今天是平平无奇的整合分析，是数据挖掘中经常用到的一部分~ 参考文献在这里⬇ A robust 6-mRNA signature for prognosis prediction of pancreatic...software.DEGs were defined with P 1 as the cut-off criteria： 作者是直接下载cel格式的原始数据...，然后用RMA函数获取表达矩阵，分别对三个数据集进行了差异分析，然后对差异分析取交集作了后续的分析。...我们也试试看吧—— # GSE15471, GSE28735 and GSE62452 rm(list = ls()) ##全局设置 ##下载的数据大小>131072字节，所以需要调整默认连接缓存，...，接下来就是常规的探针注释和差异分析了。
创建rails项目 以blog项目为例： rails new blog 只需几秒钟就会得到一个基本的rails项目结构： ?...各个目录的作用为： app：存放web应用的控制器、视图、模型、helpers等，开发主要集中在这里 bin*：各种脚本 config：路由、数据库等的配置文件 db：数据库的schema...和数据库的迁移文件 log：日志文件 package.json：npm包记录，使用yarn管理 public：静态文件 test：测试 使用 rails server 命令启动服务器即可在本地...的视图文件，将视图文件写入以下内容 hello, rails 此时，浏览器中打开 / 和 /hello/index/ 路径都将返回同样的内容 ?...文章的增加 使用以下生成数据库模型： rails generate model Article title:string content:text 使用以下迁移数据库： rails db:migrate
用于生成路径和URL地址的辅助方法 在创建资源路由时，会同时创建多个可以在控制器中使用的辅助方法，如上面的资源路由会创建以下方法： photos_path：返回值为 /photos new_photos_path...url_for 方法时传入一组对象，Rails会自动确定对应的路由： Rails能够识别各个实例...当然在使用 link_to 等辅助方法时，可以只指定对象，而不必完整调用 url_for 方法： <%= link_to.../%{name}') redirect 默认是301永久重定向，有些浏览器和代理服务器缓存这种类型的重定向，从而导致无法访问重定向前的网页，为了避免这种情况，我们可以使用 :status 选项修改响应状态...和 edit 动作上 限制创建的路由 Rails 默认会为每个 REST 式路由创建7个默认动作，可以使用 :only 和 :except 选项来微调此行为。
里面内置的数据集。...R的数据结构是数据类型的封装方式，就是怎么把各种数据类型的数据组合起来，储存相同类型的数据的（同质的），储存不同类型的数据的（异质的）， 在R中数据类型被分为字符型(character), 浮点型（double...R语言的数据结构 说到这，想必大家对R中的数据有了很深的了解，R也很贴心，有大量的R的内置数据集： R语言内置数据集，隐藏的秘密 Vectors 无论是atomic vector还是list，都属于vector...年5-9月每日空气质量 anscombe 四组x-y数据，虽有相似的统计量，但实际数据差别较大 attenu 多个观测站对加利福尼亚23次地震的观测数据 attitude 30个部门在七个方面的调查结果...好多的数据集等你去挖掘，这只是冰山一角。
这里有一个例子表明，检验系数是否为0与检验协变量是否重要是不一样的。假设真正的模型是: image.png image.png image.png image.png ? ?
下面是（ GEO数据挖掘 ）直播配套笔记 举例：GSE83521和GSE89143数据合并 1.下载数据 rm(list = ls()) library(GEOquery) library(stringr...[,match(rownames(pd2),colnames(exp2))] #(3)提取芯片平台编号 gpl <- eSet2[[1]]@annotation #(4)合并表达矩阵 # exp2的第三个样本有些异常...) Group = factor(Group,levels = c("Normal","Tumour")) save(gse,Group,exp,gpl,file = "exp.Rdata") 两个数据集样本的情况...合并后的数据 2.针对不同数据集数据的差异，需要处理批次效应 2.1 使用limma包里的removeBatchEffect()函数 rm(list = ls()) load("exp.Rdata...as.data.frame(exp),main="Original") boxplot(as.data.frame(exp2),main="Batch corrected") 2.2 使用sva包中的combat
为什么要划分数据集为训练集、验证集和测试集？ 做科研，就要提出问题，找到解决方法，并证明其有效性。这里的工作有3个部分，一个是提出问题，一个是找到解决方法，另一个是证明有效性。...无论是单一的训练集、验证集和测试集，还是进行交叉验证，你都会找到调用的方法，因此我们这里主要介绍两种常见的方法。 1....前人给出训练集、验证集和测试集 对于这种情况，那么只能跟随前人的数据划分进行，一般的比赛也是如此。...只需要把数据集划分为训练集和测试集即可，然后选取5次试验的平均值作为最终的性能评价。 验证集和测试集的区别 那么,训练集、校验集和测试集之间又有什么区别呢?...测试集是用于在完成神经网络训练过程后,为了客观评价模型在其未见过(未曾影响普通参数和超参数选择)的数据上的性能,因此测试与验证集和训练集之间也是独立不重叠的,而且测试集不能提出对参数或者超参数的修改意见
机器学习是通过研究数据和统计信息使计算机学习的过程。机器学习是迈向人工智能（AI）的一步。机器学习是一个分析数据并学会预测结果的程序。 数据集 在计算机的思维中，数据集是任何数据的集合。...在机器学习中，通常需要处理非常大的数据集。在本教程中，我们将尽量让您尽可能容易地理解机器学习的不同概念，并使用易于理解的小型数据集。 数据类型 要分析数据，重要的是要知道我们正在处理的数据类型。...我们可以将数据类型分为三个主要类别： 数值 分类 顺序 数值数据是数字，并且可以分为两个数值类别： 离散数据 - 限制为整数的数字。示例：汽车经过的数量。 连续数据 - 有无限值的数字。...通过了解数据源的数据类型，您将能够知道在分析数据时使用哪种技术。 您将在接下来的章节中了解更多有关统计学和数据分析的内容。 机器学习 - 均值、中位数、众数 在观察一组数字时，我们可以学到什么？...] 这些速度的平均值、中间值和最常见的速度值是多少呢？
在这篇博客中，我们将深入介绍如何使用Ruby on Rails（RoR）框架和Bootstrap前端框架共同开发一个简单而功能丰富的社交网络平台。...步骤1：安装Ruby on Rails首先，确保你的系统已经安装了Ruby和Ruby on Rails。...cd social_network步骤3：配置数据库在config/database.yml中配置你的数据库连接，例如使用SQLite：default: &default adapter: sqlite3...通过这个简单的例子，你可以深入了解如何使用Ruby on Rails和Bootstrap开发一个社交网络平台。...随着你的学习深入，你可以添加更多功能，例如用户认证、用户间关系、帖子、评论等，以创建一个更加完整和实用的社交网络应用。祝你在Ruby on Rails的开发之旅中取得成功！
基本数据类型转换2 和 函数调用 CGO 涉及的数据类型转换包含一下内容： 数值类型 字符串和切片类型 结构体、联合体、枚举类型‘ 数组类型 指针类型 数组和指针间的转换 切片和切片之间的转换 前面...切片和切片之间的转换就要用到 GO 里面 reflect 包提供的数据结构了， 因为 GO 里面，数组或者切片已经不是指针类型了，需要通利用 reflect 里面的数据结构来进行转换，如下： //它的引用不会被垃圾回收...，因此程序必须使用正确类型的指向底层数据的指针 type StringHeader struct { Data uintptr Len int } //它的引用不会被垃圾回收，因此程序必须使用正确类型的指向底层数据的指针...:= (*reflect.SliceHeader)(unsafe.Pointer(&q)) 再用原来的数据来填充这个空切片，此处需要注意 len 和 cap 的计算和赋值 pk.Data = qk.Data...GO 再去调用： C 语言不支持多个返回结果，但是 GO 语言支持返回过个结果，CGO 里面 我们可以用 标准库里面的 errno 宏用于返回错误状态 package main /
分享是一种态度 此教程显示了如何将 CellChat 应用于具有不同细胞类型成分的多个数据集的比较分析。几乎所有的CellChat功能都可以应用。...笔记要点 加载所需的包 第一部分：比较分析具有略有不同细胞类型成分的多个数据集 第二部分：对具有截然不同的细胞类型成分的多个数据集的比较分析 加载所需的包 library(CellChat) library...(ggplot2) library(patchwork) library(igraph) 第一部分：比较分析具有略有不同细胞类型成分的多个数据集 对于具有稍微不同的细胞类型...第二部分：对具有截然不同的细胞类型成分的多个数据集的比较分析 CellChat 可用于比较来自截然不同的生物背景的两个 scRNA-seq 数据集之间的细胞-细胞通信模式。...对于具有截然不同的细胞类型（组）组成的数据集，除了以下两个方面外，大多数 CellChat 的功能都可以应用： 不能用于比较不同细胞群之间相互作用的差异数和相互作用强度。
下载数据集请登录爱数科(www.idatascience.cn) 尝试并理解描述每个年龄段的书籍的基本功能会很有趣，我们是否可以找到一条规则，根据给定的描述，我们可以自动为新书分配年龄段？...数据预览 3. 字段诊断信息 4. 数据来源 来源于Kaggle。
这里我们要介绍一个用sqlite3来读取数据用于MindSpore的训练的案例，在有限的内存空间中避免完整的去加载整个数据集。...Sqlite3产生随机数据 因为大部分的Python中是预装了sqlite3的，这就避免了我们自己再去重复安装的麻烦，比如Spark和PySpark就是安装起来比较麻烦的典型案例，当然其性能和分布式的处理也是非常具有优越性的...0个数据和第99个数据，如果超过这个范围去检索，会返回一个空的值。...总结概要 本文按照数据流的顺序，分别介绍了：使用sqlite3数据库存储数据、从sqlite3数据库中读取数据、使用从sqlite3数据库中的数据构造MindSpore可识别的训练数据集。...对于输入的数据量比较大的场景，我们不太可能将全部的数据都加载到内存中，这就要考虑各种可以快速存储和读取的方案，数据库就是一种比较常见的方案。
这样得到的这些数据集就会存在我们所谓的批次效应，如不同实验时间、不同实验批次、不同处理方法、不同测序平台等。遇到这一情况，我们该如何选择数据和处理数据呢？...这里，我们就来介绍一下面对多个GEO数据集，我们该怎么处理？...二、整合数据及分析 在数据挖掘过程中，我们同时会分析多个数据集的表达谱数据，这样就会都得到多个差异分析列表。那么，怎么样才能挑出一些更重要的或者更有生物学意义的基因进行后续实验呢？...常规做法就是将三个数据集的差异基因列表进行overlapping，但这种方法只考虑到了gene出现的次数，并没有考虑到基因在多个差异分列表中排序上的重要性。...总体上来说，就是挑选那些在多个数据集都表现差异的基因，并且每次差异都排名靠前的那些，他们的最终综合排名也会比较靠前。
java泛型类型的调用和实例化 1、泛型调用类似于普通方法调用，但你不是把参数传递给方法，而是把类型参数传递给Box类本身。...Box integerBox; 类型参数和类型变量术语: 许多开发人员可以混淆地使用术语“类型参数”和“类型变量”，但这两个术语并不相同。编码时，提供类型参数以创建参数化类型。...所以 T 在Foo 食物 是一个类型参数，而 String 字符串在Foo f 是一个类型参数。...2、泛型调用实例化类，像往常一样使用new关键字，但是在类名和括号之间放置。 通常称为参数化类型(相当于方法的实际参数)。...Box integerBox = new Box(); 以上就是java泛型类型的调用和实例化，希望对大家有所帮助。
本文对VLM领域多个任务的常见数据集和benchmark做了简要介绍，以方便读友看论文时参考。...⚠️注意：本文信息仍在时常更新中 常见任务和评测数据 常见的多模态任务有：视觉问答VQA、视觉常识推理VCR（选择题并解释原因）、指代表达RE（给定图片和一个句子，判断句子正确还是错误）、图文检索VLR...OCR开源数据，来源是20个公开数据集，约5.6M真实的+17.9M仿真的： https://github.com/large-ocr-model/large-ocr-model.github.io/...Visual Grounding数据集。...数据集是从网页数据Common Crawl中筛选出来的图像-文本对数据集，它包含5.85B的图像-文本对，其中文本为英文的数据量为2.32B，这就是LAION2B数据集，它是LAION5B的英文子集。
但是现在基本上大家的单细胞转录组项目不太可能是单个样品啦，所以一定会触及到多个样品整合的问题，整合是为了尽可能的去除批次等不需要的差异但是尽可能的保留生物学差异，是一个两难问题，所以关于它的算法基本上都是发表在...但是如果你选择：单细胞降维聚类分群的另外一个工具选择Pagoda2，其实也有一个配套的单细胞数据集整合的算法选择conos，让我们来一起看看吧。...', repos='https://kharchenkolab.github.io/drat/', type='source') # install.packages("conos") 然后对测试数据集构建...实例数据演示conos的整合 前面的包的安装和加载是一样的，这个时候不选择示例数据，而是 读取pbmc3k和5k数据集 ： ## 2.1 读取pbmc3k和5k数据集 ---- library(conosPanel...pbmc3k和5k数据集 ，需要的两个文件 在我自己的电脑，不过如果你看完了以前的单细胞系列教程，应该是很容易自己去制作它。
下载数据集请登录爱数科(www.idatascience.cn) 数据集包含RSSI读数，这些读数是在现实世界和可操作的室内环境中从蓝牙低功耗（BLE）iBeacon阵列中收集的，用于定位和导航。...共6611条数据，15个字段。 1. 字段描述 2. 数据预览 3. 字段诊断信息 4....数据来源 Mehdi Mohammadi and Ala Al-Fuqaha, {mehdi.mohammadi, ala-alfuqaha}@wmich.edu, Department of Computer...数据引用 M. Mohammadi and A.
WenetSpeech数据集 10000+小时的普通话语音数据集，使用地址：PPASR WenetSpeech数据集 包含了10000+小时的普通话语音数据集，所有数据均来自 YouTube 和 Podcast...为了提高语料库的质量，WenetSpeech使用了一种新颖的端到端标签错误检测方法来进一步验证和过滤数据。...然后制作数据集，下载原始的数据是没有裁剪的，我们需要根据JSON标注文件裁剪并标注音频文件。...--wenetspeech_json参数是指定WenetSpeech数据集的标注文件路径，具体根据读者下载的地址设置。...，跟普通使用一样，在项目根目录执行create_data.py就能过生成训练所需的数据列表，词汇表和均值标准差文件。
幸运的是，现在有非常多的开源数据集，并且涵盖了多个领域，这里介绍几个常用的可以查找数据集的网站以及一些在计算机视觉常用的图像数据集： Kaggle 数据集:每个数据集都是一个小型社区，用户可以在其中讨论数据...包含各式各样的真实数据集。 Amazon 数据集：该数据源包含多个不同领域的数据集，如：公共交通、生态资源、卫星图像等。...UCI机器学习资源库：来自加州大学信息与计算机科学学院的大型资源库，包含100多个数据集。用户可以找到单变量和多变量时间序列数据集，分类、回归或推荐系统的数据集。...参数可以实现设置随机生成器种子的作用； 可以将种子传递给多个行数相同的数据集，可以在相同的索引上分割数据集。...但对于不大的数据集，这会出现采样偏差的风险。简单说，就是样本代表性不够，可能随机选择的都是同种类型的数据。
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