Bookdown 是个素颜版的 LaTeX，满足了 99% 的需求，而使用难度大概只有 LaTeX 的 1%，性价比极高。...而 RMarkdown 是建立在 Markdown 基础之上的一种语言，旨在方便将文本和代码混合在同一个文件中。 用途:Markdown 主要用于编写格式化文本，如网页、文章、文档等。...而 RMarkdown 则专门设计用于数据分析与报告，允许在同一个文件中交织代码 (通常是 R 代码) 和文字说明。 代码执行:Markdown 无法直接执行代码，只能将代码块展示为格式化文本。...而 RMarkdown 可以执行嵌入的代码块，将结果动态渲染到文档中。这对于分析报告和可重复研究非常有用。 输出格式:Markdown 通常会被渲染为 HTML、PDF 等格式。...而 RMarkdown 主要由 R 生态圈中的工具支持，如 RStudio IDE。
默认为left,可以为right或者center fig.cap ：设置图片的标题 fig.subcap：设置图片的副标题 out.width和out.height选项指定在输出中实际显示的宽和高，如果使用如...如 pander::pander(lmr) ? 但是，经过试验发现， 表中中有中文时pander包会出错。...第五章：总结一些常用技巧 关于RMarkdown使用时，小编日常会使用的一些有用技巧，当然我也是通过学习谢大大的Rmarkdown-cookbook[17]以及日常使用需求上网搜的解决方案，在此分享给大家...在这些情况下，我们可以通过以竖线（|）开头的线来使用线块。换行符和所有前导空格将保留在输出中。...外部数据你可以不用markdown的形式输入，可以在R代码块使用 knitr::include_graphics() 具体可以见：和我的b站视频。 5.8.代码块的行号?
这里所说的解决方案不仅是指R语言里面有诸多的图形语法系统（比如base系统、grid系统、lattic系统等），更重要的是它拥有（目前比较成熟的）系统级输出方案，你可以理解为如何在项目中从一而终的组织你的分析内容...这对于既想在数据可视化上追求更优质体验但是又不具备前端开发能力的数据分析或者数据科学从业者而言绝对是一个福音。（当然如果你是计算机领域出身的数据人，当我没说）。...第二套框架便是使用rmarkdown+flexdashboard+可视化组间（各种图形语法以及表格、文本信息等），rmarkdown是基于通用markdwon语法深度扩展的R语言markdown实现，在保留通用标记语法的基础上扩展了相当多的应用场景...renderPlot输出的shiny图形组件，可以直接dashboard的控件布局，直接输出的R内置图形可以支持自定义单个图形的长款尺寸。...Text Annotations 文本块即不做任何代码修饰正文，随便写就好。
image-20200923214945182 代码块： ? image-20200923215012642 数学公式（LaTex语法）： ?...RMarkdown 小抄[8]，打印使用，镜像：https://www.jianguoyun.com/p/Da0QaqwQ6uuVCBjNtr4D。...另外有时候文章代码需要格式化，推荐下面两个 R 包 formatR[13] styler[14] 注意，在使用 RMarkdown 时，使用 RStudio 提供的 knit 按钮是非必须的，我们可以直接通过...R 命令执行这一渲染（格式转换）过程，如 rmarkdown -> html： rmarkdown::render("week19/example.Rmd", output_format = "html_document...") 如果是使用 bookdown 写书，则是： bookdown::render_book("index.Rmd") Reference [1] Typora: https://typora.io
Rmarkdown的一个重要特点就是可以在普通Markdown语法之上内嵌R等语言代码，并可以格式化输出和展示代码的结果，如展示图表等。...本文主要是展示如何使用Rmarkdown渲染pdf版中文报告（需要对Rmarkdown有一定了解）。...似乎是谢益辉(https://yihui.org/)的rticles包出现了bug，所以更确切的说，本文是展示如何在Rstudio中使用rticles包的CTex模板完成中文pdf报告的渲染。...中文pdf渲染 在Rstudio中，File -> New File -> R Markdown，打开Rmarkdown新建对话框。使用从模板新建，创建CTex模板文件。...RMarkdown渲染成pdf是先渲染成LaTeX，然后再转成pdf的，所以上面的准备工具中也可以看到需要安装一种LaTeX编译环境，此处是使用益辉大佬的tinytex包自动安装的当前系统可用的tinytex
日期 这里先提一下Rmd 的行内代码特性，行内代码的结果插入到一个段落中间， 代码以r`开头，以```结尾， 如r sin(pi/2)``在结果中会显示为1。...用Markdown来写作[2] 先前提到过，Rmd 的行内代码特性，行内代码的结果插入到一个段落中间， 代码以r`开头，以```结尾， 如r sin(pi/2)``在结果中会显示为1。...image.png 3.3 代码块部分 代码块部分使用{r} chunk code 的形式： library(lubridate) now() name 用来定义该段code chunk 的名称。...关于输出的几个选项 另外，根据R 代码的几个特征： 是否运行 是否显示代码 是否显示输出结果 是否显示输出的图像结果 是否提示warning, message 或error 比如加载相关包的代码块，我们就可以使用...从PDF 转换为其他格式 可以使用adobe acrobat 软件，除了字体之外，还可以使用： 参考资料 [1]https://www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/docs
传统上，大多数生物学家会在R中执行阶段2和3，然后启动Word或Powerpoint并复制粘贴阶段4的所有内容。...并且由于使用 纯文本，因此文件很小，并且可以在各种设备上轻松编辑。 作为科学家，我们不仅撰写论文，而且还撰写笔记，代码，电子邮件，提醒，待办事项列表，博客文章等。...RStudio实现了一种称为“ RMarkdown”（或RMarkdown）的东西。此外，它包括“代码块”，这些代码块将由R运行。...knitr 报告 该 knitr 软件包的编写是在单个文档中结合了RMarkdown和R代码的元素 。从一个例子开始。...它还可以在安装LaTeX的系统上产生PDF输出。”” 首先，您需要下载并 安装pandoc。安装后，您便可以使用pnadoc knitr软件包随附的 功能将生成的md文件转换为所需的任何格式。
并列方式展示演示文稿 使用方法：将以下代码块添加到幻灯片R Markdown文件中，之后，对该rmd文件进行重新渲染。...你可以在放映的幻灯片上直接书写内容，实时更新。主要是使用.can-edit [...]实现。...你也可以使用橡皮擦来删除线条或单击“清除（trash）”按钮清除当前幻灯片上的所有涂鸦。 注意，当你更改幻灯片时，图纸将保持在每张幻灯片上。在绘图模式下不能更改幻灯片。...面板 要定制面板的外观，可以使用直接在幻灯片的R块中调用style_panelset_tabs()。...学会了前面这些使用的技巧，我相信你的写轮眼幻灯片b格已不同往日，敬请的玩吧！ 小编其实还有其他需求：如何在写轮眼中加入video？如何加入背景音乐？暂时还没有去搜索方法，也不知道有没有。
前两期内容见：R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（中）；R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（上） 第 3 章 Bookdown 中的章节标题 我们在第3章讲述章节标题的设置、标签与引用. 3.1...第 4 章 Bookdown中的公式与定理 这是第 4 章的内容, 讲述浮动对象定理与公式的标签与引用. 4.1 公式标签的设定 Rmarkdown中公式除了无标号的公式(用一对$$实现)，可以使用LaTeX...第 5 章 Bookdown中的图形 5.1 由R生成单个图形示例 这是第5章的内容， 讲述浮动对象图形的标签与引用....R代码块的标签引用, 并带前缀fig:, 例如 图\@ref(fig:fig4-2)和图\@ref(fig:fig4-3)为两个图的并置与堆叠....Rmarkdown 视频新增两节视频（写轮眼幻灯片制作）需要视频内的文档，可在公众号回复【rmarkdown】
Rstudio其他快捷键可见Rstudio常用快捷键以及窗口操作有用技巧，Rstudio界面介绍可见：Rstudio界面介绍（上），Rstudio界面介绍（下）。...默认为left,可以为right或者center fig.cap ：设置图片的标题 fig.subcap：设置图片的副标题 out.width和out.height选项指定在输出中实际显示的宽和高，如果使用如...2.插入外部图形文件 如果一个图不是由一个R代码块生成的，你可以用两种方式包含它: 方法一 使用Markdown语法!...方式三 在代码块中使用knitr函数knitr::include_graphics()。图片尺寸更改与插入R代码生成的图形的情况相同。...如 pander::pander(lmr) ? 但是，经过试验发现， 表中中有中文时pander包会出错。
I 代码 eval 是否运行代码块，有些代码块是不运行的，仅仅是为了展示使用。 RMarkdown的代码选项是接受R变量的，所以可以根据特定条件去控制一个代码块是否执行。...下面的RMarkdown代表根据isShow的结果是否大于0来决定是否执行第二个代码块。...asis是非常有用的选项，可以使用代码模拟Markdown语法，比如如下的代码可以生成三级标题，它等同于在RMarkdown中书写### 测试三级标记可以通过代码产生 `。...include 如果为FALSE，会隐藏本代码块和代码块输出，但是会执行代码内容，可用于做初始化，比如在RMarkdown的开始位置： ```{r setup, include = FALSE} # 导入工具包...注意RMarkdown中图片的输出是不需要使用pdf或者ggsave等方法进行保存，只需要将图片plot或者print即可。
以下是R Markdown的一些主要特点和用途： 可嵌入R代码：在R Markdown文档中，你可以直接嵌入R代码块，并使用R语言进行数据处理、分析和可视化。...你可以使用Markdown或HTML标记语言来格式化文本和添加样式。 动态生成结果：R Markdown可以自动执行R代码块，并将结果嵌入到文档中。...可交互性和可重复性：R Markdown文档可以包含交互式元素，如Shiny应用程序、可交互的图表和动态可视化。...引自chatGPT的解释，BioinfoArk提供的中国区chatGPT Rmarkdown使用 新建：打开Rstudio，在New File里面选择RMarkdown 设置相应的开头部分：输入标题、...名字以及勾选需要的选项 使用方法：可以按照文件分的区域，按照需要的格式整理注释信息、代码块或者导入图片等。
它通过记录BPF数据路径(datapath)的钩子来实现Cilium数据路径，那么Cilium数据路径是如何与容器编排层继承，以及如何在各层(如BPF数据路径和Cilium代理)之间更新对象的？...该钩子在协议栈的L3层之前运行，但可以访问与报文相关的大多数元数据，适用于本地节点的处理，如配置L3/L4 endpoint策略以及限制达到endpoints的流量。...服务块可以使用TC ingress钩子在任何接口上实现一个独立的负载均衡，或集成到endpoint策略对象中。...下面将展示连接单个节点上的endpoint可能存在的数据流(进入一个endpoint以及endpoint到网络设备)。...与上面类似，通过启用socket layer Enforcement并使用L7代理可以避免在TCP通信的endpoint和L7策略之间运行endpoint策略块。L3加密块可以在启用时加密报文。 ?
针对代码伴随，早期对这类图书有二个解决方案： Sweave/knitr + R 本质上它是在 TEXTEX 嵌入R代码块，并由R在后台运行后将结果也嵌入到 TEXTEX 中，再由 TEXTEX 的编译引擎生成...或由pandoc由md转化为html, 其中的数学公式由Mathjax完成渲染. 1.3.3 Rmarkdown向Bookdown过渡 在科技高度发达的互联系时代，读者使用的媒介基本有三类：较为专业的电脑...Bookdown注重不同类型读者的媒体使用的差异，并很好地实现统一编写与差异化输出。...Rmarkdown 视频新增两节视频（写轮眼幻灯片制作）需要视频内的文档，可在公众号回复【rmarkdown】 R沟通｜Rmarkdown教程（4） R沟通｜Rmarkdown教程（3） R沟通...｜Rmarkdown教程（2） R沟通｜Rmarkdown教程（1）
简介 上一期我们讲解了如何使用谢益辉写的xaringan包[1]制作幻灯片，推文在这：R沟通｜用xaringan包制作幻灯片。但是最后留了一个小尾巴，如果你不喜欢最原始版本的主题的话。...例子：YAML 然后，在程序块中加载xaringanthemer并设置主题[4]。...建立在showtext[5]包的基础上，旨在与Google字体无缝协作。 还提供了颜色和填充比例，用于根据幻灯片中使用的原色匹配顺序的颜色比例。有关更多详细信息，请参见？...在Rmarkdown中你也可以加入表情哦！不妨试试😎 如果你对Rmarkdown制作文本沟通系列感兴趣，可以看前几次推文。...xaringanthemer/articles/xaringanthemer.html#themes [5] showtext: https://github.com/yixuan/showtext [6] 如何在写轮眼中加入元素
我列出了Genesis所有内置的“钩子”，把它们比喻成乐高里连接各个积木块的小凸点。 如果把钩子（hook）看作是积木上的小凸点，那么动作(action)就是积木块的操作指南。...好的，让我们看看如何在代码中使用。...第二部分告诉我们要挂载到哪个钩子上，在这里钩子的名字是“hook”。如果这个钩子不存在，那么要添加的动作(action)就不会执行。...你可以将多个动作(action)“勾”到同一个钩子上，并使用优先级来强行安排执行顺序。...通常是1，因为动作(action)实际上并没有传递任何可以使用的东西;但是，不过有时这可能非常有用。
在本指南中，我们将学习如何在运行Ubuntu 14.04的腾讯CVM上设置开源Shiny Server。...安装在CVM上的最新版本的R（如何在Ubuntu 14.04上设置R） 具有sudo权限的非root用户。 本教程中的所有命令都应以非root用户身份运行。...我们将以一种方式安装shiny，使其可供服务器上的所有用户使用。...现在使用GDebi安装下载的文件。 sudo gdebi shiny-server.deb 现在应该在端口3838上安装并运行Shiny Server 。...让我们安装rmarkdown包来修复它。
R语言是主要在学术界用的编程语言，写作是其内涵之义，于是有了 RMarkdown。...基于RMarkdown语法yihui进一步扩张了RMarkdown的应用，于是有了bookdown及其plus，以及blogdown。字面意思，前者是用来写书的后者是用来写博客的。...bookdown把版式这一块结合tinytex做到了尽可能的极致，让写作者可以安心喻内容，而不必花太多心思在版式上。可以说解决了书籍的排版问题。...现在，bookdown可以让我们省去排版的烦恼，直接写起来，而且里面还有大量的版式可以使用。 今天主要是来初探一番bookdown，写书是思想的火花在碰撞，有了想法，版式不是问题啦。.../RStudio/Rmarkdown/Rmarkdown/.Rproj.user" [
特别是，我们无法使用上下文管理器将单个操作包装在向后传递中。 理论上，可以通过对跟踪视图的深入分析以及将后向传递中的每个片段与其前向传递中的相应操作进行匹配来识别有问题的模型操作。...使用 PyTorch Backward Hooks 进行性能分析 尽管 PyTorch 不允许您包装单独的向后传递操作，但它确实允许您使用其钩子支持来添加和/或附加自定义功能。...每个钩子都被编程为使用 torch.profiler.record_function 函数简单地将消息添加到捕获的分析跟踪中。...换句话说，通过将脚本配置为使用确定性算法，我们修改了 torch.gather 向后传递的默认行为。事实证明，正是这种变化导致需要同步事件。事实上，如果我们删除此配置，性能问题就会消失！...在这篇文章中，我们展示了如何在迭代过程中使用 PyTorch 向后钩子以及 torch.profiler.record_function 来识别向后传递中性能问题的根源。
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