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读取文件大坑(pythonscanpy库)

基于《pythonscanpy库读取几种常见格式单细胞数据文件汇总》文章,不知道有没有细心小伙伴发现,使用scanpy读取单细胞数据txt文件或者其他格式文件,得到AnnData数据对象有点奇怪...使用scanpyread_text()进行读取txt文件,要注意了哦!...注意:如果你使用scanpy其他读取文件函数进行读取不同格式文件,一定要小心了哦,一定要查看读取后Anndataobs是不是存储细胞信息,var是不是存储基因信息!..."填坑" 如果你也使用scanpyread_text()这个函数来读取txt文件,或使用scanpy别的读文件函数读取别的格式文件读取AnnData也出现上述这种情况,别慌!...可以看出var存储都是基因信息 哈哈,我们通过"补救措施"把它变成了一个正常AnnData数据对象了。 如果你使用scanpy文件函数要注意哦,一定要先查看obs和var存储是什么!

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List.add 方法添加元素只会添加最后一条元素问题与解决

List.add 方法添加元素只会添加最后一条元素分析解决 前言 一、问题描述 二、原因分析 1.简化分析 2.回归本题 总结 ---- 前言 之前编写业务代码, 遇到了一个比较神奇现象,...如标题中描述那样: 在对list 集合使用 add/set 方法并且遍历添加对象, 只会添加最后一个元素问题 ...., 而且遍历几遍就有几条相同元素 对上述代码进行断点调试 由我们对每次循环对象属性和 userList 中属性对比可知: 每次循环结束后, userList 中所有的数据都会变成最后一次遍历数据...List 中 add, set 方法添加对象(Object) 或者是集合(Collection), 添加是对对象引用 2....循环外声明对象或集合, 循环内使用list.add 就会导致list 中引用数据地址全部都是最后一次添加元素地址 如果想要避免.

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解决Python导入文件FileNotFoundError问题

文件名称为 temp.py 要导入文件temp.py同级目录images文件夹下那么应该保证要导入文件 imagesmodel_mnist.png 要跟前面的temp文件同一目录(不满足...,也就是你访问了不存在文件,但其实你访问文件如果不存在,切访问用是w方法法,是会新建文档,所以问题主要是,没有这个文件夹,新建即可。...详细解释 python,os库对于文件读写,是有要求。...由于你文件打开方式是’w’,也就是文件不存在就创建文件,所以那个pkl文件(我指的是相对路径中pkl)不存在会自动创建,这不是问题,问题就在于那个相对路径,就是那个path是否存在,这个文件夹不存在一样会出问题...以上这篇解决Python导入文件FileNotFoundError问题就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考。

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详解Pandas读取csv文件2个有趣参数设置

导读 Pandas可能是广大Python数据分析师最为常用库了,其提供了从数据读取、数据预处理到数据分析以及数据可视化全流程操作。...其中,在数据读取阶段,应用pd.read_csv读取csv文件是常用文件存储格式之一。今天,本文就来分享关于pandas读取csv文件2个非常有趣且有用参数。 ?...01 sep设置None触发自动解析 既然是csv文件(Comma-Separated Values),所以read_csv默认sep是",",然而对于那些不是","分隔符文件,该默认参数下显然是不能正确解析...02 parse_dates实现日期多列拼接 完成csv文件正确解析基础上,下面通过parse_dates参数实现日期列拼接。首先仍然是查看API文档中关于该参数注解: ?...; 传入嵌套列表,并尝试将每个子列表中所有列拼接后解析为日期格式; 出啊如字典,其中key为解析后新列名,value为原文件待解析列索引列表,例如示例中{'foo': [1, 3]}即是用于将原文件

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Django添加bootstrap框架无法加载静态文件解决方式

开始setting.py中设置如下; ? html文件写法如下: ? 这样设置一直无法加载静态文件,只需要修改setting.py文件如下: ? 就可以加载到静态文件了。...,’static’) 6.项目下总urls.py(不是appurls.py)中: #项目上线后,需要自己配置static静态文件路径 url(r’^static/(?...(及上debug=False,生产环境配置需设置好才有效) 2.项目下总urls.py(不是appurls.py)中,urlpatterns下面添加: from XMJonline.settings...response = render_to_response('500.html',{}) response.status_code = 500 return response 4.项目的templates文件添加自己想要...7.成功跳转到自己配置500页面。 以上这篇Django添加bootstrap框架无法加载静态文件解决方式就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考。

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genome browser中添加自己注释文件

不过有时候我们需要用自己注释文件,主要有两种方式可以实现:add custom track或者将GTF文件转为bigBed文件写到trackDb.txt中。...1. add custom track track hubs页面的最下面选择add custom track: ? 以下界面填写url或者直接上传文件: ?...然后如下界面点击go就可以了: ? 这样方便快捷,但是有个很大弊端,就是这样自己看可以,但是当我们把链接(http://genome-asia.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?...所以我们custom track中添加GTF也就不会被别人看到。 我们可以将GTF 转为bigBed写在hub.txt中,这样就可以被别人看到了。 2....(但是如果将同样文件医add custom track情况加入的话则可以) ?

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链表----链表中添加元素详解--使用链表虚拟头结点

在上一小节中关于链表中头部添加元素与在其他位置添加元素逻辑上有所差别,这是由于我们在给链表添加元素需要找到待添加元素位置前一个元素所在位置,但对于链表头来说,没有前置节点,因此逻辑上就特殊一些...size = 0; } (3)改进之前add(int index,E e)方法,之前对头结点添加元素单独做了处理(if-else判断),如下: 1 //链表index(0--based...//链表index(0--based)位置添加元素e (实际不常用,练习用) public void add(int index, E e) { if (index...new Node(e, prev.next); size++; } (4)改进addFirst()方法,该方法依托于add(int index,E e)方法 //链表头添加元素...e 80 public void addFirst(E e) { 81 add(0, e); 82 } 83 84 //链表末尾添加元素 85 public

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Roslyn 分析语法树添加条件编译符号支持

我们代码中会写 #if DEBUG 或者 [Conditional("DEBUG")] 来使用已经定义好条件编译符号。...而定义条件编译符号可以代码中使用 #define WALTERLV 来实现,也可以通过项目属性中设置条件编译符号(Conditional Compilation Symbols)来实现。...然而如果我们没有做任何特殊处理,那么使用 Roslyn 分析使用了条件编译符号源码,就会无法识别这些源码。...我们使用 Roslyn 分析语法树,会创建语法树一个实例。如果使用默认构造函数,那么就不会识别设置了条件编译符号语句,如下图: ?...而实际上构造函数参数中带有 preprocessorSymbols 参数,即预处理符号。传入此预处理符号情况下,Roslyn 就可以识别此符号了: ?

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Python中按路径读取数据文件几种方式

img 其中test_1是一个包,util.py里面想导入同一个包里面的read.py中read函数,那么代码可以写为: from .read import read def util():...img 现在,我们增加一个数据文件,data.txt,它内容如下图所示: ? img 并且想通过read.py去读取这个数据文件并打印出来。...img pkgutil是Python自带用于包管理相关操作库,pkgutil能根据包名找到包里面的数据文件,然后读取为bytes型数据。...如果数据文件内容是字符串,那么直接decode()以后就是正文内容了。 为什么pkgutil读取数据文件是bytes型内容而不直接是字符串类型?...所以使用pkgutil可以大大简化读取包里面的数据文件代码。

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Shell 命令行,svn add 需要添加很多文件简化脚本

Shell 命令行,svn add 需要添加很多文件简化脚本 我一直使用 git 版本管理工具,对于 svn 很不熟悉。现在接到一个项目是用 svn 进行管理。...我简单看了一下 svn 管理命令,就开始上手工作了。 结果发现,svn 貌似没有 git git add -A 这样添加所有未添加文件命令。 或许有,我没有更深研究,因为用过就不用了。...表示未添加文件 我们可以用 grep ? 过滤出来需要添加文件。 sed 可以过滤掉 ?...和 空格,只留下这些要上传文件路径 使用一个 for 循环,文件路径前面加上 svn add 就可以实现添加文件了。 整体代码非常短,也非常简单,但是避免了我一次次输入。...最后,我把这个代码写成全局命令,命名为 svnadd 就可以在任何地方使用了。 实现方式2 上面用了循环,其实,svn add 是可以接受多个文件参数,也就是可以通过命令,来添加所有的文件

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盘点一个文件读取utf-8错误解决办法

一、前言 前几天Python白银交流群有个叫【大侠】粉丝问了一个Python读取文件时候报错问题,这里拿出来给大家分享下,一起学习下。 二、解决过程 看上去代码有报错,截图如下。...这个错误倒是很常见,因为数据没有给utf-8编码,或者读取时候,没有指定utf-8编码,都会报类似的错。 上图是他代码,15行那里指定一下编码就可以了。 指定编码之后,就完美解决啦!...这篇文章主要分享了一个文本文件读取utf-8错误解决办法,针对该问题给出了具体解析和代码演示,帮助粉丝顺利解决了问题。 最后感谢粉丝【大侠】提问,感谢【dcpeng】给出具体解析和代码演示。

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你必须掌握Flutter中添加资源文件方法

Flutter 中,需要在根目录下 pubspec.yaml 文件中配置资源路径,资源才能被打包使用。现在,看看如何配置资源吧。 1....添加图片资源文件 1.1 添加本地图片资源 flutter: assets: // 表示引入根目录下 images 文件夹下所有资源文件 - images/ // 只添加...使用:Image.asset(“images/pic.png”) 1.2 添加依赖插件图片资源 1.添加依赖插件 pubspec.yaml 文件 dependencies 下添加依赖插件。...这种情况不能一次性注册一个文件图片了,只能一张图一张图添加。...2.添加字体资源 字体资源添加格式如下,同样是 pubspec.yaml中: flutter: fonts: // 一组字体名称 - family: Schyler fonts

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