需求描述 已经有了100个物种进化树文件，我想从这个树文件里挑选出10个我感兴趣的物种的进化关系。...treeio这个R语言包里有一个函数drop.tip()可以实现，但是他不是直接挑选出来感兴趣的，而是去掉不感兴趣的。...image.png 将结果保存到树文件中 treeio::write.nexus(tree_reduced,file="../..
注意，图中的 5123 80 代表将宿主机的 5123 端口请求转发到虚拟机中的 80 端口。 Vagrant：虚拟机管理工具，通过它，我们可以使用文本来定义、管理虚拟机。...启动目标机器，用于部署 Nginx 在命令行中执行以下命令： vagrant up 注意，Vagrantfile 文件中的 config.vm.box 值必须改成你的 vagrant box 。...配置流水线 配置 Jenkins 任务从远程仓库拉取 Jenkinsfile，如下图所示： ? 除此之外，不需要其它配置了，是不是很简单？ 4. 手工触发一次自动化构建 点击“立即构建”： ?...deploy/playbook.yaml" } }}} environment 部分：用于定义流水线执行过程中的环境变量。...= -1){ var link = document.createElement('link'); var head = document.getElementsByTagName('head')[0]
我们使用Ansible实现自动化。想简单了解Anbible，可以看看简单易懂Ansible系列 —— 解决了什么。...Vagrant只不过是自动化了这个过程。Vagrant会基于一个称为Vagrantfile的文件来创建机器。...Vagrantfile部分内容如下（想看全文件点这）： Vagrant.configure(2) do |config| ANSIBLE_RAW_SSH_ARGS = [] VAGRANT_VM_PROVIDER...imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 安装hubot-rocketchat adapter 启动时需要指定这几个环境变量以便Hubot...在Jenkins中安装Jenkins插件rocketchatnotifier 在系统设置中，设置rocketchatnotifier参数： [image.png] 在构建job中设置post build
SSH连接远程服务器 基本的Bash命令 文件权限及处理 环境变量相关 简单的编写shell脚本 你还需要一台服务器，如果没有可以在本地新建虚拟机，我建议搭建至少两台，以便了解的Ansible的批处理能力...搭建虚拟机非常简单，你可以搜一下VirtualBox和Vagrant。...Ansible自带很多模块，基于模块工作 Ansible将部署逻辑放在一个称为"playbook”的YAML文件中。通常，文件名是playbook.yml。...组织受控机器的逻辑被放在inventory文件中。它是ini格式的，默认文件名为hosts。 这两个文件构成了Ansible自动化部署的基础。...只要运行ansible-playbook --inventory hosts --user vagrant --ask pass playbook.ymI命令，输入SSH登录时用户vagrant的密码，
从字面上来看，provision是准备，实现的功能是在原生镜像的基础上，进行一些附加的操作，以改变虚拟机的环境，比如安装应用，发布程序等。...2.3 环境变量 为命令行指定环境变量，env的格式为hash，是一个hash对象的列表，多个环境变量，多次配置env。...Tips: env新增的环境变量，是顺序执行赋值操作的，实例中JAVA_HOME，系统中原来是没有的，如果JAVA_HOME和PATH这两个参数顺序换一下，把JAVA_HOME放在后面，PATH在拼接JAVA_HOME...5.1 集群管理，自动化配置等系统 ansible,cfengine,Chef,puppet 每一套系统都可以写本书了，所以这里不详细说明。...简单来说 Ansible 是一个极简化的应用和系统部署工具，类似 Puppet、Chef、SaltStack。
本文采用vagrant软件基于VirtualBox的虚拟机进行自动化管理，先要安装VirtualBox和vagrant两个软件。...vagrant: 流浪 stray, wandering, wanderings, vagrant, vagabonds, strayed 配置环境 创建工作目录 $ mkdir -p ~/ansible...=vagrant ansible_ssh_private_key_file=~/.vagrant.d/insecure_private_key $ cat Vagrantfile 输出： # -*- mode...received, 0% packet loss, time 0ms rtt min/avg/max/mdev = 3.116/3.116/3.116/0.000 ms 因为以测试都是以hosts文件中的...ansible multi -s -a "tail /var/log/messages" #或 ansible multi -s -m shell -a "tail /var/log/messages
然后使用命令, 命名为vagrant的box： vagrant box add centos/7 CentOS-7-x86_64-Vagrant-2004_01.VirtualBox.box cat <...-d "/var/log/journal" ]; then mkdir /var/log/journal fi if [ !...之后安装，否则会出错： pip uninstall urllib3 pip uninstall chardet pip install requests (这些命令应该都已经在 setup.sh 中执行过了...doc/rpm-package-key.gpg repo_gpgcheck: yes gpgcheck: yes when: k8s_package_version is defined playbook中安装这些需要访问海外网站...，可以从国内下载，然后改个tag： k8s.gcr.io/kube-apiserver:v1.14.8 k8s.gcr.io/kube-controller-manager:v1.14.8 k8s.gcr.io
这是一个关于Vagrant的学习系列，包含如下文章： Vagrant入门 创建自己的Vagrant box 用Vagrant搭建Jenkins构建环境 用Vagrant和Ansible搭建持续交付平台...在config.vm.provision配置项中，我们指定了所使用的Ansible配置文件ansible/playbook.xml，该文件将同时用于Go Server和Go Agent的provision...事实上，Vagrant会基于Vangrantfile自动为我们生成Ansible的inventory文件，并放在与Vgrantfile文件同级的.vagrant/provisioners/ansible.../inventory/vagrant_ansible_inventory文件中。...ansible_ssh_port=2200 ansible_ssh_user='vagrant' ansible_ssh_private_key_file='/Users/yteng/github/vagrant
使用环境变量是配置 Node.js 程序的好方法。而且许多包或模块可以基于不同的 NODE_ENV 变量的值表现出不同的行为。 存储环境变量的一种方法是将它们放在 .env 文件中。...这些文件允许你指定各种环境变量及其相应的值。 在大多数情况下，你不希望将 .env 文件添加到源代码控制中（即Git）。...因此，应该将它的文件名添加到 .gitignore 文件中，以确保在以后的提交中都被排除在外。...process.env 现在具有在 .env 文件中定义的键和值。...感谢阅读，请在下面的评论中告诉我你的想法。
inventory (INI格式)示例 我们在 ansible自动化运维工具环境准备 这一篇文章中，已经把node1、node2、node3 绑定到了/etc/hosts里面如下。...ansible_ssh_pass=vagrant node2 ansible_connection=ssh ansible_user=vagrant ansible_ssh_pass=vagrant...node3 ansible_connection=ssh ansible_user=vagrant ansible_ssh_pass=vagrant 使用 ping命令检查服务器存活 对ansible...=ssh ansible_user=vagrant ansible_ssh_pass=vagrant node2 ansible_connection=ssh ansible_user=vagrant...其实ansible自动化运维工具环境准备 这一篇文章中，我们已经通过脚本实现了免密登陆，这里我再单独拿出来做个简单的演示。
InfluxDB中；时序分析监控工具Grafana负责从InfluxDB中读取并展示指标数据，设定阈值，配置预警。...通过Ansible URI与网页服务交互。从监控对象服务器中提取的所有指标均存储在监控数据库中。 接下来创建Grafana数据源，对接数据库InfluxDB，读取全部指标数据。...例如，根据主机名称（ansible_hostname）可以判断指标从哪个服务器上采集的。...四、在监控服务中接入服务器 执行vagrant up monitor命令，启动监控服务器。 然后在浏览器中输入http://192.168.33.10:3000，访问Grafana。...启动server1，执行vagrant up server1命令，继续执行ansible-playbookplaybook-add-server.yml -u vagrant -k -i hosts命令
你可以在任何时候向Vagrant中添加新的box以备后用，在执行vagrant up时，Vagrant首先检查本地是有存在所需要的box，如果有则直接使用，如果没有则下载。...the Vagrant Host # config.vm.provision "ansible" do |ansible| ansible.playbook = "playbook.yml..." end end 在使用第（2）种方法时，Vagrant会首先检查box中是否已经安装了Ansible，如果没有，则会自动安装到虚拟机上，然后再运行provision： Vagrant.configure...("2") do |config| # Run Ansible from the Vagrant VM config.vm.provision "ansible_local" do |ansible...在使用public network时，虚拟机和Host在网络中具有同等的地位（共同使用Host机的物理网卡与外界通信），就相当于在Host所在网络中又多了一台计算机一样，此时虚拟机可以使用网络中的DHCP
, 带去了 Lucene, 抽出底层的存储和计算, 变为子项目 Hadoop 从 2006 年开始, Yahoo!...什么是 Vagrant 从现在就开始要搭建一个测试集群了, 回顾前面的课程, 先来说说虚拟机的痛点 安装麻烦 建立虚拟机的时候, 我的网段好像写错了, 和别人的 IP 不一样, 总是操作失误 虚拟机弄好以后...中的总控, 根配置文件比如说这次运行 Ansible 的最终任务是搭建好一个 CM 集群, 那我们应该就有一个 Playbook 叫做 cm_playbook.yml Roles Ansible 任务中的角色例如为了完成...使用 Vagrant 整合 Ansible Ansible 是一个非常知名的自动化运维工具, 不仅仅只是为了搭建测试环境, 在测试环境和正式环境中, 其应用都很广泛, 先来看看在正式环境中该如何使用 Ansible...在 13 台机器中, 选择一台作为主控 在主控机器中放入 Ansible 脚本 执行命令运行 Ansible, Ansible 会在 Playbook 中标示的机器上运行 ansible-playbook
原因：2017年4月14日 星期五 尝试搭建Ceph环境 说明：尝试Vagrant、Ansible、SaltStack自动部署Ceph或DockerCeph 简介 测试环境为macOS Sierra 10.12.4...Ansible、Vagrant部署Ceph，部署较为复杂，部署到虚拟机中，接近真实环境，部署难度较为复杂。 虚拟机直接部署Ceph：部署很复杂，维护困难，但是极接近生产环境。...在了解到Ansible是python项目后，第一时间使用virtualenv+virtualenvwrapper进行开发，这样不会影响到机器中的其他环境。...---- 参考 Ansible官网 Ansible中文权威指南 ---- SaltStack自动安装 Ceph-Salt，从github的ceph-salt项目后： cd ceph-salt/vagrant...vagrant up vagrant会bootstrap自动安装3个节点，master、node01、node02，安装如下： this may take a long long while.
而Ansible在执行任务之前都会收集当前的系统和环境信息作为上下文环境（这在Ansible中称为Facts） 设计原则 有非常简单的设置过程和最小的学习曲线。 可以快速和并行地管理机器。...在我的例子中，我用Vagrant创建了两个虚拟机。我将在第一台机器上安装Ansible，而在第二个有我应用的一些配置。 多机的配置来自我以前的文章。...在master上，使用以下命令安装Ansible： $ vagrant ssh master 如果要求输入密码，请输入vagrant。...和安装Ansible的命令（当然你也可以配置在脚本中，在Vagrantfile中调用执行）： sudo apt-get install software-properties-common sudo apt-add-repository...这个例子中虽然Ansible仅安装在一台机器上（ansible不安装在master而是安装在你的电脑上也可以），但可以在其他机器上执行命令来安装工具或操作（比如说对playbooks进行版本控制）。
结合从他人得到的意见，我认为 Puppet 及 Chef 在配置和运行方面过于复杂。由于我是Python粉，所以我时常关注 Ansible 及 Salt 。...这使得我们可以精准控制多台机器，比如在升级一个应用程序之前把机器从负载均衡器中剔除出去。 Salt有两种模块：执行模块 和 状态模块 。...Vagrant支持 当讨论测试时，DevOps人喜欢Vagrant。直到现在我还没用过它。Vagrant可以使用Slat和Ansible提供的模块来初始化机器。...你可以使用 Overstate 在集群中以特定顺序设置多种角色来实现基础编排。 Ansible比Salt在编排方面更好，因为它简单。Salt将来会更好，因为在集群变化中它更具持续反应性。...学习曲线 Ansible这方面更好。Ansible更容易学习及提高。因为我们只需拷贝一份Ansible GIT代码库，然后设置一些环境变量就可以执行playbook了。
例如，Ops可以在多节点集群环境中重现问题，测试者可以部署多个版本的应用程序来执行测试用例和验证更改。这些优势使团队能够更快地解决问题，从而提高敏捷性。 为什么使用Vagrant和Ansible？...Ansible安装在你的机器上。有关特定平台的安装，请参阅Ansible安装指南。...N的值表示集群中存在的节点数，可以相应地进行修改。在下面的示例中，我们将N的值设置为2。...在kubernetes-setup目录中创建两个名为master-playbook.yml和node-playbook.yml的文件。 在master-playbook.yml文件中，添加以下代码。...在kubernetes-setup目录中创建名为node-playbook.yml的文件。 将以下代码添加到node-playbook.yml中 步骤3.1：开始添加步骤2.1到2.3的代码。
它们可以描述您希望远程系统执行的策略，也可以描述一般IT过程中的一系列步骤。 基本上，可以使用Playbooks来管理远程机器的配置和部署。...在我的例子中，我设置了两个带有Vagrant（一个基于Ruby的工具，用于创建和部署虚拟化开发环境）的虚拟机。对于第一个，我已经安装了Ansible，而第二个中，我进行了一些配置。...像我以前的文章中那样配置多机系统。...： #vagrant ssh machine1 如果要求输入密码，请输入“vagrant”。...为检查一切是否正常，运行以下命令： ansible all -m ping -s -k -u vagrant 输出应该是： machine2 | SUCCESS => { "changed
、mac OS平台，并且支持virtualBox、VMware、AWS、Hyper-v或其他自定义的服务上提供服务，在编排中支持的shell、chef、puppet、ansible等，可以应用在整个DevOps...Vagrant的help中，对命令的解释已经很详细了，就不做过多解释了，如果不太明白，可以官网文档中看下，很详细 ?...因为镜像文件还挺大的，C盘资源稀缺，所以最好通过设置环境变量VAGRANT_HOME来将该目录改到其他存储位置，设置环境变量如下 ?...注释：.vagrant.d这个目录不是必须这么命名，这里是为了统一 设置好位置后，开始下载镜像，玩过docker都知道，docker run的时候，会先本地查找镜像是否存在，如果不存在，就会从远程仓库下载对应的镜像...，Vagrant一样的，当box不存在时，会先从网上下载，缓存到上面设置的家目录中 ?
使用一个服务管理工具是很方便的，在接下来的实例中我们采用supervisor作为服务管理工具。...因此，我直接用第一节中的vagrant创建的ubuntu/trusty64(14.04的64位版本)做测试，需要安装的环境包括docker.io, python-dev, ansible。...另外我这里没有用书中自带代码中的作者自己写的docker模块，而是用的ansible自带的docker模块，有些语法点有所不同，我已经做了修改适配。...另外要注意的是，docker模块在ansible新版本中已经不推荐使用了，取而代之的是docker_container， docker_image模块。...其中dockerfiles中的是Dockerfile，包括四个目录，用来创建镜像文件，启动容器在playbook中执行。
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