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Python+大数据学习笔记(一)

PySpark使用 pyspark: • pyspark = python + spark • 在pandas、numpy进行数据处理时,一次性数据读入 内存中,当数据很大时内存溢出,无法处理;此外...,很 多执行算法是单线程处理,不能充分利用cpu性能 spark的核心概念之一是shuffle,它将数据集分成数据块, 好处是: • 在读取数据时,不是数据一次性全部读入内存中, 是分片,用时间换空间进行大数据处理...pyspark: • 在数据结构上Spark支持dataframe、sql和rdd模型 • 算子和转换是Spark中最重要的两个动作 • 算子好比是盖房子中的画图纸,转换是搬砖盖房子。...spark = SparkSession\ .builder\ .appName("PythonWordCount")\ .master("local[*]")\ .getOrCreate() # 文件转换为..., nullable: 指示该字段的值是否空 from pyspark.sql.types import StructType, StructField, LongType, StringType

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PySpark数据类型转换异常分析

1.问题描述 ---- 在使用PySpark的SparkSQL读取HDFS的文本文件创建DataFrame时,在做数据类型转换时会出现一些异常,如下: 1.在设置Schema字段类型DoubleType...u'23' in type ”异常; 3.字段定义StringType类型,SparkSQL也可以对数据进行统计如sum求和,非数值的数据不会被统计。...DoubleType的数据类型导致 解决方法: from pyspark.sql.types import * 或者 from pyspark.sql.types import Row, StructField...3.总结 ---- 1.在上述测试代码中,如果x1列的数据中有空字符串或者非数字字符串则会导致转换失败,因此在指定字段数据类型的时候,如果数据中存在“非法数据”则需要对数据进行剔除,否则不能正常执行。...(RDD.scala:323) [uvqmlxqpit.jpeg] [al3thynyrb.jpeg] 2.若不对“非法数据”进行剔除,则需要将该字段数据类型定义StringType,可以正常对字段进行统计

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PySpark UD(A)F 的高效使用

由于主要是在PySpark中处理DataFrames,所以可以在RDD属性的帮助下访问底层RDD,并使用toDF()将其转换回来。这个RDD API允许指定在数据上执行的任意Python函数。...这个底层的探索:只要避免Python UDF,PySpark 程序大约与基于 Scala 的 Spark 程序一样快。如果无法避免 UDF,至少应该尝试使它们尽可能高效。...4.基本想法 解决方案非常简单。利用to_json函数所有具有复杂数据类型的列转换为JSON字符串。因为Arrow可以轻松处理字符串,所以可以使用pandas_udf装饰器。...如前所述,必须首先使用参数 cols_in 和 cols_out 调用它,不是仅仅传递 normalize。...作为最后一步,使用 complex_dtypes_from_json 转换后的 Spark 数据帧的 JSON 字符串转换回复杂数据类型

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Pandasspark无痛指南!⛵

(types_dict)Pandas 可以通过如下代码来检查数据类型:df.dtypes PySparkPySpark 指定字段数据类型的方法如下:from pyspark.sql.types import...可以通过如下代码来检查数据类型:df.dtypes# 查看数据类型 df.printSchema() 读写文件Pandas 和 PySpark 中的读写文件方式非常相似。...df.take(2).head()# 或者df.limit(2).head()注意:使用 spark 时,数据可能分布在不同的计算节点上,因此“第一行”可能会随着运行变化。...,dfn]df = unionAll(*dfs) 简单统计Pandas 和 PySpark 都提供了 dataframe 中的每一列进行统计计算的方法,可以轻松对下列统计值进行统计计算:列元素的计数列元素的平均值最大值最小值标准差三个分位数...(在我们的例子中 FloatType) 总结本篇内容中, ShowMeAI 给大家总结了Pandas和PySpark对应的功能操作细节,我们可以看到Pandas和PySpark的语法有很多相似之处,但是要注意一些细节差异

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图解大数据 | 综合案例-使用Spark分析挖掘零售交易数据

,格式如下: [商品编号,销量] (5)商品描述的热门关键词Top300 Description字段表示商品描述,由若干个单词组成,使用 LOWER(Description) 单词统一换为小写。...调用 createDataFrame() 方法将其转换为 DataFrame 类型的 wordCountDF,word字符串的记录剔除掉,调用 take() 方法得到出现次数最多的300个关键 词...销售额表示单价乘以销量,需要注意的是,退货时的销量负数,所以对结果求和可以表示销售额。...调用 createDataFrame() 方法将其转换为DataFrame类型的 tradePriceDF ,调用 collect() 方法结果以数组的格式返回。...调用createDataFrame()方法将其转换为DataFrame类型的saleQuantityDF,调用collect() 方法结果以数组的格式返回。

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Spark SQL实战(04)-API编程之DataFrame

Spark DataFrame可看作带有模式(Schema)的RDDSchema则是由结构化数据类型(如字符串、整型、浮点型等)和字段名组成。...这些隐式转换函数包含了许多DataFrame和Dataset的转换方法,例如RDD换为DataFrame元组转换为Dataset等。...通过调用该实例的方法,可以各种Scala数据类型(如case class、元组等)与Spark SQL中的数据类型(如Row、DataFrame、Dataset等)之间进行转换,从而方便地进行数据操作和查询..._,则这些隐式转换函数无法被自动引入当前上下文,就需要手动地导入这些函数,这样会使编码变得比较麻烦。 例如,在进行RDDDataFrame之间的转换时,如果不导入spark.implicits...._等包,并通过调用toDF()方法RDD换为DataFrame。而有了导入spark.implicits._后,只需要直接调用RDD对象的toDF()方法即可完成转换。

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没有自己的服务器如何学习生物数据分析(上篇)

由于文章篇幅较长,我们分为上篇和下篇分别进行推送。...更重要的是,这里由于是和数据科学界接轨,强烈推荐把数据简单处理后(抓取信息,规定每一列的名称,扔掉某些行),放进 SparkSQL中,用 SQL 语句,用 人话 不是代码,去人机交互,分析数据。... DataFrame 则类似是R 中的 DataFrameRDD + 表头。 但是 这里的 RDD 虽然类似列表,DataFrame 虽然也跟 R 很像,却都不支持行列操作。...再下篇中,我们介绍如何利用该平台和PySpark具体解决我们的生物信息数据分析问题。 敬请期待!...说明:文中所有 加粗蓝色字体 在作者博客中均为链接,由于微信的限制无法点击,可以点击阅读原文查看作者博客。 本文编辑:思考问题的熊

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使用Pandas_UDF快速改造Pandas代码

Pandas_UDF介绍 PySpark和Pandas之间改进性能和互操作性的其核心思想是Apache Arrow作为序列化格式,以减少PySpark和Pandas之间的开销。...一个StructType对象或字符串,它定义输出DataFrame的格式,包括输出特征以及特征类型。...快速使用Pandas_UDF 需要注意的是schema变量里的字段名称为pandas_dfs() 返回的spark dataframe中的字段,字段对应的格式符合spark的格式。...toPandas分布式spark数据集转换为pandas数据集,对pandas数据集进行本地化,并且所有数据都驻留在驱动程序内存中,因此此方法仅在预期生成的pandas DataFrame较小的情况下使用...换句话说,@pandas_udf使用panda API来处理分布式数据集,toPandas()分布式数据集转换为本地数据,然后使用pandas进行处理。 5.

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没有自己的服务器如何学习生物数据分析(下篇)

不过 SparkSQL 的结果是个 DataFrame, R 语言倒是能直接收进去,Python 默认的数据类型,没有这个,怎么办?...来,我们先抑制住重复造轮子、准备自己写一个的冲动,由于我们最开始 Import 了 pandas,这个包引入后, Python 也就支持 DataFrame 了。...有Python基础的注意,由于 map 返回的是 pandas 的 DataFrame 不是 Python 默认的list,实际上 reduce 的 append 是 Pandas的append 不是系统...("Chrom", StringType())])df2 = sqlCtx.createDataFrame(rdd, schema2)df2.show() 结果: +--------------...access_token=499996f6a4e6f93e448907bf219bae6310975c0d02521c7c67ef02b79b1ccf77 说明:文中所有 加粗蓝色字体 在作者博客中均为链接,由于微信的限制无法点击

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PySpark SQL——SQL和pd.DataFrame的结合体

:这是PySpark SQL之所以能够实现SQL中的大部分功能的重要原因之一,functions子类提供了几乎SQL中所有的函数,包括数值计算、聚合统计、字符串以及时间函数等4大类,后续专门予以介绍...1)创建DataFrame的方式主要有两大类: 从其他数据类型转换,包括RDD、嵌套list、pd.DataFrame等,主要是通过spark.createDataFrame()接口创建 从文件、数据库中读取创建...与spark.read属性类似,.write则可用于DataFrame对象写入相应文件,包括写入csv文件、写入数据库等 3)数据类型转换。...DataFrame既然可以通过其他类型数据结构创建,那么自然也可转换为相应类型,常用的转换其实主要还是DataFrame=>rddDataFrame=>pd.DataFrame,前者通过属性可直接访问...,后者则需相应接口: df.rdd # PySpark SQL DataFrame => RDD df.toPandas() # PySpark SQL DataFrame => pd.DataFrame

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总要到最后关头才肯重构代码,强如spark也不例外

从优化到重构的血泪史 在程序开发这个行当,优化和重构注定是两个无法摆脱的问题。 当一个项目启动的时候,由于投入有限,可能招不到特别匹配的人才,或者是为了快速满足业务的需要。...往往会采取一些不是特别合理的设计来构建项目,这个应该很好理解,为了图快牺牲一些性能或者是拓展性。而且有时候由于视野和能力的限制,早期的开发者可能也是无法意识到设计中的不合理性的。...因为上层都是以业务导向的,技术做得好不好不重要,能赚钱才是王道。 但问题是优化并不是无止境的,很多时候核心设计的不合理才是大头,边边角角的修补只能聊胜于无。...studentDf = spark.read.json(jsonstr) 执行完这一句之后,RDDDataFrame的工作就完成了。严格说起来这是读取操作,并不是真正的转化操作。...RDDDataFrame稍微复杂一些,我们晚点再说。 如果我们想要查看DataFrame当中的内容,我们可以执行show方法,这是一个行动操作。

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RDD换为DataFrame

为什么要将RDD换为DataFrame?因为这样的话,我们就可以直接针对HDFS等任何可以构建RDD的数据,使用Spark SQL进行SQL查询了。这个功能是无比强大的。...Spark SQL支持两种方式来RDD换为DataFrame。 第一种方式,是使用反射来推断包含了特定数据类型RDD的元数据。...Java版本:Spark SQL是支持包含了JavaBean的RDD换为DataFrame的。JavaBean的信息,就定义了元数据。...由于其具有隐式转换的特性,所以Spark SQL的Scala接口,是支持自动包含了case class的RDD换为DataFrame的。...首先要从原始RDD创建一个元素Row的RDD;其次要创建一个StructType,来代表Row;最后动态定义的元数据应用到RDD上。

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2021年大数据Spark(二十五):SparkSQL的RDD、DF、DS相关操作

数据类型CaseClass样例类时,通过反射Reflecttion获取属性名称和类型,构建Schema,应用到RDD数据集,将其转换为DataFrame。...指定类型+列名 除了上述两种方式RDD换为DataFrame以外,SparkSQL中提供一个函数:toDF,通过指定列名称,数据类型元组的RDD或Seq转换为DataFrame,实际开发中也常常使用...= RDD[Row] + Schema组成,在实际项目开发中灵活的选择方式RDD换为DataFrame。 ​​​​​​​...1)、RDD转换DataFrame或者Dataset 转换DataFrame时,定义Schema信息,两种方式 转换为Dataset时,不仅需要Schema信息,还需要RDD数据类型CaseClass... 3)、DataFrame与Dataset之间转换 由于DataFrameDataset特例,所以Dataset直接调用toDF函数转换为DataFrameDataFrame换为Dataset

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