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R绘图 | 表达矩阵画箱线图

变量可以分为很多种,如连续变量分类变量等。...当数据集中包含了分类变量连续变量时,我们想了解连续变量是怎样随着不同分类变量水平变化而变化,这时散点图中则会出现大量重叠,而箱式图则可以更清晰展示这类数据。...箱式图用于多组数据平均水平和变异程度直观分析比较。每组数据均可呈现其最小值、最大值、平均水平,最小值、最大值形成间距都可以反映数据变异程度。 主要函数geom_boxplot()。...本期我们以表达矩阵例来做箱式图。 1 原始数据 常规表达矩阵每一一个基因,每一列一个样本,如果拿到数据不符合上述规则,首先需要对数据进行调整。...如果每一一个样本,每一列一个基因则需要使用t()进行转置。

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SPSS用KMEANS(K均值)、两阶段类、RFM模型在P2P网络金融研究借款人、出款人行为数据规律|附代码数据

聚类分析应用实现 本文使用SPSS对923位有效借款人数据进行聚类分析。其中,选择信用等级作为分类变量,由于样本数据既有连续变量也有分类变量,所以,本文使用两阶段类。...,也可以验证“帕雷托法则”——公司80%收入来自20%顾客,通过消费金额可以看出哪些是重点客户,公司营业额贡献最大。...本文以K-Means类法工具,以加权RFM度量值,P2P网络借贷平台中出借人进行分类,基本思路: 1)将RFM中三指标准化,在加权之前需要对数据进行标准化处理。...最大值与最小值,MM、MN分表出借人M最大值与最小值。...RFM模型中,出借人客户分类是通过每个客户类别RFM平均值与总RFM平均值相比较来决定,而单个指标的比较只能有2种情况:大于(等于)或小于平均值,因此可能有2×2×2=8种类别,所以,本文将个数定为

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当今最火10大统计算法,你用过几个?

分类 分类是一种数据挖掘技术,数据分配类别以帮助进行更准确预测和分析。分类是一种高效分析大型数据集方法。...线性判别分析(LDA):每个观察结果计算“判别值”来对它所处响应变量类进行分类。这些分值可以通过找到自变量线性连接来获得。...该算法分为两个阶段:(1)拟合包含 k 个预测因子所有模型,其中 k 模型最大长度;(2)使用交叉验证预测损失选择单个模型。...和 PCR 类似,PLS 也是一种降维方法,它首先提取一个新较小特征集合(原始特征线性组合),然后通过最小二乘法将原来模型拟合为一个新具有 M 个特征线性模型。 7....而支持向量机是保留最大间隔分离超平面,因此本质上,它是一个约束最优化问题,其中支持向量机间隔在约束下被最大化,从而完美地对数据进行分类(硬间隔分类器)。

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当今最火10大统计算法,你用过几个?

分类 分类是一种数据挖掘技术,数据分配类别以帮助进行更准确预测和分析。分类是一种高效分析大型数据集方法。...线性判别分析(LDA):每个观察结果计算“判别值”来对它所处响应变量类进行分类。这些分值可以通过找到自变量线性连接来获得。...该算法分为两个阶段:(1)拟合包含 k 个预测因子所有模型,其中 k 模型最大长度;(2)使用交叉验证预测损失选择单个模型。...和 PCR 类似,PLS 也是一种降维方法,它首先提取一个新较小特征集合(原始特征线性组合),然后通过最小二乘法将原来模型拟合为一个新具有 M 个特征线性模型。 7....而支持向量机是保留最大间隔分离超平面,因此本质上,它是一个约束最优化问题,其中支持向量机间隔在约束下被最大化,从而完美地对数据进行分类(硬间隔分类器)。

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分类问题数据挖掘之分类模型

其中系数ci确定原则是使两组间区别最大,而使每个组内部离差最小。...样本类针对观测样本进行分类,而变量类则是试图找出彼此独立且有代表性变量,而又不丢失大部分信息。变量类是一种降维方法。...适用范围:属于智能类方法,用于解决海量数据或者具有复杂类别结构聚类分析问题。可以同时处理离散和连续变量,自动选择类数,可以处理超大样本量数据。...采用BPN法过程中需要选择几个参数 ①学习率和惯性因子 BP算法本质上是优化计算中梯度下降法,利用误差对于权、阀值一阶导数信息来指导下一步权值调整方向,以求最终得到误差最小。...在网络参数中,学习率和惯性因子是很重要,它们取值直接影响到网络性能,主要是收敛速度。提高学习速度,应采用大。但太大却可能导致在稳定点附近振荡,乃至不收敛。

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测试数据科学家类技术40个问题(能力测验和答案)(上)

然后,从根本上来说,对同一集群用户进行相似的推荐。 在某些情况下,电影推荐系统也可以归分类问题,将最适当某类电影分配给特定用户组用户。...K均值类算法 层次类算法 期望-最大类算法 多样类算法 选项: 1 2 3 2 4 1 3 1 2 4 以上都是 答案:D 在上面四个选项中,只有K均值类和期望-最大类算法有在局部最小值出收敛缺点...将集群id设置输入要素,并将其作为序数变量。 将集群质心设置输入要素,并将其作为连续变量。 将集群大小设置输入要素,并将其作为连续变量。...选项: 1 1 2 1 4 3 2 4 以上都是 答案:F 将集群 id 设置序数变量和将集群质心设置连续变量,这两项可能不会为多维数据回归模型提供更多相关信息。...举个例子,根据头发长度将人们分成两组,将类 ID 存储叙述变量,将类质心存储连续变量,这样一来,多维数据回归模型将会得到有用信息。 Q13.

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数据科学家需要掌握十大统计技术详解

分类 分类是一种数据挖掘技术,数据分配类别以帮助进行更准确预测和分析。...分类是一种高效分析大型数据集方法,两种主要分类技术是:logistic 回归和判别分析(Discriminant Analysis)。 logistic 回归是适合在因变量二元类别的回归分析。...线性判别分析(LDA):每个观察结果计算「判别值」来对它所处响应变量类进行分类。这些分值可以通过找到自变量线性连接来获得。...该算法分为两个阶段:(1)拟合包含 k 个预测因子所有模型,其中 k 模型最大长度;(2)使用交叉验证预测损失选择单个模型。...和 PCR 类似,PLS 也是一种降维方法,它首先提取一个新较小特征集合(原始特征线性组合),然后通过最小二乘法将原来模型拟合为一个新具有 M 个特征线性模型。 7.

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入门 | 从线性回归到无监督学习,数据科学家需要掌握十大统计技术

分类 分类是一种数据挖掘技术,数据分配类别以帮助进行更准确预测和分析。...线性判别分析(LDA):每个观察结果计算「判别值」来对它所处响应变量类进行分类。这些分值可以通过找到自变量线性连接来获得。...该算法分为两个阶段:(1)拟合包含 k 个预测因子所有模型,其中 k 模型最大长度;(2)使用交叉验证预测损失选择单个模型。...和 PCR 类似,PLS 也是一种降维方法,它首先提取一个新较小特征集合(原始特征线性组合),然后通过最小二乘法将原来模型拟合为一个新具有 M 个特征线性模型。 7....k 均值类:根据数据到集群中心距离将其分成 k 个不同集群。 层次类:通过数据层级表示而构建不同集群。 ? 本文机器之心编译,转载请联系本公众号获得授权。

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14个Seaborn数据可视化图

图6:“车费”和“性别”条形图 我们可以推断出女性平均票价比男性高。 b.统计图 它计算分类变量出现次数。 这是单变量分析一个例子。...图7:是否幸存和' P-class '计数图。 c.箱型图 这是一个总结图。它给出了一个连续变量最大值、最小值、平均值、第一个四分位数和第三个四分位数信息。同时,它让我们掌握了离群值信息。...我们可以对一个连续变量进行绘图,也可以根据一个连续变量分析不同分类变量。...图9:“年龄”和“性别”之间violin图 高级绘制方法 a.strip图 这是一个连续变量分类变量之间图。 它以散点图为主,但补充使用分类变量分类编码。...类图使用层次类来形成不同集群。 网格 网格图为我们提供了对可视化更多控制,并通过一代码绘制各种各样图形。

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compareGroups包,超级超级强大临床基线特征表绘制包

从上面我们可以看到,数据集中分类变量都显示因子,并且都添加了标签。...在使用compareGroups包前需要注意下: 首先需要知道数据集中哪些变量分类变量,将其转换为因子,并注意是不是有序分类变量; 给分类变量添加标签属性,默认情况下输出基线特征表会包含变量标签。...选择研究人群 4.1 选择分组变量 在上面我们简单统计描述了下总样本人群基线特征,下面可以添加分组变量分析看看。 数据集中group分类变量,表示不同饮食方式,分为三组。...descrTable(group ~ age + sex + smoke + waist + hormo, # 左边分组变量,右边基线表变量 data = predimed...method中数字解释:1表示指定连续变量正态分布;2表示指定连续变量非正态分布;3表示将连续变量指定为分类变量;NA表示变量自动执行Shapiro-Wilks检验来确定是正态分布还是非正态分布。

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SPSS(十五)spss之聚类分析(图文+数据集)

(距离最近)两类合并为一类 再从这n-1类中找到最接近两类加以合并 依此类推,直到所有的变量/观测被合为一类 使用者再根据具体问题和类结果来决定应当分为几类 特点 一旦记录/变量被划定类别,其分类结果就不会再进行更改...可以对变量或记录进行变量可以为连续或分类变量变量虽然可以为连续型或者分类型,但是不能混用,要不就是全分类这样使用,要不就全连续变量类) 提供距离测量方法非常丰富 运算速度较慢 案例:体操裁判打分倾向类...树状图,233.297换算成下面的25 发现意大利和东方集团(中国、俄罗斯、罗马尼亚)类有一些问题 变量类一般默认距离相关性(默认是平方欧氏距离) 得到结果好很多 这个例子也可以使用因子分析解决...,还有智能分析类方法 两步类算法(TwoStep Cluster) 特点: 处理对象:分类变量连续变量 自动决定最佳分类数 快速处理大数据集 前提假设: 变量间彼此独立 分类变量服从多项分布,...设置其最大类数 类需要注意地方 距离测量方法 使用默认值即可 变量选择 无关变量有时会引起严重错分 应当只引入在不同类间有显著差别的变量 尽量只使用相同类型变量进行分析(使用连续变量,将分类变量用于结果解释

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R语言k-means类、层次类、主成分(PCA)降维及可视化分析鸢尾花iris数据集|附代码数据

画一个图来显示情况 (b)部分:层次类 使用全连接法对观察值进行类。 使用平均和单连接对观测值进行类。 绘制上述类方法树状图。...向下滑动查看结果▼ 使用k-means类法将数据集聚成2组 使用足够大nstart,更容易得到对应最小RSS值模型。...数据分享|R语言用主成分PCA、 逻辑回归、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化 R语言逻辑回归logistic模型分析泰坦尼克titanic数据集预测生还情况R语言是否对二分连续变量执行逻辑回归...逻辑回归(LASSO,岭回归)高维变量选择分类模型案例 R语言有RStan多维验证性因子分析(CFA) 主成分分析(PCA)原理及R语言实现及分析实例 R语言无监督学习:PCA主成分分析可视化 R语言使用...)高维变量选择分类模型案例 R语言用标准最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分

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R语言笔记完整版

=TRUE,ylab='')——Hmisc包分位箱图 earth.count(na.omit(x),number=4,overlap=1/5)——连续变量x离散化,把x转化为因子类型;...是个数或者是初始类中心,iter.max最大迭代次数(默认为10),nstart是随机集合个数(当centers个数时),algorithm动态类算法,例如:km<-kmeans...,一般用于(目标变量分类型)分类分析,也可以把linout设为TRUE再添加一个阶跃函数转为逻辑型输出。...(CART)算法(输入、输出分类连续变量) rpart()——拟合树模型,参数xval设置k折交叉验证 prune()——剪枝 party包:条件推理决策树(...CHAID)算法(输入、输出分类连续变量) ctree() 随机森林 randomForest包:分类与回归树随机森林 randomForest

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R语言主成分PCA、因子分析、类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据

原始变量是可观测显在变量,而假想变量是不可观测潜在变量,称为因子。设p个变量,则因子分析数学模型可表示: 称 公共因子,是不可观测变量,他们系数称为因子载荷。...由于因子载荷阵是不唯一,所以应该对因子载荷阵进行旋转。目的是使因子载荷阵结构简化,使载荷矩阵每列或元素平方值向0和1两极分化。有三种主要正交旋转法。四次方最大法、方差最大法和等量最大法。...聚类分析内容非常丰富,有系统类法、有序样品类法、动态类法、模糊类法、图论类法、类预报法等;最常用最成功聚类分析系统类法,系统类法基本思想为先将n个样品各自看成一类,然后规定样品之间...系统类方法:1、最短距离法;2、最长距离法;3、中间距离法;4、重心法;5、类平均法;6、离差平方和法(Ward法)。 ...)高维变量选择分类模型案例 R语言用标准最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分

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R语言主成分PCA、因子分析、类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据

原始变量是可观测显在变量,而假想变量是不可观测潜在变量,称为因子。设p个变量,则因子分析数学模型可表示: 称 公共因子,是不可观测变量,他们系数称为因子载荷。...由于因子载荷阵是不唯一,所以应该对因子载荷阵进行旋转。目的是使因子载荷阵结构简化,使载荷矩阵每列或元素平方值向0和1两极分化。有三种主要正交旋转法。四次方最大法、方差最大法和等量最大法。...聚类分析内容非常丰富,有系统类法、有序样品类法、动态类法、模糊类法、图论类法、类预报法等;最常用最成功聚类分析系统类法,系统类法基本思想为先将n个样品各自看成一类,然后规定样品之间...系统类方法:1、最短距离法;2、最长距离法;3、中间距离法;4、重心法;5、类平均法;6、离差平方和法(Ward法)。 ...)高维变量选择分类模型案例 R语言用标准最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分

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R语言主成分PCA、因子分析、类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据

原始变量是可观测显在变量,而假想变量是不可观测潜在变量,称为因子。设p个变量,则因子分析数学模型可表示: 称 公共因子,是不可观测变量,他们系数称为因子载荷。...由于因子载荷阵是不唯一,所以应该对因子载荷阵进行旋转。目的是使因子载荷阵结构简化,使载荷矩阵每列或元素平方值向0和1两极分化。有三种主要正交旋转法。四次方最大法、方差最大法和等量最大法。...聚类分析内容非常丰富,有系统类法、有序样品类法、动态类法、模糊类法、图论类法、类预报法等;最常用最成功聚类分析系统类法,系统类法基本思想为先将n个样品各自看成一类,然后规定样品之间...系统类方法:1、最短距离法;2、最长距离法;3、中间距离法;4、重心法;5、类平均法;6、离差平方和法(Ward法)。 ...)高维变量选择分类模型案例 R语言用标准最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分

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R语言主成分PCA、因子分析、类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据

原始变量是可观测显在变量,而假想变量是不可观测潜在变量,称为因子。设p个变量,则因子分析数学模型可表示:称为公共因子,是不可观测变量,他们系数称为因子载荷。...由于因子载荷阵是不唯一,所以应该对因子载荷阵进行旋转。目的是使因子载荷阵结构简化,使载荷矩阵每列或元素平方值向0和1两极分化。有三种主要正交旋转法。四次方最大法、方差最大法和等量最大法。...为此采用方差最大正交旋转方式,使各变量在某个因子上产生较高载荷,而其余因子上载荷较小,从而得到旋转后因子载荷矩阵,如下表所示:由表和旋转后因子图可以看出,通过旋转后公共因子解释原始数据能力提高了...聚类分析内容非常丰富,有系统类法、有序样品类法、动态类法、模糊类法、图论类法、类预报法等;最常用最成功聚类分析系统类法,系统类法基本思想为先将n个样品各自看成一类,然后规定样品之间...系统类方法:1、最短距离法;2、最长距离法;3、中间距离法;4、重心法;5、类平均法;6、离差平方和法(Ward法)。

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手把手教你绘制临床基线特征表

从上面我们可以看到,数据集中分类变量都显示因子,并且都添加了标签。...在使用compareGroups包前需要注意下: 需要知道数据集中哪些变量分类变量,将其编码因子,并注意是不是有序分类变量; 给分类变量添加标签属性,默认情况下输出基线特征表会包含变量标签。...选择研究人群 4.1 选择分组变量 在上面我们简单统计描述了下总样本人群基线特征,下面可以添加分组变量分析看看。 group分类变量,也是基线表y变量,表示不同饮食方式。...descrTable(group ~ age + sex + smoke + waist + hormo, # 左边分组变量,右边基线表变量 data = predimed...如果要指定某一连续变量非正态分布变量,比如说指定waist非正态分布变量,则: descrTable(group ~ age + smoke + waist + hormo,

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数学建模及其基础知识详解(化学常考知识点)

3.1 、TOPSIS评价法,优化可用熵权法 3.2 、主次分析法和因子分析法 主成分分析法通过克服相关性、重叠性,用较少变量来代替原来较多变量,而这种代替可以反映原来多个变量大部分信息,这实际上是一种...因子分析法用少数几个假想变量来表示其基本数据结构。这几个假想变量能够反映原来众多变量主要信息。原始变量是可观测显在变量,而假想变量是不可观测潜在变量,称为因子。...最佳平方、最佳一致等) 三、假设检验(概率论与数理统计方法) 1、相关系数 1.1、皮尔逊相关系数 皮尔逊相关系数适用于呈正态分布连续变量。...参考:【机器学习】逻辑回归) 2、线性判别分析(LDA或称Fisher判别法)和多分类问题(运用“拆分”策略,通过多个二分类学习器来解决多分类问题,即将多分类问题拆解多个二分类问题,训练出多个二分类学习器...算法,又称均值漂移算法 4、EM算法 高斯混合模型+类期望最大化(EM)优化算法 5、系统(层次)类算法 八、时间序列分析 1、指数平滑方法 指数平滑法是以时间序揭示其历史资料变化规律,克服了移动平均预测法没有充分利用时间序列全部数据信息和对参与运算

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测试数据科学家类技术40个问题(附答案和分析)

将集群id设置输入要素,并将其作为序数变量。 将集群质心设置输入要素,并将其作为连续变量。 将集群大小设置输入要素,并将其作为连续变量。...选项: 1 1 2 1 4 3 2 4 以上都是 答案:F 将集群 id 设置序数变量和将集群质心设置连续变量,这两项可能不会为多维数据回归模型提供更多相关信息。...举个例子,根据头发长度将人们分成两组,将类 ID 存储叙述变量,将类质心存储连续变量,这样一来,多维数据回归模型将会得到有用信息。 Q13....答案:C 对于层次平均值,两个簇接近度指的是不同集群中每一对点对近似值平均值。这是最大值和最小值方法之间中间方法,下面的等式可以表示: 我们来计算一下某些簇之间距离。...在6%样本数据集中,使用 Ward 方法产生结果和使用最大值、最小值、组平均类结果会有所不同。 Q23. 根据下图,簇数量最佳选择是?

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