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寻找与疾病相关SNP位点——R语言从SNPedia批量提取搜索数据

初次使用SNPedia   SNPedia主页网址为http://snpedia.com/index.php/SNPedia,比如我想查找与crouzon综合症相关SNP,只需要在SNPedia搜索...crouzon syndrome,即会出现许多相关SNP搜索结果   如果这时候想看每个SNP相关信息,就要每个链接分别点进去   后来发现我们只需要提取里面的部分信息,Orientation...,Stabilized,Reference,Chromosome,Position,Gene,还有clinvar表格信息,这时候我们就可以从网页利用RCurl包,XML包,正则表达是把所需要内容提取出来...,返回匹配字符串 pattern:匹配模式,比如"abc[a-z]*" stringlist:字符串列表,list("abc","abcde","cdfe") return : 列表里字符串匹配结果...,返回存在匹配字符串列表index pattern:匹配模式 stringlst:待匹配字符串列表 return:存在返回匹配字符串在列表index findlist <- gregexpr

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追踪记录每笔业务操作数据改变利器——SQLCDC

如果在默认情况下,执行如下SQL语句查看数据库TestDbCDC是否开启,你将会看到该字段为0。 ?...下面的T-SQL代码片断,我们通过执行该存储过程为TestDb打开了CDC特性。...通过执行下面的T-SQL将我们创建Users表CDC特性打开,其中@role_name参数被设置成NULL,表明不对读取改变数据操作进行授权。...执行上面一段T-SQL之后,会有如下一个系统表被创建出来,我们发现Users表三个字段也在该表。此外。...由于在上面的T-SQL,我们只改动了Birthday,这个和100这个是吻合。 六、记录删除记录数据改变 我们最后来演示当我们对记录实施删除操作时候,CDC会为我们记录下怎样数据。

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SQL Server 2005 正则表达式使模式匹配和数据提取变得更容易

目录 CLR 用户定义函数 模式匹配 数据提取 模式存储 匹配 在匹配项中进行数据提取 总结 尽管 T-SQL 对多数数据处理而言极其强大,但它对文本分析或操作所提供支持却很少。...其次,它并未对包含在过程名称实际实体名称执行任何测试。第三,问题在于查询测试四个字符长度均为六个字符,这样可以通过从六个字符提取一个子串来简化代码,然后根据每个可接受操作进行比较。...此表可用于存储允许您描述在数据库存储原始客户端数据方式分组模式,这样您就可以创建计算列以便从客户端数据中提取实际需要数据。...匹配 并非确定字符串是否与模式匹配,它有时需要提取每个匹配项。以前,这类提取需要游标循环访问字符各部分。该过程不仅速度慢,而且代码也难于理解和维护。正则表达式是执行此操作更好方法。...它使用新生成关键字来创建比早期版本框架更方便枚举器。它将按需返回在输入字符检测到各个匹配项。 图 3 代码定义了表 CLR UDF。

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笨方法刷 leetcode(一)

->可以利用已有列表、字符串、元组或字典内容来创建集合,其中重复会被丢弃; 所以就可以通过set()来得到一个剔除重复集合,并且比较两者长度,如果长度相等,则证明字符唯一;如果长度不等,则字符不唯一...,你需要将这个整数每位上数字进行反转。...= t # 遍历新列表,并将结果一个个追加到空字符 i = "-" + i # 将"-"与最终字符串i组合,得到最终字符串 else:...""" if not strs: return "" else: prefix = strs[0] # 把字符串列第一个字符串赋给一个变量...# 在把第二个字符字符与第一个字符字符比对前,先判断后续字符长度是否大于等于第一个字符长度(防止提取后续字符字符时,出现溢出) if strs

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_T-SQL程序练习01

在 Microsoft SQL Server 7.0 T-SQL 有着为数不少新增功能,包括新预存程序、系统资料表、函数、资料型别、陈述式以及现存陈述式选项。...这些都被保留在 SQL Server 2000 ,因此我们在这里要先回顾 (特别是在您还不很熟悉 SQL Server 7.0 T-SQL 功能,这个温习就很重要了)。...你必须为每个字段或变量选择一个数据类型以适配于存储在相应字段或变量数据。另外,还需要考虑存储需求并选择高效率存储数据类型。...然而,如果为此字段使用字符或数字数据类型,那么最终结果就可以在此字段存储任何字符和数字类型数据,而它们并不代表一个日期。最后,选择正确数据类型会带来正确执行计划,从而改善数据库性能。...as varchar(4))+'公斤' else set @str='你身材非常标准' return @str; end执行结果:四、写一个T-SQL多语句表函数 ,根据父母血型列出孩子所有可能血型

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Python|有趣shuffle方法

) 原始字符串列表: ['Paint It Black', 'Gimme Shelter', '同情魔鬼', '满意', '你不能总是得到你想要东西'] 第一次shuffle之后字符串列表...6、在Python改组多维数组 假设您有一个多维数组,并且想要对其进行无序排列。在这个例子使用numpy模块创建一个二维数组。...7、在Python随机播放字典 在python不可能修改字典。但是,我们可以重新排列字典键迭代顺序。从字典中提取所有键并将其添加到列表,无序排列该列表并使用新无序排列键访问字典。...,在上面的随机变换我们先获取键,然后在通过键获取对应数据 结语 通过上面对shuffle函数学习,我们需要注意是以下几点: 1、在使用这个函数时我们一定要记得引入相应库,在这个函数我们常用库有...2、在shuffle函数是不能够接受字符串这种数据类型,我们需要字符串转换成其他数据类型。如果直接输入字符串则会报错。

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QStringList 学习笔记

,用 <<来添加字符串,相当于JavaListadd()方法....3.替换字符串 replace() 通过replace()方法我们可以替换掉list某一位置 qstrList.replace(0,"Web"); 第一个参数为我们要替换位置,后面的参数表示我们要替换...4.删除字符串 removeAt(), removeFirst(), removeLast(), and removeOne() 我们可以根据方法名,推断出个方法具体作用,根据实际需要选着对应方法...过滤filter() 可以让你提取一个新列表只包含这些字符串包含一个特定字符串(或匹配特定正则表达式): QStringList list; list << "Bill Murray" << "...与QList一样,QStringList是隐式共享。它提供了快速基于索引访问,以及快速插入和删除。将字符串列表作为值参数传递是快速和安全

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《MSSQL2008技术内幕:T-SQL语言基础》读书笔记(上)

:TRUE、FALSE与UNKNOWN   SQL支持使用NULL表示缺少,它使用是三谓词逻辑,代表计算结果可以使TRUE、FALSE与UNKNOWN。...在SQL,对于UNKNOWN和NULL处理不一致,这就需要我们在编写每一条查询语句时应该明确地注意到正在使用是三谓词逻辑。   ...WHERE region N'WA' OR region IS NULL;   另外,T-SQL对于NULL值得处理是先输出NULL再输出非NULL值得顺序,如果想要先输出非NULL,则需要改变一下排序条件...如果不需要支持输入,则使用视图;反之,则使用内联表函数。 四、集合运算 4.1 UNION 并集运算 ?   在T-SQL。UNION集合运算可以将两个输入查询结果组合成一个结果集。...这里需要是,集合运算对行进行比较时,认为两个NULL相等,所以就返回该行记录。 4.3 EXCEPT 差集运算 ?   在T-SQL,集合之差使用EXCEPT集合运算实现

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SQL ServerGUID

大家好,又见面了,是全栈君,今天给大家准备了Idea注册码。...SQL Server NewID() 函数可以产生 GUID 唯一,使用此函数几种方式如下: 1) 作为列默认 将 uniqueidentifier 默认设为 NewID(),这样当新行插入表时...2)使用 T-SQLT-SQL 中使用 NewID()函数,如“INSERT INTO Table(ID,… ) VALUES(NewID(),…)”来生成此列 GUID 。...3)提前获取 GUID 由于特殊功能需要需要预先获知新行 ID ,也可以使用如下 C# 代码提前获得 GUID ,再存储到数据库: SqlCommand cmd = New SqlCommand...便于数据库移植,其它数据库并不一定具有 IDENTITY 列,而 Guid 列可以作为字符型列转换到其它数据库,同时将应用程序中产生 GUID 存入数据库,它不会对原有数据带来影响。

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Pandas Query 方法深度总结

SQL WHERE 语句。...结果是一个 DataFrame,其中包含所有从南安普敦出发乘客: query() 方法接受字符串作为查询条件串,因此,如果要查询字符串列,则需要确保字符串被正确括起来: 很多时候,我们可能希望将变量值传递到查询字符...== "{embarked}"') 就个人而言,认为与 f-string 方式相比,使用 @ 字符更简单、更优雅,你认为呢 如果列名中有空格,可以使用反引号 (``) 将列名括起来: df.query...指定多个条件查询 我们可以在查询中指定多个条件,例如假设想获取所有从南安普敦 (‘S’) 或瑟堡 (‘C’) 出发乘客。...,我们可以使用 isnull() 方法查找缺失: df.query('Embarked.isnull()') 现在将显示 Embarked 列缺少行: 其实可以直接在列名上调用各种 Series

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SQL 扩展事件

如果是2012以后SSMS客户端,也可以访问2008 数据库实例,但是看不到扩展事件UI。在2008版本缺少UI,意味着必须写T-SQL和XQuery来挖掘事件数据。...图1     需要注意,扩展时间优点之一就是事件会话保存于服务器元数据,因此默认重启后保存在实例,然而追踪定义则不是,在重启后必须要执行一个自定义存储过程来重新创建追踪。...在这个分析器总共有180个时间供你选择,找到需要。下面再事件库下面的输入框输入completed ,下面的对话框自动将包含这个单词事件筛选出来少于15个事件。 ?...接着下面输入文件名,选择浏览输入文件输出位置。路径最大长度是260个字符。例子中使用是D:\temp\HighReadQueries。这里不需要包含文件默认扩展名.xel。...生成T-SQL脚本,选择脚本按钮点击OK或者创建完成后右键输出创建脚本到查询窗口(之前介绍了)。这里加上了相应注释,以便理解。

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