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绘图资源rpubs推荐

rpubs这个网页其实不仅仅是绘图资源,同时包含了很多各行各业的统计示例,但是它是以创作者用户为单位组织内容,并没有行业分区的板块,也没有思维导图那样的层次结构供检索和学习。...不可否认的是里面的优秀资源确实不少,比如;https://rpubs.com/Mentors_Ubiqum/geom_col_1 一步步带你绘制各种各样条形图: ggplot: How to stack...其实中文领域,公众号才是最好的资源,类似的绘图细节有《老俊俊的生信笔记》: 环形热图进阶 ggplot 绘制环形堆叠条形图 精彩目录, 值得细读: 其实它的底层仍然是ggplot系列 但是如果你要从ggplot2...一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

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    绘图资源rpubs推荐

    rpubs这个网页其实不仅仅是绘图资源,同时包含了很多各行各业的统计示例,但是它是以创作者用户为单位组织内容,并没有行业分区的板块,也没有思维导图那样的层次结构供检索和学习。...不可否认的是里面的优秀资源确实不少,比如;https://rpubs.com/Mentors_Ubiqum/geom_col_1 一步步带你绘制各种各样条形图: ggplot: How to stack...其实中文领域,公众号才是最好的资源,类似的绘图细节有《老俊俊的生信笔记》: 环形热图进阶 ggplot 绘制环形堆叠条形图 精彩目录, 值得细读: 其实它的底层仍然是ggplot系列 但是如果你要从ggplot2...一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

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    R语言ggplot2画热图添加分组信息的颜色条

    之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现,下面的B图是折线图加柱形图,相对比较容易实现,上面的A图稍微有点复杂,我想到的办法是拼图,图A可以看成三个热图,然后加一个堆积柱形图,最后将四个图组合到一起...最初的想法是左侧的颜色条用堆积柱形图来实现,又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包的推文,发现他是用geom_tile()函数实现的,仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。...首先解决昨天的遗留问题:ggplot2画图添加文字内容的时候如何添加下划线 非常感谢下面这位的留言 文本添加下划线的小例子 df<-data.frame(A=1:10, B...首先是准备热图的数据 如何画这个热图昨天的推文已经介绍过了,点击下方蓝色字可以直达昨天的推文 R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子 接下来是准备分组颜色条的数据 下面是画这个颜色条...legend.title = element_blank())+ scale_fill_manual(values = c("green","blue","red")) 将分组颜色条和热图拼接到一起

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    R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

    今天公众号后台有人留言作图,示例图如下 ?...image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和热图的拼接,右侧的热图可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色,按照一定的数值来映射大小...基本的思路有了。今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes

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    如果伦敦地铁图是数据科学家画的……

    意识到这点,Beck设计了今日地铁图的初稿,以一种尽可能简单的方法将所有线路绘制成直线,清楚显示线路互相连接的位置。...首先,让我们将网络的边变成官方地铁图的配色,并且根据节点所处的线路给节点(即站点)上色。当节点属于多条线路时,我们可以选择ID号码最小的线路为该节点的颜色。...我们还需要定义与线路匹配的节点颜色,以及与伦敦地铁图相近的字体。...我用的是Gill Sans,虽然它是非官方字体,但是非常接近(Eric Gill实际上为设计了原始地铁图字体的Edward Johnson工作)。 此处是生成网络的代码。...: http://rpubs.com/keithmcnulty/tubemap 在绘制这张图时,我们完全不考虑地铁图的地理位置意义,将Beck的设计原则发挥到极致,并借助数据科学方法以最美观的方式将地铁图可视化

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    可能会用到的30个R语言包~第四期

    1 webshot 在 生信星球 公众号看到的推文 听说你的桑基图也无法保存?...详细介绍可以看链接 https://rpubs.com/maomaoworm/690424 6 GGally的ggpairs()函数 展示多变量两两之间相关系数,参考链接 https://rpubs.com...19 tastypie 绘制漂亮的饼图的R版 公众号 R语言统计与绘图 推文 tastypie包,绘制漂亮的饼图R包 ? image.png ?...不妨试试ezcox 很方便的做Cox回归分析模型和森林图 23 ggstream 公众号 DataCharm 看到的推文 河流图绘制技巧分享 之前有人在公众号留言问过鱼型图,但是自己也不知道,不过好像就是这个...()更改颜色的话是不能按照不同的数据集来修改的,这个时候可以用这个包中的函数 如下代码 library(ggnewscale) library(ggplot2) df1<-data.frame(A=1:

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    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    4.数据可视化与 `ggplot2` 处理大数据时,以图片的形式显示信息更有效。可视化应该有自己的整个过程(有很多要知道!)。...Hadley Wickham的RPubs(http://rpubs.com/hadley/ggplot2-layers)或RStudio 的cheetsheat(http://rpubs.com/hadley...尝试不同的东西,在图上同时显示细胞类型和基因型。为此,我们可以为列标题指定shape映射,不同形状表示不同的celltype。...图的直线达到的点是除异常值外的最小值和最大值。 使用四分位值(IQR)确定异常值,IQR定义为:Q3-Q1。低于Q1或高于Q3超过1.5 x IQR的任何值都被视为异常值,并表示为竖线上方或下方的点。...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中(而不是简单地在屏幕上显示)。第一种(也是最简单的)是直接从RStudio“Plots”面板导出,点击绘图面板上方的Export。

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    绘图资源sthda推荐

    昨天在《生信技能树》公众号分享了 绘图资源rpubs推荐 ,引起了大家的兴趣,读者纷纷留言表示希望可以多推荐类似的资源。...一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。...✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

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    绘图资源sthda推荐

    昨天在《生信技能树》公众号分享了 绘图资源rpubs推荐 ,引起了大家的兴趣,读者纷纷留言表示希望可以多推荐类似的资源。...一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。...✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

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    如何让你的海报在最短时间引起用户注意?

    海报如何脱颖而出 现如今各种线上线下宣传推广随处可见,海报宣传单满天飞,每个人都在用尽最大努力做最好的推广宣传。那么就海报设计而言,如何在最短的时间内引起消费者的注意,引起读者进一步阅读的兴趣?...二.颜色的运用 2.(1)从产品定位出发 一般产品都会其主题色,如教育一般为蓝色调,化妆品一般为粉色调...人们都知道绿灯行,红灯停,所以也就延伸为绿色代表正确,红色代表错误,利用人们内心根生蒂固的思维模式...在不同的情景下,利用颜色进行情感表达也不失为一个有效的方式。 ?...五.印刷的四个自检查法 印刷可能是很多人比较苦恼的一个问题,好多人只注重效果图而忽视了落地的效果,由于对印刷工艺,效果图的色值与实物的色值相去甚远。...5.(2)问题可能在显示器 液晶屏偏色现象普遍,导致印刷成品色差较大也是有可能的。 5.(3)问题可能在转换格式过程 文件格式的转换,会引起色差,如:ai转cdr后是会偏差的。

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    Google Earth Engine(GEE)——R 语言图像可视化(内含NDWI指数计算和掩膜镶嵌后的图像展示)

    调色板 要以彩色显示图像的单个波段,请使用palette由 CSS 样式颜色字符串列表表示的色带设置参数。(有关更多信息,请参阅此参考资料)。...另请注意,如果您将shown参数定义为FALSE,这会导致图层在添加到地图时不可见。始终可以使用地图左上角的图层管理器再次打开它。结果应该类似于图 2。...掩膜 您可以使用image$updateMask()根据蒙版图像中的像素不为零的位置设置单个像素的不透明度。遮罩中等于 0 的像素被排除在计算之外,并且不透明度设置为 0 以进行显示。...与其他 R 包的集成 MapaddLayer()创建一个带有以下额外属性的传单对象:标记、名称、不透明度、显示、最小值、最大值、调色板和图例。...{mapedit}:为传单交互式地图添加空间数据编辑功能(类似于代码编辑器几何工具)。

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    QIIME2-2019.10更新学习笔记

    4.改进了识别无效初始值时显示的错误消息-以前的错误消息非常不透明,现在它实际上告诉您错误是什么!...q2-sample-classifier 1.将热图可视化器添加到了classify-samples流程。 2.修正了混淆矩阵中导致ROC绘图在不分层、不平衡数据上失败的错误。...3.将cividis添加到可用的颜色图列表中。 4.增加了调整混淆矩阵热图颜色比例的能力。 5.对此插件中定义的转换器进行了一些更新,以使其能够与最新版本的Pandas一起使用。...7.修复了此插件产生的热图可视化中的一个错误,该错误导致某些单元格被修剪,看起来很奇怪! q2-feature-table 1.已将cividi添加到热图的可用颜色映射表列表中。...2.更新了热图,以同时接受样本元数据和特征元数据,从而可以沿每个轴标注样本/特征。 q2-longitudinal 1.将cividis添加到可用的颜色图列表中。

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    这样画热图,涉嫌操纵数据了吗

    很多朋友都有这样的疑问,为什么别人绘制出来的热图,差异那么明显,除了首先他们本身就先做了差异分析,挑选出来了有差异的基因,然后才热图可视化外,其实还有一个步骤,就是按照基因(行)对表达矩阵进行zscore...首先看原始表达矩阵热图 代码如下: # 2.热图 load(file='heatmap_input.Rdata') ## 2.1 数据预处理 t <- log2(cgexp+1) t <- na.omit...第一次zscore 可以看到,上下调的基因清晰可见,但是这个时候很多人不理解热图上面的层次聚类,会错误的以为tumor被normal隔离成为了两个分组。...这个时候,如果你使用我的热图代码,通常是会在zcore的时候,设置一个上限值,比如2或者1.6,代码如下: 然后限定zscore的范围 代码如下: ## 2.3 进行scale后设定最大最小值的情况...限定zscore的范围 很有意思,这个时候上下调基因仍然是清晰可见,而且很容易看出来高低表达量分组,而且不会出现上面热图的tumor被normal隔离成为了两个分组的假象!

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    算法科普:有趣的游程编码

    首先从一个简单的例子开始:编码一个在 5 * 5 方块上使用三种颜色绘制的图像。 图 1 根据方块不同的颜色匹配不同的字母。这里使用 Y 代表黄色,使用 G 代表绿色,使用 B 代表蓝色。...按照这种操作,图 2 的 25 个字符就能缩短为 20 个字符了。 动图 3 这样,如果我们知道每行有 5 个方块,原始图像就可以从代码中提取出来了。这种还原的操作也就是我们俗称的 解压。...图 4 观察图 4 的图像与对应的代码,可以发现:虽然使用 游程编码 使得总体的字符数减少,但对于那些不具备相同颜色的部分,在进行游程编码后,字符数反而会增加。...图 6 因此,根据要编码的数据,游程编码可能具有压缩效果,也可能不具有压缩效果。 所以,对一定数量连续的数据使用游程编码才是正确的使用时机。 再举个例子,考虑一下在单色传单上使用游程编码。...当然,这样显示是有一个要求的,那就是 代码的第一个数字必须是白色方块的连续数。只有使用了这个规则,才能通过代码还原出之前的图像。

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