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Neurology:早期、未用药帕金森病存在特异的白质连接

计算个体水平连通性分数 计算每个PD患者的组特异性WM解剖连接矩阵(A)内的积的和代表总连通性强度,作为被试连通性分数。并观察是否与病程与疾病严重程度存在相关。...计算平均rich-club 、feeder、local边强度,并进行组间比较,观察PD患者在rich-club组织结构是否存在改变,以及这些节点边强度是否与临床指标相关。...对于每一个连接计算测试数据,阈值为t=3.1,得到一组阈上连接,以显示显著差异(Pcorr连接强度(rich-club edges)及其输入的支线连接强度(feeder edge strength)(图5B)显著增强。...这表明,PD患者的运动受损或异常症状可能与rich-club的过强连接有关。同时,feeder edge强度与累积DaT分数存在显著正相关(图6)。 ?

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使用OpenCV+Python进行Canny边缘检测

尽管“强度梯度”这个名词可能听起来很复杂,但它只是指边缘的方向。一条边实际上可以指向任何方向,但该算法只查看四个方向以简化事情。方向是水平、垂直和两个对角线方向。...同样,非最大抑制这个名字听起来很复杂,实际上这是一个简单的操作。 我们通过检查每个像素在其梯度方向上的相邻像素来确定它是否具有最大强度,从而对每个像素应用非最大抑制。...接下来,我们将每个边缘的强度梯度与两个阈值进行比较,如果边缘的强度梯度大于最大阈值,则将其标记为强(或确定)边缘;相反,如果边缘的强度梯度小于最小阈值,则将其丢弃。...Canny 边缘算法使用假设来简化事情,它假设连接到强边的弱边本身就是强边,同样,未连接到强边缘的弱边缘是噪声或颜色变化。在阈值化的上下文中,这就是滞后的含义。...通过使用滞后边缘跟踪,我们可以看到 D 没有连接到任何通过绿色区域的线段,这意味着它没有连接到任何强边,因此它被丢弃。 这很好,但是算法如何准确地知道弱边是否连接到强边?

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    Codeforces Round #178 (Div. 2)

    每本书都有厚度t和宽度w,t只能为1或2,然后他想做一个书架,我们可以将一本书放在其他书的上面,如题目中的图,然后尽可能的使他们的总厚度最小,输出最小值。...这道题我不会做,感觉是dp,有点像01背包,和01背包不同的是它的厚度是随着放上面书的书面和宽度而变化的。感觉数据量也不大,我觉得可以用暴力来求解。看了别然的博客,发现此题用暴力会tle,我就不试了。...,可以删掉一条边再将这条边换个位置,要保证改变后仍然是树的形状,现在问你所有点对的距离之和最小是多少。...5000个点,马上想到n^2..然后就是暴力枚举去掉每条边 ,剩下的就是两棵树,然后重新连接一条边,稍微想一下,这条边肯定就是将两棵树的重心连起来,所以,接下来的事情就简单了。。。...比赛的时候看错了题,以为边可以修改很多次。。。然后各种YY,不够仔细啊。。。

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    图计算中的顶点和边是什么?请解释其概念和作用。

    图计算中的顶点和边是什么?请解释其概念和作用。 在图计算中,顶点(Vertex)和边(Edge)是构成图结构的两个基本元素。它们分别表示实体或对象和它们之间的关系或连接。...边(Edge): 概念:边是图中的连接,表示顶点之间的关系。边可以是有向的或无向的,有向边表示关系具有方向性,无向边表示关系没有方向性。...边的权重可以用于表示关系的强度或重要性。...每个顶点都有一个唯一的ID和一个字符串类型的属性,每条边都连接两个顶点并具有一个双精度类型的权重。最后,我们通过打印顶点属性和边权重来验证图的创建结果。...通过这个代码案例,我们可以清楚地看到顶点和边在图计算中的作用。顶点用于表示实体或对象,并存储其属性信息,而边用于表示实体之间的关系或连接,并可以具有权重来表示关系的强度。

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    阿尔茨海默病早期诊断的脑结构分级图 论文研读笔记

    使用intra-subject可变性的框架)到一个有效的脑结构分级图中 引言 对AD患者进行的神经影像学研究显示,当诊断确定时,大脑结构改变就已经是晚期的了。...他们中的一些人基于ROI在大规模分析中捕获脑结构的变化。大脑皮层和海马(HIPP)等特定结构的改变通常通过体积、形状或皮层厚度(CT)测量来捕捉。...基于斑块的评分(PBG)框架[3]被提出来以更好地分析inter-subject的相似性 还有一些提出捕捉受试者大脑结构改变的相关性的方法。...该方法结合了inter-subject模式相似性和intra-subject变异性,以更好地检测AD改变。...模式相似度采用基于patch的分级策略进行估计,而结构分级之间的主题内差异性基于图建模,实验显示了两种信息的互补性 总结 该方法提出了一个新的框架以提取MRI图像中的特征用以进行分类,并分别使用基于一个线性

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    eLIFE:脑电结合眼动研究:自闭症儿童社交脑网络的早期改变

    本结果提供了有力的证据表明:社交脑网络的定向功能连接改变是ASD大脑早期非典型发育的核心组成部分。 研究要点 新生儿容易被声音,面部表情和社交行为所吸引。...PDC是一种可以在同一模型中同时考虑所有信号,并在频域中估计大脑连接的多变量方法。它通过确定模型强度的多元自回归模型计算。 1)为每个参与者和每个数据片段计算wPDC,然后取平均值。...区域-区域定向功能连接 使用Granger因果模型,分别在theta六个节点中的每个节点以及alpha三个节点中的每个节点上计算了区域间功能连接的组间差异。...在theta频率,来自ASD儿童的六个ROI的所有连接都强于TD参与者中最强的关联。这表明ASD儿童中存在theta频段区域间强连接。图3中显示了theta频段上六个ROI的区域间定向功能连接。...在alpha频段中,区域-区域定向功能连接分析显示,与TD同龄人相比,ASD儿童从额中回右侧眶部和左侧楔骨出发的连接更强,而从右侧STG出发的连接较弱。

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    PNAS:青少年大脑功能连接的保守和破坏性模式变化

    2.2 连接强度的年龄相关变化 由一对区域fMRI时间序列之间的相关性定义的FC,或2个节点之间边的权值,一般为正。全球平均相关系数随着年龄的增加而减弱。...对于每个区域节点,我们通过平均其与所有其他区域之间的相关性来估计其连通性强度(或加权度)。我们还专门计算了皮层和皮层下节点集之间或皮层内的连接强度。...使用年龄相关变化的混合效应线性模型,我们估计了14岁时FC的基线强度,FC14,以及每个节点加权度随年龄变化的线性变化率ΔFC14-26(图1A)。我们还估计了每个边的FC的基线和年龄相关的变化。...与年龄相关的连通性强度的变化率在区域上也不均匀。在青春期,大多数区域的皮质-皮质连通性增强,以初级运动皮层和感觉皮层最为迅速。然而,与年龄相关的皮质-皮质下连接强度的变化具有不同的解剖分布。...FC的破坏性变化位于由记忆、心智化、还有社会处理任务。相反,FC的保守性改变位于被运动和感觉任务激活的皮层区域。 我们在每个皮质节点估计皮质厚度收缩。

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    BRAIN:X连锁肌张力障碍-帕金森综合症的基底节和小脑病理研究

    综上,本文对以肌张力障碍为主的XDP患者进行的皮层和皮层下灰质分析表明: (1)富含纹状小体的嘴侧纹状体所受影响最为显著; (2)皮层厚度仅在主要与纹状小体有结构连接的脑区变薄。...除了基底节及其对应的皮层区域,文章对小脑的灰质情况也进行了研究。以肌张力障碍为主的早期XDP中,小脑和丘脑间的连接显示出微观结构异常,这可能导致丘脑-皮层调节障碍进而导致肌张力障碍。...然后,图像调制,保留每个图像的灰质体素强度信息。最后用FWHM为8mm的平滑核进行平滑。 为了进行统计分析,文章建立了一个包含两个协变量(年龄和扫描机器)的广义线性模型(GLM)。...全脑分析结果同样发现了壳核、尾状核和苍白球的灰质体素强度显著下降,其他脑区无显著改变(图1B,表3)。...接着,作者对基于连接的纹状体分区的灰质体素强度进行组间比较。

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    BP:基于静息态功能连接生物标志物的四种阿尔茨海默病亚型

    图2A显示了每个子类型的RFN(即占功能连接集群前20%的功能连接),表示两个数据集中每个子类型的特定网络(也见图S3)。...此外, AD患者改变的连接强度(t值)显示显著相关性在MCADI和ADNI数据集(亚型2、3和4的皮尔逊相关系数分别为r = 0.71,0.67,0.84)(图2E),这一发现表明,结果是可重复的。...结果显示,如上所述(图2D),在亚型中可以识别出网络特异性的改变,并且在RFN中存在亚型特异性的改变。简而言之,与每个亚型相关的RFN的平均功能连接明显弱于与其他亚型相关的RFN。图2....图4A显示了平均灰度体积,说明亚型1在4个亚型中体积最大,但其他3种亚型的差异很小。图4B显示了皮质厚度比较,图4C显示了未校正的成对比较,以显示亚型之间的微小差异。...(B)通过将一种亚型与其他亚型(图中的“其他”)进行比较,以证明其亚型特异性的解剖特征。(C)左下区域为GMV的两对比较,右上区域为皮质厚度结果。4.

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    Gephi网络图极简教

    )来展示实体之间的关系,通过量化以节点和连接为组件的网络结构指数(Index),从而能够在统一的框架下寻找复杂系统的共性。...3.图的度量 节点数(Nodes):节点的个数。 边数(Edges):边或连接的个数。...平均度(Average degree):表示每个节点连接边的平均数,如果络图是无向图,平均度的计算为 2*edges/nodes。...Gephi 实现网络图绘制 1.Gephi 安装 下文Gephi官网安装(我略,你不能略) 2.数据处理 以CSV格式文件为例: 边文件((edge):前两列为节点ID,另一列为相关系数。...厚度:根据显示需要修改边线厚度,此处改为5。 重新调整权重:打勾,根据边线权重显示不同厚度。 另外的选项可根据需要自行调整。在之前的设置中也可以通过预览来查看效果,一步一步调整。

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    Micapipe:一个用于多模态神经成像和连接组分析的管道

    每一列代表不同的模态矩阵: (A)测地线距离、(B)结构连接、(C)功能连接和(D)微观结构轮廓协方差。对角线显示了通过测量绘制在每个数据集表面上的平均值。...我们的评估集中在区域间矩阵边的一致性,第一个特征向量(梯度),以及三个广泛使用的图理论测量(节点强度、特征路径长度、聚类系数),为多达四种矩阵模式(即测地线距离、功能连接、结构连接、微观结构协方差)。...值得注意的是,该实现不仅计算共享直接连接的顶点之间的距离,而且还计算按顺序共享一条边的三角形对之间的距离,从而减轻了网格配置对计算距离的影响。顶点GD值平均,以提高计算性能。...最初的fMRI处理步骤包括去除前五个卷体,以确保磁场饱和度,图像重定向(LPI),以及运动和失真校正。...对于MPC、FC和GD,矩阵按行设置阈值,以保留前20%的边缘。对SC矩阵进行对数变换,以减少连接强度的方差,但不设置阈值。

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    Neurology:颞叶癫痫:海马病理学基础与脑网络连接组拓扑结构和可控性的联系

    同样,仅在TLE-HS中,网络可控性较低,说明功能动力学的范围受限。海马成像标志物与大尺度网络改变相关,尤其是同侧CA1-3区。对多个网络的系统评估结果显示海马回路的变化最大。...经校正皮质厚度后,结果一致,表明结果与灰质体积萎缩无关。 结论 TLE中海马硬化程度与连接组拓扑结构重塑和结构控制的功能动力学相关,癫痫伴胶质细胞增生的改变可忽略不计。...基于这些流线,对每个区域间配对的受试者平均FA进行测量,并将数据存储在全脑连接矩阵中。连通性强度由FA值来量化,而不是基于流线的数量,因此没有控制2个给定ROI之间的距离。...与新皮层形态的关系 基于表面的皮层厚度分析显示,与健康对照相比,额中央区,眶额叶和颞叶中央区域的TLE-HS和TLE-G均出现明显萎缩(图4A)。...图显示p FDR 的校正结果(黑色轮廓)叠加在Cohen d效果尺寸图上(以d > 0.2为阈值,半透明)。TLE-HS中的效应量较大,但经过多次比较校正后,患者亚组间无显著差异。

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    Diabetes:糖尿病周围神经病变患者的初级躯体感觉皮层的结构及功能异常

    每个被试的fMRI图像采集超过7个block,使用经典的block设计包含基线与刺激,改变7次。...每一个Block包含一个30s热刺激时期,刺激强度根据被试不同(作者在进行fMRI实验之前,对每个被试都进行了基于个体差异的热痛容忍度测试,是不是处处见细节!)...、表面形变,以最大强度转换处作为组织过渡的边界来定义灰白质/灰质脑脊液边界。...从整个3D MR体积在分割与形变过程得到的强度及连续性信息创建基于皮层表面图谱,通过计算灰质白质边界以及灰质脑脊液边界每个皮层顶点(vertex)间的最短距离测量皮层厚度。...箱图显示蓝圈内激活信号强度变化百分数的中值、四分位数间距、最小值和最大值。疼痛型DSP无感知型显示足部侧缘向脸部/唇部移动。采用Mann–Whitney U 检验(双边,p<0.05)。 ? 图4.

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    【python-opencv】canny边缘检测

    Canny Edge Detection是一种流行的边缘检测算法。它由John F. Canny发明,这是一个多阶段算法,我们将经历每个阶段。...2、查找图像的强度梯度 然后使用Sobel核在水平和垂直方向上对平滑的图像进行滤波,以在水平方向(Gx)和垂直方向(Gy)上获得一阶导数。从这两张图片中,我们可以找到每个像素的边缘渐变和方向。...将其舍入为代表垂直,水平和两个对角线方向的四个角度之一。 3、非极大值抑制 在获得梯度大小和方向后,将对图像进行全面扫描,以去除可能不构成边缘的所有不需要的像素。...强度梯度大于maxVal的任何边缘必定是边缘,而小于minVal的那些边缘必定是非边缘,因此将其丢弃。介于这两个阈值之间的对象根据其连通性被分类为边缘或非边缘。...尽管边C低于maxVal,但它连接到边A,因此也被视为有效边,我们得到了完整的曲线。但是边缘B尽管在minVal之上并且与边缘C处于同一区域,但是它没有连接到任何“确保边缘”,因此被丢弃。

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    Python - 使用 Matplotlib 可视化在 NetworkX 中生成的图形

    然后,使用“networkx”库中的“Graph()”子例程创建一个空白的图形变量“G”。 为了定义图表的布局,通过“add_edge()”函数放置两条连接线。...添加节点后,我们将开发边来连接节点。为了在节点之间添加边,我们利用 add_edge() 函数。例如,节点 1 和节点 2 通过四加权边连接。 要查看图表,我们必须首先定位节点。...此外,我们还使用 draw_networkx_edge_labels() 函数包含边缘权重。此函数将边权重添加为相应边附近的标签。 最后,我们使用 plt.show() 显示图形图。...此函数生成一个简单的路径图,其中包含 5 个以线性方式连接的节点。 为了组织可视化,我们使用 Matplotlib 的 subplots() 方法来构建子图。...这有助于我们将绘图区域划分为多个部分以显示不同的图形。 现在,是时候在第一个子图上绘制原始图形了。我们使用索引 0 访问第一个子图,并使用 set_title() 函数设置其标题。

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    60种常用可视化图表的使用场景——(上)

    60种常用可视化图表的使用场景——(下):http://t.csdnimg.cn/BCMdb 1、点阵图 点阵图表 (Dot Matrix Chart) 以点为单位显示离散数据,每种颜色的点表示一个特定类别...但缺点是:不能如其他双轴图表般清楚显示节点之间的结构和连接,而且过多连接也会使图表难于阅读。 推荐的制作工具有:Protovis (编程语言)、D3 (编程语言)。...网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接,而定向网络图则可显示连接是单向还是双向(通过小箭头)。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...每个线集对应于一个维度/数据集,其数值/类别由该线集内的不同线段所表示。每条线的宽度和流程路径,均由类别总数的比例份数所决定。每条流程路径都可以用不同颜色代表,以显示和比较不同类别之间的分布。

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    可视化图表样式使用大全

    网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接,而定向网络图则可显示连接是单向还是双向(通过小箭头)。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...连接地图非常适合用来显示地理连接和关系,也可以通过研究连接地图上的连接分布或集中程度来显示空间格局。...节点围绕着圆周分布,点与点之间以弧线或贝塞尔曲线彼此连接以显示当中关系,然后通过每个圆弧的大小比例再给每个连接分配数值。此外,也可以用颜色将数据分成不同类别,有助于进行比较和区分。...我们也把日历当作可视化工具,适用于显示不同时间段的活动事件的组织情况。 今天我们最常用的日历形式是公历,每个月份的月历由七个垂直列组成(代表每周七天),另有约五至六行以水平方式代表星期。

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    60 种常用可视化图表,该怎么用?

    网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接,而定向网络图则可显示连接是单向还是双向(通过小箭头)。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...连接地图非常适合用来显示地理连接和关系,也可以通过研究连接地图上的连接分布或集中程度来显示空间格局。...节点围绕着圆周分布,点与点之间以弧线或贝塞尔曲线彼此连接以显示当中关系,然后通过每个圆弧的大小比例再给每个连接分配数值。此外,也可以用颜色将数据分成不同类别,有助于进行比较和区分。...我们也把日历当作可视化工具,适用于显示不同时间段的活动事件的组织情况。 今天我们最常用的日历形式是公历,每个月份的月历由七个垂直列组成(代表每周七天),另有约五至六行以水平方式代表星期。

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    常用60类图表使用场景、制作工具推荐!

    网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接,而定向网络图则可显示连接是单向还是双向(通过小箭头)。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...连接地图非常适合用来显示地理连接和关系,也可以通过研究连接地图上的连接分布或集中程度来显示空间格局。...节点围绕着圆周分布,点与点之间以弧线或贝塞尔曲线彼此连接以显示当中关系,然后通过每个圆弧的大小比例再给每个连接分配数值。此外,也可以用颜色将数据分成不同类别,有助于进行比较和区分。...我们也把日历当作可视化工具,适用于显示不同时间段的活动事件的组织情况。 今天我们最常用的日历形式是公历,每个月份的月历由七个垂直列组成(代表每周七天),另有约五至六行以水平方式代表星期。

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