文档建议反馈控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

Jelys Note之生信入门class5

（1） 一般在读取时就赋值！...一切操作在r语言中进行 （4）R特有的数据保存格式：Rdata Rdata：保存的是变量，不是表格文件 支持多个变量存到同一个Rdata 是R语言特有的数据存储格式，其他软件无法打开 · 相关命令：...1.输出文件、输入文件、输出的图片、保存的Rdata、 脚本和Rmd文件+Rproject 读取：surv变量=read.table("import/文件名) 2.分步骤 加载上一级的文件、相隔文件夹调用文件时...R语言读文件时串列了怎么办！不报错！=哑巴地雷 连续两个分隔符=空列=一切看不见的东西都会被认为是！...用于读取/导出文件的R包 fread（）实现智能读取【data.table】 export（）导出【rio】 import_list---多个工作部的数据，引入

88210

PQ-M及函数：为什么加了新的内容，拆分列不对了？

这个直接操作的方法是有点儿问题，主要是因为，操作分列的时候，PQ会直接生成固定的列名，原来最多只要3个内容，就只生成了3列，所以以后有更多的数据时，就没有地方放了。你看原来生成的代码： 小勤：啊。...Step-02：修改原拆分列代码中的固定列名列表为动态列名列表 {"1"..Text.From(List.Max(已添加自定义[内容数]))} 用List.Max读取前面一步生成的列（还记得对前面步骤生成的结果的列怎么引用的吗...理解PQ里的数据结构之二、行列引用》）的最大值，得到最多可能分出的内容数。 然后用Text.From转为文本（因为列名必须是文本） 最后用构造列表的方法去得到动态的字段名序列。 小勤：啊。...理解了，反正就是想办法根据内容的最大项数构造一个动态的列名列表给拆分列的步骤去用。 大海：对的。 小勤：那要是超过10列怎么办？用{"1"..##}的方式会不会出错啊？ 大海：好问题。你试试？...小勤：出错了。 大海：对的。如果超过10项内容，会出错，因为简单的构造字符列表不能出现2个字符的内容。 小勤：那怎么办？

49020
您找到你想要的搜索结果了吗？
是的
没有找到

数据分析必备：掌握这个R语言基础包1%的功能让你事半功倍！（附代码）

.csv只是text file（文本文件）的一种，文本文件在微软的Windows操作系统中常以拓展名为.txt的形式呈现。...如果文件中的第一行比数据整体的列数量少一时，则会默认使用第一列来作为行名。 col.names：列名。可以通过指定一组向量来进行列名设置。 na.strings：对默认值的处理。...这里暂且称这些问题数据集为不规则数据集，简单说就是，实际列的个数多于列名的个数。read.table函数为这些问题准备了相应的参数。 ? 1....这是因为read.table会扫描文件中前五行的数据（包括变量名称）并以此为标准来确定变量数，airlines.csv中开始的五行数据都只有两列，所以后续的数据也都强制读取成两列。...但是在处理实际工作中成百上千行的数据时，这种手动指定变量个数的方法就显得笨拙而低效了。下面的代码演示了如何实现自动检测数据集所需的变量数： 部分结果展示如表1-8所示。

3.2K10

Python数据分析实战之数据获取三大招

>>> print(fout.tell()) # 输出指针位置 >>> fout.close() # 关闭文件对象 60 由于文件读写时都有可能产生IOError，一旦出错，后面的fout.close...可以使用try … finally来保证无论是否出错都能正确地关闭文件: >>> try: ... file_object = open('./text.txt', 'r') ......index_col : int or sequence or False, default None 用作行索引的列编号或者列名，如果给定一个序列则有多个行索引。.../test.csv')读取文件时。 坑1：index列。保存文件时默认保存索引，读取文件时默认自动添加索引列，即将保存的索引作为第一列读取到DataFrame。.../test.csv', index_col=0) ---- 坑2：原本日期格式的列，保存到csv文件后仍为日期格式。但再次读取文件时将以字符串的格式读取到DataFrame。

6.4K30

R语言基础教程——第8章：文件的输入与输出

24 34 读写文件 1 从文件中读取数据库获矩阵 read.table()函数是R最基本函数之一，主要用来读取矩形表格数据。...或者要读取的表中包含行名称的列序号或列名字符串。 在数据文件中有行头且首行的字段名比数据列少一个的情况下，数据文件中第1列将被视为行名称。...值在读取数据时候转换成NA （11）colClasses 用于指定列所属类的字符串向量。 （12）nrows 整型数。用于指定从文件中读取的最大行数。负数或其它无效值将会被忽略。...当该参数值设置为TRUE时，则该函数读取完指定列数后将转到下一行。这允许用户在最后一个字段后面添加注释。...（24）text 字符串类型。当未提供file参数时，则函数可以通过一个文本链接从text中读取数据。 （25）skipNul 逻辑值。是否忽略空值。默认为FALSE。

4.6K31

Python数据分析实战之数据获取三大招

>>> print(fout.tell()) # 输出指针位置 >>> fout.close() # 关闭文件对象 60 由于文件读写时都有可能产生IOError，一旦出错，后面的fout.close...可以使用try … finally来保证无论是否出错都能正确地关闭文件: >>> try: ... file_object = open('./text.txt', 'r') ......index_col : int or sequence or False, default None 用作行索引的列编号或者列名，如果给定一个序列则有多个行索引。.../test.csv')读取文件时。 坑1：index列。保存文件时默认保存索引，读取文件时默认自动添加索引列，即将保存的索引作为第一列读取到DataFrame。.../test.csv', index_col=0) ---- 坑2：原本日期格式的列，保存到csv文件后仍为日期格式。但再次读取文件时将以字符串的格式读取到DataFrame。

6K20

R3数据结构和文件读取

,R包：多个函数的打包存放，包含函数，数据，帮助文件，描述文件，library里面是R包，没有就安装（3种），安装成功的标识是library没有error#options("repos"=c(CRAN=...文件打开方式1默认EXCEL，2记事本，3subline（适用大文件）4R语言读取，一般赋值读取，文件读取了，就会生成数据框，对数据框进行的修改不会同步到表格文件#TSV（\t 制表符tab分隔））#但是纯文本文件的这些后缀没有意义...，只是约定俗称，如果一个文件后缀是csv，但是制表符分隔,也没有问题#1.读取ex1.txt（含列名）ex1 <- read.table("ex1.txt")#此时第一行是列名，txt默认header=...它可以接受任何单个字符或字符串作为参数，用于将文本数据内容分割成列。常见的分隔符包括逗号（,），制表符（\t），分号（;）等。例如，当读取以逗号分隔的CSV文件时，应该将sep参数设置为逗号（,）。...当sep = "\t"时，read.table将使用制表符作为分隔符来读取文本文件中的数据。#4.soft 的行数列数是多少？

2.7K00

【生信技能树培训】R语言中文件的读取

二、R语言读取文件的函数read.csv() : 通常读取csv格式，但也可以读取其他纯文本文件read.table() : 通常用于读取txt格式文件三、 将数据框导出为文件（一）导出为表格文件函数...**Tips：**加载的时候，文件在工作目录以下的目录时，输入文件名用Tab补全时，会自动补全其相对路径。也可以通过../...... 来指定上一层级目录的文件的读取。...#当指定fill参数为TRUE时，读取文件时，会自动将空行的地方填充成NA。但是，当出现某些行间隔空缺的时候，会将空行后一列的内容补充到前一列的空行中来，从而造成数据错乱。见下图。...图片单独指定fill参数为TRUE时，E列中826行开始的内容会被移动到D列的空行中。见下图。**原因在于，用纯文本查看文件时会发现，在862行之后的第4列与后面的内容之间有两个制表符分隔。...Excel可以正确识别两个制表符，知道两列之间有一个空列，而R语言中该函数无法识别。

3.8K30

数据分析必备：掌握这个R语言基础包1%的功能，你就很牛了

.csv只是text file（文本文件）的一种，文本文件在微软的Windows操作系统中常以拓展名为.txt的形式呈现。...函数read.table实用参数及功能对照： file：数据文件路径+文件名，也可以是一个url，或者是文字数据 header：设置逻辑值来指定函数是否将数据文件的第一列作为列名。...如果文件中的第一行比数据整体的列数量少一时，则会默认使用第一列来作为行名 col.names：列名。...这里暂且称这些问题数据集为不规则数据集，简单说就是，实际列的个数多于列名的个数。read.table函数为这些问题准备了相应的参数。 ? 1....这是因为read.table会扫描文件中前五行的数据（包括变量名称）并以此为标准来确定变量数，airlines.csv中开始的五行数据都只有两列，所以后续的数据也都强制读取成两列。

2.7K50

R语言基础-02（数据框、下载包）

## [1] "gene" "change" "score"#修改数据框就是修改向量#改行名和列名rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名...Species=="a"|test$Species=="c",]test[test$Species %in% c("a","c"),]矩阵不支持$删除#删除 rm(l)#删除一个rm(df1,df2)#删除多个...首先考虑原因1.2，多搜索多尝试提示connection、download：网络问题提示writable、permission：权限问题，管理员方式打开R图片读取表格、fread函数input <- read.csv...t"read.table()library(data.table)input <- fread("data/input.csv",header = T,row.names = 1,sep = ",")Tips：输出文件时不要覆盖原文件需要用非...proj的文件夹内的文件时，写全路径多用tabfread函数读取快且遇空行不易出错引用自生信技能树马拉松课程小洁老师R语言基础

64430

生信入门课DAY5--向逸一

xx<- 1:10 #从1-10之间所有的整数xx<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）xx<- rep(1:3,times=2) #1-3 ...）①读取本地数据Usageread.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'", dec = "...，1.2.3.4...colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改X<-read.csv(file = "huahua.txt...⑤提取元素- X[x,y]#第x行第y<em>列</em>- X[x,]#第x行- X[,y]#第y<em>列</em>- X[y] #也是第y<em>列</em>- X[a:b]#第a列到第b<em>列</em>- X[c(a,b)]#第a<em>列</em>和第b<em>列</em>- X$<em>列名</em>#也可以提取<em>列</em>...①大小写问题，更改大小写②是否赋值给X，赋值对象可能<em>出错</em>，重新赋值一次

35840

R语言 数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...tsv改变文件名而来的，此时用csv打开会报错，该知识点用于防止部分代码中错误应用csv套用tsv等#文件读写部分(文件位于R_02的Rproject中)#1.读取ex1.txt txt用read.table...读，变量名不需要有""，文件名是真实存在的文件，要有""#直接读取如果失败，需要指定参数#ex1 <- read.table("ex1.txt") #读入该文件后会发现原文件被认为没有列名，列名被当作第一行...，应选用header=T#2.读取ex2.csv 导入后生成一个数据框#ex2 <- read.csv("ex2.csv") #读入该文件后会发现原文件第一列被错误当作数据而非行名，且列名的.变成了-，...txt且不容易出现报错#4.soft 的行数列数与列名dim(soft)colnames(soft)#为了更为方便地处理，可以将不同类型的文件建设文件夹放在Rproject下，读取的时候只需按文件目录的格式输入文件夹名后

7.6K00

Day5-i 生信星球学习-数据结构

矩阵（Matrix） 数组（Array） 数据框（Data frame）List向量标量和向量的区分元素：指的是数字或者字符串（用chr表示）等，根据它可以区分两个词：标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量...(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5)] #第1个和第5个元素根据值x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框读取本地数据...，sep = "," tsv 文件 sep = "\t"header=TRUE代表读入数据时将第一行作为列名查看行名和列名、行数和列数colnames(a)#查看列名rownames(a)#查看行名...- a[x,y]#第x行第y列- a[x,]#第x行- a[,y]#第y列- a[y] #也是第y列- a[a:b]#第a列到第b列- a[c(a,b)]#第a列和第b列- a$列名#提取列（Tab自动补全...，只能提取一列）直接使用数据框中的变量plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)iris是R语言的内置数据,plot作图XXX.R文件即为脚本文件

14010

Day3

(列名 =向量(列的内容), 列名 =向量(列的内容))###由已有数据转换或处理得到读取表格文件df2 <- read.csv("gene.csv")R语言内置数据属性dim(df1)#维度nrow(...df1)#行数ncol(df1)#列数rownames(df1)#行名colnames(df1)#列名取子集:取列: $按坐标: [] #2,2取第二行第二列按名字,c('gene','change')...df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05)改行和列名--赋值全部：rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")一个-取出后赋值：colnames...(df1)2 <- "CHANGE"两个数据框的连接/合集-mergemerge(test1,test2,by="共同<em>列</em>的<em>列名</em>")merge(test1,test3,by.x = "name",by.y...pheatmap::pheatmap()列表list:可装万物新建 <- list(m1 = , m2=)取子集[[]]、$补充：元素的“名字”-names()难点：数据框按逻辑值取子集删除变量：一个rm(x)多个

5910

岩酱的生信学习笔记 Day5 (R语言数据结构）

#R语言数据结构##1.向量向量：多个元素组成的变量，元素可以是数字或者字符串。...个元素x[c(1,5)]#第1个和第5个元素根据值x[x==10]# 等于10的元素x[x<0]# 小于0的元素x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素2.数据框(1).读取数据...；row.names=1将第一列设为行名(2).查看行名、列名、行数列数colnames(a)#查看列名rownames(a)#查看行名dim(a)#a数据框多少行多少列(3).数据框的导出write.table..."）#保存当前所有变量save(a,file="test.RData“）#保存其中一个变量load("test.RData“）#再次使用Rdata时加载的命令(5)提取元素a[x,y]#第x行第y列a[...x,]#第x行a[,y]#第y列a[y] #也是第y列a[a:b]#第a列到第b列a[c(a,b)]#第a列和第b列a$列名#也可以提取列（优秀写法，支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

11110

R-rbind.fill|列数不一致的多个数据集“智能”合并，Get！

Q：多个数据集，列数不一致，列名也不一致，如何按行合并，然后保留全部文件的变量并集呢？ A：使用 rbind.fill 函数试试！...数据集按列合并时，可以根据merge 或者 dplyr函数包的merge系列函数决定连接方式，达到数据合并的需求。...data1，data2，data3 列数不一致，列名也不一致，现在需要按行合并，可能的问题： 1）rbind： 是根据行进行合并（行叠加）但是要求rbind(a, c)中矩阵a、c的列数必需相等。...2）列数相同的时候，变量名不一致也会合并，导致出错 二 rbind.fill“智能”合并 列数不一致多个数据集，需要按行合并，尝试使用plyr包rbind.fill函数 library(plyr) rbind.fill...呐，就是这样，rbind.fill函数会自动对应数据列名，不存在的会补充列，缺失时NA填充。

2.6K40

从零开始的异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

数据框 data.frame 数据框 约等于表格：1.数据框不是一个具体文件，只是R语言内部的一个数据；2.数据框每一列只能有一种数据类型 图片 新建和读取数据框 #新建和读取数据框 df1 <- data.frame..."up","down"),each = 2), score = c(5,3,-2,-4)) df1 df2 <- read.csv("gene.csv") #读取文件的时候注意文件路径...，默认只会从工作目录中读取文件，否则可能出现报错 df2 图片 数据框属性 数据框属性 # dim(df1) # nrow(df1) #输出行数 ncol(df1) #输出列数 # rownames(...df1[,3] df1[,ncol(df1)] #ncol()函数统计列数，一共多少列，就是取最后一列 #如何取数据框除了最后一列以外的其他列？...增加一列 在$后面写一个不存在的列名表示增加一列 df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05) df1 #改行名和列名 rownames(df1) <- c("r1",

1.8K20
点击加载更多

扫码

添加站长 进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

更多标签

活动推荐

    运营活动

    活动名称
    广告关闭

    腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    领取腾讯云代金券

    热门产品

    热门推荐

    更多推荐

    Copyright © 2013 - 2024 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有

    深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 深公网安备号 44030502008569

    腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号 | 京公网安备号11010802020287

    领券