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R语言ggplot2画添加分组信息的颜色

之前有人在公众号留言问文章开头这幅如何实现,下面的B是折线图加柱形,相对比较容易实现,上面的A稍微有点复杂,我想到的办法是拼图,A可以看成三个,然后加一个堆积柱形,最后将四个组合到一起...最初的想法是左侧的颜色条用堆积柱形来实现,又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包的推文,发现他是用geom_tile()函数实现的,仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。...Good Good Study, Day Day Up")))+ labs(x=expression(paste(italic("ABC"),"123"))) 下面进入今天推文的正式内容 首先是准备的数据...如何画这个昨天的推文已经介绍过了,点击下方蓝色字可以直达昨天的推文 R语言ggplot2画带有空白格的简单小例子 接下来是准备分组颜色条的数据 下面是画这个颜色条 df2<-read.csv...legend.title = element_blank())+ scale_fill_manual(values = c("green","blue","red")) 将分组颜色条和拼接到一起

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跟SCI学umap| ggplot2 绘制umap,坐标位置颜色 ,大小还不是你说了算

umap/tsne作为单细胞转录组的王牌图形之一,当seurat 或者 singleR 直接绘制的umap/tsne 需要调整的时候,可能比较难调整,当然AI或者PS都可以办到 。...umap所需的数据就是每个cell的坐标以及cluster或者celltype信息,然后绘制点 umap = pbmc@reductions$umap@cell.embeddings %>% #坐标信息...调整color,颜色列表来自于https://www.jianshu.com/p/67d2decf5517 allcolour=c("#DC143C","#0000FF","#20B2AA","#FFA500...(2)text 根据cluster的位置,手动添加,需要尝试,倒是效果会好一些。...更多注释详见ggplot2-annotation|画图点“精”,让自己“解释” 3.4 调整umap - repel - labels 1)计算每个cluster的median 坐标位置 cell_type_med

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还在用Matplotlib? 又一可视化神器Altair登场

如果变量类型指定为类别变量,那么 Altair 会为每个类别赋予不同的颜色。(例如 红色,黄色,蓝色) 补充:Vega-Lite 有两种类型的类别变量:名义变量和序数变量。...从图中可以看到,每个国家都用了不同的颜色表示。我们仅仅改变了变量 country_id 的编码,即用 N (Nominal 名义变量)替换了 Q (Quantitative 量化变量)。...这点小小的改变就足以使得 Altair 明白,它不该使用连续色标,而是使用独立色标。 图表的扩展 Altair 的另一个美妙之处就是,我们可以从现有的图表中创建新的图表。...Vega-Lite 交互性非常强大,我们不仅能够使用一行代码来添加 tooltips,还能将的选择区与另一个可视化关联。 高度灵活性。Altair的marks可以理解为图表构建中的模块。...如下图所示,我们用圆圈标记、线标记和文本标记的组合来构建一个。最终的代码可读性强,而且易于修改,这对于 matplotlib 来说是很难的。 ? ?

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当我做 hackathon 时我在做什么 (2)

比如 GG 里提到,「饼是极坐标下的柱状」。你品,你仔细品。 ?...美感可以通过大小,颜色等方面表达出来,其中最重要的表达手段,或者说视觉通道就是颜色颜色可以描述变量的模式/规律,可以做类别标注,也可以起高亮和强调的作用。...下图展示了 IPython Kernel 如何跟 Jupyter 通讯的(这的审美,唉,要不是没时间自己画,我真不好意思放上来): ?...然而,IElixir 实现了基本的消息通讯,但有些细节似乎没有测试过。比如对 html 片段的支持。...注意看这幅,它是两个 chart 组合而成的,还使用了 selection 来提供交互。用户在选择小的时候,大会随之而动。 嗯。开森。

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被Altair圈粉了!这款Python数据可视化库真香!

它非常简单、友好,并基于强大的Vega-Lite JSON规范构建,我们只需要简短的代码即可生成美观、有效的可视化效果。...对照柱形的实现代码,条形的实现代码变化的部分如下所示。...2015",titleFont="Calibri",titleFontSize=25,titlePadding=15))0)… 在类alt.X()中,使用month 提取时间型变量date 的月份,映射在位置通道...第9 章,介绍使用Altair 设置颜色的方法,以及配置图形属性的作用范围的实现方法。...如果喜欢本文欢迎 在看丨留言丨分享至朋友圈 三连  文推荐   详解强化学习多智能体博弈算法——蒙特卡洛树搜索 想做好分布式架构?这个知识点一定要理解透!

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R语言ggplot2绘图单元格为方块的—1—调整图例的位置

今天公众号后台有人留言作图,示例如下 ?...image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和的拼接,右侧的可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色,按照一定的数值来映射大小...今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 正常做一个柱形 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes

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Altair适用于气象领域的Python数据可视化库,文末送书!

它非常简单、友好,并基于强大的Vega-Lite JSON规范构建,我们只需要简短的代码即可生成美观、有效的可视化效果。...可以将可视化作品导出为PNG/SVG 格式的图片、独立运行的HTML 格式的网页,或者在线上Vega-Lite 编辑器中查看运行效果。 在Altair中,使用的数据集要以“整洁的格式”加载。...对照柱形的实现代码,条形的实现代码变化的部分如下所示。...titleFont="Calibri", titleFontSize=25, titlePadding=15) ) 0) … 在类alt.X()中,使用month 提取时间型变量date 的月份,映射在位置通道...labelColor:序号标签颜色。 labelFontSize:序号标签大小。 title:子区标题。 titleFont:子区字体。 titleFontSize:子区字体大小。

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真香!Python数据可视化 被Altair圈粉了!

它非常简单、友好,并基于强大的Vega-Lite JSON规范构建,我们只需要简短的代码即可生成美观、有效的可视化效果。...可以将可视化作品导出为PNG/SVG 格式的图片、独立运行的HTML 格式的网页,或者在线上Vega-Lite 编辑器中查看运行效果。 在Altair中,使用的数据集要以“整洁的格式”加载。...对照柱形的实现代码,条形的实现代码变化的部分如下所示。...titleFont="Calibri", titleFontSize=25, titlePadding=15) ) 0) … 在类alt.X()中,使用month 提取时间型变量date 的月份,映射在位置通道...labelColor:序号标签颜色。 labelFontSize:序号标签大小。 title:子区标题。 titleFont:子区字体。 titleFontSize:子区字体大小。

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博客 | 12个流行的Python数据可视化库总结

与Bokeh一样,Plotly的强项正在制作交互式,但它提供了一些在大多数库中没有的图表,如等高线图,树状和3D图表。...可以使用它来创建各种地图类型,例如等值线,和点密度贴图。你必须安装Pyglet(面向对象的编程接口)才能使用geoplotlib。...你可以根据或树形的完成度或点的相关度对数据进行过滤和排序。 10....Altair Altair是一个基于 Vega-lite 的声明性统计(declarative statistical)可视化python库。...声明意味着只需要提供数据列与编码通道之间的链接,例如x轴,y轴,颜色等,其余的绘图细节它会自动处理。声明使Altair变得简单,友好和一致。使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。 ?

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12个流行的Python数据可视化库总结

与Bokeh一样,Plotly的强项正在制作交互式,但它提供了一些在大多数库中没有的图表,如等高线图,树状和3D图表。...可以使用它来创建各种地图类型,例如等值线,和点密度贴图。你必须安装Pyglet(面向对象的编程接口)才能使用geoplotlib。...你可以根据或树形的完成度或点的相关度对数据进行过滤和排序。 10....Altair Altair是一个基于 Vega-lite 的声明性统计(declarative statistical)可视化python库。...声明意味着只需要提供数据列与编码通道之间的链接,例如x轴,y轴,颜色等,其余的绘图细节它会自动处理。声明使Altair变得简单,友好和一致。使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。

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为了更好的EasyShu,Vega-lite图表学习点滴分享

,但后面也重构了很久,直到全面熟悉和掌握了ECharts后,才能得心应手,做出想要的效果,特别是被张杰老师这样的图表专家鞭策下,目前除了满足基本的交互外,对学术论文级的场景需求也完全得到满足(导出矢量、...图例大小位置调整,图例追加等都花了不少精力去优化,2.8版本见分晓)。...Vega-lite的官网: https://vega.github.io/vega-lite/ 。其中的Tutorial版块做得非常好,深入浅出,特别是入门的GetStart。...看完文档后,再用心看了下 Ecosystem 的生态版块,Vega-lite的生态还是不少,好多其他语言和工具在其之上的封装,例如python的Altair轮子。...在上述的Vega-lite上找到了其官方推荐的Vega-lite笔记教程,网址如下: https://observablehq.com/@uwdata/introduction-to-vega-lite

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R语言绘制圈、环形可视化基因组实战:展示基因数据比较

颜色是矩阵中数值的重要美学映射。用户必须用用户定义的颜色模式指定col参数。如果矩阵是连续数字,如果矩阵是字符,col的值应该是一个命名的颜色向量。 下面的是之前的圆形版本。...side参数控制树状相对于轨道的位置。注意,树枝是在一个分离的轨道上。...下图是正常布局的,现在我将用圆形布局改变它们。 直观地显示了DNA甲基化、基因表达和其他基因组水平信息之间的相关性。 原始是用随机数据集生成的。...pvalue:甲基化和相关基因表达之间的相关测试的P值。数值是-log10转换的。 type:基因的类型(如蛋白质编码基因或林肯RNAs)。...ret.data("r sector.indexoup2) # 这是DMR2在\`group2\`图中的位置

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