R中的因子用于存储不同类别的数据，可以用来对数据进行分组，例如人的性别有男和女两个类别，根据年龄可以将人分为未成年人和成年人，考试成绩可以分为优，良，中，差。...R 语言创建因子使用 factor() 函数，向量作为输入参数。...) #输出sex，会发现有levels这一行信息 sex #判断sex是否为因子 is.factor(sex) 我们可以看到输出sex的时候，除了显示字符串的内容以外，这里还有一行levels，证明sex...关于这个参数后面我们还会给大家举个更实际的，跟临床数据相关的例子。 R中的因子使用还是更广泛的，例如做差异表达分析的时候我们可以根据因子将数据分成两组。...绘制boxplot的时候，我们也可以根据因子来将数据分成两组。
前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...*","stage III/IV",stage) #将剩下的Stage I和Stage II替换成stage I/II stage=gsub("Stage....*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表
通常我们会使用比对好的fasta文件构建进化树，fasta文件中大于号后的内容就是最终进化树上的文字标签。如果拿到进化树文件后你想替换掉其中的一些内容，那该怎么办呢？...本篇推文介绍一下使用R语言的ggtree包实现这个目的 这个问题是来源于公众号的一位读者的提问 ?...大家可以关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 留言相关问题，如果我恰巧会的话，我会抽出时间介绍对应的解决办法 首先你已经有了构建好的进化树文件 (Synergus:0.1976902387,(((((Periclistus...image.png 第一列x就是进化树中原本的序列名称 第二列y是想要替换成的id名称 读入进化树文件 library(treeio) tree<-read.newick("ggtree_practice_aligned.fasta.treefile...image.png 把这个新的进化树写出到文件里 write.tree(tree1@phylo,file = "pra.nwk") 这样就达成目的了 这里导出的进化树文件没有了最初的支持率的信息，我们再通过一行代码给他加上就好了
p=13584 ---- 今天上午，在课程中，我们讨论了利率制定中可观察和不可观察异质性之间的区别（从经济角度出发）。为了说明这一点，我们看了以下简单示例。让 X 代表一个人的身高。...by=.2) > lines(x,f1(x),lty=2,col="red") > lines(density(X)) 如果看那条黑线，可能会想到一种混合分布，例如 当我们有一个获得混合分布不可观察的异质性因子...也许我们可以使用实际观察到的变量来解释样本中的异质性。在形式上，这里的想法是考虑具有可观察到的异质性因素的混合分布：性别， 现在，我们对以前称为类[1]和[2]的解释是：男性和女性。...: 0.5488, Adjusted R-squared: 0.5465 F-statistic: 240.8 on 1 and 198 DF, p-value: < 2.2e-16 我们得到的均值和方差的估计与之前获得的估计相同...因此，正如今天上午在课堂上提到的，如果您有一个不可观察的异质性因子，我们可以使用混合模型来拟合分布，但是如果您可以得到该因子的替代，这是可观察的，则可以运行回归。
当我们有一个获得混合分布不可观察的异质性因子：概率 p1，一个随机变量 ，概率p2，一个随机变量 。...也许我们可以使用实际观察到的变量来解释样本中的异质性。在形式上，这里的想法是考虑具有可观察到的异质性因素的混合分布：性别， 现在，我们对以前称为类[1]和[2]的解释是：男性和女性。...因此，如果您有一个不可观察的异质性因子，我们可以使用混合模型来拟合分布，但是如果您可以得到该因子的替代，这是可观察的，则可以运行回归。...点击标题查阅往期内容 R语言实现：混合正态分布EM最大期望估计法 在R语言和Stan中估计截断泊松分布 在R语言中使用概率分布：dnorm，pnorm，qnorm和rnorm R语言混合正态分布EM...最大期望估计 在R语言和Stan中估计截断泊松分布 更多内容，请点击左下角“阅读原文”查看报告全文 ?
例70：C语言写一个函数，将一个字符串中的元音字母复制到另一字符串，然后输出。 ...解析：if语句判断一下每一个字母是否符合元音字母，读者看着道题的时候，需要注意一点的是如果用scanf函数是否可以，思考为什么要用gets函数？.../主函数 { void copy(char s[],char c[]); //函数声明 char str[80],character[80]; //定义字符数组 printf("输入字符串.../提示语句 gets(str); //键盘录入 copy(str,character); //调用该函数 printf("元音字母是：%s\n",character);//输出复制后的字符串...以上，如果你看了觉得对你有所帮助，就给小林点个赞，分享给身边的人叭，这样小林也有更新下去的动力，跪谢各位父老乡亲啦~ C语言 | 将字符串中的元音字母复制到另一个字符串中 更多案例可以go公众号：C语言入门到精通
例外是如果您使用其他语言（如C）直接访问R数据，但这超出了本课程的范围。相反，我们将考虑基本数据类型：数字，整数，逻辑和字符，以及称为“因子”的更高级数据类。...由于这只是一个警告，R将继续执行脚本或者函数中的任何后续命令，而“错误”将导致R停止。 5.3.2 字符/字符串 “character”类存储各种文本数据。...编写程序时习惯将包含多个字母的数据称为“字符串”，因此大多数作用于字符数据的R函数将数据称为“字符串”，并且通常在其名称中包含“str”或“string”。...因此，当存储具有重复元素的字符串向量时，更有效地办法是将每个元素分配给整数并将向量存储为整数和附加的字符串与整数关联的表格中。因此，默认情况下，R将读取数据表的文本列作为因子。...例如，将两个因子结合在一起会将它们转换为数字形式，原始的字符串将丢失。
首先，在源变量框中选中需要进行分析的变量，点击右边的箭头符号，将需要的变量调入变量（Variables）栏中（图3）。在本例中，全部8个变量都要用上，故全部调入（图4）。...在Display栏中，选中Unrotated factor solution（非旋转因子解）复选项，则在分析结果中给出未经旋转的因子提取结果。...选中Save as variables栏，则分析结果中给出标准化的主成分得分（在数据表的后面）。...、 t-SNE算法降维与可视化分析3.主成分分析(PCA)基本原理及分析实例4.R语言实现贝叶斯分位数回归、lasso和自适应lasso贝叶斯分位数回归5.使用LASSO回归预测股票收益数据分析6.r语言中对...lasso回归，ridge岭回归和elastic-net模型7.r语言中的偏最小二乘回归pls-da数据分析8.R语言用主成分PCA、 逻辑回归、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化9.R语言主成分分析
1、金融高频因子计算 我们通过一个具体的例子来引入金融高频因子计算的问题。下面这个因子表达式是用DolphinDB的脚本语言写的。...通过订阅函数subscribeTable，我们将流数据表tickStream与状态引擎rse进行关联。任何实时数据的注入，都将触发状态引擎的计算，输出因子值到结果表result。...在后续的版本中，DolphinDB将允许用户用插件来开发自己的状态函数，注册后即可在状态引擎中使用。 3.4 自定义状态函数 响应式状态引擎中可使用自定义状态函数。...，定义多个因子时，代码会更简洁。...第一节中的因子表达式改为下面的自定义状态函数factor1后，计算逻辑简洁明了。
数据被打包为 zip 文件，所以需要做的不仅仅是调用 read_csv()。使用tempfile() 基础 R 中的 函数来创建一个名为 temp. 这是我们将放置压缩文件的地方。...如果我们导入不同的 FF 因子集，我们将需要指定不同的列名。 作为一种替代方法，下面的代码块在导入后将列转换为数字，但更通用。它可以应用于其他 FF 因子集合。...为了做到这一点，我们将X1列重命名为date，然后将我们的列格式改为数字。...因此，我们的 3 因子 FF 方程为 lm(R_excess ~ MKT_RF + SMB + HML。 我们将在 CAPM 代码流中添加一项，即为我们的系数包括 95% 的置信区间。...因此，市场因素在该模型中占主导地位，而其他两个因素的置信区间为零。 ---- 本文摘选《R语言Fama French (FF) 三因子模型和CAPM多因素扩展模型分析股票市场投资组合风险/收益可视化》
使用forcats处理因子 因子在 R 中用于处理分类变量。从历史上看，因子远比字符串更容易处理。因此，R 基础包中的很多函数都自动将字符串转换为因子。...准备工作 使用forcats包来处理因子，这个包提供了能够处理因子的工具，其中还包括了处理因子的大量辅助函数。...library(tidyverse) library(forcats) 创建因子 假设我们想要创建一个记录月份的变量： x1 <- c("Dec", "Apr", "Jan", "Mar") 使用字符串来记录月份有两个问题...在创建因子时，将水平设置为unique(x)，或者在创建因子后再对其使用fct_inorder()函数，也可以达到这个目的： f1 改为较为详细的排比结构： gss_cat %>% mutate(partyid = fct_recode(partyid, "Republican, strong" = "Strong republican
通过一系列内建函数和库，你可以用 R 语言学习数据可视化，特别是它还有很多图形前端。本文将简单介绍 R 语言的编程基础，带你逐步实现第一个可视化案例。...你可以将 R shell 当成计算器使用，执行简单的数学，甚至高级的机器学习算法。...在 R 中我们使用 print() 函数返回参数中给定的字符串： $R > print("Hello World!") [1] "Hello World!"...和原子向量不同，列表中的变量不局限于单一的数据类型，可以包含任意的数据类型的混合。一个列表可以包含其它列表。 R 语言中的列表可以用 list() 函数创建。...语言里的 for 循环可以在任何列表或矢量中执行。
二、选择R的原因 尽管R语言在处理大数据集时存在性能限制，可能不适合直接处理海量数据，但它在教学和实验环境中的作用无可替代。...数组是对向量和矩阵的扩展，适用于处理更复杂的数据。 （四）因子 因子是一种专门用于表示分类或有序类别数据的R数据类型。因子将分类数据编码为整数，并保存这些整数与原始类别标签之间的映射关系。...4.拼接字符串： paste()函数 可以将多个数据项拼接为一个字符串。...例如，使用 summary(data) 可以查看向量data的相关统计指标。 7.因子函数： factor() 函数用于将字符向量转换为有序或无序因子，便于进行分类分析。...掌握R语言的核心功能，有助于深入理解数据、提升分析能力，并在实际应用中取得关键成果。
写在前面：公众号又被我搁置好久，闲来无事，写写近期学的R语言吧，主要分为两个部分写，一主要为数据处理，二为ggplot作图。...这两个部分将生信分析的绝大多数常用命令都讲到了，作为R语言入门是够用的，但是学海无涯，以此只是作为一个引子，想要进步还是要自己多学多练，举一反三才行。..."R11.txt", sep = "\t", header = T) #读取R11.txt文件，header = T表示将数据的第一行作为标题 ?...mode主要用于区别数据存放的方式，而class是一种更细微的分类方式，比如矩阵，就是一种更“有序”的数据存放方式。此命令比mode常用。 ?...Vlookup，可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能；by.x，by.y：指定依据哪些行合并数据框，默认值为相同列名的列 ?
关于数据整理，原则是根据你的呈现目标整理&根据R语言函数对数据的要求整理。即既要满足想要呈现的内容又要满足代码对输入数据的要求。因此，要用计算机语言的思考方式，根据自己的目标整理数据。...但是，准确的说，上面这种数据排布形式只是方便填写和阅读，并不能用于作为R语言的输入数据的排布形式。因此，我们需要按照计算机语言能够理解的思维方式重新整理数据。...导入R前的数据整理 一、数据整理的原则 我自己总结的原则是，如果你画的是二维图，即只有X和Y轴的图，那么你的数据需要整理成核心只有两列的数据表。...二、什么叫“核心只有两列的数据表” 因为最终画出来的图只有x和y轴，无论你将数据分了多少组，将样本分了多少组，即你要做多少种标记（颜色、形状等等）或者你重复测了多少次，有多少平行数据等等，图像要表现的关系核心...关于因子 因子相当于是给分类变量设置顺序。即因子水平中指定的顺序即为分类变量的顺序。这与分类变量本身在向量中的排列顺序无关。
系列文章《C语言经典100例》持续创作中，欢迎大家的关注和支持。...喜欢的同学记得点赞、转发、收藏哦～ 后续C语言经典100例将会以pdf和代码的形式发放到公众号 欢迎关注：计算广告生态 即时查收 1 题目 编写函数fun() 函数功能：将M行N列的二维数组中的字符数据...，按列的顺序依次放到一个字符串中 例如： 二维数组中的数据为： W W W W S S S S H H H H 则字符串中的内容是：WSHWSHWSH [image.png] 2 思路 第一层循环按照列数进行...M 3 #define N 4 /** 编写函数fun() 函数功能：将M行N列的二维数组中的字符数据，按列的顺序依次放到一个字符串中 例如： 二维数组中的数据为： W W W W S S S...S H H H H 则字符串中的内容是：WSHWSHWSH **/ // 0 1 2 3 // 0 W W W W // 1 S S S S // 2 H H H H char *fun(char
分别是向量形式输入数据 显示对象的结构 显示对象的统计概要 首先，以向量的形式输入数据➊。然后，将diabetes和status分别指定为一个普通因子和一个有序型因子。...最后，将数据合并为一个数据框。函数str(object)可提供R中某个对象（本例中为数据框）的信息➋。...R中一些头麻的地方 对象名称中的句点（.）没有特殊意义，但美元符号（$）却有着和其他语言中的句点类似的含义，即指定一个数据框或列表中的某些部分。例如，A$x是指数据框A中的变量x。...❏ R不提供多行注释或块注释功能。你必须以#作为多行注释每行的开始。出于调试目的，你也可以把想让解释器忽略的代码放到语句if(FALSE){... }中。将FALSE改为TRUE即允许这块代码执行。...这些是面向开发者的R语言,很多反常规的设计 也许输入数据最简单的方式就是使用键盘了。有两种常见的方式：用R内置的文本编辑器和直接在代码中嵌入数据。我们首先考虑文本编辑器。
/p/71392ef45d01 很多R语言用户并不认为自己是程序员，我也是:)，精通专业知识，理解R语言的标准数据结构，但是缺乏正规编程训练，你是这样的吗？.../p/71392ef45d01很多R语言用户并不认为自己是程序员，我也是:)，精通专业知识，理解R语言的标准数据结构，但是缺乏正规编程训练，你是这样的吗？...一书中介绍了更详细的错误处理方法。...##1） 内在排序 因子可用于图形排序，通常read.csv()中自动转换为因子，我们一般options(stringsAsFactors = F)，但是作者出于可移植性考虑不建议将这个放到.Rprofile...##2）固定类别 比如月份排序，因子可以实现，这指的英语的Dec这种。因子还比字符串稍微节约点空间。 Apply函数家族 可以看作是循环的替代，第一次听说eapply()独立环境，这个我们应该用不到。
利用机器学习可以很方便的做情感分析。本篇文章将介绍在R语言中如何利用机器学习方法来做情感分析。在R语言中，由Timothy P.Jurka开发的情感分析以及更一般的文本挖掘包已经得到了很好的发展。...这个包的主要开发者是David Meyer。 我们仍然有必要了解文本分析方面的知识。用R语言来处理文本分析已经是公认的事实（详见R语言中的自然语言处理）。...tm包算是其中成功的一部分：它是R语言在文本挖掘应用中的一个框架。它在文本清洗（词干提取，删除停用词等）以及将文本转换为词条-文档矩阵(dtm)方面做得很好。这里是对它的一个介绍。...注意，e1071要求响应变量是数值型或因子型的。我们用下面的方法将字符串型数据转换成因子型： ? 测试结果准确度： ?...扩大训练集后，利用更复杂的方法我们对推文做的情感分析可以得到一个更好的结果。示例演示如下： 推文情感分析 数据来自victornep。victorneo展示的是用python对推文做情感分析。
Wide- to long-format data: the melt function 例子使用内置于R中的空气质量数据集（airquality）。首先，我们将列名更改为小写方便使用。...Graphpad，经典绘图工具初学初探 维恩(Venn)图绘制工具大全 （在线+R包） 在R中赞扬下努力工作的你，奖励一份CheatShet 别人的电子书，你的电子书，都在bookdown R语言 -...R中的实现 一文看懂PCA主成分分析 富集分析DotPlot，可以服 基因共表达聚类分析和可视化 R中1010个热图绘制方法 还在用PCA降维？...12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化 编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出 R语言统计入门课程推荐——生物科学中的数据分析Data...使用dplyr进行数据操作30例 交集intersect、并集union、找不同setdiff R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换 1数据类型（向量、数组、矩阵、 列表和数据框） 2读写数据所需的主要函数
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