.where(cond,xarr,yarr) 当符合条件时是x,不符合是y,常用于根据一个数组产生另一个新数组。...-1其实没有实际意义,而是只定义了第一个参数量——这个数组有两,然后我们并不用关心数,而让Numpy自己计算出新数组数。...如:a.max()和a.min()其中,括号内我们还可以传入我们想要参数,axis=1或者axis=0,分别表示获得每行最大(小)值和获得每最大(小)值 平均值: 获得矩阵中元素平均值可以通过函数...同样地,可以通过传入axis=0和axis=1参数获得整个矩阵、平均值 方差和标准差: 方差函数为var(),方差函数var()相当于函数mean(abs(x - x.mean())**2),...在计算机中,当以RGB模式表示颜色时,反相实现是用255(前提是R/G/B都是8位)分别减去R,G,B值,得到即为反相对应RGB值。

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