基因组选择在育种中的应用, 其基础是常规的系谱动物模型, 动物模型也可以很复杂, 看一下asreml的说明书就知道了, 有300多页, 据我了解, 其厚度可以用这个公式表示:
?...这个教程是asreml在基因组选择和分子育种中的应用, 下面是我的读书笔记....3, 基因组选择
理论介绍
GBLUP所依据的公式为:
?
M是n*m构成的矩阵, n是个体数, m为标记数(marker), g是每个标记的BLUP值....相关的R包, 参考wgaim包
在下一章节中, 我们将对GS的延伸方法: Fast Bayes A进行介绍.
4, 基因组选择的其它方法
EM BayesA-like方法, 参考 Sun et al....PEV会给出标记的标准误, 结果不可靠
基因型的GBLUP在.sln中, mark的效应在.mef中, 标记的权重(weight)在.mef中, 大效应的标记在.res文件中.
6, asreml基因组选择考虑