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1.5w字的Rmarkdown入门教程汇总

这样的代码段如果有标签, 可以在后续代码段中被引用。 加选项include=FALSE, 则本代码段仅运行, 但是代码和结果都不写入到生成的文档中。...[图的标题](xxx.png){width=50%} 注意:图片文件放的位置(如果和rmd同一目录,则可以直接xxx.png;如果在其他位置记得加上相对路径)。 ?...可以用knitr包的kable函数来显示: knitr::kable(co) ? kable()函数的digits=选项可以控制小数点后数字位数, caption=选项可以指定表的标题内容。...编译后得到的结果,这是他模板原始的样子,如果想调整页面行间距,字体颜色等,请见下次推文(公众号:庄闪闪的R语言手册),我将会把这些小细节进行汇总。 ?...5.6.控制图片输出大小??? 这个我在文稿和教程中说的挺清楚了。

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    1.5w字的Rmarkdown入门教程汇总

    这样的代码段如果有标签, 可以在后续代码段中被引用。 加选项include=FALSE, 则本代码段仅运行, 但是代码和结果都不写入到生成的文档中。...[图的标题](xxx.png){width=50%} 注意:图片文件放的位置(如果和rmd同一目录,则可以直接xxx.png;如果在其他位置记得加上相对路径)。 ?...可以用knitr包的kable函数来显示: knitr::kable(co) ? kable()函数的digits=选项可以控制小数点后数字位数, caption=选项可以指定表的标题内容。...编译后得到的结果,这是他模板原始的样子,如果想调整页面行间距,字体颜色等,请见下次推文(公众号:庄闪闪的R语言手册),我将会把这些小细节进行汇总。 ?...5.6.控制图片输出大小??? 这个我在文稿和教程中说的挺清楚了。

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    71-R分享01-Rmd新手入门指南

    ★借助于R的knitr和rmarkdown扩展包的帮助, 可以在Markdown格式的源文件中插入R代码, 使得R代码的结果能够自动插入到最后生成的研究报告中。”...,如3 表示只会显示到 ### 对应的标题。...toc_float,其包括两个选项,collapsed 控制是否显示子标题;smooth_scroll 控制跳转动画,默认为T 分别表示不显示: --- title: "01-美化作图" author:...rmarkdown::render()命令编译有重要差别: 用Knit图标编译,Rmd文件中的程序会在一个崭新的会话中执行, 当前会话中已经定义的函数、变量、导入的扩展包不会影响到编译结果; 用rmarkdown...4.2 其他格式文件的转换 从HTML格式可以转换成PDF格式 打开浏览器进入选定的网页后,可以选择菜单“打印”, 选打印机为“另存为PDF”, 然后选“更多设置”, 将其中的“缩放”改为自定义, 比例改为

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    R沟通|Rmarkdown教程(4)

    rticles软件包提供了各种期刊和出版商的模板: JSS articles (Journal of Statistical Software) R Journal articles CTeX documents...(中文pdf,强烈推荐!)...CTeX Documents(中文版本) 下载完对应的包之后,找到对应模板打开即可。输出pdf是需要配置tex环境的哦!建议安装Tinytex,具体安装教程见前面。 ?...编译后得到的结果,这是他模板原始的样子,如果想调整页面行间距,字体颜色等,请见下次推文(公众号:庄闪闪的R语言手册),我将会把这些小细节进行汇总。 ?...接下来我对部分相对不错的模板进行展示,你可以直接复制我的头部文件到.rmd格式中,或者打开模板窗口进行选择(操作在下面)。

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    一篇极其容易上手的 LaTex 学习文档

    \end{document} 将文档保存在你希望的位置,然后在排版工具的下拉选框中选中 XeLaTeX 后,按下绿色的编译按钮。一会儿,如果没有意外,屏幕的右边就会出现编译之后结果。...你可以将导言区理解为是对整篇文档进行设置的区域——在导言区出现的控制序列,往往会影响整篇文档的格式。 通常在导言区设置页面大小、页眉页脚样式、章节标题样式等等。...这个控制序列能将在导言区中定义的标题、作者、日期按照预定的格式展现出来。 章节和段落 \documentclass[UTF8]{ctexart} \title{你好,world!}...\centering 用来使插图居中; \caption 命令设置插图标题,LaTeX 会自动给浮动体的标题加上编号。注意 \label 应该放在标题命令之后。...段间距 通过修改长度 \parskip 的值来调整段间距。

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    R沟通|Bookdown中文书稿写作手册(中)

    /github.com/rstudio/bookdown) 是继knitr和rmarkdown扩展包之后, 另一个增强markdown格式的扩展, 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表、文献自动编号和引用等适用于编写书籍的功能...在bookdown的管理下一本书的内容可以按章节分解成多个Rmd文件, 其中可以包含可执行的R代码, R代码生成的统计汇总结果、表格、图形可以自动插入到生成的内容中, 表格和图形可以是浮动排版的。...文件, 项目中每个.Rmd文件都作为一章,其第一行是以一个#号和空格开头的一级标题。...每一章可以有若干节与子节,分别用markdown的二级标题(二个#开始)和三级标题(三个#开始)编写。...bookdown的章、节、子节标题单独成一行,其后可以添加标签, 章节的标签是标题后加空格,然后是大括号内以#号开头的标签, 如 # 引言 {#intro} ## 关于bookdown {#bookdown

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    R tips:RMarkdown代码块的控制选项

    I 代码 eval 是否运行代码块,有些代码块是不运行的,仅仅是为了展示使用。 RMarkdown的代码选项是接受R变量的,所以可以根据特定条件去控制一个代码块是否执行。...asis是非常有用的选项,可以使用代码模拟Markdown语法,比如如下的代码可以生成三级标题,它等同于在RMarkdown中书写### 测试三级标记可以通过代码产生 `。...如果为FALSE,则不显示,改为显示到渲染console中。 message 和warning类似,绝大多数情况下也是不需要显示的。...error 错误发生时,是否继续执行code,如果为FALSE则不继续执行,一般情况下,出现error后是不能让代码继续执行的,error的出现需要仔细寻找代码的问题并修正。...fig.height,fig.width:设置图片的大小的地方。 注意RMarkdown中图片的输出是不需要使用pdf或者ggsave等方法进行保存,只需要将图片plot或者print即可。

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    R:如何使用RMarkdown渲染中文pdf报告

    Rmarkdown作为一种将R等编程语言和Markdown的简洁语法结合在一起的增强版Markdown语法,其在报告输出、数据分析、沟通交流中的易用性和便利性已得到了足够的体现。...Rmarkdown的一个重要特点就是可以在普通Markdown语法之上内嵌R等语言代码,并可以格式化输出和展示代码的结果,如展示图表等。...暂时也不确定是怎么回事,反正我去查看rticles包的github备份,里面的ctex也没有template.tex 由于RMarkdown的输出格式是在YAML头文件里面的output控制的,而相应的格式输出其实是调用相应的输出函数...而ctex的格式输出是由ctex_article函数控制的,而它的源码就是封装了pdf_document_format函数,添加了latex_engine信息,那么就可以考虑修改output头文件。...: ctexart信息就可以在RMarkdown中正常使用CTex了,保存修改后,点击Knit to PDF即可正常进行渲染了。

    4.4K10

    RMarkdown进阶操作

    同时在前面的一篇博客中我们介绍了使用RMarkdown去写Latex Beamer演示文档的方法,RMarkdown是由谢益辉等大神对Markdown、Latex和R语言等常用高级编程语言的结合,使得我们可以同时用这几种语言去构造一个...导入Latex宏包 在RMarkdown标题处,我们可以自己写一个普通的Latex文档mysty.tex如下: \usepackage{graphicx} \usepackage{animate} \usepackage...{subfigure} \lstset{ breaklines=true, basicstyle=\ttfamily } 然后在RMarkdown的标题处引入该tex文件: --- title...这两个参数表示切割图片的第一张的数字编号和最后一张的数字编号,加了loop参数之后会自动循环播放,同时我们还可以加上controls这个控件,用于控制动态图的进退等,非常的灵活方便。...RMarkdown不仅仅继承了Markdown语言的简洁便利,还允许我们仍然使用Latex中的一些高级操作,甚至我们可以在生成的Beamer演示文档PDF中去展示一些动态的效果图,这是通过PPT等工具去生成

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    Rmarkdown使用及转换为R文件

    Rmarkdown简介 想必熟悉小洁老师的学员们都有看过小洁老师发的如何做好你的R语言笔记,这也是马拉松课程的课前准备工作的一项——学习如何记录笔记。 那什么是Rmarkdown呢?...代码块可以包含任何有效的R代码,并且可以在文档中的不同位置重复使用。 多种输出格式:R Markdown支持多种输出格式,包括HTML、PDF、Word、Markdown等。...你可以根据需要选择适合的输出格式,并使用相应的R包和设置来生成最终的文档。 可嵌入文本和标记:除了R代码,你还可以在R Markdown文档中嵌入文本、标题、段落、列表、链接、图片等。...你可以使用Markdown或HTML标记语言来格式化文本和添加样式。 动态生成结果:R Markdown可以自动执行R代码块,并将结果嵌入到文档中。...引自chatGPT的解释,BioinfoArk提供的中国区chatGPT Rmarkdown使用 新建:打开Rstudio,在New File里面选择RMarkdown 设置相应的开头部分:输入标题、

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    如何使用命令行运行R语言的rmd rmarkdwon文件

    使用rarkdown的render函数, 进行Rmd文件的运行和解析, 参数outputfile是输出文件名称和格式, 这里的格式为html, 可以选择pdf或者word格式....结果中, 将Rmd文件中的markdwon语法进行了转化, 比如"###"变为了标题....">"变为了引用, Rmarkdown还有一个优势, 其能够将执行R代码, 然后将结果保存为markdown的格式, 其它标准markdown不具备这种能力....当然, jupyter也可以对python, R, Julia进行markdown的转化, 包括代码和图表结果, 掌握markdown是每个数据分析师应该具备的技能....A最先发送的是pdf格式, 在发送中将文件取消, 不一会儿B同事收到了一个后缀为md的文件. md是markdown格式的后缀, 需要特定的软件转换后查看. 桥段2: ?

    6.4K31

    R沟通|Bookdown中文书稿写作手册(上)

    章节标题是浮动的,最主要用于书签的生成; 公式是浮动的,这是数学、统计等理科书的特点,公式引用必不可少; 图形是浮动的,统计图形作为可视工具,在说明数据或展示分析结果时经常会引用相应的图形; 表格是浮动的...针对代码伴随,早期对这类图书有二个解决方案: Sweave/knitr + R 本质上它是在 TEXTEX 嵌入R代码块,并由R在后台运行后将结果也嵌入到 TEXTEX 中,再由 TEXTEX 的编译引擎生成...pdf。...前者以pdf类图书为主呈现给读者,同时可以完成标注等工作;后者以文字型的电子图书为主,消磨时间为主;而平板的使用者逐渐成为电子类图书的新势力,包括pdf和epub之类的电子书。...目前Bookdown可以生成三类图书: gitbook,可自由出版在git pages上 epub, 发表到大量的电子图书平台上 pdf, 正规的图书出版公司以电子或纸质形式出版 推荐: 可以保存以下照片

    2.3K21

    别人的电子书,你的电子书,都在bookdown

    bookdown是著名R包作者谢益辉开发的,支持采用Rmarkdown (R代码可以运行)或普通markdown编写文档,然后编译成HTML, WORD, PDF, Epub等格式。...还有很多基于Bookdown的教程,一时也想不起来,欢迎大家补充。我们前面转录组和R培训的教案也是用bookdown写作的,后续再调整下格式,出一批电子书和纸质书,有意向和需求的欢迎联系。...Rscript -e "bookdown::render_book('index.Rmd', 'bookdown::pdf_book')" 在前面的内容运转起来后,再看后面的内容。...另外当目录下同时存在name1.png和name1.pdf文件时,会自动选择在HTML展示name1.png文件,在PDF输出中引入name1.pdf格式的文件。...当图或表的标题太长时,也可以使用Text Reference引用一段话作为图和表的标题。 Here is normal text.

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    学术写作注意事项——格式问题

    近几年的文献需要追踪和引用,投稿期刊的文章需要引用多篇(3-4)近 2 年文献(个人观点,和 IF 有关)。 5. 图表问题 a. 图表标题后需要添加符号。...最好将图片放到新的文件夹中(例如:figure,然后使用上述(figure/xx.pdf)加载图片)。 d....图表最好放在文中的 top/bottom 位置,可以通过[tb]来修改,例如:\begin{figure}[tb] \end{figure}。 e. 小数点后保留位数同类型数据需要保持一致。...小编有话说 这些是目前小编能想到的一些小细节。如果读者有什么补充可文末留言,或者来我的 Github[3] 提出 issue。希望这个系列能够和读者们一起完善下去,为更多的科研新手造福。...教程(4) R沟通|Rmarkdown教程(3) R沟通|Rmarkdown教程(2) 写作

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    R沟通|用bookdown制作图书(1)

    介绍 R的bookdown扩展包是继knitr和rmarkdown扩展包之后, markdown格式的另一种扩展, 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表自动编号和引用、链接, 文献引用和链接等适用于编写书籍的功能...在bookdown的管理下:一本书的内容可以分解成多个Rmd文件, 其中可以有可执行的R代码, R代码生成的文字结果、表格、图形可以自动插入到生成的内容中, 表格和图形可以是浮动排版的。...元数据部分进行有关设置, 如标题、作者、日期等。...每个.Rmd文件第一行, 应该是以一个井号和空格开头的一级标题, 后面再加空格然后有大括号内以井号开头的章标签, 如 # 随机数 {#rng} 0101-usage.rmd给出了中文图书Bookdown...建议安装谢益辉的TinyTeX[4]。 然后在项目文件夹中找到对应的pdf文件,打开就是你自己制作好的书籍了!下面是我日记本截图: ? pdf格式 ?

    1.5K40

    一份其实很短的 LaTeX 入门文档

    \begin{document} 与 \documentclass{article} 之间的部分被称为导言区。导言区中的控制序列,通常会影响到整个输出文档。...\end{document} 导言区复杂了很多,但和之前的文档主要的区别只有一处:定义了标题、作者、日期。 在 document 环境中,除了原本的你好,world!...,还多了一个控制序列 maketitle。这个控制序列能将在导言区中定义的标题、作者、日期 按照预定的格式展现出来。 使用titling宏包可以修改上述默认格式。参考TeXdoc....\centering 用来使插图居中;\caption 命令设置插图标题,LaTeX 会自动给浮动体的标题加上编号。注意 \label 应该放在标题命令之后。...的值来调整段间距。

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    R沟通|Rmarkdown(5)一些常用技巧

    简介 关于RMarkdown使用时,小编日常会使用的一些有用技巧,当然我也是通过学习谢大大的Rmarkdown-cookbook[1]以及日常使用需求上网搜的解决方案,在此分享给大家。...但是,在某些情况下,例如在经文和地址中,我们可能希望保留缩进。在这些情况下,我们可以通过以竖线(|)开头的线来使用线块。换行符和所有前导空格将保留在输出中。...例如:如果想把目录和正文内容分开,可以在在正文前面加入这个代码 ? 这时输出的结果,目录一个界面,正文另起一页。 ? 5. 控制文本输出的宽度 有时从R代码输出的文本可能太宽。...如果输出文档具有固定的页面宽度(例如,PDF文档),则文本输出可能会超过页面的页边距。 R全局选项宽度可用于控制R函数输出的文本宽度,如果默认值太大,则可以尝试使用较小的值。...控制图 这个我在文稿和教程中说的挺清楚了。

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