Mamba是LLM的一种新架构，与Transformers等传统模型相比，它能够更有效地处理长序列。就像VIT一样现在已经有人将他应用到了计算机视觉领域，让我们来看看最近的这篇论文“Vision Mamba: Efficient Visual Representation Learning with Bidirectional State Space Models,”
生物体不同细胞内一般情况下具有相同的 DNA 序列，但是最终会分化为不同的细胞。例如人体内不同的组织细胞具有相同的 DNA 序列，但是分化为不同的细胞，例如血细胞，神经细胞，肌细胞等。这些都是由于基因表达调控的差别。
今天小编分享的这篇paper是来自《Genome biology》的综述，其回顾了空间转录组学中统计和机器学习方法的最新发展，总结了有用的资源。
本教程为最新安装Linux的教程，想看更详细可以到我B站主页看视频教程 本教程参考自 https://wiki.archlinux.org/index.php/Installation_guide 本教程于2019.11.9日编写，请根据查阅时间参考本教程（官网安装方式未更新，则本教程保持最新状态） 教程中的镜像更新时间：2019.11.01
Printf(“valriable x has value = %d\n”, x)
本节已经把常用的元字符全部都罗列完了，Unicode相关的控制\p等没有列出，平常用不太多，把这些融汇贯通基本就可以解决90%的正则问题了。接下来我们来探讨一下正则引擎的原理，有助于我们写出正确、效率高的正则表达式。
组织的复杂性使得在分子水平上以高通量的方式识别组织功能变得十分困难。而免疫组织化学和H&E染色是了解基于蛋白质表达和细胞形态的组织结构的基础工具。近年来空间转录组技术的发展将传统组织学技术的优点与RNA测序的巨大通量结合起来。在基因表达信息上分层的能力提供了更清晰、更全面的生物图片，这些图片是在组织切片上捕捉得到。
主要是想起来自己vim还不太会用，所以说记得这个课程的vim教学不错，干脆就花时间看看整套课程，重点看一下vim的使用，我看的版本是社区的中文翻译版的文档，这些工具大多我都已经能够熟练使用了，所以就没去看英文的视频感觉有点浪费时间。
我们想把其中的日期改为美国日期格式'mm/dd/yyyy'.比如 2019-06-12 改成 06/12/2019 格式
为了更好地表征神经母细胞瘤组中不同的恶性和免疫细胞特征，使用多重离子束成像(MIBI)，结合金属偶联抗体和time-of-flight质谱，在福尔马林固定石蜡包埋组织中生成41种蛋白质的高分辨率空间图。首先对两个高质量肿瘤标本(HTAPP-102-SMP-11 (II组)和HTAPP-130SMP-91 (IV组))的MIBI捕获进行平片处理，生成大的2000 μm x 2000 μm阵列。CD56/NCAM(神经母细胞瘤标志物)、增殖(Ki67)和转录活性染色质(H3K27ac)的表达都在肿瘤邻近区富集，而免疫效应物标志物(CD11c、CD4和CD8)在基质邻近区富集。接下来，使用11例患者样本的30个样本(fov)进行了MIBI分析，主要来自II组(n=7)。根据蛋白表达来标注细胞类型，并观察了与sc/snRNA-seq相关的免疫细胞密度的样本间和区域间差异。邻域分析(n=30)确定了细胞类型共定位的广泛模式。与PLANB一致，恶性肿瘤细胞分裂成一个免疫细胞很少的邻域，而免疫细胞丰富的邻域有四种不同的原型。例如，邻域“3”特别富含B细胞，而巨噬细胞主要定位于邻域“2”，也含有CD4 T、CD8 T和树突状细胞(DC)。
2021年1月19日，深圳华大生命科学研究院联合国内外多机构共同开发的全新空间转录组测序技术：Stereo-seq对外发布，该技术以前所未有的（亚细胞级）分辨率对组织切片进行高通量转录组分析，区域可扩展到厘米级，具有高灵敏度和均匀的捕获率。相关研究内容已经在BioRxiv上进行了预印刊载。
运行结果：['ab', 'fd', 'ft', 'fs', 'f', 'df', 'fss', 'dfd', 'fs', 'uu', 'fsd']
字符串处理是 Python 中最基本的操作之一了，但其实有些用法你真的可能没有注意到，这里分享一篇关于 Python 字符串处理的总结文章，希望对大家有帮助。
1、ls 文件属性： -：普通文件 d：目录文件 b：块设备 c：字符设备文件 l：符号连接文件 p:命令管道 s：套接字文件 文件权限： 9位数字，每3位一组 文件硬链接次数 文件所属主（owner） 文件的属组（group） 文件大小（size），单位默认是字节 ls常用选项： -l：显示文件属性，ls -l=ll -h：做相应的单位转换显示 -a：显示所有文件 -A：显示.和..以为的所有文件 -d：显示目录自身属性 -i：显示文件的缩影接点号码（index node ，inode） -r：逆序显示文件列表 -R：递归显示文件 2、cd cd：change directory cd：回到用户的家目录 cd ~username：进入指定用户的家目录 cd - ：在当前目录和前一次所在的目录来回切换 cd ..:切换至其父目录 3、printenv：显示当前环境变量信息
之前我们介绍了基础配置部分和快捷键配置部分。如果你配置了这两个部分，vim已经算是比较好用了。但是作为代码编辑器来讲还是显的比较简陋，用这些配置来完成日常的编码任务会显得力不从心。vim比较强大的一点是它拥有丰富的插件系统。大量高手在上面为它开发各种形式的插件。今天我们将从插件管理开始，利用前人的成果丰富我们的vim功能
URLconf 在settings.py文件中通过ROOT_URLCONF指定根级url的配置 urlpatterns是一个url()实例的列表 一个url()对象包括： 正则表达式 视图函数 名称name 编写URLconf的注意： 若要从url中捕获一个值，需要在它周围设置一对圆括号 不需要添加一个前导的反斜杠，如应该写作'test/'，而不应该写作'/test/' 每个正则表达式前面的r表示字符串不转义 请求的url被看做是一个普通的python字符串，进行匹配时不包括get或post
dev：device——存放外接设备（磁盘，光盘），不能被直接使用，需要被挂载——#mount
文章背景： 工作中，有时需要批量更新单元格内的信息。可以通过正则表达式匹配对应信息，然后再更新成自己想要的内容。
Django的路由系统 URL配置其实就是告诉Django项目你执行代码的路径，本质就是路径和调用的视图函数之间的映射关系表。Django通过这个表，可以把路径匹配到对应的视图函数，从而开始执行相应的函数。 Django 1.11版本 URLConf官方文档 URLconf配置 基本格式 在urls.py文件中配置 from django.conf.urls import url urlpatterns = [ url(正则表达式, views视图函数，参数，别名), ] 这里需要注意的是
文章背景： 最近在看同事写的VBA正则表达式，发现其中用到了非捕获组(?:Expression)。因此，本文对非捕获组的用法做了一些研究。
一、基础指令 1.ls指令 ../ 上级目录 ./ 当前目录 ls -al -l 表示list,一详细列表的形式显示 -a 表示显示所有目录和文件 2.pwd指令 3.cd指令 cd~ 回到家目录 4.midir指令 mkdir 路径 mkdir -p 路径 创建多层目
NE 的中心思想就是找到一种映射函数，该函数将网络中的每个节点转换为低维度的潜在表示
Django的urls系统简介 Django 1.11版本 URLConf官方文档：https://docs.djangoproject.com/en/1.11/topics/http/urls/ URL配置(URLconf)就像Django 所支撑网站的目录。它的本质是URL与要为该URL调用的视图函数之间的映射表。 你就是以这种方式告诉Django，对于这个URL调用这段代码，对于那个URL调用那段代码。 URLconf配置 基本格式： from django.conf.urls import url
目前关于空间转录组学的许多文献是技术性的，并不面向不熟悉该领域的研究人员。近日，《Genome Medicine》发表了一篇综述文章为空间转录组学提供了一个入门指南：涵盖了生物医学研究所需的可用技术、实验设计考虑和生物信息学分析。
Regular Expressions (Regex)：正则表达式，软件工程中最为强大，且广泛适用，令人信服的技术之一。从验证电子邮件地址到执行复杂的代码重构器，正则表达式的用途非常广泛，是任何软件工程师工具箱中必不可少的条目。
简洁、优雅的URL 模式在高质量的Web 应用中是一个非常重要的细节。Django 允许你任意设计你的URL，不受框架束缚。
空间转录组学的发展极大地扩展了复杂多细胞生物系统的知识。那么大家常常提到的空间转录组技术都有哪些技术？
传统的卷积已经普遍被使用，现在陆续出现新的卷积方式，越来越高效，也越来越被他人认可，在性能方面也得到了较大的提升。
()表示捕获分组，()会把每个分组里的匹配的值保存起来，从左向右，以分组的左括号为标志，第一个出现的分组的组号为1，第二个为2，以此类推
为了进一步提高Windows操作系统上可用的攻击面，添加易受攻击的软件以及启用或禁用某些集成组件很重要。
对于高质量的Web 应用来说，使用简洁、优雅的URL 模式是一个非常值得重视的细节。Django 让你随心所欲设计你的URL，不受框架束缚。
shell编程 一、基础指令 1.ls指令 ../ 上级目录 ./ 当前目录 ls -al -l 表示list,一详细列表的形式显示 -a 表示显示所有目录和文件 2.pwd指令 3.cd指令 cd~ 回到家目录 4.midir指令 mkdir 路径 mkdir -p 路径
关于空闲空间的管理，前面提到的是已被占用的数据块的组织和管理。接下来要解决的问题是，当我要保存一个数据块时，应该将其放在硬盘的哪个位置。难道需要扫描所有的块，随意找个空的地方放吗？
Linux下安装Oracle需要做一些准备工作，如，依赖包、组和用户、内核参数、资源限制、目录、环境变量等。 安装环境：CentOS7 64位、Oracle11g(11.2) #Linux下Oracle安装准备工作#、#CentOS7#、#Oracle11g#
为什么说版本控制系统非常有用？即使您只是一个人进行编程工作，它也可以帮您创建项目的快照，记录每个改动的目的、基于多分支并行开发等等。和别人协作开发时，它更是一个无价之宝，您可以看到别人对代码进行的修改，同时解决由于并行开发引起的冲突。
1.如果你是以普通用户登录的话，修改自己的密码，使用passwd命令。会让你先输入自己的旧密码，再输入两遍新密码。
Hi-C 技术源于基因组捕获技术（Chromosome conformation capture，3C），用于分析染色质三维空间结构的一种测序方法。1
arXiv: 2108.13341：https://arxiv.org/pdf/2108.13341.pdf
这里表示 test 可以 任意主机上 任何用户 但这个用户不能属于root组 执行vim命令
注：为了理解的一致性，本文档将使用SDK规定的术语，不做翻译。注意区分Measurements和instrument的区别，前者指的是度量数据，后者是一个工具
近日，Facebook AI、新加坡国立大学、360 人工智能研究院的研究人员提出一种新的卷积操作 ——Octave Convolution (OctConv)。
Linux 下使用 sudo 命令，可以让普通用户也能执行一些或者全部的 root 命令。本文就对我们常用到 sudo 操作情景进行简单分析，通过一些例子来了解 sudo 命令相关的技巧。
在linux系统下，普通用户无法直接执行root用户权限下的命令，如果想让普通用户执行只有root用户才能执行的操作命令。 下面罗列下经常使用sudo命令的几个场景： 1.用户无权限执行root命令 普通用户登录 shell 之后，如果自身没有权限访问某个文件或执行某个命令时，若该用户获得root授权，那么就可以在需要执行的命令之前加上 sudo，临时切换到root用户的权限，完成相关的操作。在sudo于1980年前后被写出之前，一般用户管理系统的方式是利用su切换为超级用户。但是使用su的缺点之一在于必须
正好我自己也有听播客的习惯，只不过几乎都是中文，但现在我已经尝试听了一段时间的英文播客，觉得效果还不错。
文摘菌反问一句，还有比你的二次元老婆更合适的人选吗？既然如此，为何不和你的二次元老婆组个乐队玩玩？
普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞或一个器官混合到一起去提取RNA，获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值。单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA，然后建库测序，获得是是单个细胞的表达值。在每个细胞里面基因的表达具有随机性，且存在异质性。而且这些细胞群中会存在不同类型的细胞，尤其是当我们对整个组织或者器官进行测序时，它们本身就是由不同类型的细胞组成的，而我们用普通转录组来测序，相当于掩盖住了这些不同的细胞类型的差异，展示的是整个组织的平均的状态，所以说单细胞从这个来看跟普通转录组就不同在是用一个细胞测，不是用一堆细胞测。
其中，论文一作陈云鹏现于新加坡国立大学读博士，师从颜水成和冯佳时，两人也是这篇论文的作者。其他作者来自Facebook AI。
PS：一般来说，应该会将 Dockerfile 置于一个空目录下，或者项目根目录下。如果该目录下没有所需文件，那么应该把所需文件复制一份过来。如果目录下有些东西确实不希望构建时传给 Docker 引擎，那么可以用 .gitignore 一样的语法写一个.dockerignore，该文件是用于剔除不需要作为上下文传递给 Docker 引擎的。基本思路：1.编写.dockerignore文件 2.容器只运行单个应用 3.将多个RUN指令合并为一个 4.基础镜像的标签不要用latest 5.每个RUN指令后删除多余文件 6.选择合适的基础镜像(alpine版本最好)
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
实时音视频
即时通信 IM
对象存储
