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单细胞SCENIC分析——寻找驱动基因

Nature methods, 2017) 二、SCENIC分析工作流搭建 SCENIC分析工作流: ?...图3 不同TFs调控强度 (数据来源:Birey F., et al....Nature, 2017.) 2 TFs调控靶基因 表1记录了每个TF调控靶基因及对应调控强度(仅展示调控强度Top20regulons)。...TFs所调控靶基因往往不止一个,如FOXA1可以调控靶基因SPON1、NTN1和SULF1。该部分结果将为后续筛选关键TFs提供一定依据。 表1 TFs调控靶基因及其调控强度 ?...SCENIC分析拓展 SCENIC分析不仅可以用于筛选得到有价值TFs,还可以结合其他验证手段或数据分析工具来探索更深层次生物学意义。这里小编为大家提供了一些TFs后续研究分析思路: 1.

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使用Jenkins来实现内部持续集成流程(下)

目录 配置项目构建 添加任务 添加源代码地址和登录凭据 添加构建触发器  TFS添加WebHook  添加构建步骤 后端UI  API端  配置项目构建 1、添加任务...(比如TFS)添加WebHook(如果服务器不支持添加WebHook,可以考虑使用“轮询SCM”,此处未作尝试) 4、TFS添加WebHook 打开TFS 选中项目 右边设置 选择服务挂钩 ?...该类型事件触发器=>选择 “已推送代码” 筛选器 存储库=>选择对应存储库 分支=>选择要推送分支 下一步 ?...设置和身份验证用户名和密码 填写Jenkins访问地址和用户名、密码 集成级别=>选择“JenkinsTFS插件” 点击测试按钮: ?...参考链接:  https://weblogs.asp.net/scottgu/automating-deployment-with-microsoft-web-deploy

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使用Jenkins来实现内部持续集成流程(下)

目录 配置项目构建 添加任务 添加源代码地址和登录凭据 添加构建触发器 TFS添加WebHook 添加构建步骤 后端UI API端 配置项目构建 1 添加任务 ?...(比如TFS)添加WebHook(如果服务器不支持添加WebHook,可以考虑使用“轮询SCM”,此处未作尝试) 4 TFS添加WebHook 打开TFS 选中项目 右边设置 选择服务挂钩 ?...该类型事件触发器=>选择 “已推送代码” 筛选器 存储库=>选择对应存储库 分支=>选择要推送分支 下一步 ?...设置和身份验证用户名和密码 填写Jenkins访问地址和用户名、密码 集成级别=>选择“JenkinsTFS插件” 点击测试按钮: ?...参考链接: https://weblogs.asp.net/scottgu/automating-deployment-with-microsoft-web-deploy

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tfs安装教程_怎么安装2010office激活成功教程版

项目集下默认有如下组:   在每个项目下默认有如下组:   每个权限组可以包括不同成员,具有不同操作权限。   2.3.2....项目权限配置   项目的权限配置包括了项目级、源代码、区域、团队查询、生成权限控制。   项目权限控制,只是用于控制用户是否对本项目的访问权限,同理项目集也一样。...有项目访问权限不代表具有源代码、区域等权限,需要一一配置,不过TFS会默认生成4个权限组,对应不同内容也有默认配置,一般来说只需要配置这些组成员即可。   ...区域权限,主要是对工作项内容进行控制,例如能否创建工作项,能否关闭任务等等。   团队查询,主要是控制一些已定制查询信息权限。   生成,主要对生成操作进行权限控制。   2.3.3....设置方法如下:   在服务器VS2010团队资源管理中选择项目集下项目,右键选择显示项目门户网站,出现如下站点:   点击红色圈中链接—网站操作,在下拉框中选择网站设置,出现下图页面。

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不同数据库转录因子差异如何

通过转录因子注释和表达量聚类分析,再结合WGCNA分析确定候选转录因子与所关注性状之间相关性,建立以转录因子为hub gene调控网络,这是一个非常系统机制研究思路。...不同数据库中收集转录因子信息有所不同,接下来,我们以下列三个数据库:AnimalTFDB 3.0、The Human Transcription Factors 和RcisTarget包自带motifAnnotations_hgnc_v9...数据库为例,为大家展示一下这三个数据集所含转录因子信息差异: ****读取不同数据库下载得到TFs列表 #1_来源于AnimalTFDB3,下载链接:http://bioinfo.life.hust.edu.cn...AnimalTFDB3_TFs) #2_来源于CCBR,下载链接:http://humantfs.ccbr.utoronto.ca/....在我们筛选转录因子用于研究时,建议整合至少三个网站信息进行overlapping分析!

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记一个复杂组件(Filter)从设计到开发

以便后面查询,更希望能大家一起探讨,以求得更优质代码架构和实现思路。...配置参数能够指定 通过 url 传入相关筛选 id 能够初始化面板选中 … 最终组件产出 由于 rax 1.0 ts+hooks 开源版本还在开发中,所以仓库链接暂时就不放上了 rax-pui-filter-utils...console 处可见抛出查询参数 设计与思考 前端组件架构图(初版) ? 组件架构图(终板) ?...而且,对于 rax 而言,不同容器滚动方式还不同(但是我们提供这样方法给你去调用) panel 面板里面数据请求、逻辑处理都是你自己业务逻辑。...formatNavConfig 方法,具体内容根据不同组件业务需求不同代码逻辑不同,这里就不展开说明了 NavBar 中还需要注意就是被动更新:Panel 层点击后,NavBar 上文字更新,因为这里我们利用父组件来进行

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TFS(Team Foundation Server)介绍和入门

在.NET平台上,大量支持工具可以非常好地独立工作,可是,为了使得各种工具之间都够互相协作,还是常常须要一些手动工作。...訪问工作项存储器 创建了团队项目后,开发小组须要做第一件事是分解已经创建初始工作项集。这些工作项帮助开发者完毕一系列能够使得软件项目成功開始活动,而且根据不同开发模型选择不同工作项。...通过展开团队项目节点,就能够看到工作项目录,继续展开然后打开查询目录可看到所有或部分工作项。 书写定制得工作项查询 最后须要书写一个新工作项查询列表。...新定义查询能够放在“团队查询”和“我查询”这两个目录不论什么一个。团队查询是一个可被项目小组中全部开发者訪问全局可訪问容器,我查询是一个由每一个程序开发员全部私有查询集。...,各项目採用不同配置管理工具、无统一规范,随着时间推移我们项目管理风险不断上升、项目实施难度不断添加�、项目实施质量难以掌控。

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试点项目背后支撑:农行研发中心 DevOps 工具链集成揭秘

1 背景介绍 DevOps 工程建设之初,需求、开发、测试、运维人员,使用不同工具来支撑日常工作,工具集成度不高,沟通成本和时间成本较高。...图3 TFS与自动化测试工具ATP集成设计流程图 TFS 调起 ATP 自动执行,TFS 向 ATP 发送信息后,ATP 自动筛选执行环境资源池后将该系统全量界面级案例和接口级案例分别建立批次运行,执行完成后向...图7 TFS与ACMS集成设计流程图 3.7 TFS 与 PaaS 集成设计 本次 PaaS 云上项目采取 TFS+PaaS(Jenkins)方式实现工具链贯通。...,形成研发闭环、自动化全流程,形成满足持续集成、持续交付、运营反馈工具链,有效支撑了我行研发项目 DevOps 持续交付能力成熟度测评,如下图所示为某项目的持续集、持续交付流水线、生成变更及部署流水线应用效果...图12 某项目生成变更及部署流水线示意图 5 总结与展望 截止目前,DevOps 工程流水线工具组已初步完成各工具链集成与数据交互,实现了研发、测试、运维工具链贯通,支撑了5个试点项目组 DevOps

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存储世界,不止如此 : EB级存储引擎背后技术

[1499223323558_7584_1499223324588.png] 作者简介: 邹方明(stephenzou), 专家工程师,架构平台部,存储业务中心副总监 编者按:2017年1月,架构平台部研发...TFS存储家族总存储量突破1EB,相当于1亿部蓝光高清视频数据总量,在这1EB数据中,图片数突破万亿,文件数超过5000亿,从2007年1PB到2012年100PB,每一个存储量级突破,都意味着不同挑战...而这些增长下,TFS1.0家族显得越来越跟不上时代发展,从而暴漏出了索引层成本高,功能不够丰富,数据层数据安全与成本之间矛盾。...3.1.2 索引存储引擎升级 我们使用了多年KV存储引擎,也遇到了新挑战,不支持范围查询接口。业务有相关需求时,需要通过大量数据组织逻辑,以构建出适用数据模型。...在文件存储平台上,在TFS家族中推出了一系列针对不同用户场景使用分支存储系统,包括适应腾讯视频等高频存储业务使用多副本存储引擎,适应QQ离线传文件等临时存储业务使用即删即用存储引擎,等等。

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初学者不会写接口怎么办?微软Visual Studio 2022无脑式API接口创建——Swagger一键导入APIKit快速测试

ASP.NET Core项目 具体项目创建 编辑项目名称与项目位置 创建配置 创建API控制器 修改路由配置 配置跨域 准备创建接口 创建【RESTful风格】API接口 完整接口代码(复制就能用)...社区版是免费。 主页链接:【Visual Studio 2022 IDE - 适用于软件开发人员编程工具】 主要面向学生、开源软件开发者等个人,我们大学生肯定是免费使用。...社区版本具体说明 社区版本在测试过程中 社区版不支持TFS。但你可以另外搭建TFS服务,只是个人开发不需要这个东西。 社区版有单元测试。没有性能测试,没有负载测试,没有性能分析。...Core项目 具体项目创建 这里可以在筛选中依次选择【C#】=>【Windows】=>【Web】,在列表中选择【ASP.NET Core Web API】来快速创建接口 编辑项目名称与项目位置...打开EolinkAPIkit,引入swagger.json文件 导入需要一点时间 执行完毕后就会看到【导入成功】,正在写入项目,所以任务显示【进行中】。

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迁移TFS,批量将文档导入SharePoint 2013 文档库

一、需求分析 公司需要将存在于旧系统(TFS)所有的文档迁移至新系统(SharePoint 2013)。现已经将50G以上文档拷贝到SharePoint 2013 Server上。...除此之外,这些存在于TFS文档,名称也是"不规则",即包含了SharePoint 2013文档命名不支持字符如"&", "\"", "?"...了解了文档内容和命名规则后,接下来就是分析怎样导入至SharePoint文档库中: 首先,每一个二级文件夹命名是有规则,正好是项目编号(Project Number),如GCP-xxxx-xxx-xxx...对应创建规则存在于如下List中 ? 其中Project Number即项目编号,与TFS中文件夹名称一致。...List.xls //分割字符串,得到父子FolderUrl,在文档库中创建文件夹 foreach (string strUrl in

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【52ABP实战教程】0.1-- Devops如何用VSTS持续集成到Github仓库!

TFS是微软推出一款ALM(Application Lifecycle Management)软件生命周期管理工具。...VSTS(Visual Studio Team System)是基于SaaS(多租户)化TFS云产品。 听了之后是不是感觉很强大。...在11月2日微软科技大会上,微软研发部门全球副总裁潘正磊女士宣布了微软研发云VSTS将于2017年底前落地中国香港。然后在10号时候VSTS老大布雷恩就宣布开通了VSTS在中国香港节点。...链接地址:https://github.com/ltm0203/aspnetcore 我们在VSTS中为项目创建一个自定义通知消息,方法是利用VSTS构建生成URL,利用markdown语法来完成...然后将vsts中生成徽章标记链接,粘贴到README.md文件中即可。

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个人永久性免费-Excel催化剂功能第67波-父子结构表转换添加辅助信息之子父关系篇

用人工方式来少量解读这样父子层级关系,还算可行,如大批量地处理,这种结构将很难进行分析利用,需要展开更多额外信息附加到其他列中供筛选查询等调用。如下图所示。...更丰富信息父子结构表 配合Excel自身字体颜色、字号、筛选排序等操作,在上图信息中,已经极大丰富了对父子表所要读取查询信息。...例如,想查询A006下属所有公司,仅需要关系链列筛选包含A006字样即可。 筛选A006及其下属公司结构 同时还可以只查询最底层叶子结构记录数,使用【是否叶子级】列来筛选即可完成。...同时【组序号】列更可以查看不同树下组织结构图(一个顶级结构为一棵树,如下图,示例数据为2棵树,两组父子关系) 列表中出现两组数据,两棵父子关系树 具体操作 以上示范最终效果,经过【Excel催化剂...此篇父子结构转换,实属惊艳之作。 预告 此篇父子结构,数据源为子父关系,下篇再来一个父子关系,应用场景也是十分广阔,特别是制造业中物料管理BOM物料分解,敬请期待。

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伸手党福利 - 直击TFS技术内幕

等公司重要产品数据存储,截止到2017年年初,TFS承载数据突破1EB。...读访问时,通过索引查询判断是大记录、桶记录,通过相应索引从磁盘读取数据,大记录直接返回,桶记录则需要遍历查询获得对应小记录、或确认遍历不到空记录。...四、TFS数据存储 在丰富业务场景驱动下,TFS数据存储也发展出来不同差异。...在TFS数据存储系统中,将文件切分分块数据block存储在存储节点chxd;存储节点上以2GB空间聚集多个分块数据、把2GB空间称为chunk;将分布在不同存储节点上一个或者多个chunk组合成数据多副本或者纠删码条带...4.1 基于存储单元结对Append-Only存储引擎 在众多同构存储节点,不同副本分布设计和存储引擎将是直接影响数据存储系统性能。

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DevOps工具介绍连载(31)——Microsoft Team Foundation Server(TFS

TFS简介 Team Foundation Server(TFS)是一种为 Microsoft 产品提供 源代码管理、数据收集、报告和项目跟踪,而为协作软件开发项目。...它是Microsoft应用程序生命周期管理(ALM)工具核心协作平台,简单说它是管理和开发软件项目的整个生命周期平台工具。 初始配置 ?...工作项 通过工作项给大家布置工作内容,后期可以通过工作项查询方式得知对代码做了什么修改以及为什么这么做。...冲突解决 在签入或者获新时候,往往会产生冲突,冲突产生在于不同代码签入者对代码同一处代码做了修改,此时TFS不知道要选择哪一处修改,所以需要将冲突展示出来让用户去选择。...变更集 在签入挂起更改时,将创建一个变更集来存储一些相关信息,其中包括:文件和文件夹修订、指向相关工作项链接、签入说明、注释、策略遵从性以及签入所有者名称和日期/时间等系统元数据。

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vs2008连接tfs2013_VS连接SQL网页登录

如果你TFS服务器名字是tfs2,使用默认虚拟目录:tfs。端口默认是8080。 TFS 2010下可以管理很多个collection,默认名字是defaultcollection。...问题2: 问题描述: 同样Server Name,提示不同错误:TF31002: Unable to connect to this Team Foundation Server:http://...值名字就是Team Explorer 2008将要显示名字,值就是你TFS服务URL地址,这个地址应该类似于“http://serverName:8080/tfs/collectionName”。...估计原因及解决方案: 使用VS2008 Team Explorer无法新建TFS2010项目,如果需要新建项目需要升级到VS2010项目使用VS2010 Team Explorer 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献...发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/190212.html原文链接:https://javaforall.cn

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【收藏】23个circRNA数据库网址

Cell Death and Disease, 数据库主要通过文献检索circRNA和disease所有相关研究结果而搭建构成,收集日期截止于2017年11月份,一共收集了354项研究分析结果...,环状RNA在患病者中表达趋势,相关文献pubmed id等信息,主要用于检索环状RNA和疾病之间关系,circR2Disease还可以构建环状RNA和疾病之间互作网络 10....用户可以搜索和浏览circRNAsTFBSs,以及其他相关信息,针对特定TFs、细胞系或感兴趣circRNAs。...该网站主界面清晰,设计人性化,在Advance Retrieval可以根据基因名称(Gene symbol),PubMed ID及细胞或组织类型等多种检索条件,满足不同查询需求 21. exoRBase...在这个数据库里面可以查询到某个 circRNA 在不同癌症临床样本表达情况。mionocirc是第一个广泛临床,以癌症为中心circRNAs资源。

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