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基因组中是否存在未被DNA测序覆盖区域(学徒翻译)

换言之:一些基因组区域不能很好地被NGS技术测序DNA所覆盖。在此,我们将解释这一点重要原因。 重复DNA序列 重复DNA序列(例如串联重复序列)在许多物种中广泛存在。...因此,来自具有高/低GC含量区域片段表现不足,导致读取覆盖率低且不均衡(图1)。 一个常见例子是恶性疟原虫,一种疟疾病原体。其基因组一些编码区具有70%AT含量。...因此,直到最近,才有可能对寄生虫基因组进行测序。目前项目试图通过使PCR(扩增)产生假象最小化或放弃扩增步骤(2)来改善这些区域测序。 ?...图1:在各种扩增条件全基因组碱基组成偏差曲线,线性尺度。 图片来自(3)。...这导致各种基因组区域不均匀覆盖,并且可导致欠/未覆盖区域。 总结 这些实例表明,使用NGS进行准确DNA测序还存在许多技术难题需要解决。

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SonarQube8.3中Maven项目的测试覆盖率报告

SonarQube6.2开始,测试报告不再在这些类别中分开。SonarQube将所有测试报告合并为一份涵盖整体测试报告。...在以下各节中,提出了满足以下条件解决方案: 构建工具:Maven。 该项目可以是多模块项目。 单元测试和集成测试是每个模块一部分。 测试覆盖率是通过JaCoCo Maven插件来衡量。...之后,我们来看看Maven项目配置以生成涵盖单元测试和集成测试测试报告。最后,SonarQube仪表板中显示了SonarQube配置,用于测试报告可视化查看。...SonarQube测试报告可视化 现在,我们想在SonarQube中可视化我们测试报告。成功构建后,我们必须在我们项目中运行SonarMaven3插件(命令mvn sonar:sonar)。...仪表板中打开项目时,我们会看到总体测试覆盖率报告。

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站】mysql覆盖索引使用注意

mysql覆盖索引使用注意 使用注意 1、索引必须存储列值。 覆盖索引不适用于所有索引类型。 2、MySQL只能使用B-TREE。 Hash和full-text索引没有存储值。...3、不同存储引擎有不同覆盖索引。 4、并不是所有的存储引擎都支持。 5、注意取出SELECT列表值所需列。...如果要使用覆盖索引,一定要注意取出SELECT列表值所需列,而不是SELECT*,因为如果把所有字段一起做索引,会导致索引文件过大,查询性能下降,不能用覆盖索引。...primary key, k int NOT NULL DEFAULT 0, s varchar(16) NOT NULL DEFAULT '', index k(k)) engine=InnoDB; #插入数据...into T values(100,1, 'aa'),(200,2,'bb'),(300,3,'cc'),(500,5,'ee'),(600,6,'ff'),(700,7,'gg'); 以上就是mysql覆盖索引使用注意

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站】mysql覆盖索引高性能探究

mysql覆盖索引高性能探究 1、高性能原因 索引通常比记录要小,覆盖索引查询只需要读索引,而不需要读记录。 索引都按照值大小进行顺序存储,相比与随机访问记录,需要更少I/0。...大多数数据引擎能更好缓存索引,例如MyISAM只缓存索引。 2、实例 ijiangtao_local_db_mysql表action列包含索引。...使用explain分析下面的查询语句,对于索引覆盖查询(index-covered query),分析结果Extra值是Using index,表示使用了覆盖索引 : explain select `...action` from ijiangtao_local_db_mysql.t_user_action_log; 以上就是mysql覆盖索引高性能探究,大家也可以试着找一些覆盖索引进行练习。

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是什么

只是当设计师看了无数关于深色模式讨论;当无数产品跟进上线了深色模式;再当无数App深色模式被骂改了又改,回头来看看,你黑,到底是什么黑。...Chapter 1 我所经历过深色模式 虽然,我真正开始做UI设计是近年,但是曾经还是体验过很多深色模式界面的。甚至有很多产品,天生就是深色模式。...故事开始其实都是深色模式:命令行界面 啥?这也算深色模式?你对。...大概就4点: 专注内容:深色和浅色在空间关系感知上,的确是有很大差距。可以,之所以深色UI带来最体验上差别,就是让屏幕看起来更无界,更专注于内容。...A2:首先,希望在设计上尽量使用统一规范。因为在前期设计师给到适配规范时候,开始刷界面是比较快,但是会发现有很多界面覆盖不到。这是由于前期设计用了太复杂逻辑,或者做了特殊逻辑。

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程序员模型过拟合时候,是什么?

; 过于复杂参数或结构模型(相较于数据而言),在可以“完美地”适应数据同时,也学习更多噪声; 如上图以虚线区分效果来形象表示模型拟合效果。...偏差(Bias) 是指用所有可能训练数据集训练出所有模型输出值与真实值之间差异,刻画了模型拟合能力。偏差较小即模型预测准确度越高,表示模型拟合程度越高。...方差(Variance) 是指不同训练数据集训练出模型对同预测样本输出值之间差异,刻画了训练数据扰动所造成影响。...方差分解” 说明,模型拟合过程泛化性能是由学习算法能力、数据充分性以及学习任务本身难度所共同决定。...(拓展:通过在神经网络网络层引入随机噪声,也有类似L2正则化效果) 提前停止(Early stopping):通过迭代次数截断方法,以限制模型学习权重。

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程序员模型过拟合时候,是什么?

; 过于复杂参数或结构模型(相较于数据而言),在可以“完美地”适应数据同时,也学习更多噪声; 如上图以虚线区分效果来形象表示模型拟合效果。...偏差(Bias) 是指用所有可能训练数据集训练出所有模型输出值与真实值之间差异,刻画了模型拟合能力。偏差较小即模型预测准确度越高,表示模型拟合程度越高。...方差(Variance) 是指不同训练数据集训练出模型对同预测样本输出值之间差异,刻画了训练数据扰动所造成影响。...” 说明,模型拟合过程泛化性能是由学习算法能力、数据充分性以及学习任务本身难度所共同决定。...(拓展:通过在神经网络网络层引入随机噪声,也有类似L2正则化效果) 提前停止(Early stopping):通过迭代次数截断方法,以限制模型学习权重。

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【译】我平台工程是什么

如今,每个人都在建立一个“平台”,以加快数字产品大规模交付。但什么样平台才是有效数字平台呢?...一些组织试图在现有共享服务基础上进行平台建设时,因为没有解决组织结构和运营模式问题,最终陷入困境。 “平台”到底是什么?...很显然这种方式能够提高一致性但是降低了整体自主性、反应能力和应对变化能力。这不可能是唯一方法。 因此,能够减少 Backlog 耦合平台是好。平台提供服务必须不需要工单和分配工作。...而且,即使意图是好,但要逐步将应用程序接口构建到所需丰富程度,这个过程需要巨大工作量也是难于承受。...成功建立交付平台有一些先决条件。首先,你可能已经开始摆脱以“项目”作为技术交付主要资金和人员机制。平台是一种产品,需要一个长期稳定产品团队来负责构建和运行。

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